5,759 research outputs found

    Perspectives on the Zika outbreak: herd immunity, antibody-dependent enhancement and vaccine

    Get PDF
    Submitted by Adagilson Silva ([email protected]) on 2017-05-05T18:22:21Z No. of bitstreams: 1 zika17abr25.pdf: 150751 bytes, checksum: 7c2ffa760d310a51900bc0b7bc387677 (MD5)Approved for entry into archive by Adagilson Silva ([email protected]) on 2017-05-05T18:26:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 zika17abr25.pdf: 150751 bytes, checksum: 7c2ffa760d310a51900bc0b7bc387677 (MD5)Made available in DSpace on 2017-05-05T18:26:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 zika17abr25.pdf: 150751 bytes, checksum: 7c2ffa760d310a51900bc0b7bc387677 (MD5) Previous issue date: 2017Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia e Terapia Experimental. Recife, PE, Brazil.Universidade Federal de Pernambuco. Laboratório de Imunopatologia Keizo Asami. Setor de Virologia. Recife, PE, Brazil.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia e Terapia Experimental. Recife, PE, Brazil.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia e Terapia Experimental. Recife, PE, Brazil.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia e Terapia Experimental. Recife, PE, Brazil

    Bovine Dendritic Cell Activation, T Cell Proliferation and Antibody Responses to Foot-And-Mouth Disease, Is Similar With Inactivated Virus and Virus Like Particles

    Get PDF
    Foot-and-mouth disease (FMD) is a highly contagious disease of cloven-hoofed animals that causes severe economic losses in the livestock industry. Currently available vaccines are based on the inactivated FMD virus (FMDV). Although inactivated vaccines have been effective in controlling the disease, they have some disadvantages. Because of these disadvantages, investigations are being made to produce vaccines in low containment facilities. The use of recombinant empty capsids (also referred as Virus Like Particles, VLPs) has been reported to be a promising candidate as a subunit vaccine because it avoids the use of virus in the vaccine production and conserves the conformational epitopes of the virus. Mignaqui and collaborators have produced recombinant FMDV empty capsids from serotype A/ARG/2001 using a scalable technology in mammalian cells that elicited a protective immunity against viral challenge in a mouse model. However, further evaluation of the immune response elicited by these VLPs in cattle is required. In the present work we compare the effect that VLPs or inactivated FMDV has on bovine dendritic cells and the humoral response elicited in cattle after a single vaccination.Fil: Quattrocchi, Valeria. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Bidart, Juan Esteban. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Mignaqui, Ana Clara. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche; ArgentinaFil: Ruiz, Vanesa. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Ferella, Alejandra. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Langellotti, Cecilia Ana. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Gammella, Mariela Vanesa. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Ferraris, Sergio Raúl. Universidad Maimónides; ArgentinaFil: Carrillo, Jorge. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Agroindustria; ArgentinaFil: Wigdorovitz, Andrés. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Durocher, Yves. National Research Council; CanadáFil: Cardillo, Sabrina Beatriz. Biogenesis Bago S.a..; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Charleston, Bryan. The Pirbright Institute; Reino UnidoFil: Zamorano, Patricia Ines. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; Argentin

    MOLECULAR EPIDEMIOLOGY OF A MEASLES VIRUS IN SAO PAULO, BRAZIL: AN IMPORTED CASE

    Get PDF
    Made available in DSpace on 2015-10-02T12:45:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1914 bytes, checksum: 7d48279ffeed55da8dfe2f8e81f3b81f (MD5) marilda_siqueira_etal_IOC_2013.pdf: 124463 bytes, checksum: adaa9d6892ca08363d203a2f07d20c4f (MD5) Previous issue date: 2013Instituto Adolfo Lutz. Centro de Virologia. São Paulo, SP, BrasilInstituto Adolfo Lutz. Centro de Virologia. São Paulo, SP, BrasilInstituto Adolfo Lutz. Centro de Virologia. São Paulo, SP, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Centro de Vigilância Epidemiológica do Estado de São Paulo,Instituto Adolfo Lutz. Centro de Virologia. São Paulo, SP, Brasi

