63 research outputs found
Comprehensive analysis of high-performance computing methods for filtered back-projection
This paper provides an extensive runtime, accuracy, and noise analysis of Computed To-mography (CT) reconstruction algorithms using various High-Performance Computing (HPC) frameworks such as: "conventional" multi-core, multi threaded CPUs, Compute Unified Device Architecture (CUDA), and DirectX or OpenGL graphics pipeline programming. The proposed algorithms exploit various built-in hardwired features of GPUs such as rasterization and texture filtering. We compare implementations of the Filtered Back-Projection (FBP) algorithm with fan-beam geometry for all frameworks. The accuracy of the reconstruction is validated using an ACR-accredited phantom, with the raw attenuation data acquired by a clinical CT scanner. Our analysis shows that a single GPU can run a FBP reconstruction 23 time faster than a 64-core multi-threaded CPU machine for an image of 1024 X 1024. Moreover, directly programming the graphics pipeline using DirectX or OpenGL can further increases the performance compared to a CUDA implementation
Jahresbericht 2006 zur kooperativen DV-Versorgung
:VORWORT 9
ĂBERSICHT DER INSERENTEN 12
TEIL I
ZUR ARBEIT DER DV-KOMMISSION 15
MITGLIEDER DER DV-KOMMISSION 15
ZUR ARBEIT DES LENKUNGSAUSSCHUSSES FĂR DAS ZIH 17
TEIL II
1 DAS ZENTRUM FĂR INFORMATIONSDIENSTE UND
HOCHLEISTUNGSRECHNEN (ZIH) 21
1.1 AUFGABEN 21
1.2 ZAHLEN UND FAKTEN (REPRĂSENTATIVE AUSWAHL) 21
1.3 HAUSHALT 22
1.4 STRUKTUR / PERSONAL 23
1.5 STANDORT 24
1.6 GREMIENARBEIT 25
2 KOMMUNIKATIONSINFRASTRUKTUR 27
2.1 NUTZUNGSĂBERSICHT NETZDIENSTE 27
2.1.1 WiN-IP-Verkehr 27
2.2 NETZWERKINFRASTRUKTUR 27
2.2.1 Allgemeine Versorgungsstruktur 27
2.2.2 Netzebenen 27
2.2.3 Backbone und lokale Vernetzung 28
2.2.4 Druck-Kopierer-Netz 32
2.2.5 Funk-LAN (WLAN) 32
2.2.6 Datennetz zwischen den UniversitĂ€tsstandorten und AuĂenanbindung 33
2.2.7 Datennetz zu den Wohnheimstandorten 36
2.3 KOMMUNIKATIONS- UND INFORMATIONSDIENSTE 38
2.3.1 Electronic-Mail 38
2.3.1.1 EinfĂŒhrung einheitlicher E-Mail-Adressen an der TU Dresden 39
2.3.1.2 EinfĂŒhrung funktionsbezogener TU-Mail-Adressen 40
2.3.1.3 ZIH verwaltete Nutzer-Mailboxen 40
2.3.1.4 Web-Mail 41
2.3.2 WWW 41
2.3.3 WÀhlzugÀnge 43
2.2.4 Time-Service 43
3 ZENTRALE DIENSTANGEBOTE UND SERVER 45
3.1 BENUTZERBERATUNG (BB) 45
3.2 TROUBLE TICKET SYSTEM (TTS) 45
3.3 NUTZERMANAGEMENT 46
3.4 LOGIN-SERVICE 47
3.5 STORAGE-MANAGEMENT 47
3.5.1 Backup-Service 50
3.5.2 File-Service 52
3.6 LIZENZ-SERVICE 54
3.7 PERIPHERIE-SERVICES 54
3.8 PC-POOLS 55
3.9 SECURITY 56
4 SERVICELEISTUNGEN FĂR DEZENTRALE DV-SYSTEME 59
4.1 ALLGEMEINES 59
4.2 PC-SUPPORT 59
4.2.1 Investberatung 59
4.2.2 Implementierung 59
4.2.3 Instandhaltung 59
4.2.4 Notebook-Ausleihe 60
4.3 MICROSOFT WINDOWS-SUPPORT 60
4.4 ZENTRALE SOFTWARE-BESCHAFFUNG FĂR DIE TU DRESDEN 66
4.4.1 ArbeitsgruppentÀtigkeit 66
4.4.2 Strategie des Software-Einsatzes an der TU Dresden 67
4.4.3 Software-Beschaffung 67
5 HOCHLEISTUNGSRECHNEN 75
5.1 HOCHLEISTUNGSRECHNER/SPEICHERKOMPLEX (HRSK) 75
5.1.1 HRSK-Neubau 76
5.1.2 SGI Altix 3700 (Stufe 1a) 76
5.1.3 SGI Altix 4700 77
5.1.4 Linux Networx PC-Farm (Stufe 1a) 78
5.1.5 Linux Networx PC-Farm 79
5.2 NUTZUNGSĂBERSICHT DER COMPUTE-SERVER 80
5.2.1 SGI Origin 3800 82
5.2.2 NEC SX6i 82
5.2.3 SGI Origin 2800 83
5.2.4 Anwender-Cluster 84
5.3 BIODATENBANKEN-SERVICE 84
