Ontology portal. A repository intended for structured data consumption and data mining related algorithms

La web semántica es un área de investigación y desarrollo muy relevante en la actualidad. El aumento exponencial del volumen de datos y la necesidad de manejar información de manera eficiente han llevado a las tecnologías semánticas a ganar más importancia. En particular, la web semántica se utiliza cada vez más para mejorar la calidad y precisión de la información disponible en línea, lo que resulta en una mejor experiencia del usuario y una mayor eficiencia en la gestión de datos. En consecuencia, han surgido muchos portales web que utilizan la web semántica para organizar y clasificar la información en línea. Estas aplicaciones proporcionan un punto centralizado para acceder a los datos de ontologías, lo que facilita su uso y ayuda a los usuarios a encontrar la información que necesitan de manera más rápida y eficiente. En este contexto, el presente Trabajo de Fin de Grado se enfoca en el desarrollo de un portal web de ontologías para el proyecto nacional “Aether”. Este proyecto es una iniciativa que reúne a cinco grupos de investigación de universidades españolas en el campo de análisis de datos y Big Data. El objetivo principal del proyecto es encontrar soluciones tecnológicas para problemas reales de interés para la industria y la sociedad, como la agricultura, la medicina , el análisis de datos científicos, las ciudades inteligentes, la Industria 4.0 y el análisis de riesgos. En este sentido, el portal web de ontologías será una herramienta crucial para mejorar la eficiencia y calidad de la información disponible en línea. El trabajo no solo describirá el proceso de desarrollo de la aplicación, desde la metodología hasta la implementación de la solución, sino que también se enfocará en el rendimiento, la accesibilidad y el SEO, para asegurar la mejor experiencia posible para los usuarios

An Approach to Compare Bio-Ontologies Portals

International audienceBackground: main biomedical information retrieval systems are based on controlled vocabularies and most specifically on terminologies or ontologies (T/O). These classification structures allow indexing, coding, annotating different kind of documents. Many T/O have been created for different purposes and it became a problem for finding specific concepts in the multitude of existing nomenclatures. The NCBO (National Center for Biomedical Ontologies) BioPortal2 and the CISMeF (Catalogue et Index des SitesM'edicaux de langue Franc¸aise) HeTOP3 projects have been developed to tackle this issue. Objective: the present work consists in comparing both portals. Methods: we hereby are proposing a set of criteria to compare bio-ontologies portals in terms of goals, features, technologies and usability. Results: BioPortal and HeTOP have been compared based on the given criteira. While both portals are designed to store and make T/O available to the community and are sharing many basic features, they are also very different mainly because of their basic purposes. Conclusion: thanks to the comparison criteria, we can assume that a merge between BioPortal and HeTOP is possible in terms of functionnalities. The main difficulties will be about merging the data repositories and applying different policies on T/O content

An Approach to Compare Bio-Ontologies Portals

International audienceBackground: main biomedical information retrieval systems are based on controlled vocabularies and most specifically on terminologies or ontologies (T/O). These classification structures allow indexing, coding, annotating different kind of documents. Many T/O have been created for different purposes and it became a problem for finding specific concepts in the multitude of existing nomenclatures. The NCBO (National Center for Biomedical Ontologies) BioPortal2 and the CISMeF (Catalogue et Index des SitesM'edicaux de langue Franc¸aise) HeTOP3 projects have been developed to tackle this issue. Objective: the present work consists in comparing both portals. Methods: we hereby are proposing a set of criteria to compare bio-ontologies portals in terms of goals, features, technologies and usability. Results: BioPortal and HeTOP have been compared based on the given criteira. While both portals are designed to store and make T/O available to the community and are sharing many basic features, they are also very different mainly because of their basic purposes. Conclusion: thanks to the comparison criteria, we can assume that a merge between BioPortal and HeTOP is possible in terms of functionnalities. The main difficulties will be about merging the data repositories and applying different policies on T/O content