    A New Cage-Like Particle Adjuvant Enhances Protection of Foot-and-Mouth Disease Vaccine

    Get PDF
    Foot-and-Mouth Disease (FMD) is an acute viral disease that causes important economy losses. Vaccines with new low-cost adjuvants that stimulate protective immune responses are needed and can be assayed in a mouse model to predict their effectiveness in cattle. Immunostimulant Particle Adjuvant (ISPA), also known as cage-like particle adjuvant, consisting of lipid boxes of dipalmitoyl-phosphatidylcholine, cholesterol, sterylamine, alpha-tocopherol, and QuilA saponin, was shown to enhance protection of a recombinant vaccine against Trypanosoma cruzi in a mouse model. Thus, in the present work, we studied the effects on the magnitude and type of immunity elicited in mice and cattle in response to a vaccine based on inactivated FMD virus (iFMDV) formulated with ISPA. It was demonstrated that iFMDV–ISPA induced protection in mice against challenge and elicited a specific antibody response in sera, characterized by a balanced Th1/Th2 profile. In cattle, the antibody titers reached corresponded to an expected percentage of protection (EPP) higher than 80%. EPP calculates the probability that livestock would be protected against a 10,000 bovine infectious doses challenge after vaccination. Moreover, in comparison with the non-adjuvanted iFMDV vaccine, iFMDV–ISPA elicited an increased specific T-cell response against the virus, including higher interferon gamma (IFNγ)+/CD8+ lymphocyte production in cattle. In this work, we report for first time that an inactivated FMDV serotype A vaccine adjuvanted with ISPA is capable of inducing protection against challenge in a murine model and of improving the specific immune responses against the virus in cattle.Fil: Bidart, Juan Esteban. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Kornuta, Claudia Alejandra. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Gammella, Mariela Vanesa. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Gnazzo, Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Puerto Iguazú | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Puerto Iguazú; ArgentinaFil: Soria, Ivana. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Langellotti, Cecilia Ana. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Mongini, Claudia. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Galarza, Roxana. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estacion Experimental Agropecuaria Cuenca del Salado. Agencia de Extension Rural Chascomus.; ArgentinaFil: Calvinho, Luis Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Santa Fe. Estación Experimental Agropecuaria Rafaela; ArgentinaFil: Lupi, Giuliana Antonella. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional del Litoral; ArgentinaFil: Quattrocchi, Valeria. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Marcipar, Iván Sergio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional del Litoral; ArgentinaFil: Zamorano, Patricia Ines. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; Argentin

    Representing and coding the knowledge embedded in texts of Health Science Web published articles

    Get PDF
    Despite the fact that electronic publishing is a common activity to scholars electronic journals are still based in the print model and do not take full advantage of the facilities offered by the Semantic Web environment. This is a report of the results of a research project with the aim of investigating the possibilities of electronic publishing journal articles both as text for human reading and in machine readable format recording the new knowledge contained in the article. This knowledge is identified with the scientific methodology elements such as problem, methodology, hypothesis, results, and conclusions. A model integrating all those elements is proposed which makes explicit and records the knowledge embedded in the text of scientific articles as an ontology. Knowledge thus represented enables its processing by intelligent software agents The proposed model aims to take advantage of these facilities enabling semantic retrieval and validation of the knowledge contained in articles. To validate and enhance the model a set of electronic journal articles were analyzed

