The screening of anti-HBV siRNA s and antivirus research in vitro and in vivo

乙型肝炎病毒（HBV）感染是全世界最重要的公共卫生问题之一，严重危害人类健康。尽管预防疫苗免疫降低了乙肝发生率，但目前全世界仍有约4亿HBV感染者，当前的药物治疗方法尚不足于应对该挑战，因此迫切需要发展新的更为有效的治疗手段以对付HBV的威胁。RNAi是近年来发现的细胞内序列特异性抑制基因表达的机制，将RNAi技术应用于包括病毒性肝炎等在内的疾病治疗已成为当前的研究热点，而获得兼具高效抑制特性和保守性特征的RNAi靶位是RNAi治疗方法获得成功应用的重要基础。本研究以生物信息学为辅助，通过建立多基因型HBV细胞和小动物表达模型，对HBV基因组上潜在的siRNA靶点进行了规模化筛选和验证，获得多...Hepatitis B infection is one of the most important popular heathy problem.Although the application of HB vaccine greatly reduced the incidence of Hepatitis B,more than 400 million people worldwide are persistently infected with the hepatitis B virus (HBV). The current drug treatments is still insufficient to cope with the challenges. RNA interference is a sequence-specific gene silencing mechanism...学位：理学硕士院系专业：生命科学学院生物学系_生物化学与分子生物学学号：2012005130212

Development and preliminary application of cell and humanized mouse models supporting HBV infection

乙型肝炎病毒（HepatitisBvirus，HBV）可引起急慢性乙型肝炎、肝硬化、肝癌等疾病，是严重危害人类健康的重要病原体。尽管新发HBV感染由于乙肝疫苗的发明和推广得到了有效的控制，但世界范围内仍然有数以亿计的慢性HBV感染者需要得到有效的治疗。现有的核苷类和干扰素类药物治虽能控制病情进展但不能有效根治，急需发展更为有效的治疗药物。此外，慢性HBV感染导致肝硬化和肝癌等终末期肝病的致病机制仍不十分清楚，对于HBV感染早期过程的了解仍然十分有限。而上述问题的解决均离不开能实现HBV感染完整生命周期的实验模型。HBV具有严格的宿主特异性和嗜肝性，缺乏高效的可开展规模化研究的细胞和动物感染模型...Hepatitis B virus (HBV), which can cause acute and chronic hepatitis, liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma, is a is one of the most important pathogen threatening human health globally. Although the development and application of HB vaccine effectively reduced the new HBV infection, there were still more than hundreds of million people who chronically infected by HBV require more effective...学位：理学博士院系专业：生命科学学院_生物化学与分子生物学学号：2172008015043

靶向HIV-1pol的高效人工miRNA的构建与体外抗病毒能力评价

RNAi技术在抗HIV-1治疗研究中已显示出巨大潜力,获得可高效特异抑制HIV-1的RNAi元件是进行相关研究的重要基础。miRNA在抑制和表达方式上相比siRNA具有更多的优势。本研究即探讨构建可高效特异靶向HIV-1的人工miRNA元件。选择以保守性较好的HIV-1pol基因为靶区筛选高效保守的RNAi序列,设计了16个可靶向pol区高保守区段的RNAi靶点,构建表达载体与HIV-1感染性克隆进行共转染抑制实验,筛选显示pol1026序列兼具高保守性及高抑制效率特点。以天然miR-30a为基础骨架构建了靶向pol1026靶点的人工miRNA元件,通过与HIV-1感染性克隆质粒的共转染抑制实验验证获得了可有效抑制HIV-1表达的人工miRNA元件(miR-1026E)。通过与携带靶序列的报告质粒的共转染实验证明miR-1026E具有良好的靶点特异性。本研究进一步构建了携带miR-1026E表达元件的重组慢病毒,转导MT-4细胞并对转导后细胞进行克隆化筛选,获得稳定整合miR-1026E表达元件的MT-4-miR1026E细胞克隆,该细胞在体外攻毒实验中可高效抑制HIV-1的复制,具有显著的抑制HIV-1的能力。同时应用实时RT-PCR方法检测显示,miR-1026E在细胞中不会影响内源性代表miRNA(miR-181与miR-16)的表达水平和干扰素效应相关基因stat1的表达水平,具有良好的特异性。所获得的可特异高效抑制HIV-1复制的人工miRNA元件可为抗HIV-1研究提供重要参考

