A Standardised Procedure for Evaluating Creative Systems: Computational Creativity Evaluation Based on What it is to be Creative

Computational creativity is a flourishing research area, with a variety of creative systems being produced and developed. Creativity evaluation has not kept pace with system development with an evident lack of systematic evaluation of the creativity of these systems in the literature. This is partially due to difficulties in defining what it means for a computer to be creative; indeed, there is no consensus on this for human creativity, let alone its computational equivalent. This paper proposes a Standardised Procedure for Evaluating Creative Systems (SPECS). SPECS is a three-step process: stating what it means for a particular computational system to be creative, deriving and performing tests based on these statements. To assist this process, the paper offers a collection of key components of creativity, identified empirically from discussions of human and computational creativity. Using this approach, the SPECS methodology is demonstrated through a comparative case study evaluating computational creativity systems that improvise music

Полиморфизм гена хемокинового рецептора CCR5 у больных рассеянным склерозом в Сибирском регионе

Multiple sclerosis is chronic inflammatory disease of the central nervous system in the development of which chemokines of the type Tx1 play the leading role. Chemokines and their receptors participate in the development of multiple sclerosis as a result of drawing immune cells into central nervous system. Mutation of CCR5 delta32 decreases functional activity of the appropriate receptor on cellular surface and thus can reduce migration of leucocytes into foci of injury. Aimed at studying the role of mutation in multiple sclerosis, we compared frequency of gene type CCR5 in peripheral mononuclears of 102 multiple sclerosis patients and in 136 healthy subjects. The results obtained allow to conclude that polymorphism of chemokine receptor gene CCR5del32 is not a leading factor in the susceptibility to multiple sclerosis in the studied population.Рассеянный склероз (РС) — хроническое воспалительное заболевание центральной нервный системы, в развитии которого ведущее значение имеют Тх1 типа. Хемокины и их рецепторы участвуют в развитии РС вследствие привлечения иммунных клеток в центральную нервную систему. Мутация CCR5 delta32 уменьшает функциональную активность соответствующего рецептора на клеточной поверхности и тем самым может редуцировать миграцию лейкоцитов в очаги поражения. С целью изучения роли мутации при РС сравнилась частота генотипа CCR5 в периферических мононуклеарах 102 больных РС и 136 здоровых лиц. Полученные результаты позволяют заключить, что полиморфизм гена хемокинового рецептора CCR5del32 не является ведущим фактором в восприимчивости к рассеянному склерозу в изученной популяции

Монотерапия ниволумабом у больных метастатическим колоректальным раком: современные подходы к оценке ответа опухоли

Aim of the study: a systematic analysis of the modern literature data on the nivolumab monotherapy efficacy in patients with metastatic colorectal cancer (mCRC). Material and methods. The review summarizes the results of clinical studies of the nivolumab efficacy in patients with mCRC between 2012 and 2022. The current approaches to assessing the tumor response in patients treated with immune checkpoint inhibitors are considered, including response patterns and criteria. Results. Data analysis showed that the use of nivolumab in mCRC patients had significant clinical benefits. Nivolumab monotherapy was shown to improve survival in patients with high microsatellite instability (MSI) or deficiencies in mismatch repair (dMMR) that progressed during standard chemotherapy. Numerous clinical studies indicate the atypical response to nivolumab. Traditional response criteria, such as RECIST do not always adequately assess the therapeutic efficacy of nivolumab in patients with mCRC. Conclusion. To improve the efficacy of mCRC treatment, standardized approaches based on the proposed specific criteria for response to immunotherapy, including immune related RECIST, immune RECIST, and immune-modified RECIST must be developed.Цель исследования ‒ систематический анализ данных современной литературы об эффективности применения ниволумаба в монорежиме у больных метастатическим колоректальным раком (мКРР). Материал и методы. В обзор включены данные клинических исследований за период с 2012 по 2022 г., оценивающих эффективность лечения ниволумабом у больных мКРР. Рассмотрены текущие подходы к оценке опухолевого ответа, включая характер иммунного ответа и критерии ответа. Результаты. Анализ литературы показал, что применение ниволумаба при мКРР имеет значимые клинические преимущества. Продемонстрировано, что монотерапия ниволумабом улучшает показатели выживаемости у пациентов с высокой микросателлитной нестабильностью (MSI) или нарушением механизма репарации неспаренных оснований ДНК (dMMR), которые прогрессировали на фоне стандартной химиотерапии. Многочисленные клинические исследования указывают на развитие атипичных реакций ответа на ниволумаб. Традиционные критерии ответа, такие как RECIST, не всегда адекватно оценивают терапевтическую эффективность ниволумаба у пациентов с мКРР. Заключение. Для повышения эффективности лечения мКРР необходима разработка стандартизированных подходов, основанных на предложенных специфических критериях ответа на иммунотерапию, включая иммунологический Recist, иммунный Recist и иммуномодифицированный RECIST