5.4 ANWENDUNGSSOFTWARE 85
5.5 VISUALISIERUNG 85
5.6 PERFORMANCE TOOLS 86
6 WISSENSCHAFTLICHE KOOPERATION, PROJEKTE 89
6.1. DAS PROJEKT âKOMPETENZZENTRUM FĂR VIDEOKONFERENZDIENSTEâ 89
6.1.1 Ăberblick 89
6.1.2 Aufgaben und Entwicklungsarbeiten 89
6.1.3 Neuer Webauftritt 91
6.1.4 Weitere AktivitÀten 91
6.1.5 Der Dienst âDFNVideoConferenceâ - Mehrpunktkonferenzen im G-WiN 92
6.1.6 Tendenzen und Ausblicke 93
6.2 D-GRID 93
6.2.1 Hochenergiephysik Community Grid (HEP CG) - Entwicklung von Anwendungen und Komponenten zur Datenauswertung in der Hochenergiephysik in einer nationalen e-Science-Umgebung 93
6.2.2 MediGRID - Ressourcefusion fĂŒr Medizin und Lebenswissenschaften 94
6.2.3 D-Grid Integrationsprojekt 94
6.2.4 Chemomentum 95
6.3 BIOLOGIE 95
6.3.1 BISON (Biologie-inspirierte Techniken zur Selbstorganisation in dynamischen Netzwerken) 95
6.3.2 VerstÀndnis der molekularen Grundlage der Biogenese und Funktion der Endocytose 96
6.3.3 Mathematische Modellierung und Computersimulation des Tumorwachstums und Therapien 96
6.3.4 Entwicklung eines SME-freundlichen Zuchtprogramms fĂŒr Korallen 97
6.3.5 Analyse raum-zeitlicher Musterbildung von Mikroorganismen 97
6.3.6 Regeneration beim Axolotl 97
6.3.7 Entwicklung und Analyse von stochastischen Interagierenden Vielteilchen-Modellen fĂŒr biologische Zellinteraktion 98
6.3.8 Kompetenznetzwerk MTBio 98
6.4 PERFORMANCE EVALUIERUNG 98
6.4.1 Automatisches Auffinden von Performance-EngpÀssen in parallelen 98
Programmen unter Zuhilfenahme ihrer Tracedaten
6.4.2 SFB 609: Elektromagnetische Strömungsbeeinflussung in Metallurgie, KristallzĂŒchtung und Elektrochemie - Teilprojekt A1: Numerische Modellierung turbulenter MFD-Strömungen 99
6.5 HERSTELLERKOOPERATIONEN 100
6.5.1 Intel-Kooperation 100
6.5.2 NEC-Kooperation 100
7 AUSBILDUNGSBETRIEB UND PRAKTIKA 101
7.1 AUSBILDUNG ZUM FACHINFORMATIKER/FACHRICHTUNG ANWENDUNGSENTWICKLUNG 101
7.2 PRAKTIKA 101
8 AUS- UND WEITERBILDUNGSVERANSTALTUNGEN 103
9 VERANSTALTUNGEN 105
10 PUBLIKATIONEN 107
TEIL III
BERICHTE DER ZENTRALEN EINRICHTUNGEN UND DER ZENTRALEN UNIVERSITĂTSVERWALTUNG
AUDIO-VISUELLES MEDIENZENTRUM (AVMZ) 113
LEHRZENTRUM SPRACHEN UND KULTURRĂUME (LSK) 121
UNIVERSITĂTSARCHIV 125
ZENTRALE UNIVERSITĂTSVERWALTUNG 127
MDC 129
BIOTECHNOLOGISCHES ZENTRUM (BIOTEC) 131
TEIL IV
BERICHT DER SĂCHSISCHEN LANDESBIBLIOTHEK - STAATS UND UNIVERSITĂTSBIBLIOTHEK DRESDEN 13
Boosting XML Filtering with a Scalable FPGA-based Architecture
The growing amount of XML encoded data exchanged over the Internet increases
the importance of XML based publish-subscribe (pub-sub) and content based
routing systems. The input in such systems typically consists of a stream of
XML documents and a set of user subscriptions expressed as XML queries. The
pub-sub system then filters the published documents and passes them to the
subscribers. Pub-sub systems are characterized by very high input ratios,
therefore the processing time is critical. In this paper we propose a "pure
hardware" based solution, which utilizes XPath query blocks on FPGA to solve
the filtering problem. By utilizing the high throughput that an FPGA provides
for parallel processing, our approach achieves drastically better throughput
than the existing software or mixed (hardware/software) architectures. The
XPath queries (subscriptions) are translated to regular expressions which are
