Bioinformatic analysis of characteristics and structure of the human genome: tracking the footprints of natural selection mediated by gene expression

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Élever et éveiller. Note de lecture sur Christophe Perrin (dir.), "Qu’appelle-t-on un séminaire? La pédagogie heideggérienne"

Note de lecture sur Christophe Perrin (dir.), Qu’appelle-t-on un séminaire? La pédagogie heideggérienne, Bucarest, Zeta Books, 2013, 262 page

La philosophie dépaysée ? L’héritage des sciences humaines selon Hans-Georg Gadamer

Lorsqu’on se rassemble, entre chercheurs, pour un ouvrage portant sur des thèmes aussi essentiels que l’« univers », le « sens de l’homme » ou la « vie », on attend bien plus que le simple échange de résultats de recherches. Un véritable dialogue devrait pouvoir s’établir, par-delà les terminologies et les particularités des domaines respectifs. Je pense ici à la recherche d’une langue commune dans laquelle pourrait s’articuler, se confronter et s’entendre ce que nous avons à dire sur la plac..

Cost optimization of protein synthesis in the human genome

EstanciasCasi la totalidad de las células en nuestro cuerpo contienen una copia de nuestro genoma. Los genes contienen la información necesaria para producir todas las proteínas que realizan todas las actividades en la célula. Enfermedades como el cáncer o defectos hereditarios pueden resultar de errores en la secuencia de los genes. Hoy a más de 50 años del descubrimiento de la estructura del ADN, los investigadores cuentan con la secuencia completa del genoma humano. En contraste, el conocimiento acerca de la organización del genoma y la función de los genes es muy pobre. Dado que el tamaño de la población de las especies de mamíferos es reducida, generalmente se asume que la fuerza de la selección natural es relativamente débil. A continuación se presentan los resultados más recientes que evalúan esta hipótesis. La comparación de los niveles de actividad con las características físicas (como su longitud o composición) de los genes, ha revelado que aquellos genes con mayor actividad tienen características peculiares. Estas observaciones se cuentan entre las primeras en mostrar que las secuencias génicas muestran patrones consistentes con la acción de la selección natural para aumentar la eficiencia de la síntesis de proteínasVirtually all cells in our body hold a complete copy of the genome. The 35000 human genes contained in the genome are required to produce all the proteins in the cell allowing us to carry out the activities of our daily lives. If our genes go wrong then diseases such as cancer might develop or inherited defects past on to future generations. On the 50th anniversary of the discovery of the DNA structure, the human genome sequence has already been cracked. Still very little is known about its organization and the function of most genes it contains. It is usually assumed that selection mediated by expression is a weak force in determining gene characteristics in humans. Here we present recent evidence of a relationship between physical characteristics of genes with levels of activity in human genes. We found that highly active genes tend to be smaller and have a particular nucleotide composition compared to other genes of lower activity. Together these results constitute the first systematic studies to show that gene sequences in mammalian genomes show signatures consistent with the action of natural selection to increase efficiency of protein synthesi

Développement de nouvelles réactions catalysées à l'or pour la synthèse organique

Homogeneous gold catalysis has become in only a few years a very active research field. As part of my PhD research activities, I have developed a series of new methodologies based on the pronounced carbophilicity of gold(I) complexes. These transformations are based on the activation of alkynes by a catalytic amount of an electrophilic gold(I) complexe in order to trigger their funcitonalization either by the nucleophilic addition of carbon nucleophiles such as alkenes, alkynes, or aromatics, or the addition of heteoatoms such as oxygen. Notably gold(I) complexes have proved to be efficient for a series of transformations which are known to be difficult such as the transfer of an hydride onto an alkyne.La chimie organique est toujours à la conquête de nouveaux terrains. Ces dix dernières années, la catalyse homogène par des espèces électrophiles d'or(I) et d'or(III) subit un fort développement. Ces espèces ont une réactivité d'acide de Lewis très prononcée, et peuvent notamment activer des insaturations carbonées telles que des alcènes, des allènes ou des alcynes. Ce manuscrit détaillera plusieurs transformations qui utilisent la réactivité de ces complexes. Ces réactions sont basées sur l'activation électrophile de groupements alcynes par un complexe d'or(I) ce qui permet leur fonctionnalisation par l'addition de nucléophiles variés. Ces nucléophiles peuvent être un hétéroatome, une oléfine, une fonction alcyne ou un noyau aromatique. L'activation électrophile des fonctions alcynes a également permis l'initiation d'un transfert d'hydrure formel 1,5