Primera evidencia de infección por el virus de la coriomeningitis linfocítica (arenavirus) en roedores Mus musculus capturados en la zona urbana del municipio de Sincelejo, Sucre, Colombia

Introduction: The lymphocytic choriomeningitis virus is an Old World arenavirus that infects Mus musculus, and can cause congenital hydrocephalus, chorioretinitis and multisystemic failure in transplant human recipients. Although the disease has not been clinically diagnosed in Colombia yet, there have been reports of infection with the Pichindé virus in rodents from Cauca and Valle del Cauca departments, and with the Guanarito virus in rodents from Córdoba department.Objective: To identify the lymphocytic choriomeningitis virus from Mus musculus captured in the municipality of Sincelejo.Materials and methods: We evaluated 80 samples of plasma by ELISA using antigen from lymphocytic choriomeningitis virus. Additionally, a nested RT-PCR was performed to seropositive and seronegative samples for the S-segment.Results: We found a 10% seroprevalence (8/80) and the viral genome was detected in 16 brain samples; the alignment (BLAST) and the phylogenetic analysis (MrBayes, version 3.2.2) confirmed the presence of the lymphocytic choriomeningitis virus.Conclusion: The results indicated that human infection with the lymphocytic choriomeningitis virus in humans could occur in the urban area of Sincelejo, although no cases have been reported so far.Introducción. El virus de la coriomeningitis linfocítica es un arenavirus del Viejo Mundo que se hospeda en el ratón casero (Mus musculus), y puede causar infecciones congénitas, hidrocefalia, coriorretinitis y falla orgánica múltiple en pacientes receptores de trasplantes. En Colombia aún no se ha reportado la enfermedad mediante diagnóstico clínico, pero en estudios serológicos se ha detectado la infección por el virus Pichindé en roedores en los departamentos del Cauca y Valle del Cauca, y por el virus Guanarito, en roedores en Córdoba.Objetivo. Detectar el virus de la coriomeningitis linfocítica en M. musculus en el municipio de Sincelejo. Materiales y métodos. Se evaluaron 80 muestras de plasma mediante la prueba ELISA usando antígeno del virus de la coriomeningitis linfocítica. Además, se empleó la reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR) anidada en muestras de animales seropositivos y seronegativos para la detección del segmento S.Resultados. Se encontró una seroprevalencia de 10% (8/80) y se detectó el genoma viral en 16 muestras de cerebro; el alineamiento (en la Basic Local Alignment Search Tool, BLAST) y el análisis filogenético (mediante el programa MrBayes, versión 3.2.2) confirmaron que correspondía al virus de la coriomeningitis linfocítica.Conclusión. Los resultados indicaron que la infección por el virus de la coriomeningitis linfocítica en humanos podría ocurrir en el área urbana de Sincelejo, aunque hasta la fecha no se hayan reportado casos

Infecciones por arenavirus

The infectious syndromes associated with arenaviruses in South America are four: febrile syndrome of viral origin; Haemorrhagic fevers with or without neurological involvement; Aseptic meningitis and meningo-encephalitis. Among the Arenavirus of the new world is the Tacaribe complex where the viruses are found: Junín (Argentina), Guanarito (Venezuela), Machupo (Bolivia) and Sabiá (Brazil), which are characterized by hemorrhagic fevers. In Colombia the arenavirus Pichindé was isolated in 1965, from the rodent Oryzomys albigularis, in the valley of Pichindé (Valle del Cauca). This arenavirus produces a persistent infection in its host and is not pathogenic for the man. There is evidence of the circulation of the Guanarito virus in rodents from Córdoba, but there are no cases diagnosed in humans; In Colombia, the genome of the lymphocytic choriomeningitis virus was detected in the brains of rodents Mus musculus. The diagnosis is based on the knowledge of local epidemiology and the suspicion of a patient with fever in endemic areas, where infections such as malaria, dengue and leptospirosis, sepsis of bacterial origin and rickectomy have been excluded. Virus isolation in the feverish period is the gold standart, but it implies contact with the virus that is highly infectious, which represents a public health problem. Serology has been used for diagnosis, but there is no commercial evidence and only research groups and large public health laboratories have these tests. Most of the patients present a moderate severity, which needs adequate hydration, antipyretics and anti-inflammatories. All patients with severe signs should be aggressively treated. The use of drugs has not demonstrated a decrease in mortality but a significant reduction in viremia.Los síndromes infecciosos asociados a arenavirus en América del sur son cuatro: síndrome febril de origen viral; fiebres hemorrágicas con o sin compromiso neurológico; meningitis asépticas y meningo-encefalitis. Entre los Arenavirus del nuevo mundo, está el complejo Tacaribe donde se encuentran los virus: Junín (Argentina), Guanarito (Venezuela), Machupo (Bolivia) y Sabiá (Brasil), que se caracterizan por causar fiebres hemorrágicas. En Colombia fue aislado el arenavirus Pichindé en 1965, del roedor Oryzomys albigularis, en el valle de Pichindé (Valle del Cauca). Este arenavirus produce una infección persistente en su hospedero y no es patógeno para el hombre. Hay evidencias de la circulación del virus Guanarito en roedores de Córdoba, pero no existen casos diagnosticados en humanos; en Sincelejo (Colombia) se detectó el genoma del virus coriomeningitis linfocítica en cerebros de roedores Mus musculus. El diagnóstico se basa en el conocimiento de la epidemiología local y la sospecha de un paciente con un cuadro febril en zonas endémicas, donde se han excluido infecciones como: malaria, dengue y leptospirosis, sepsis de origen bacteriano y rickectsiosis. El aislamiento viral en periodo febril es el gold standart, pero implica el contacto con el virus que es altamente infectante, lo que representa un problema de salud pública. Se ha usado la serología para el diagnóstico, pero no hay pruebas comerciales y sólo grupos de investigación y grandes laboratorios de salud pública poseen estas pruebas. La mayor parte de los pacientes presentan un cuadro de gravedad moderada, que necesita una adecuada hidratación, antipiréticos y antiinflamatorios. Todos los pacientes con signos de severos deben tener un manejo agresivo. El uso de medicamentos no ha demostrado una disminución de la mortalidad, pero si una reducción significativa de la viremia