    Development and validation of a bovine parainfluenza virus type 3 indirect ELISA

    Get PDF
    Serological assays, including enzyme-linked immunosorbent assays (ELISA), provide an usefultool for screening animals for the presence of antibodies (Abs) against a wide range of infectious agents (including viruses that cause respiratory disease in cattle) and are mainly used in veterinary medicine to assist to the control and disease?s monitoring. The aim of the present study was developing and validating one indirect enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) based on semi purified bovine parainfluenza virus type 3 (BPIV3).This test would allow to detect and quantify Abs against PI3 in serum sample from cattle and guinea pigs on both purposes diagnostic and typify/specify the quality of vaccines. The diagnostic sensitivity and specificity from the assay was 88% and 100% for bovine samples, using a threshold of corrected optical density, ODc =0.300, and 91% and 100% for guinea pig samples with a ODc =0.250.The intermediate precision expressed as the assays positive control coefficient of variation (CV) was 20% for bovines and 8.5% for guinea pigs. Both techniques reproducibility obtained in interlaboratory assays was CV=17% for bovines and 15% for guinea pigs, which found the requirements of OIE (CV<30%). The efficacy of biological medicinal products, such as vaccines, relies an optimal model testing quality control. The validated ELISAs represents an important tool for testing vaccine quality, and quantifying and controling BPIV3 infections on cattle.Fil: Maidana, Silvina Soledad. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; Argentina. Universidad de Morón. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales; ArgentinaFil: Odeon, Maria Mercedes. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche; ArgentinaFil: Ferreccio, Carola Maria. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Grazziotto, Noelia Magalí. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; ArgentinaFil: Alvarez, Irene. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Rocha, Lucia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; ArgentinaFil: Parreño, Gladys Viviana. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; ArgentinaFil: Romera, Sonia. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; Argentina. Universidad de Morón. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales; Argentina. Universidad del Salvador; Argentin

    Hantavirus Pulmonary Syndrome in Tucumán province associated to an unexpected viral genotype

    Get PDF
    We describe the characterization of the viral genotype involved in the first case of hantavirus pul-monary syndrome reported in Tucumán, a Northwestern province of Argentina. A 23-year-old woman, with no record of travel history and previously diagnosed with an antiphospholipid syndrome, died after 11 days of severe cardiopulmonary insufficiency. Among the four endemic regions of hantavirus pulmonary syndrome in Argentina, the Northwest Region has the highest incidence, exceeding 50% of all reported cases in the country. Until now, only Salta and Jujuy (2 out of the 6 provinces composing the Northwest Region), reported cases of hantavirus pulmonary syndrome, all of which occurred in the Yungas Forest area. Remarkably, the viral genotype characterized in this case showed higher nucleotide identity with the Andes-BsAs genotype most prevalent in Buenos Aires province, located 1400 km apart from Tucumán, than with any of the commonly found genotypes in the Northwest Region. The Andes-BsAs genotype has been associated with 30% lethality and interhuman transmission in Buenos Aires province. Interhuman transmission cannot be ruled out in the present case.Fil: Ciancaglini, Matías. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Adm.nacional de Laboratorio E Instituto de Salud "dr.c.g.malbran". Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virologia; ArgentinaFil: Bellomo, Carla María. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Adm.nacional de Laboratorio E Instituto de Salud "dr.c.g.malbran". Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virologia; ArgentinaFil: Torres Cabrero Clara. Hospital Italiano; ArgentinaFil: Alonso Daniel. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Adm.nacional de Laboratorio E Instituto de Salud "dr.c.g.malbran". Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virologia; ArgentinaFil: Bassi, Sabrina Cecilia. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Adm.nacional de Laboratorio E Instituto de Salud "dr.c.g.malbran". Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virologia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Iglesias, Ayelén Aluminé. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Adm.nacional de Laboratorio E Instituto de Salud "dr.c.g.malbran". Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virologia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Martinez, Valeria Paula. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Adm.nacional de Laboratorio E Instituto de Salud "dr.c.g.malbran". Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virologia; Argentin

    Neutralizing antibodies for venezuelan equine encephalitis virus in horses from brazilian Pantanal.

    Get PDF
    The Brazilian Pantanal hosts large concentrations of diverse wildlife species, including migratory birds, and therefore this region is potentially important for arbovirus studies in South America. Neutralizing antibodies for equine encephalitis viruses, including Eastern equine encephalitis virus (EEEV) and Western equine encephalitis virus (WEEV) have been reported in Pantanal equines.Trabalho apresentado no XXIV Congresso Brasileiro de Virologia & VIII Reunião do Mercosul de Virologia, Porto Seguro, BA. VV561

