Divide and conquer: a review of methods to partition the regional species diversity into its alpha and beta components

Hace más de medio siglo Robert Whittaker propuso que la diversidad regional (diversidad γ) podía ser dividida en dos componentes: α y β. A lo largo de los años surgieron dos formas básicas para relacionar estos tres componentes de la diversidad de especies: un método aditivo y otro multiplicativo. Ambos métodos de partición difieren en sus propiedades, expresiones e interpretaciones, y cada vez son más utilizados para analizar los patrones de diversidad α y β a través de múltiples escalas. Recientemente se han generado contribuciones importantes sobre las propiedades, usos y limitaciones de estos métodos de partición de la diversidad. El propósito de este trabajo es revisar la evolución de los conceptos de partición de la diversidad y en sus componentes α y β, a través de sus formas aditiva y multiplicativa, haciendo una síntesis del marco conceptual y metodológico de ambas aproximaciones. Además, se plantea un ejemplo hipotético de aplicación de ambos métodos en un diseño jerárquico a través de varias escalas para explicar el significado biológico de los valores obtenidos. El método de partición multiplicativo de la diversidad es el que debe usarse si los objetivos del estudio son medir la diversidad verdadera de especies, mientras que el método aditivo puede ser útil para medir la diferenciación absoluta entre comunidades con unidades fácilmente entendibles. Los métodos de partición de la diversidad son una parte importante del estudio de la diversidad en paisajes heterogéneos, y sus resultados pueden ser utilizados para la toma de decisiones en biología de la conservación.More than half a century ago Whittaker proposed that the regional diversity (γ) could be divided into two components: α and β. Over the years two basic ways to relate these three compontens of species diversity emerged: an additive and a multiplicative method. Both methods of diversity partitioning differ in their properties, expressions and interpretations, and have been increasingly used to analyze patterns of α and β diversity across multiple scales. Recently, important contributions have been generated on the properties, uses and limitations of these methods. The purpose of this paper is to review the evolution of the concepts of partitioning gamma diversity components, through additive and multiplicative forms, making a synthesis of the conceptual and methodological framework of both approaches. As a conclusion, if the aim of the study is to measure the true diversity, we should use the multiplicative diversity partitioning method. Diversity partitioning methods are an important part of the study of diversity in heterogeneous landscapes, and its results can be used for decision making in conservation biology.Fil: Pereyra, Laura Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - CONICET - Jujuy; Argentina;Fil: Moreno, Claudia E.. Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo. Instituto de Ciencias Básicas e Ingeniería. Centro de Investigaciones Biológicas; México

Living up to their name: Profamilia takes on gender-based violence

This issue of Quality/Calidad/Qualité describes the evolution of Profamilia through its work on gender-based violence in the Domincan Republic.Their project was conceived along two simultaneous paths: providing support services directly to women and girls who had experienced violence and initiating advocacy in the wider policy arena. Profamilia joined the commission that ultimately designed and promoted a law to increase protection against violence, especially domestic violence against women and children. Although the clinics now run a dynamic service program, the agency has also sustained its advocacy activities. Most of Profamilia’s advocacy work is undertaken in partnership with other NGOs or with government agencies and has converted the organization from a family planning organization to a sexual and reproductive health organization that truly serves women

Insecticidal features displayed by the beneficial rhizobacterium Pseudomonas chlororaphis PCL1606

The biocontrol rhizobacterium Pseudomonas chlororaphis is one of the bacterial species of the P. fuorescens group where insecticide ft genes have been found. Fit toxin, supported with other antimicrobial compounds, gives the bacterial the ability to repel and to fght against eukaryotic organisms, such as nematodes and insect larvae, thus protecting the plant host and itself. Pseudomonas chlororaphis PCL1606 is an antagonistic rhizobacterium isolated from avocado roots and show efcient biocontrol against fungal soil-borne disease. The main antimicrobial compound produced by P. chlororaphis PCL606 is 2-hexyl-5-propyl resorcinol (HPR), which plays a crucial role in efective biocontrol against fungal pathogens. Further analysis of the P. chlororaphis PCL1606 genome showed the presence of hydrogen cyanide (HCN), pyrrolnitrin (PRN), and homologous ft genes. To test the insecticidal activity and to determine the bases for such activity, single and double mutants on the biosynthetic genes of these four compounds were tested in a Galleria mellonella larval model using inoculation by injection. The results revealed that Fit toxin and HPR in combination are involved in the insecticide phenotype of P. chlororaphis PCL1606, and additional compounds such as HCN and PRN could be considered supporting compoundsOpen Access funding provided thanks to the CRUE-CSIC agreement with Springer Nature. Funding for open access charge: Universidad de Málaga / CBUA. This work was supported by the research project AGL2017-83368-CO2-1-R of Ministerio de Ciencias y Tecnología, and the project UMA-FEDERJA-046 of Junta de Andalucía