Búsqueda de virus zoonóticos en roedores y murciélagos de algunas zonas del Caribe colombiano

Las zoonosis son enfermedades infecciosas transmisibles desde animales vertebrados al ser humano bajo condiciones naturales y representan un problema de salud pública. La etiología de las zoonosis incluye bacterias, virus, hongos, parásitos y priones. Dentro de las zoonosis virales se encuentran alrededor de 23 familias de virus RNA de cadena sencilla que, algunas de ellas causan las fiebres hemorrágicas. Estas zoonosis suelen ser mortales y han sido motivo de estudios eco-epidemiológicos en busca de animales reservorios y el nicho ecológico de estas entidades. El objetivo de este estudio fue el de buscar Orthohantavirus, Mammarenavirus, Phlebovirus y Orthobunyavirus en tejidos de roedores y murciélagos procedentes de algunas áreas del Caribe colombiano. A través de PCR convencionales se llevó a cabo un análisis para detectar esos virus en tejidos de 283 murciélagos y 120 roedores capturados de algunas áreas del Caribe colombiano. A partir, de murciélagos no se logró detectar genoma viral, sin embargo, en tejidos de roedores, uno de pulmón y otro de riñón capturados en Urumita y Villanueva (Guajira) respectivamente, se detectó un amplicón de 264 pb que correspondió al gen S de Orthohantavirus. Las dos muestras fueron secuenciadas por secuenciación de nueva generación (NGS), con el fin de identificar a que secuencias del género Orthohantavirus estaban relacionadas. No obstante, las secuencias no correspondieron a Orthohantavirus. La vigilancia epidemiológica de virus zoonóticos en murciélagos y roedores es importante por su posible capacidad de cruzar a otras especies de animales silvestres y de ahí a los humanos.Zoonoses are infectious diseases that can be transmitted from vertebrate animals to humans under natural conditions and represent a public health problem. The etiology of zoonoses includes bacteria, viruses, fungi, parasites, and prions. Within the viral zoonoses there are about 23 families of single-stranded RNA viruses, some of which cause hemorrhagic fevers. These zoonoses are usually fatal and have been the subject of eco-epidemiological studies in search of reservoir animals and the ecological niche of these entities. The objective of this study was to search for Orthohantavirus, Mammarenavirus, Phlebovirus and Orthobunyavirus in tissues of rodents and bats from some areas of the Colombian Caribbean. Through conventional PCR, an analysis was carried out to detect these viruses in tissues of 283 bats and 120 rodents captured from some areas of the Colombian Caribbean. From bats, it was not possible to detect the viral genome, however, in rodent tissues, one from the lung and the other from the kidney captured in Urumita and Villanueva (Guajira) respectively, a 264 bp amplicon was detected that corresponded to the S gene of Orthohantavirus. The two samples were sequenced by next generation sequencing (NGS), in order to identify which sequences of the genus Orthohantavirus were related. However, the sequences did not correspond to Orthohantavirus. Epidemiological surveillance of zoonotic viruses in bats and rodents is important because of their potential ability to cross over to other species of wild animals and from there to humans.Línea de Investigación: Enfermedades emergentes y reemergentesMaestrí