不同水生脊椎动物的血清与黏液蛋白图谱分析

因脊椎动物的血清与黏液中含有大量蛋白质及其他生物活性物质,而具有多种生理、生化与抗病防御功能。为了解水生脊椎动物血清与黏液中所含主要蛋白成分及其异同,我们分别从中华鲟(Chinese stur-geon Aclpenser sinensis grdy)、鲫鱼(Crucian carp Carassius auratus)、草鱼(Grass carp Ctenopharyngodonidellus)、赤点石斑鱼(Red-spotted grouper Epinephelus akaara)、青石斑鱼(Banded grouper Epinephelusawoara)、狗鱼(Pikes Esox reicherti)、江豚(Finless porpoise Neophocaena phocaenoides)、黄颡鱼(Yellow catfishPelteobagrus fulvidraco)、鳜鱼(Mandarin fish Siniperca chuatsi)这9种水生脊椎动物中,采集血清和皮肤黏液样本。利用考马斯亮蓝G-250法,测定了不同水生脊椎动物的血清和黏液样品中总蛋白的含量;经SDS-PAGE蛋白电泳,分别获得不同水生脊椎动物血清及黏液蛋白图谱;比较和分析了同种动物血清和黏液、不同动物之间血清与血清或黏液与黏液之间蛋白图谱的差异。结果表明:这些动物的血清蛋白组分有显著相似性,在分子量45—120 kD之间,蛋白条带大量集中分布;除青石斑鱼外,其他8种水生脊椎动物都有分子量约为28 kD和14 kD相同或相近的两条蛋白带。草鱼、鲫鱼、鳜鱼、狗鱼、黄颡鱼和江豚的黏液蛋白,除了都含有分子量大小约为45 kD的蛋白条带外,其他无显著相似性。对同种水生脊椎动物的血清与黏液蛋白比较,虽然黄颡鱼的血清与黏液中分子量相近的蛋白带最多,也仅约为38%,可见其蛋白带的种类和含量都存在显著差异

水生动物病毒的电镜和荧光显微镜观察

应用透射电镜和荧光显微镜对三种水生动物病毒粒子形态、病毒感染细胞的超微结构变化及亚细胞定位进行比较和研究。负染电镜观察显示:鳜鱼弹状病毒(SCRV)粒子呈典型的子弹状形态,长约76～118 nm,直径约29～52 nm;鲈鱼呼肠孤病毒(LJRV)粒子呈正二十面体结构,具有双层衣壳,直径约70～80 nm;蛙虹彩病毒(RGV)粒子呈正二十面体结构,具有囊膜,直径大小约150 nm。超薄切片观察表明,宿主细胞的基本结构遭到不同程度的破坏,成熟病毒粒子分布在胞质中或以出芽的方式释放到胞外,且RGV增殖后在胞质中聚集形成晶格状结构。免疫荧光观察进一步显示,RGV感染细胞后能产生多个直径大小不一的包涵体。本研究结果有助于了解和认识水生动物病毒的超微形态特征、复制过程及致病机理

Improved Method for Fuzzy C-Means Clustering Algorithm

由于传统的模糊C均值(fuzzy C-MEAnS,fCM)算法没有考虑像素点的空间邻域信息,仅涉及像素的单点灰度,在处理含有噪声的图像时有很大的局限性,因此分割效果较差。针对fCM的缺陷,提出一种新的改进算法,该算法引入gIbbS随机场,将gIbbS随机场先验概率与像素点隶属度的乘积作为新的像素隶属度。实验表明,改进后的算法有良好的分割效果,既可以较为完整地保留图像边界细节,又能较好地去除图像的噪声。The traditional fuzzy C-means (FCM) algorithm has great limitations in dealing with the noisy images owing to not considering the spatial information of the pixels and only involving the pixel gray of a single point,so it's poor in segmenting an image.For the defects of the FCM algorithm,a new improved algorithm is proposed in this article,in which a product of Gibbs priori probability and the membership is regarded as the new pixel membership.Experimental results show that the improved algorithm has a good segmentation result;it can retain more complete edge details of image and can remove the image noise more effectively.南京军区重点项目(项目编号:11Z023); 福建省自然科学基金项目(项目编号:2008J0312

Fast local binary fitting optimization approach for image segmentation

针对灰度不均匀图像难以正确分割和分割结果依赖于初始轮廓的问题,提出一种快速稳定的分割算法,首先通过自适应距离保持水平集演化(AdPlS)算法进行初始分割以获取较好的初始轮廓,然后采用局部二值拟合(lbf)模型进行快速分割。实验表明,改进后的模型有良好的分割效果,较好地解决了分割速度、精度及稳定性之间的矛盾。It is difficult to get the correct segmentation results for the intensity inhomogeneity images,and the segmentation results are very sensitive to the initial contours.Thus,a fast and stable approach was proposed to overcome these disadvantages.First,an Adaptive Distance Preserving Level Set(ADPLS) method was utilized to get a better initial contour.Second,the Local Binary Fitting(LBF) model was used for a further segmentation.The experimental results show that the improved model can achieve good performance and is better to solve the contradiction among the segmentation speed,accuracy and stability.南京军区重点项目(11Z023); 福建省自然科学基金资助项目(2008J0312