Этнические аспекты наследственного рака молочной железы

This study aimed to reveal the spectrum of BRca1 and BRca2 genes mutation in various ethnic groups of the Russian Federation. asystematic literature search includes data for the past 10 years and was conducted by using electronic databases of pubmed, eliBRaRY and ect.Material and methods. The review includes research data on the frequency of mutations of breast cancer-associated genes in various ethnic groups of the Russian Federation.Results. For «slavic» patients with a family history, the BRca1/2 mutation testing is the standard of care. in addition, the development of new antitumour drugs has resulted in improved survival rates. more than 1000 mutations of the BRca1 gene have been identified. Recent research is focused on the confirmation the beneficial effect of identified mutations. For the indigenous population (mongoloid ethnic groups), there are no standards for the treatment of inherited breast cancer. thus, the advances in molecular oncology for the treatment of hereditary breast cancer are not available for the indigenous population of the Russian Federation.Conclusion. In this context, the search for markers of early cancer detection and the development of criteria for therapy response are relevant for indigenous people. the development of new predictive and prognostic criteria of breast cancer among mongoloid ethnic groups with a family history will allow the innovative strategies for personalized molecular therapy to be developed.Цель исследования – провести систематический анализ данных, имеющихся в современной литературе, о спектре мутаций генов BRca1 и BRca2 в различных этнических группах Российской Федерации.Материал и методы. В обзор включены данные исследований о частоте встречаемости мутаций РМЖ-ассоциированных генов у различных этнических групп Российской Федерации, опубликованные за последние 10 лет. Поиск производился в системах pubmed, eliBRaRYи др.Результаты. В настоящее время тестирование BRca1/2 мутаций является стандартом в лечении наследственного РМЖ у «славянских» пациентов с семейной историей, достигнут прогресс в разработке новых противоопухолевых препаратов и значительный рост показателей выживаемости, идентифицировано более 1000 мутаций гена BRca1, продолжается поиск патогенных клинически значимых мутаций для данной группы больных. Однако на данный момент отсутствуют сведения о молекулярных факторах, которые обусловливают риск развития наследственных форм РМЖ для коренного населения Российской Федерации (буряты, эвенки, якуты, алтайцы, тувинцы, хакасы и др.). Таким образом, современные достижения молекулярной онкологии в лечении наследственных форм РМЖ не доступны для коренного населения Российской Федерации.Заключение. Представленные данные подтверждают актуальность поиска маркеров ранней диагностики, эффективности терапии, риска прогрессирования РМЖ у коренных этносов. Данные о молекулярных механизмах наследственного РМЖ у этнических групп с семейной историей, принадлежащих к монголоидной расе, позволят в перспективе разработать инновационные стратегии персонализированной молекулярной терапии

Новая мутация в гене PALB2, ассоциированная с наследственным раком молочной железы у молодой пациентки, принадлежащей к якутской этнической группе