El biocontrol de Pseudomonas chlororaphis PCL1606 es debido al compuesto antifúngico producido por los genes dar

XXIV Congreso de Microbiología SEMPseudomonas chlororaphis PCL1606 es una rizobacteria con capacidad de biocontrol frente a Rosellinia necatrix, agente causal de la podredumbre radicular blanca y Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycorpersici, que causa la podredumbre de cuello y raices de las plantas de tomate. Esta bacteria se caracteriza por la producción del antibiótico antifúngico 2-hexil, 5-propil resorcinol (HPR). Para determinar las bases genéticas de la producción de HPR en P. chlororaphis PCL1606, se rastreó una genoteca genómica de PCL1606 empleando como sonda los genes dar decritos previamente como responsables de la producción de HPR en P. aurantica BL915. Tras el análisis, se aisló el plásmido pCGNOV-1, que contenía un clon genómico con la presencia de cinco genes homólogos a los genes dar. Para determinar el papel de cada uno de los genes homólogos a los genes dar en la producción de HPR y su capacidad de biocontrol, se llevó a cabo la construcción de una colección de mutantes dirigidos en la producción de HPR por inserción. Además se obtuvieron los correspondientes complementantes de los mutantes defectivos. Sobre estos mutantes y sus respectivos complementates, se realizó una caracterización fenótipica de las propiedades relacionadas con el biocontrol, entre ellas la capacidad de antagonismo frente a Rosellina necatrix y Fusarium oxysporum, la producción de antibióticos y ensayos de control biológico en los sistemas experimentales aguacate-Rosellinia y tomate-Fusarium. Los resultados obtenidos muestran que los genes darA, darB pierden la capacidad de producir HPR. Esta propiedad queda restaurada al complementar cada uno de los mutantes con sus respectivos genes. Estos genes darA y darB junto con el gen darR, estan involucrados en la capacidad de biocontrol de la cepa silvestre P. fluorescens PCL1606. En conclusión, la capacidad de biocontrol de la cepa P. chlororaphis PCL1606 depende de la producción de HPR, llevada a cabo por los genes dar. Esta investigación ha sido apoyada por el Proyecto GL2011-30345-C02-01 (MICINN, España). CE Calderón recibió el apoyo de una beca de FPI, MICINN, España

Interacciones multitrófica en la rizosfera de aguacate de la cepa de biocontrol pseudomonas chlororaphis PCL1606 con el hongo fitopatógeno rosellinia necatrix CH53

Pseudomonas pseudoalcaligenes AVO110 es un agente de biocontrol frente a la podredumbre radicular blanca causada por Rosellinia necatrix, seleccionado por su eficiente capacidad de colonizar de forma competitiva las puntas radiculares de plantas de aguacate, así como por su actividad antagonista in vitro frente a este patógeno. Su principal mecanismo de biocontrol se basa tanto en la competición por nicho y nutrientes, como en la colonización competitiva de las hifas de R. necatrix, alimentándose de metabolitos fúngicos. Para detectar genes de AVO110 implicados en su multiplicación y supervivencia en presencia de exudados fúngicos, se analizó una colección de mutantes, de entre los cuales, 26 mostraron un crecimiento atenuado (Growth Attenuated Mutants, mutantes GAM). Los mutantes GAM-22, GAM-24 y GAM-26, afectados en genes codificadores de una exodeoxirribonuclesa, una histidina kinasa y un regulador transcripcional, respectivamente, mostraron un defecto en la capacidad de colonización de las raíces de plantas de aguacate con respecto a la cepa silvestre. Sin embargo, el mutante GAM-3, afectado en una proteína con dominios GGDEF/EAL/PAS, mostró una mayor capacidad de colonización de la rizosfera. Finalmente, los mutantes GAM-3 y GAM-26 también mostraron un incremento en la formación de biopelícula in vitro en comparación con la cepa silvestre. *Este trabajo ha sido financiado por el MINECO (AGL-2011-30354-C02-01) y por la Junta de Andalucía (P10-AGR.5797), cofinanciados por el Fondo Social Europeo.*Este trabajo ha sido financiado por el MINECO (AGL-2011-30354-C02-01) y por la Junta de Andalucía (P10-AGR.5797), cofinanciados por el Fondo Social Europeo. Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

Alpha and beta phylogenetic diversities jointly reveal ant community assembly mechanisms along a tropical elevational gradient

