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Recherche de marqueurs génétiques et évaluation de la variabilité génétique dans le cadre d'un programme de sélection de l'hußtre plate Ostrea edulis au parasite Bonamia ostrea
Dans le cadre du projet de relance de l'huĂźtre plate en France, projet menĂ© par l'IFREMER et soutenu par les rĂ©gions Bretagne et Poitou-Charentes, un programme de sĂ©lection pour la recherche de rĂ©sistance au Bonamia ostreae, protozoaire parasite ayant entraĂźnĂ© une diminution importante des stocks cultivĂ©s, a Ă©tĂ© engagĂ© Ă partir de 1985. Deux populations ont ainsi Ă©tĂ© sĂ©lectionnĂ©es et prĂ©sentent maintenant des signes de rĂ©sistance (ou de tolĂ©rance) accrue par rapport aux tĂ©moins du milieu naturel. Dans le cadre de ce programme, l'identification de marqueurs molĂ©culaires a Ă©tĂ© initiĂ©e Ă partir d'octobre 1993 (Naciri et al, 1995). Mon sujet de thĂšse s'inscrit dans cette continuitĂ©. Mon travail s'articule en 2 parties: - Dans un premier temps, la recherche de marqueurs molĂ©culaires du gĂ©nome, essentiellement marqueurs microsatellites, basĂ©s sur l'utilisation de sondes monolocus pour des sĂ©quences correspondant Ă la rĂ©pĂ©tition en tandem, et en n exemplaires, de deux paires de bases (par exemple (CA)n/(TG)n). Ces marqueurs sont potentie\1ement neutres, rĂ©partis dans tout le gĂ©nome et en gĂ©nĂ©ral fortement polymorphes. - Dans un deuxiĂšme temps, leur utilisation dans le cadre du programme de sĂ©lection: âą En Ă©valuant le taux de polymorphisme prĂ©sent dans les populations sĂ©lectionnĂ©es. âą En dĂ©butant une cartographie du gĂ©nome de l'huĂźtre plate Ostrea edulis. En raison du nombre trĂšs important de marqueurs nĂ©cessaires pour un tel travail, l'objectif sera rĂ©duit Ă la mise en Ă©vidence de groupes de liaison. âą En recherchant un Ă©ventuel marqueur de la rĂ©sistance et/ou tolĂ©rance Ă la bonamiose par l'analyse d'individus de structures familiales appropriĂ©es ("F2" issues de croisement entre populations rĂ©sistantes et populations sensibles). Au terme d'un an et demi de travail, les rĂ©sultats portent sur deux points: âą Production du matĂ©riel biologique. L'essentiel du matĂ©riel biologique nĂ©cessaire Ă cette Ă©tude, Ă savoir principalement les nouvelles gĂ©nĂ©rations de sĂ©lection et leur tĂ©moin, ainsi que les familles prĂ©vues pour la recherche d'un marqueur de rĂ©sistance, a Ă©tĂ© produit Ă l'Ă©c\oserie de La Tremblade et est actuellement en Ă©levage dans diffĂ©rentes stations (La Tremblade, Bouin, La TrinitĂ© sur Mer). La menace d'HerpĂšs virus qui pĂšse sur ces lots n'est cependant pas Ă©cartĂ©e. âą Recherche de marqueurs. Un sĂ©jour de 4 mois au Laboratoire GĂ©nome et Populations, dans le cadre de l'URM N° 16, a permis la rĂ©alisation d'une nouvelle banque gĂ©nomique partielle d'Ostrea edulis. L'exploitation de cette banque a conduit Ă l'identification de 33 nouveaux microsatellites, qui s'ajoute aux 12 identifiĂ©s par Naciri et al (1995). Les premiers essais d'amplification laisse espĂ©rer qu'une vingtaine au moins de marqueurs de ce type pourront ĂȘtre utilisĂ©s en routine. Les projets d'Ă©valuation de la variabilitĂ© gĂ©nĂ©tique et surtout de cartographie de liaison s'en trouvent consolidĂ©s
Quelle gestion génétique de la domestication chez les poissons ?
