Synthetic Progress of Jiadifenolide

Jiadifenolide是一个从我国特有药物假地枫皮中分离得到的结构新颖的seco-prezizaanes型倍半萜类化合物,具有一个高度氧化的五环笼状结构,7个连续手性中心.它在较低浓度下有效促进神经元的生长,被认为是一种小分子营养剂,具有治疗神经退行性疾病的潜力.总结了过去五年间关于此分子的合成研究进展.Jiadifenolide, a new seco-prezizaane-type sesquiterpenoid, was isolated from Chinese unique medicine Illicium jiadifengpi. It contains a highly oxygenated cagelike architecture with seven contiguous stereocenters. It displays potent neurotrophic activity at very low concentration and is regarded as a promising lead compound for developing drugs for neuro-degenerative diseases. This review summarizes the synthetic efforts towards jiadifenolide in the last five years.国家自然科学基金(Nos.21142007,21272194,21572187,U1405228);; 中央高校基本科研业务费专项资金(No.20720160025);; 教育部长江学者和创新团队发展计划资助项目~

Diversity of culturable endophytic fungi of common reed ( Phragmites australis) in coastal wetland

内生真菌在植物生长以及抵御环境胁迫过程中起着非常重要的生态作用.本研究从黄河三角洲滨海湿地1350个芦苇组织切片中分离得到318株内生真菌,通过对rDNA ITS的分型、测序及系统进化分析,研究了该地区芦苇植株根、茎、叶中可培养内生真菌的种类组成及在不同盐度、不同组织中的分布情况.根据序列相似性(以98%为阈值),共获得12个真菌分类操作单元(OTUs).在门级分类水平上,子囊菌门为绝对优势菌群,在各组织和站位中均有分布.芦苇根组织中分离得到的内生真菌OTU数相对较多,叶组织和茎组织中分离到的OTU数相同,且叶中的OTU在根中均存在.潮上区(低盐区)内生真菌OTU数最多,高潮区次之.根中可培养..

基于不同初值的微震源定位方法

分析微震源定位方法中的线性定位方法和Geiger定位方法以及各自特点,并提出线性定位方法和Geiger定位方法相结合的联合定位方法。以柿竹园全数字多通道微震监测系统为背景,通过进行人工定点爆破试验,分别采用线性定位方法、常规Geiger定位方法及联合定位方法对震源进行定位。通过与实际爆破坐标进行对比分析得出,联合定位方法解决线性定位求解精度低的问题;同时优化常规Geiger定位方法初值选择,提高迭代求解效率,避免当Geiger定位方法求解出现奇异矩阵时,迭代初值不准确造成定位误差较大甚至无法定位等问题

Computational Identification of Alternative Splicing in Next-Generation Sequencing Data

随着测序技术的发展,下一代测序技术(nEX-T gEnErATIOn SEQuEnCIng)给生物信息学领域研究带来了新的机遇和挑战.由于选择性剪切(AlTErnATIVE SPlICIng,AS)在真核生物基因表达和蛋白质多样性方面的重要性,识别选择性剪切位点一直都是研究的重点.下一代测序技术的出现,使得选择性剪切研究的计算方法不断地变化.介绍了选择性剪切过去和目前研究的状况,然后总结了基于rnA-SEQ数据的选择性剪切研究方法、软件以及数据库,并利用了rnA-SEQ数据比较了相关软件,最后讨论了选择性剪切中计算方法的发展方向和前景.With the development of sequencing technology,Next-Generation Sequencing brought opportunities and challenges to the bioinformatics.As the importance of alternative splicing in gene expression and protein diversity in eukaryotes,alternative splicing identification has been the focus of bioinformatics research.The computation methods for alternative splicing need to be improved since the appearance of Next-Generation Sequencing.We introduce the past and current research of AS firstly;then conclude and compare the research methods,software and databases of AS based on RNA-seq data;finally try to discuss the development and prospect of the computational methods on AS.国家自然科学基金(No.61001016;No61102136);福建省自然科学基金(No.2011J05158);厦门大学基础创新科研基金(中央高校基本科研业务费专项资金)(No.2011121049

镓在抗菌方面的研究进展

抗生素发现\"黄金时代\"的结束以及日趋严重的抗生素耐药性问题给我们留下一个戏剧性的、缺乏新型药物来防治耐药病原体感染的难题。这使得从现有非抗生素药物中筛查抗菌活性药物成为一种新尝试。近期研究表明:美国食品药品监督管理局(FDA)批准的、本来用于治疗高血钙的药物硝酸镓具有良好的抗菌活性。不同于其他抗生素,镓的药理性质依靠化学拟态,它可以在目标酶分子中取代铁,从而干扰、扰乱细菌含铁蛋白的功能及细菌代谢,无论是在体外实验还是在体内实验中,镓对多种病原体,包括多重耐药病原体都表现出杀菌活性。因此一些含镓制剂有望被开发成有潜力的非传统抗菌药物,帮助治疗多重耐药细菌感染。国家自然科学基金(No.81673242、No.81473251、No.31741006、No.31370166和No.81301474);;福建省自然科学基金(No.2014J01139和No.2015J01345);;厦门大学校长基金(No.20720160060