Background. Breast cancer (BC) is the most common female malignancy worldwide. Partner And Localizer of BRCA2 gene (PALB2) is directly involved in DNA damage response. Germline mutation in PALB2 has been identified in breast cancer and familial pancreatic cancer cases, accounting for approximately 1–2% and 3–4%, respectively. The goal of this report was to describe new PALB2 mutation in a young Yakut breast cancer patient with family history of cancer. Material and Methods. Genomic DNA were isolated from blood samples and used to prepare libraries using a capture-based target enrichment kit, Hereditary Cancer Solution™ (SOP HiA GE NETICS , Switzerland), covering 27 genes (ATM, APC, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CHEK2, EPCAM, FAM175A, MLH1, MRE11A, MSH2, MSH6, MUTYH, NBN, PALB2, PIK3CA, PMS2, PMS2CL, PTEN, RAD50, RAD51C, RAD51D, STK11, TP53 and XRCC2). Paired-end sequencing (2 × 150 bp) was conducted using NextSeq 500 system (Illumina, USA ). Results. Here we describe a case of a never-before-reported mutation in the PALB2 gene that led to the early onset breast cancer. We report the case of a 39-year-old breast cancer Yakut woman with a family history of pancreatic cancer. Bioinformatics analysis of the NGS data revealed the presence of the new PALB2 gene germinal frameshift deletion (NM_024675:exon1:c.47delA:p.K16fs). In accordance with dbPubMed ClinVar, new mutation is located in codon of the PALB2 gene, where the likely pathogenic donor splice site mutation (NM_024675.3:c.48+1delG) associated with hereditary cancer-predisposing syndrome has been earlier described. Conclusion. We found a new never-before-reported mutation in PALB2 gene, which probably associated with early onset breast cancer in Yakut indigenous women with a family history of pancreatic cancer.Актуальность. Рак молочной железы занимает лидирующие позиции по уровню заболеваемости во всем мире. Ген онкосупрессор PALB2 наряду с такими генами, как BRCA1, BRCA2, вовлечен в процессы репарации поврежденной ДНК. Частота встречаемости герминальных мутаций гена PALB2 при раке молочной железы и семейных случаях рака поджелудочной железы составляет приблизительно 1–2 % и 3–4 % соответственно. Представлен клинический случай 39-летней женщины, принадлежащей к якутской этнической группе, с диагнозом рак молочной железы с семейной историей рака поджелудочной железы. Материал и методы. Геномная ДНК выделена из периферической крови, ДНК-библиотеки приготавливали с использованием набора Hereditary Cancer Solution™ (Sophia Genetics, Швейцария) для изучения статуса 27 генов (ATM, APC, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CHEK2, EPCAM, FAM175A, MLH1, MRE11A, MSH2, MSH6, MUTYH, NBN, PALB2, PIK3CA, PMS2, PMS2CL, PTEN, RAD50, RAD51C, RAD51D, STK11, TP53 и XRCC2). Секвенирование (2 × 150 п.н.) проводилось с использованием системы NextSeq 500 (Illumina, США). Результаты. По результатам биоинформатического анализа данных NGS у 39-летней женщины, принадлежащей к якутской этнической группе, с диагнозом рак молочной железы с семейной историей рака поджелудочной железы обнаружена новая герминальная мутация гена PALB2 со сдвигом рамки считывания (NM_024675: Exon1: c.47delA: p.K16FS). В соответствии с dbPubmed ClinVar новая мутация гена PALB2 расположена в том же кодоне, где ранее была описана, вероятно патогенная, мутация сайта сплайсинга (NM_024675.3: Exon1: c.48+1delG), вовлеченная в патогенез наследственных форм рака молочной железы и яичника. Заключение. Впервые у 39-летней женщины, принадлежащей к якутской этнической группе, с диагнозом рак молочной железы и с семейной историей рака поджелудочной железы обнаружена новая, вероятно патогенная, герминальная мутация гена PALB2 со сдвигом рамки считывания (NM_024675: Exon1: c.47delA: p.K16FS)

Вариабельность митохондриального генома у больных раком молочной железы в популяции якуток