靶向HIV-1 vif的高效人工miRNA的构建及慢病毒介导的体外抗病毒研究

RNAi在HIV-1的治疗研究中得到了广泛的应用,构建高效并且安全的RNAi抗病毒元件是开展相关研究的基础。vif37是以前的研究中筛选获得的靶向HIV-1 vif的高抑制效率兼具保守性的RNAi靶点。miRNA在抑制效率和启动子的选择上比常用的shRNA具有优势。本研究探索以人工miRNA结构引发vif37靶点对应的RNAi。本研究以天然的miR-155前体为骨架,采用步移的方式设计了3个靶向vif37的人工miRNA,以RNA聚合酶Ⅱ类启动子指导表达。miRNA表达质粒和HIV-1的感染性克隆pNL4-3共转染的结果显示,3个人工miR-NA中只有miR-vif37H具有抑制效果,效率与shRNA-vif37相当。与携带靶序列的荧光素酶报告质粒共转染实验证明miR-vif37H具有良好的抑制特异性。用表达miR-vif37H的重组慢病毒转导HIV-1的敏感细胞MT-4,克隆化后获得稳定表达miR-vif37H的细胞株MT-4-miR37H,该细胞可以有效抑制HIV-1的体外复制。实时RT-PCR检测结果显示,与shRNA-vif37相比,miR-vif37H的表达水平明显下降,安全性更好。进一步的实时RT-PCR检测结果还显示,miR-vif37H在细胞内的稳定表达不会影响内源代表性miRNA(miR-181和miR-16)的加工以及干扰素应答相关基因Stat1的mRNA水平。miR-vif37H是一个特异的高效RNAi元件,为vif37靶点的进一步应用研究奠定了基础

重组慢病毒对不同哺乳动物细胞基因转移及表达效率的研究

慢病毒是一种具有独特优点和巨大应用潜力的哺乳动物细胞基因转移载体,我们对慢病毒载体对不同哺乳动物细胞的基因转移及表达效率进行了平行比较研究.应用第三代重组慢病毒系统构建了携带CMV启动子-EGFP报告基因表达元件的重组慢病毒Lenti-EGFP,分别对多种不同哺乳动物细胞进行转导实验,在转导48 h后应用流式细胞仪检测报告基因在不同细胞株中的转移及表达效率.我们共使用了29种哺乳动物细胞株,包括14种人类组织细胞,5种猴组织细胞,9种鼠组织细胞,1种兔组织细胞.结果显示,重组慢病毒具有良好的基因转移能力,可有效进入多数哺乳动物细胞,对不同种属来源的细胞没有表现出特别的偏嗜性,但对贴壁培养细胞的基因转移效率明显高于对悬浮培养细胞.本研究为重组慢病毒系统的合理使用提供了基础

靶向HIV-1 vif的高效siRNA的筛选及慢病毒介导的体外抗病毒研究

RNAi技术在艾滋病治疗研究中已展现出巨大的潜力,兼具高效抑制特性和保守性的siRNA靶位是其获得成功应用的重要基础。本研究选择以HIV-1 vif基因为靶区筛选高效保守的RNAi序列,共选择设计了30个识别不同位点的siRNA序列,以pSUPER为载体构建了相应的shRNA表达质粒。通过与pNL4-3质粒在293FT细胞中进行共转染抑制实验,以及对初筛获得的高效序列进行保守性分析显示siRNA-vif37序列具有高效抑制效率和较好的保守性特征。通过与pGL3-vif报告质粒的共转染实验证明siRNA-vif37具有vif基因抑制特异性。带有shRNA-vif37表达元件的重组慢病毒转导后的MT-4细胞在HIV-1NL4-3体外攻毒实验中可显示出较有效的抑制病毒复制的能力,本研究进一步对转导后细胞进行克隆化筛选,获得稳定整合shRNA-vif37表达元件的MT-4-vif37细胞克隆,该细胞具有显著的抑制病毒复制的能力,在高攻毒剂量下仍可获得良好的抑制效果。本研究为进一步应用RNAi技术进行新型艾滋病治疗方法研究提供了重要基础