Despite the long-standing interest in the organization of ant communities across elevational gradients, few studies have incorporated the evolutionary information to understand the historical processes that underlay such patterns. Through the evaluation of phylogenetic α and β-diversity, we analyzed the structure of leaf-litter ant communities along the Cofre de Perote mountain in Mexico and evaluated whether deterministic- (i.e., habitat filtering, interspecific competition) or stochastic-driven processes (i.e., dispersal limitation) were driving the observed patterns. Lowland and some highland sites showed phylogenetic clustering, whereas intermediate elevations and the highest site presented phylogenetic overdispersion. We infer that strong environmental constraints found at the bottom and the top elevations are favoring closely-related species to prevail at those elevations. Conversely, less stressful climatic conditions at intermediate elevations suggest interspecific interactions are more important in these environments. Total phylogenetic dissimilarity was driven by the turnover component, indicating that the turnover of ant species along the mountain is actually shifts of lineages adapted to particular locations resembling their ancestral niche. The greater phylogenetic dissimilarity between communities was related to greater temperature differences probably due to narrow thermal tolerances inherent to several ant lineages that evolved in more stable conditions. Our results suggest that the interplay between environmental filtering, interspecific competition and habitat specialization plays an important role in the assembly of leaf-litter ant communities along elevational gradients

Stability properties of black holes in self-gravitating nonlinear electrodynamics

We analyze the dynamical stability of black hole solutions in self-gravitating nonlinear electrodynamics with respect to arbitrary linear fluctuations of the metric and the electromagnetic field. In particular, we derive simple conditions on the electromagnetic Lagrangian which imply linear stability in the domain of outer communication. We show that these conditions hold for several of the regular black hole solutions found by Ayon-Beato and Garcia.Comment: 15 pages, no figure

Escarabajos coprófagos de la cuenca alta y media del río Bita, Vichada, Colombia

Se realizó la caracterización del ensamblaje de escarabajos coprófagos en la cuenca alta y media del río Bita, en el marco de la alianza interinstitucional por el “Río Bita, protegido”. Los escarabajos fueron recolectados con trampas de caída, en 4 localidades del departamento del Vichada, entre enero y junio de 2016. El conjunto de datos contiene 1904 registros procedentes de la revisión de 6253 especímenes, depositados en la colección del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (Instituto Humboldt). Un total de 17 géneros y 34 especies son reportadas para el río Bita; 15 especies con epíteto específico completo y 19 especies con código único de morfoespecie (12 códigos previamente establecidos en la colección de referencia del Instituto Humboldt (CRECC) y 7 nuevas codificaciones, con base en el estudio de los caracteres morfológicos incluyendo la genitalia del macho). Hasta la fecha no se contaba con información sobre la riqueza de escarabajos coprófagos de la cuenca del río Bita, por lo que estos resultados se consideran los primeros registros de este grupo taxonómico en el extremo nororiental del territorio nacional y aportan a la línea base para la declaratoria del río Bita bajo la figura del primer río protegido de Colombia

Escarabajos coprófagos de la cuenca alta y media del río Bita, Vichada, Colombia

The dung beetle assemblage of the upper and middle basin of the Bita River was characterized in the interinstitutional framework alliance of “Río Bita, protegido (protected Bita River)”. The beetles were collected with pitfall traps in 4 locations in the department of Vichada, Colombia between January and June 2016. The dataset contains 1904 records from the 6253 specimens inspected and deposited at the Research Institute of Biological Resources Alexander von Humboldt (IAvH). Seventeen genera and 34 species are reported for the Bita River; 15 species with complete scientific names and 19 species with single morphospecies code identifier (12 codes previously established in the reference collection of IAvH (CRECC) and 7 new codifications, based on the study of morphological characters including male genitalia). To date, there was no information on the dung beetles richness in the Bita River basin; these results are the first records of this taxonomic group in the northeastern part of the national territory, and thus contribute to the construction of the baseline for the declaration of the Bita River as the first protected river of Colombia.Se realizó la caracterización del ensamblaje de escarabajos coprófagos en la cuenca alta y media del río Bita, en el marco de la alianza interinstitucional por el “Río Bita, protegido”. Los escarabajos fueron recolectados con trampas de caída, en 4 localidades del departamento del Vichada, entre enero y junio de 2016. El conjunto de datos contiene 1904 registros procedentes de la revisión de 6253 especímenes, depositados en la colección del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (Instituto Humboldt). Un total de 17 géneros y 34 especies son reportadas para el río Bita; 15 especies con epíteto específico completo y 19 especies con código único de morfoespecie (12 códigos previamente establecidos en la colección de referencia del Instituto Humboldt (CRECC) y 7 nuevas codificaciones, con base en el estudio de los caracteres morfológicos incluyendo la genitalia del macho). Hasta la fecha no se contaba con información sobre la riqueza de escarabajos coprófagos de la cuenca del río Bita, por lo que estos resultados se consideran los primeros registros de este grupo taxonómico en el extremo nororiental del territorio nacional y aportan a la línea base para la declaratoria del río Bita bajo la figura del primer río protegido de Colombia