类岩石材料声发射参数与应力和应变耦合本构关系

利用液压伺服试验系统和声波监测仪开展了岩石和混凝土材料声发射特性试验研究,并在试验基础上研究了损伤变量与声发射参数之间的量化关系.结果表明,损伤变量与声发射参数呈线性关系.采用基于Weibull分布的损伤本构模型及损伤变量与声发射数间的经验公式,推导出应力、应变参量与声发射数参量的耦合模型,该模型参数可以根据应力--应变全曲线及损伤变量与声发射数关系曲线的几何边界条件确定其表达式,方式简单适用.通过与岩石和混凝土试样单轴压缩试验实测结果对比,证实模型可以很好地反映单轴受压状态下岩石和混凝土的应力、应变与声发射数的耦合关系

深埋双轨巷道围岩与支护结构稳定性的有限元仿真分析

采用有限元方法对深埋双轨巷道在无支护和有支护条件下围岩与支护结构的受力及变形特征进行分析,给出两种支护条件下围岩的应力分布特征、巷道周边特征点的变形(位移)大小及破坏区的范围,对支护前后巷道周边特征点处的应力、位移和屈服度进行对比分析,计算了混凝土支护结构所受内力和弯矩的大小,并给出其分布特征图。通过研究得出围岩能够自行稳定、支护结构设计参数合理和原设计方案可行的结论

基于小波变换的大尺度岩体结构微震监测信号去噪方法研究

为将小波去噪方法应用于大尺度岩体结构微震监测信号的去噪研究,首先在MAT-LAB环境下进行仿真,验证了使用Symlet6小波进行小波去噪的可行性;利用4种自适应阈值规则对含噪信号进行去噪对比,结果表明4种阈值去噪后的信号在均方差较小的情况下都极大地提高了信号的信噪比,有效地去除了噪声,对不同的含噪信号,无偏似然原则阈值去噪后的信噪比最高,同时均方差也最小,在去噪时显得更为有效;以柿竹园全数字多通道微震监测系统为背景,将MATLAB仿真结论应用于现场微震信号的去噪研究,结果表明小波阈值去噪特别适合大尺度岩体微震信号这一类非稳定信号的去噪分析,既可以对低信噪比的微震信号提取出有效信号,也可以对频率覆盖范围广的微震信号在各尺度上提取并重构出有效信号,实现了对微震真实信号和噪声信号的有效分离

甲酸甲酯氢解制甲醇铜基催化剂上吸附物种的现场红外光谱表征

应用原位红外光谱的方法，在反应现场条件下，研究了促进型甲酸甲酯（ＭＦ）氢解制甲醇铜铬催化剂上的化学吸附物种．结果表明，在ＭＦ氢解反应条件下，工作态催化剂上主要的化学吸附物种和反应中间物种是ＣＨ３Ｏ－ＣＨＯ…Ｈ－Ｏ（ａ）（１７５１，２７３０，１４５５ｃｍ－１）、ＣＨ３Ｏ－ＣＨＯ…Ｃｕ＋（ａ）（１６５４，２７３０，１４５５ｃｍ－１）、ＣＨ３Ｏ－ＣＨＯ…Ｃｒ３＋（ａ）（１５５２，２７３０，１４４５ｃｍ－１）和ＯＣＨ３（３０１２，２９４６，１４５５ｃｍ－１）．结合对该催化剂活性位本质的探讨，推断了甲酸甲酯氢解制甲醇的主要反应途径

Co修饰碳纳米管促进的Cu-ZrO_2催化剂上CO_2加氢制甲醇

利用微波助多元醇化学还原沉积法,制备一类Co修饰的多壁碳纳米管(CNT)基复合材料(y%Co/CNT),进而用其作为添加剂,制备共沉淀型y%Co/CNT促进的Cu-ZrO2催化剂,CuiZrj-x%(y%Co/CNT).Co对CNT的修饰明显地提高了该催化剂对CO2加氢制甲醇的催化活性.在Cu1Zr1-10%(4.3%Co/CNT)催化剂上,5.0 MPa,513 K,V(H2)/V(CO2)/V(N2)=69/23/8,GHSV=8 000 mL/(h.g)的反应条件下,CO2加氢的转化频率(TOF,即单位时间(s)内在单个表面活性金属Cu0位上CO2加氢转化的分子数)达2.89×10-3s-1,是相同条件下非促进的原基质Cu1Zr1和单纯CNT促进的对应物Cu1Zr1-10%CNT上这个值(2.36×10-3s-1和2.40×10-3s-1)分别的1.22和1.20倍;在CO2加氢产物中甲醇的C-基选择性为～92%,时空产率达176 mg/(h.g-cat.).催化剂的表征研究显示,Co修饰CNT促进的催化剂对H2优良的吸附活化性能对CO2加氢转化频率(TOF)的显著提高起着重要作用