then mapped to FPGA devices. By introducing stacks within the FPGA we are able
to express and process a wide range of path queries very efficiently, on a
scalable environment. Moreover, the fact that the parser and the filter
processing are performed on the same FPGA chip, eliminates expensive
communication costs (that a multi-core system would need) thus enabling very
fast and efficient pipelining. Our experimental evaluation reveals more than
one order of magnitude improvement compared to traditional pub/sub systems.Comment: CIDR 200
Jahresbericht 2008 zur kooperativen DV-Versorgung
:VORWORT 9
ĂBERSICHT DER INSERENTEN 10
TEIL I
ZUR ARBEIT DER DV KOMMISSION 15
MITGLIEDER DER DV KOMMISSION 15
ZUR ARBEIT DES LENKUNGSAUSSCHUSSES FĂR DAS ZIH 17
ZUR ARBEIT DES WISSENSCHAFTLICHEN BEIRATES DES ZIH 18
TEIL II
1 DAS ZENTRUM FĂR INFORMATIONSDIENSTE UND HOCHLEISTUNGSRECHNEN (ZIH) 21
1.1 AUFGABEN 21
1.2 ZAHLEN UND FAKTEN (REPRĂSENTATIVE AUSWAHL) 21
1.3 HAUSHALT 22
1.4 STRUKTUR / PERSONAL 23
1.5 STANDORT 24
1.6 GREMIENARBEIT 25
2 KOMMUNIKATIONSINFRASTRUKTUR 27
2.1 NUTZUNGSĂBERSICHT NETZDIENSTE 27
2.1.1 WiN IP Verkehr 27
2.2 NETZWERKINFRASTRUKTUR 27
2.2.1 Allgemeine Versorgungsstruktur 27
2.2.2 Netzebenen 27
2.2.3 Backbone und lokale Vernetzung 28
2.2.4 Druck Kopierer Netz 32
2.2.5 Funk LAN (WLAN) 32
2.2.6 Datennetz zwischen den UniversitĂ€tsstandorten und AuĂenanbindung 33
2.2.7 Datennetz zu den Wohnheimstandorten 38
2.3 KOMMUNIKATIONS UND INFORMATIONSDIENSTE 39
2.3.1 Electronic Mail 39
2.3.1.1 Einheitliche E-Mail-Adressen an der TU Dresden 42
2.3.1.2 Struktur- bzw. funktionsbezogene E-Mail-Adressen an der TU Dresden 42
2.3.1.3 ZIH verwaltete Nutzer-Mailboxen 43
2.3.1.4 Web-Mail 43
2.3.1.5 Neuer Mailinglisten-Server 43
2.3.2 WWW 44
2.3.3 Authentifizierung und Autorisierung (AAI) 46
2.3.3.1 Shibboleth 47
2.3.4 WÀhlzugÀnge 47
2.3.5 Time Service 47
3 ZENTRALE DIENSTANGEBOTE UND SERVER 49
3.1 BENUTZERBERATUNG (BB) 49
3.2 TROUBLE TICKET SYSTEM (TTS) 50
3.3 NUTZER MANAGEMENT 51
3.4 LOGIN SERVICE 53
3.5 BEREITSTELLUNG VON VIRTUELLEN SERVERN 53
3.6 STORAGE MANAGEMENT 54
3.6.1 Backup Service 54
3.6.2 File Service und Speichersysteme 56
3.7 LIZENZ SERVICE 57
3.8 PERIPHERIE SERVICE 57
3.9 PC POOLS 57
3.10 SECURITY 59
3.10.1 IT Sicherheit 59
3.10.2 DFN PKI 59
3.10.3 VPN 59
3.10.4 Konzept der zentral bereitgestellten virtuellen Firewalls 59
4 SERVICELEISTUNGEN FĂR DEZENTRALE DV SYSTEME 61
4.1 ALLGEMEINES 61
4.2 PC SUPPORT 61
4.2.1 Investberatung 61
4.2.2 Implementierung 61
4.2.3 Instandhaltung 61
4.3 MICROSOFT WINDOWS SUPPORT 62
4.4 ZENTRALE SOFTWARE BESCHAFFUNG FĂR DIE TU DRESDEN 71
4.4.1 ArbeitsgruppentÀtigkeit 71
4.4.2 Strategie des Software Einsatzes an der TU Dresden 71
4.4.3 Software Beschaffung 72
5 HOCHLEISTUNGSRECHNEN 73
5.1 HOCHLEISTUNGSRECHNER/SPEICHERKOMPLEX (HRSK) 73
5.1.1 HRSK Core Router 74
5.1.2 HRSK SGI Altix 4700 74
5.1.3 HRSK PetaByte Bandarchiv 76
5.1.4 HRSK Linux Networx PC Farm 77
5.1.5 HRSK Linux Networx PC Cluster (HRSK Stufe 1a) 79
5.2 NUTZUNGSĂBERSICHT DER HPC SERVER 79
5.3 SPEZIALRESSOURCEN 80
5.3.1 SGI Origin 3800 80
5.3.2 NEC SX 6 81
5.3.3 Anwendercluster 82
5.4 GRID RESSOURCEN 82
5.5 ANWENDUNGSSOFTWARE 84
5.6 VISUALISIERUNG 84
5.7 PERFORMANCE TOOLS 86
6 WISSENSCHAFTLICHE KOOPERATION, PROJEKTE 87
6.1 âKOMPETENZZENTRUM FĂR VIDEOKONFERENZDIENSTEâ 87
6.1.1 Ăberblick 87
6.1.2 Umbau der RĂ€ume des VCC 87
6.1.3 Aufgaben und Entwicklungsarbeiten 87
6.1.4 Weitere AktivitÀten 89