米非司酮对人耐药卵巢癌细胞增殖、凋亡及其对紫杉醇敏感性的影响

背景与目的:米非司酮是有效的孕酮受体拮抗剂。研究发现,米非司酮对体内外卵巢癌细胞均具有生长抑制作用,但机制尚不清楚。本研究旨在探讨米非司酮对人耐药卵巢癌细胞A2780/T增殖、凋亡及其对紫杉醇敏感性的影响,为临床应用米非司酮治疗耐药性卵巢癌提供实验依据。方法:体外培养人卵巢癌耐药细胞A2780/T,采用CCK-8法检测单用米非司酮及合用紫杉醇时对A2780/T细胞增殖的影响,分析米非司酮与紫杉醇在抑制耐药卵巢癌细胞增殖中的相互作用。采用流式细胞术分析米非司酮及米非司酮联合紫杉醇对A2780/T细胞凋亡的影响。结果:实验所选各种浓度(0.625～20μg/mL)米非司酮对A2780/T和A2780细胞均有一定程度的生长抑制作用,并呈浓度依赖性。当紫杉醇浓度为1.25或2.5μg/mL,合用米非司酮浓度为20、10、5、2.5、1.25或0.625μg/mL时,能显著抑制A2780/T细胞的增殖,并显示两种药物的协同作用(q>1.15)。当紫杉醇浓度为0.625或5μg/mL时,仅表现为两种药物的相加作用(0.85<q<1.15)。米非司酮可诱导A2780/T细胞凋亡。当米非司酮浓度为1.25、2.5和5μg/mL时,细胞凋亡率分别为(15.50±1.48)%、(26.28±0.76)%和(45.13±0.91)%。当以上3种浓度米非司酮与2.5μg/mL紫杉醇联合作用时,显示了两种药物在诱导A2780/T细胞凋亡作用上的协同效应。结论:米非司酮能够显著抑制人卵巢癌细胞A2780/T和A2780增殖,诱导A2780/T细胞凋亡,并能增强A2780/T细胞对紫杉醇的敏感性

人乳头瘤病毒假病毒制备方法的优化

人乳头瘤病毒假病毒可广泛应用于中和抗体鉴定和疫苗免疫性评估等研究.本研究对多质粒共转染293FT细胞生产HPV假病毒的方法进行了深入优化,结果显示不同的HPV结构蛋白表达质粒转染比例对于假病毒生产效率有显著的影响,HPV主要结构蛋白L1的表达水平是影响生产效率的主要因素,L2表达质粒的用量过高或过低均不利于假病毒的生产,而报告质粒的用量对假病毒生产效率的影响相对较小.综合比较显示,在该体系中L1和L2表达质粒和报告质粒以合适比例(如1∶1/10∶1/2)进行共转染可获得更为理想的生产效率.本研究同时也在293FT细胞中对磷酸钙转染方法进行了优化,通过磷酸钙与质粒用量的交叉配比试验获得了较优的转染条件.通过优化,建立了更为高效的HPV假病毒大量制备方法,在HPV16、HPV18、HPV6、HPV11假病毒生产中的应用结果显示较原方法可显著提高生产效率.本研究为HPV假病毒中和实验的规模化应用提供了有利条件