Improvement of Segmentation Correction Model Based on Local Features

基于局部特性的分割校正模型能够在图像分割的同时实现对非均匀场的校正,从而对灰度不均匀图像有较好的分割效果,然而,该模型具有局部特性,且采用多相分割,使得活动轮廓曲线对初始位置较为敏感,且分割速度较慢。针对该不足,通过引入自适应距离保持水平集算法,采用分割校正模型与自适应距离保持水平集相结合的方法,提出一种新的快速分割算法。实验结果表明,该算法可摆脱初始轮廓的限制,避免在分割灰度不均匀图像时边缘泄漏和分割不足现象,并且具有分割快速的特点。Segmentation correction model based on local features can implement the correction of intensity inhomogeneity images,for which has better segmentation effect,but with the local features of the proposed model,and using multiphase segmentation,so that it is sensitive to the initial position of the active contour curve and the segmentation is slow.Aiming at the shortage,a new fast segmentation algorithm is proposed by introducing Adaptive Distance Preserving Level Set(ADPLS) algorithm,combining the segmentation correction model and adaptive distance preserving level set method.Experimental results show that the improved algorithm not only gets rid of the influence of the initial contour,but also avoids the edge leakage and segmentation shortage phenomenon,maintains the fast segmentation.福建省自然科学基金资助项目(2008J0312

城市浅水湖泊——武汉东湖中浮游病毒的研究

位于武汉市东北郊的东湖,为长江中下游一个淡水生态的模式湖泊,也是集饮用、游泳、水上运动、钓鱼、养殖、农灌、以及调节、净化生态环境等功能于一体具代表性的城市浅水型湖泊。为了进一步了解与市区人群健康和生存环境密切相关的水环境问题,我们开展了对水生态系统中的病毒——东湖浮游病毒的研究

淡水生态系统中几种大DNA病毒研究概述

淡水生态系统中的大DNA病毒指存在于淡水系统中、基因组大小接近或超过100 kb的DNA病毒,它们通常是感染鱼类、虾类及藻类等水生生物以及两栖类的病原体,影响水产养殖动物的健康及淡水生态平衡。文章以虹彩病毒科(Iridoviridae)的沼泽绿牛蛙病毒(Rana grylio virus, RGV)和大鲵蛙病毒(Andrias davidianus ranavirus, ADRV)、鱼蛙疱疹病毒科(Alloherpesviridae)的鲫疱疹病毒(Crucian carp herpesvirus, CaHV)、线头病毒科(Nimaviridae)的克氏原螯虾病毒(Procambarus clarkii nimavirus, PCV)及肌尾病毒科(Myoviridae)的铜绿微囊藻肌尾噬藻体-滇池株(Microcystis aeruginosa myovirus isolated from Lake Dianchi, MaMV-DC)为主线,对淡水生态系统中几种大DNA病毒代表株的研究现状与文献进行概述,并提出和讨论淡水水生大DNA病毒研究及水生病毒学科发展愿景,以期为相关科研人员提供参考

噬藻体感染相关基因的研究进展

噬藻体是感染蓝细菌(蓝藻)的病毒,能调控蓝细菌种群的丰度和多样性,在许多水生生态系统的食物网动态变化和生物地球化学循环中起关键作用。噬藻体与宿主细胞发生各种相互作用,包括吸附、入侵和复制,参与感染过程,从而完成噬藻体的生命周期。本文在综述噬藻体生命周期与基因组结构相互关联的基础上,重点介绍噬藻体与宿主蓝细菌相互作用的蛋白,如噬藻体吸附蛋白、内肽酶、穿孔素、DNA聚合酶、藻胆体降解蛋白A(NblA)、毒力因子、抗CRISPR蛋白(Acr)和小分子热休克蛋白等,分析它们的分子特性,阐述它们在噬藻体感染蓝细菌以及噬藻体-蓝细菌相互作用的分子机制。为了更好地认识驱动不同噬藻体与宿主及水生环境相互作用的策略、感染效率及生态学影响,本文不仅对这些与噬藻体感染相关的重要基因研究动态进行综述与讨论,还在了解噬藻体丰富的多样性和复杂性的基础上,提出应用新技术对噬藻体感染相关基因的功能进行广泛研究,以期扩展全球水生病毒数据库,进一步认识噬藻体与宿主的相互作用机理