6.1.5 Der Dienst âDFNVideoConferenceâ Mehrpunktkonferenzen im G WiN 90
6.1.6 Tendenzen und Ausblicke 91
6.2 D GRID 92
6.2.1 Hochenergiephysik Community Grid (HEP CG) - Entwicklung von Anwendungen und Komponenten zur Datenauswertung in der Hochenergiephysik in einer nationalen e Science Umgebung 92
6.2.2 MediGRID - Ressourcefusion fĂŒr Medizin und Lebenswissenschaften 92
6.2.3 D Grid Integrationsprojekt 93
6.2.4 Chemomentum 93
6.3 BIOLOGIE 94
6.3.1 Entwicklung eines SME freundlichen Zuchtprogramms fĂŒr Korallen 94
6.3.2 Entwicklung und Analyse von stochastischen interagierenden Vielteilchen Modellen fĂŒr biologische Zellinteraktion 94
6.3.3 Verbundsystem EndoSys: Modellierung der Rolle von Rab DomÀnen bei Endozytose und Signalverarbeitung in Hepatocyten 95
6.3.4 ZebraSim: Modellierung und Simulation der Muskelgewebsbildung bei Zebrafischen 95
6.3.5 Ladenburger Kolleg BioLogistik: Vom bio inspirierten Engineering komplexer logistischer Systeme bis zur âNanoLogistikâ 96
6.3.6 RĂ€umlich zeitliche Dynamik in der Systembiologie 96
6.4 PERFORMANCE EVALUIERUNG 97
6.4.1 SFB 609: Elektromagnetische Strömungsbeeinflussung in Metallurgie, KristallzĂŒchtung und Elektrochemie Teilprojekt A1: Numerische Modellierung turbulenter MFD Strömungen 97
6.4.2 BenchIT: Performance Measurement for Scientific Applications 97
6.4.3 Parallel Programming for Multi core Architectures â ParMA 98
6.4.4 VI HPS: Virtuelles Institut â HPS 99
6.4.5 Paralleles Kopplungs Framework und moderne Zeitintegrationsverfahren fĂŒr detaillierte Wolkenprozesse in atmosphĂ€rischen Modellen 99
6.4.6 Virtuelle Entwicklung von Keramik und Kompositwerkstoffen mit maĂge schneiderten Transporteigenschaften 100
6.4.7 Designing self organized adaptive services for open source internet telephony over p2p networks 100
7 AUSBILDUNGSBETRIEB UND PRAKTIKA 103
7.1 AUSBILDUNG ZUM FACHINFORMATIKER / FACHRICHTUNG
ANWENDUNGSENTWICKLUNG 103
7.2 PRAKTIKA 104
8 AUS UND WEITERBILDUNGSVERANSTALTUNGEN 105
9 VERANSTALTUNGEN 107
10 PUBLIKATIONEN 109
TEIL III
BERICHTE DER ZENTRALEN EINRICHTUNGEN
BIOTECHNOLOGISCHES ZENTRUM (BIOTEC) 115
BOTANISCHER GARTEN 119
LEHRZENTRUM SPRACHEN UND KULTURRĂUME (LSK) 121
MEDIENZENTRUM (MZ) 125
UNIVERSITĂTSARCHIV 135
BERICHT DER ZENTRALEN UNIVERSITĂTSVERWALTUNG 137
BERICHT DES MEDIZINISCHEN RECHENZENTRUMS DES UNIVERSITĂTSKLINIKUMS CARL GUSTAV CARUS 139
SĂCHSISCHE LANDESBIBLIOTHEK â STAATS UND UNIVERSITĂTSBIBLIOTHEK DRESDEN 14
Dataflow Computing with Polymorphic Registers
Heterogeneous systems are becoming increasingly popular for data processing. They improve performance of simple kernels applied to large amounts of data. However, sequential data loads may have negative impact. Data parallel solutions such as Polymorphic Register Files (PRFs) can potentially accelerate applications by facilitating high speed, parallel access to performance-critical data. Furthermore, by PRF customization, specific data path features are exposed to the programmer in a very convenient way. PRFs allow additional control over the registers dimensions, and the number of elements which can be simultaneously accessed by computational units. This paper shows how PRFs can be integrated in dataflow computational platforms. In particular, starting from an annotated source code, we present a compiler-based methodology that automatically generates the customized PRFs and the enhanced computational kernels that efficiently exploit them