风湿性心脏病IgG和IgA-补体双特异性免疫复合物的研究

采用捕捉法ElISA，研究64例风湿性心脏病患者的Igg和IgA-补体双特异性免疫复合物（Igg/C3-TCIC和IgA/C3-TCIC）。结果发现，二者的阳性率均为62.5%，与性别、年龄、病程、rf、补体均无明显关系，而与血清Ig有一定关系；Igg/C3-TCIC的阳性率还与风湿活动和反映风湿活动的指标有关。江西省自然科学基

Virus-Free and Live-Cell Visualizing SARS-CoV-2 Cell Entry for Studies of Neutralizing Antibodies and Compound Inhibitors

新型冠状病毒SARS-CoV-2在全球蔓延，给全球公共卫生带来严重威胁。快速研制疫苗、抗体和治疗药物成为科学界面临的重大挑战。由于SARS-CoV-2的高度传染性，采用病毒感染模型进行中和抗体及小分子抑制剂的药效评估需要在高等级生物安全实验室中进行，且常需要数天时间才能完成检测，限制了抗体和药物筛选的效率。发展快速、可视、不依赖于活病毒的新冠病毒入胞检测探针和细胞模型，对于加速新冠病毒抗体和药物的研究有重要意义。夏宁邵教授团队通过CHO真核表达系统高效表达制备出C端融合抗酸荧光蛋白Gamillus的重组新冠病毒spike蛋白STG。STG经SEC分子筛和冷冻电镜确认呈现与天然病毒刺突高度相似的三聚体结构，且与ACE2有很高的亲和力（18.2nM）。STG具备良好的细胞相容性和荧光性质，研究者进一步开发了可定量测定感染恢复期血清、疫苗免疫血清中和抗体（入胞阻断抗体）水平的CSBT检测方法。除了抗体检测评估方面的应用外，该研究发展的探针和模型还可用于筛选分析抑制新冠病毒入胞及胞内转运的小分子化合物。 我校博士后张雅丽，博士生王邵娟、巫洋涛，博士后侯汪衡、袁伦志和深圳市第三人民医院沈晨光博士为共同第一作者。厦门大学夏宁邵教授、袁权教授、程通教授为该论文共同通讯作者。The ongoing corona virus disease 2019 (COVID-19) pandemic, caused by SARS-CoV-2 infection, has resulted in hundreds of thousands of deaths. Cellular entry of SARS-CoV-2, which is mediated by the viral spike protein and ACE2 receptor, is an essential target for the development of vaccines, therapeutic antibodies, and drugs. Using a mammalian cell expression system,a genetically engineered sensor of fluorescent protein (Gamillus)-fused SARS-CoV-2 spike trimer (STG) to probe the viral entry process is developed.In ACE2-expressing cells, it is found that the STG probe has excellent performance in the live-cell visualization of receptor binding, cellular uptake, and intracellular trafficking of SARS-CoV-2 under virus-free conditions. The new system allows quantitative analyses of the inhibition potentials and detailed influence of COVID-19-convalescent human plasmas, neutralizing antibodies and compounds, providing a versatile tool for high-throughput screening and phenotypic characterization of SARS-CoV-2 entry inhibitors. This approach may also be adapted to develop a viral entry visualization system for other viruses.This study was supported by National Natural Science Foundation of China (81993149041 for N.X.; 81902057 for Y.Z.; 81871316 and U1905205 for Q.Y.), the National Science and Technology Major Project of Infectious Diseases (No. 2017ZX10304402‐002‐003 for T.C. and No. 2017ZX10202203‐009 for Q.Y.), the National Science and Technology Major Projects for Major New Drugs Innovation and Development (No. 2018ZX09711003‐005‐003 for T.C.), the Science and Technology Major Project of Fujian (2020YZ014001), the Science and Technology Major Project of Xiamen (3502Z2020YJ01), and the Guangdong Basic and Applied Basic Research Foundation (2020A1515010368 for C.S.). 该研究得到了国家自然科学基金、传染病防治国家科技重大专项、福建省应急科技攻关项目和厦门应急科技攻关项目的支持