    Bioinformática e aplicações em virologia

    Get PDF
    Projeto de Pós-Graduação/Dissertação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Mestre em Ciências FarmacêuticasNa década de 1940 foi inventado o primeiro computador. A informação construía-se ligando e desligando o sistema binário. Na década de 50, a descoberta da dupla hélice no ADNveio provar que a informação genética também é escrita ligando e desligando, não um sistema binário como o computador digital, mas quaternário. Mas, só foi nos anos 90 que a informática e a biologia juntaram-se, inicialmente para decifrar a estrutura do ADN. A virologia é uma das áreas de relevância na bioinformática pelo facto dos vírus serem uma das estruturas mais elementares da vida e ao mesmo tempo, complexas. Com o intuito de facilitar o estudo e a compreensão da diversidade de vírus, foram desenvolvidas muitas classificações mas, na actualidade utiliza-se sobretudo a taxonomia do ICTV e, a combinação entre a classificação de Baltimore e LHT. O estudo dos vírus tem permitido conhecer a forma como estes utilizam os recursos energéticos das células hospedeiros e, no esclarecimento de muitos dos mecanismos biológicos dos próprios hospedeiros. Isto tem sido possível pelos desenvolvimentos tecnológicos e científicos muito significativos nas áreas da biologia molecular e da genética, nomeadamente, nas estruturas do ADN, ARN, do genoma e da sua sequenciação. A sequenciação é uma série de processos bioquímicos para a determinação da ordem dos nucleótidos. Com o avanço da tecnologia, o número de genomas sequenciados e as bases de dados necessárias para o seu estudotem vindo a aumentar rapidamente, resultando no desenvolvimento exponencial da bioinformática e promovendo a criação de centros de armazenamento e processamento de dados. A análise bioinformática nos vírus compreende tarefas relacionadas com a análise de sequências novas, incluindo identificação, anotação funcional e análise das relações filogenéticas e, para o seu estudo, existem uma grande diversidade e complexidade de ferramentas que são agrupadas em: identificação ORF e previsão de genes; procura de homogeneidade e alinhamento de sequências; reconhecimento de padrões de epítopos; análise de repetições em tandem curto; domínio transmembranar; estudos estruturais secundários e terciários; análise das vias metabólicas; e analise de dados de microarrays. Os novos desenvolvimentos, sejam bases de dados e/ou ferramentas, estão a crescer em função do aumento da procura. No entanto, ainda existem limitações, conforme foi possível validar ao longo da leitura científica sobre este tema. O objetivo deste trabalho foi levar a cabo a identificaçãodas aplicações desenvolvidas dentro da bioinformática para conhecer melhor os vírus.Espera-se que esta visão resumida, - mas muito complexadesde o olhar do farmacêutico- tenha conseguido revelar a importância e utilidade dos recursos bioinformáticos disponíveis para a investigação em virologia. The first computer was invented in the 40s. The information was built connecting and disconnecting a binary system. In the 50s, the discovery of the double helix of the DNA proved that the genetic information was also written connecting and disconnecting but a quaternary system. However, only in the 90s the informatics and the biology joined motivated for the need of decipheringthe structure of DNA. The Virology is one of the most relevant areas of study of bioinformatics because even the viruses are the most elementary alive structures, at the same time they are complex. Because of the diversity of virus, several classifications were developed, but currently, the ICTV taxonomy, the Baltimore classification and LHT are being used. The bioinformatics provide tools to understand how viruses profit the energy of the host cells and the biological mechanisms of these hosts, mainly through the technological and scientific developments of molecular biology and genetics, specifically the structures of DNA and RNA, genome and sequencing. The sequencing is a series of biochemical processes to determine the order of nucleoids. The sequenced genomes and the virus data bases are rapidly increasing. As consequence, the bioinformatics shows exponential advances and the store centers and data processing are in the increasing. Main bioinformatics tasks for virus comprehension are: identification, functional annotation and analysis of phylogenetic relations. It is possible because of the development of tools grouped for: open reading frame identification and gene prediction; homology searching and sequence alignment; patter/motif/epitope recognition; short tandem repeats; transmembrane domains; secondary and tertiary structural studies; pathway analysis; and microarray data analysis. The data bases and the tools are increasing as response to the growing demand. However, there are still problems to be solved, as verified in the scientific literature. The objective of this study was the identification of the bioinformatics applications for the study of viruses. This summarized review – even highly complex from the look of the pharmaceutic - was intended to reveal the usefulness of bioinformatics resources available for virology research
    corecore