Evaluating New Architectural Features Of The Intel(R) Xeon(R) 7500 Processor For Hpc Workloads
In this paper we take a look at what the Intel Xeon Processor 7500 family, code namedNehalem-EX, brings to high performance computing. We compare two families of Intel Xeonbased systems (Intel Xeon 7500 and Intel Xeon 5600) and present a performance evolutionof 16 node clusters based on these CPUs. We compare CPU generations utilizing dual socketplatforms and a cluster across a number of HPC benchmarks and focused on differentperformance field and aspect. We will evaluate also technologies and features like Intels HyperThreading Technology (HT) and Intel Turbo Boost Technology (Turbo Mode) and theperformance implication of these technologies for HPC
Jahresbericht 2010 zur kooperativen DV-Versorgung
:VORWORT 9
ĂBERSICHT DER INSERENTEN 10
TEIL I
ZUR ARBEIT DER DV-KOMMISSION 15
MITGLIEDER DER DV-KOMMISSION 15
ZUR ARBEIT DES IT-LENKUNGSAUSSCHUSSES 17
ZUR ARBEIT DES WISSENSCHAFTLICHEN BEIRATES DES ZIH 17
TEIL II
1 DAS ZENTRUM FĂR INFORMATIONSDIENSTE UND HOCHLEISTUNGSRECHNEN (ZIH) 21
1.1 AUFGABEN 21
1.2 ZAHLEN UND FAKTEN (REPRĂSENTATIVE AUSWAHL) 21
1.3 HAUSHALT 22
1.4 STRUKTUR / PERSONAL 23
1.5 STANDORT 24
1.6 GREMIENARBEIT 25
2 KOMMUNIKATIONSINFRASTRUKTUR 27
2.1 NUTZUNGSĂBERSICHT NETZDIENSTE 27
2.1.1 WiN-IP-Verkehr 27
2.2 NETZWERKINFRASTRUKTUR 27
2.2.1 Allgemeine Versorgungsstruktur 27
2.2.2 Netzebenen 27
2.2.3 Backbone und lokale Vernetzung 28
2.2.4 Druck-Kopierer-Netz 33
2.2.5 WLAN 33
2.2.6 Datennetz zwischen den UniversitĂ€tsstandorten und AuĂenanbindung 33
2.2.7 Vertrag âKommunikationsverbindungen der SĂ€chsischen Hochschulenâ 37
2.2.8 Datennetz zu den Wohnheimstandorten 39
2.2.9 Datennetz der FakultÀt Informatik 40
2.3 KOMMUNIKATIONS- UND INFORMATIONSDIENSTE 40
2.3.1 Electronic-Mail 40
2.3.1.1 Einheitliche E-Mail-Adressen an der TU Dresden 41
2.3.1.2 Struktur- bzw. funktionsbezogene E-Mail-Adressen an der TU Dresden 42
2.3.1.3 ZIH verwaltete Nutzer-Mailboxen 42
2.3.1.4 Web-Mail 42
2.3.1.5 Mailinglisten-Server 43
2.3.2 Authentifizierungs- und Autorisierungs-Infrastruktur (AAI) 43
2.3.2.1 AAI fĂŒr das Bildungsportal Sachsen 44
2.3.2.2 DFN PKI 44
2.3.3 WÀhlzugÀnge 44
2.3.4 Time-Service 44
2.3.5 Voice over Internet Protocol (VoIP) 44
3 ZENTRALE DIENSTANGEBOTE UND SERVER 47
3.1 BENUTZERBERATUNG (BB) 47
3.2 TROUBLE TICKET SYSTEM (OTRS) 48
3.3 NUTZERMANAGEMENT 49
3.4 LOGIN-SERVICE 50
3.5 BEREITSTELLUNG VON VIRTUELLEN SERVERN 51
3.6 STORAGE-MANAGEMENT 51
3.6.1 Backup-Service 51
3.6.2 File-Service und Speichersysteme 53
3.7 LIZENZ-SERVICE 55
3.8 PERIPHERIE-SERVICE 55
3.9 PC-POOLS 55
3.10 SECURITY 56
3.10.1 Informationssicherheit 56
3.10.2 FrĂŒhwarnsystem (FWS) im Datennetz der TU Dresden 57
3.10.3 VPN 57
3.10.4 Konzept der zentral bereitgestellten virtuellen Firewalls 57
3.10.5 Netzkonzept fĂŒr Arbeitsplatzrechner mit dynamischer Portzuordnung nach IEEE 802.1x (DyPort) 58
4 SERVICELEISTUNGEN FĂR DEZENTRALE DV-SYSTEME 59
4.1 ALLGEMEINES 59
4.2 PC-SUPPORT 59
4.2.1 Investberatung 59
4.2.2 Implementierung 59
4.2.3 Instandhaltung 59
4.3 MICROSOFT WINDOWS-SUPPORT 60
4.4 ZENTRALE SOFTWARE-BESCHAFFUNG FĂR DIE TU DRESDEN 64
4.4.1 Arbeitsgruppe Software im ZKI 64
4.4.2 Strategie des Software-Einsatzes an der TU Dresden 64
4.4.3 Software-Beschaffung 64
4.4.4 Nutzerberatungen 65
4.4.5 Software-PrÀsentationen 66