Background. The Sakha (Yakutia) population, the indigenous population of Siberia living in Yakutia, has one of the lowest rates of breast cancer (BC) incidence worldwide. The low BC incidence among the indigenous population of Yakutia has been reported by several authors, but to date the reasons for this phenomenon have not been fully elucidated. It should be noted that the study of factors that reduce the risk of BC is important for its prevention. In several studies, no hereditary BC was found in the Yakuts, and no pathogenic variants of the BRCA1/2 genes associated with hereditary syndromes of breast and ovarian cancers were found. In this regard, we decided to shift the focus to studying the mitochondrial genome of Sakha BC patients using the sequencing method.The purpose of the study was to identify BC-associated mitochondrial genome variants in Sakha patients.Material and Methods. The study included 14 Sakha patients diagnosed with BC. The median age of the patients was 49 years. DNA isolation was performed using phenol-chloroform extraction. DNA libraries were prepared using the Nextera Flex kit (Illumina, USA).Whole-genome sequencing of the mitochondrial genome was performed on a MiSeq instrument (Illuminа, USA). in the Shared Use Centre of the Research Institute of Medical Genetics, Tomsk National Research Centre of the Russian Academy of Sciences. The results obtained in BC patients were compared with those of control subjects.Results. In Sakha women with BC, 159 mitochondrial genome variants that differed from the human mitochondrial DNA (mtDNA) reference sequence (rCRS) were identified. Likely pathogenic variants m.3736G>A of the MT-ND1 gene and m.7279T>C of the MT-CO1 gene were shown to be associated with BC. For the first time, variants predisposing to BC (m.10398A>G; m.14783T>C; m.15043G>A; m.15301G>A) were identified. A distinctive feature of the mitochondrial genome of populations with a low BC incidence is a high level of mtDNA variants with changes in the length of the polycytosine region in the D310 locus.Conclusion. For the first time, mtDNA variants with changes in the length of the polycytosine tract in the D310 locus and likely pathogenic variants m.3736G>A of the MT-ND1 gene and m.7279T>C of the MT-CO1 gene were identified in Sakha BC women. The data obtained indicate that further studies on the role of the identified mtDNA variants in the development of BC using a larger sample of Sakha patients are required.Введение. Популяция саха (якуты) – коренное население Сибири, проживающее на территории Якутии, отличается одним из самых низких в мире уровнем заболеваемости раком молочной железы (РМЖ). Низкий уровень заболеваемости РМЖ коренного населения Якутии отмечен в ряде публикаций, но до настоящего времени причины этого явления не до конца выяснены. Следует отметить, что изучение факторов, снижающих риск заболевания РМЖ, имеет важное значение для его профилактики. По результатам ряда исследований, у якутов не обнаружено наследственных форм РМЖ, не найдено патогенных вариантов генов BRCA1/2, ассоциированных с наследственными синдромами РМЖ и рака яичника (РЯ). В связи с этим мы приняли решение сместить акцент на исследование митохондриального генома больных РМЖ саха методом секвенирования.Цель исследования – выявить варианты митохондриального генома, ассоциированные с РМЖ, у пациенток саха.Материал и методы. В исследование включено 14 пациенток саха с диагнозом РМЖ, средний возраст составил 49 лет. Выделение ДНК осуществляли методом фенол-хлороформной экстракции. ДНК-библиотеки готовили с помощью набора Nextera Flex (Illumina, США). Полногеномное секвенирование митохондриального генома выполнялось на приборе MiSeq (Illumina, США) на базе ЦКП Томского НИМЦ. Полученные результаты у больных РМЖ сравнивались с популяционным контролем.Результаты. У женщин саха, больных РМЖ, выявлено 159 вариантов митохондриального генома, отличающихся от референсной последовательностью митохондриальной ДНК (мтДНК) человека (rCRS). Показана ассоциация вероятно патогенных вариантов m.3736G>A гена МТ-ND1 и m.7279T>C гена MT-CO1 с РМЖ. Впервые выявлены варианты, предрасполагающие к РМЖ (m.10398A>G; m.14783T>C; m.15043G>A; m.15301G>A). Особенностью митохондриального генома популяций с низким уровнем заболеваемости РМЖ является высокий уровень вариантов мтДНК с изменением длины полицитозинового участка в локусе D310.Заключение. Впервые у женщин с РМЖ из популяции саха выявлены варианты мтДНК с изменением длины полицитозинового тракта в локусе D310 и вероятно патогенные варианты m.3736G>A гена МТ-ND1 и m.7279T>C гена MT-CO1. Полученные данные свидетельствуют о целесообразности дальнейшего изучения роли выявленных вариантов мтДНК в развитии РМЖ на расширенной выборке пациентов саха

Track E Implementation Science, Health Systems and Economics

Peer Reviewedhttps://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/138412/1/jia218443.pd