5 HOCHLEISTUNGSRECHNEN 67
5.1 HOCHLEISTUNGSRECHNER/SPEICHERKOMPLEX (HRSK) 67
5.1.1 HRSK Core-Router 68
5.1.2 HRSK SGI Altix 4700 68
5.1.3 HRSK PetaByte-Bandarchiv 70
5.1.4 HRSK Linux Networx PC-Farm 71
5.1.5 Globale Home-File-Systeme fĂŒr HRSK 73
5.1.5 Linux Networx PC-Cluster (Phobos) 73
5.2 NUTZUNGSĂBERSICHT DER HPC-SERVER 74
5.3 SPEZIALRESSOURCEN 75
5.3.1 NEC SX-6 75
5.3.2 Microsoft HPC-System 75
5.3.3 Anwendercluster 76
5.4 GRID-RESSOURCEN 77
5.5 ANWENDUNGSSOFTWARE 79
5.6 VISUALISIERUNG 80
5.7 PARALLELE PROGRAMMIERWERKZEUGE 81
6 WISSENSCHAFTLICHE PROJEKTE, KOOPERATIONEN 83
6.1 âKOMPETENZZENTRUM FĂR VIDEOKONFERENZDIENSTEâ (VCCIV) 83
6.1.1 Ăberblick 83
6.1.2 VideokonferenzrÀume 83
6.1.3 Aufgaben und Entwicklungsarbeiten 83
6.1.4 Weitere AktivitÀten 85
6.1.5 Der Dienst âDFNVideoConferenceâ - Mehrpunktkonferenzen im G-WiN 86
6.1.6 Ausblick 87
6.2 100-GIGABIT-TESTBED DRESDEN/FREIBERG 87
6.2.1 Ăberblick 87
6.2.2 Motivation 88
6.2.3 Setup und technische Umsetzung 88
6.2.4 Teilprojekte des ZIH 89
6.2.5 Fazit und Ausblick 90
6.3 D-GRID 90
6.3.1 D-Grid Integrationsprojekt 2 90
6.3.2 D-Grid Scheduler InteroperalitÀt (DGSI) 91
6.3.3 MoSGrid â Molecular Simulation Grid 91
6.3.4 WisNetGrid âWissensnetzwerke im Grid 92
6.4 BIOLOGIE 93
6.4.1 Entwicklung und Analyse von stochastischen interagierenden Vielteilchen-Modellen fĂŒr biologische Zellinteraktion 93
6.4.2 EndoSys â Modellierung der Rolle von Rab-DomĂ€nen bei Endozytose und Signalverarbeitung in Hepatocyten 93
6.4.3 SpaceSys â RĂ€umlich-zeitliche Dynamik in der Systembiologie 94
6.4.4 Biologistik â Von bio-inspirierter Logistik zum logistik-inspirierten Bio-Nano-Engineering 94
6.4.5 ZebraSim â Modellierung und Simulation der Muskelgewebsbildung bei Zebrafischen 94
6.4.6 SFB Transregio 79 - Werkstoffentwicklungen fĂŒr die Hartgeweberegeneration im gesunden und systemisch erkrankten Knochen 95
6.4.7 Virtuelle Leber - Raumzeitlich mathematische Modelle zur Untersuchung der Hepatozyten-PolaritÀt und ihre Rolle in der Lebergewebeentwicklung 95
6.4.8 GrowReg - Wachstumsregulation und Strukturbildung in der Regeneration 96
6.5 PERFORMANCE EVALUIERUNG 96
6.5.1 SFB 609 â Elektromagnetische Strömungsbeeinflussung in Metallurgie, KristallzĂŒchtung und Elektrochemie âTeilprojekt A1: Numerische Modellierung turbulenter MFD-Strömungen 96
6.5.2 BenchIT â Performance Measurement for Scientific Applications 97
6.5.3 PARMA â Parallel Programming for Multi-core Architectures - ParMA 98
6.5.4 VI-HPS â Virtuelles Institut - HPS 98
6.5.5 Paralleles Kopplungs-Framework und moderne Zeitintegrationsverfahren fĂŒr detaillierte Wolkenprozesse in atmosphĂ€rischen Modellen 99
6.5.6 VEKTRA â Virtuelle Entwicklung von Keramik- und Kompositwerkstoffen mit maĂgeschneiderten Transporteigenschaften 99
6.5.7 Cool Computing âTechnologien fĂŒr Energieeffiziente Computing-Plattformen (BMBF-Spitzencluster Cool Silicon) 100
6.5.8 eeClust - Energieeffizientes Cluster-Computing 100
6.5.9 HI-CFD â Hocheffiziente Implementierung von CFD-Codes fĂŒr HPC-Many-Core-Architekturen 100
6.5.10 SILC â Scalierbare Infrastruktur zur automatischen Leistungsanalyse paralleler Codes 101
6.5.11 TIMaCS â Tools for Intelligent System Mangement of Very Large Computing Systems 101
6.5.12 Verbundprojekt: EMI - European Middleware Initiative 102
6.5.13 H4H â Optimise HPC Applications on Heterogeneous Architectures 102
6.6 KOOPERATIONEN 102
7 DOIT - INTEGRIERTES INFORMATIONSMANAGEMENT 105
7.1 VISION DER TU DRESDEN 105
7.2 ZIELE DER PROJEKTGRUPPE 105
7.2.1 Analyse der bestehenden IT-UnterstĂŒtzung der Organisation und ihrer Prozesse 105
7.2.2 Erarbeitung von VerbesserungsvorschlÀgen 105
7.2.3 HerbeifĂŒhrung strategischer Entscheidungen 106
7.2.4 Planung und DurchfĂŒhrung von Teilprojekten 106
7.2.5 Markt- und Anbieteranalyse 106
7.2.6 Austausch mit anderen Hochschulen 106
7.3 ORGANISATORISCHE EINBINDUNG DER DOIT-GRUPPE 106
7.4 IDENTITĂTSMANAGEMENT 107
7.5 KONTAKT 108
8 AUSBILDUNGSBETRIEB UND PRAKTIKA 109
8.1 AUSBILDUNG ZUM FACHINFORMATIKER / FACHRICHTUNG ANWENDUNGSENTWICKLUNG 109
8.2 PRAKTIKA 110
9 AUS- UND WEITERBILDUNGSVERANSTALTUNGEN 111
10 VERANSTALTUNGEN 113
11 PUBLIKATIONEN 115
TEIL III
BERICHTE
BIOTECHNOLOGISCHES ZENTRUM (BIOTEC) 121
BOTANISCHER GARTEN 125
LEHRZENTRUM SPRACHEN UND KULTUREN (LSK) 127
MEDIENZENTRUM (MZ) 133
UNIVERSITĂTSARCHIV (UA) 139
UNIVERSITĂTSSPORTZENTRUM (USZ) 141
ZENTRALE UNIVERSITĂTSVERWALTUNG 143
MEDIZINISCHES RECHENZENTRUM DES UNIVERSITĂTSKLINIKUMS CARL GUSTAV CARUS 145
SĂCHSISCHE LANDESBIBLIOTHEK â STAATS- UND UNIVERSITĂTSBIBLIOTHEK 14
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Tohoku Universityć°æ ćșæèȘČ
Jahresbericht 2007 zur kooperativen DV-Versorgung
:VORWORT 9
ĂBERSICHT DER INSERENTEN 12
TEIL I
ZUR ARBEIT DER DV KOMMISSION 15
MITGLIEDER DER DV KOMMISSION 15
ZUR ARBEIT DES LENKUNGSAUSSCHUSSES FĂR DAS ZIH 17
ZUR ARBEIT DES WISSENSCHAFTLICHEN BEIRATES DES ZIH 17
TEIL II
1 DAS ZENTRUM FĂR INFORMATIONSDIENSTE UND HOCHLEISTUNGSRECHNEN (ZIH) 21
1.1 AUFGABEN 21
1.2 ZAHLEN UND FAKTEN (REPRĂSENTATIVE AUSWAHL) 21
1.3 HAUSHALT 22
1.4 STRUKTUR / PERSONAL 23
1.5 STANDORT 24
1.6 GREMIENARBEIT 25
2 KOMMUNIKATIONSINFRASTRUKTUR 27
2.1 NUTZUNGSĂBERSICHT NETZDIENSTE 27
2.1.1 WiN IP Verkehr 27
2.2 NETZWERKINFRASTRUKTUR 27
2.2.1 Allgemeine Versorgungsstruktur 27
2.2.2 Netzebenen 27
2.2.3 Backbone und lokale Vernetzung 28
2.2.4 Druck Kopierer Netz 32
2.2.5 Funk LAN (WLAN) 32
2.2.6 Datennetz zwischen den UniversitĂ€tsstandorten und AuĂenanbindung 33
2.2.7 Datennetz zu den Wohnheimstandorten 36
2.3 KOMMUNIKATIONS UND INFORMATIONSDIENSTE 38
2.3.1 Electronic Mail 38
2.3.1.1 EinfĂŒhrung einheitlicher E-Mail-Adressen an der TU Dresden 39
2.3.1.2 Funktionsbezogene TU-Mail-Adressen an der TU Dresden 40
2.3.1.3 ZIH verwaltete Nutzer-Mailboxen 40
2.3.1.4 Web-Mail 41
2.3.1.5 Neuer Mailinglisten-Server 41
2.3.2 WWW 41
2.3.3 Authentifizierung und Autorisierung (AAI) 42
2.3.3.1 Shibboleth 42
2.3.4 WÀhlzugÀnge 43
2.2.5 Time Service 43
3 ZENTRALE DIENSTANGEBOTE UND SERVER 45
3.1 BENUTZERBERATUNG (BB) 45
3.2 TROUBLE TICKET SYSTEM (TTS) 46
3.3 NUTZERMANAGEMENT 47
3.4 LOGIN SERVICE 48
3.5 STORAGE MANAGEMENT 48
3.5.1 Backup Service 49
3.5.2 File Service und Speichersysteme 52
3.6 LIZENZ SERVICE 55
3.7 PERIPHERIE SERVICE 55
3.8 PC POOLS 55
3.9 SECURITY 56
4 SERVICELEISTUNGEN FĂR DEZENTRALE DV SYSTEME 59
4.1 ALLGEMEINES 59
4.2 PC SUPPORT 59
4.2.1 Investberatung 59
4.2.2 Implementierung 59
4.2.3 Instandhaltung 59
4.3 MICROSOFT WINDOWS SUPPORT 60
4.4 ZENTRALE SOFTWARE BESCHAFFUNG FĂR DIE TU DRESDEN 64
4.4.1 ArbeitsgruppentÀtigkeit 64
4.4.2 Strategie des Software Einsatzes an der TU Dresden 65
4.4.3 Software Beschaffung 66
5 HOCHLEISTUNGSRECHNEN 67
5.1 HOCHLEISTUNGSRECHNER/SPEICHERKOMPLEX (HRSK) 67
5.1.1 HRSK Core Router 69
5.1.2 HRSK SGI Altix 4700 69
5.1.3 HRSK PetaByte Bandarchiv 70
5.1.4 HRSK Linux Networx PC Farm 72
5.1.5 HRSK Linux Networx PC Cluster (HRSK Stufe 1a) 73
5.2 NUTZUNGSĂBERSICHT DER HPC SERVER 74
5.3 SPEZIALRESSOURCEN 75
5.3.1 SGI Origin 3800 75
5.3.2 NEC SX 6 76
5.3.3 Anwendercluster 76
5.4 GRID RESSOURCEN 77
5.5 ANWENDUNGSSOFTWARE 78
5.6 VISUALISIERUNG 79
5.7 PERFORMANCE TOOLS 80
6 WISSENSCHAFTLICHE KOOPERATION, PROJEKTE 83
6.1 DAS PROJEKT âKOMPETENZZENTRUM FĂR VIDEOKONFERENZDIENSTEâ 83
6.1.1 Ăberblick 83
6.1.2 Umbau der RĂ€ume des VCC 83
6.1.3 Aufgaben und Entwicklungsarbeiten 83
6.1.4 Weitere AktivitÀten 86
6.1.5 Der Dienst âDFNVideoConferenceâ Mehrpunktkonferenzen im G WiN 86
6.1.6 Tendenzen und Ausblicke 87
6.2 D GRID 88
6.2.1 Hochenergiephysik Community Grid (HEP CG) Entwicklung von Anwendungen und Komponenten zur Datenauswertung in der Hochenergie physik in einer nationalen e Science Umgebung 88
6.2.2 MediGRID Ressourcefusion fĂŒr Medizin und Lebenswissenschaften 88
6.2.3 D Grid Integrationsprojekt 89
6.2.4 Chemomentum 89
6.3 BIOLOGIE 90
6.3.1 Mathematische Modellierung und Computersimulation des Tumorwachs tums und Therapien 90
6.3.2 Entwicklung eines SME freundlichen Zuchtprogramms fĂŒr Korallen 91
6.3.3 Analyse raum zeitlicher Musterbildung von Mikroorganismen 91
6.3.4 Regeneration beim Axolotl 91
6.3.5 Entwicklung und Analyse von stochastischen Interagierenden Vielteilchen Modellen fĂŒr biologische Zellinteraktion 92
6.3.8 Kompetenznetzwerk MTBio 92
6.3.7 EndoSys: Raum zeitliche Modellierung der Regulationsprozesse der Endozytose in Hepatocyten 92
6.3.8 ZebraSim: Modellierung und Simulation der Muskelgewebsbildung bei Zebrafischen 93
6.3.9 Biologistik: Von bio inspirierter Logistik zum logistik inspirierten Bio Nano Engineering 93
6.4 PERFORMANCE EVALUIERUNG 94
6.4.1 SFB 609: Elektromagnetische Strömungsbeeinflussung in Metallurgie, KristallzĂŒchtung und Elektrochemie Teilprojekt A1: Numerische Modellierung turbulenter MFD -Strömungen 94
6.4.2 Parallel Programming for Multi core Architectures ParMA 94
6.4.3 VI HPS: Virtuelles Institut â HPS 95
6.4.4 Paralleles Kopplungs Framework und moderne Zeitintegrationsverfahren fĂŒr detaillierte Wolkenprozesse in atmosphĂ€rischen Modellen 96
6.4.5 Virtuelle Entwicklung von Keramik und Kompositwerkstoffen mit maĂge schneiderten Transporteigenschaften 96
7 AUSBILDUNGSBETRIEB UND PRAKTIKA 97
7.1 AUSBILDUNG ZUM FACHINFORMATIKER / FACHRICHTUNG ANWENDUNGSENTWICKLUNG 97
7.2 PRAKTIKA 98
8 AUS UND WEITERBILDUNGSVERANSTALTUNGEN 99
9 VERANSTALTUNGEN 101
10 PUBLIKATIONEN 103
TEIL III
BERICHTE DER FAKULTĂTEN
FAKULTĂT MATHEMATIK UND NATURWISSENSCHAFTEN 109
Fachrichtung Mathematik 109
Fachrichtung Physik 113
Fachrichtung Chemie und Lebensmittelchemie 117
Fachrichtung Psychologie 123
Fachrichtung Biologie 125
PHILOSOPHISCHE FAKULTĂT 131
FAKULTĂT SPRACH , LITERATUR UND KULTURWISSENSCHAFTEN 135
FAKULTĂT ERZIEHUNGSWISSENSCHAFTEN 137
JURISTISCHE FAKULTĂT 141
FAKULTĂT WIRTSCHAFTSWISSENSCHAFTEN 145
FAKULTĂT INFORMATIK 153
FAKULTĂT ELEKTROTECHNIK UND INFORMATIONSTECHNIK 161
FAKULTĂT MASCHINENWESEN 169
FAKULTĂT BAUINGENIEURWESEN 179
FAKULTĂT ARCHITEKTUR 185
FAKULTĂT VERKEHRSWISSENSCHAFTEN âFRIEDRICH LISTâ 189
FAKULTĂT FORST , GEO UND HYDROWISSENSCHAFTEN 201
Fachrichtung Forstwissenschaften 201
Fachrichtung Geowissenschaften 207
Fachrichtung Wasserwesen 213
MEDIZINISCHE FAKULTĂT CARL GUSTAV CARUS 21
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