National audienceSince 1950, the number of fish species used in aquaculturehas increased from 42 to 186. Due to this greatdiversity, to the fact that most species have been bredfor a short time, and to the existence of wild geneticresources, domestication is a recurring question inaquaculture development. Genetic aspects of domesticationrelate to two main aspects : the initial setup ofbreeding techniques and creation of stocks, and themanagement of populations across generations, to provideboth production efficiency and animal welfare.Concerning the first aspect, the scarce existing studiesshow that it might be difficult to draw conclusionsregarding the ability of a particular population toadapt to a captive environment, based only on geneticvariability at neutral markers or on ecological observationsin the wild. A strain evaluation program may beconducted prior to the start of the breeding program. Itmust however be done under controlled conditions, asclose as possible to the future breeding conditions. Inany case, it is advisable to start the domestication processfrom a population with a large genetic basis, andto manage it in order to maintain suitable levels ofgenetic variability across generations. The domesticationprocess leads to important changes in many physical,ethological and/or physiological traits, but thegenetic mechanisms of these changes are not alwayscontrolled. It could be however possible to direct theevolution of adaptive traits, through targeted selectivebreeding programs.Depuis 1950, le nombre dâespĂšces de poissons en production est passĂ©e de 42 Ă 186. La grande diversitĂ© des espĂšces concernĂ©es, le caractĂšre rĂ©cent de la mise en Ă©levage et lâexistence de ressources gĂ©nĂ©tiques sauvages pour la plupart des espĂšces font de la domestication une question rĂ©currente en aquaculture. Les aspects gĂ©nĂ©tiques de la domestication concernent deux aspects majeurs : la phase de mise au point des Ă©levages et de crĂ©ation des souches de dĂ©part, et la gestion des populations au cours de lâĂ©levage pour assurer Ă la fois lâefficacitĂ© de la production et le bien-ĂȘtre du poisson. Pour le premier aspect, les Ă©tudes existantes, peu nombreuses, indiquent quâil est sans doute difficile de conclure sur les aptitudes dâune souche particuliĂšre Ă lâadaptation aux conditions dâĂ©levage sur la simple base de sa variabilitĂ© gĂ©nĂ©tique aux marqueurs neutres ou dâobservations Ă©cologiques en milieu naturel. Un testage de souche peut ĂȘtre pratiquĂ© avant la mise en Ă©levage, mais, pour ĂȘtre pertinent, il doit ĂȘtre rĂ©alisĂ© en conditions contrĂŽlĂ©es, les plus proches possibles des conditions rĂ©elles dâĂ©levage. Dans tous les cas, le choix dâune souche de dĂ©part ayant une base gĂ©nĂ©tique la plus large possible et une bonne gestion des reproductions permet dâassurer le maintien de la variabilitĂ© gĂ©nĂ©tique au cours des gĂ©nĂ©rations. Le processus de domestication sâaccompagne de modifications dâun grand nombre de caractĂšres, mais dont les mĂ©canismes gĂ©nĂ©tiques ne sont pas toujours maĂźtrisĂ©s. Il pourrait cependant ĂȘtre possible dâorienter volontairement lâĂ©volution des caractĂšres dâadaptation au milieu dâĂ©levage, Ă lâaide de programmes de sĂ©lection artificielle dirigĂ©s
Former des enseignants dans un contexte plurilingue et pluriculturel.
Longtemps refusĂ©e au nom de l'Ă©galitarisme rĂ©publicain, qui cachait bien mal une vraie myopie intellectuelle, la rĂ©flexion sur les spĂ©cificitĂ©s du contexte guyanais fait, depuis quelques annĂ©es, l'objet d'une maturation lente mais consciente et convergente de divers acteurs et du systĂšme Ă©ducatif . C'est dans cette dĂ©marche intellectuelle que prend place le prĂ©sent article, qui dressera un profil des professeurs des Ă©coles en Guyane ainsi qu'un Ă©tat des lieux de la formation des enseignants dans le dĂ©partement. Il en dĂ©coulera une rĂ©flexion didactique sur les compĂ©tences Ă viser dans un contexte d'enseignement plurilingue et pluriculturel, ainsi que des propositions axĂ©es sur le contexte d'exercice des professeurs des Ă©coles (P. E.) en Guyane1. Ces propositions aboutissent, pour conclure, Ă l'Ă©laboration d'un rĂ©fĂ©rentiel de compĂ©tences, ainsi qu'Ă des suggestions concernant les contenus de formation, en direction des PE exerçant en Guyane. Le rĂ©fĂ©rentiel s'organise en trois volets, l'un sociolinguistique, l'autre linguistique, l'autre enfin didactique. Il dĂ©cline pour chacun de ces trois domaines des savoirs, savoir-faire et savoir-ĂȘtre dont nous considĂ©rons qu'ils reprĂ©sentent des minima dans les compĂ©tences Ă mettre en Ćuvre pour un enseignant de primaire dans le dĂ©partement
Former des enseignants dans un contexte plurilingue et pluriculturel
Introduction Beaucoup de chercheurs et dâenseignants ayant exercĂ© en Guyane peuvent tĂ©moigner de lâexpĂ©rience suivante : ils se trouvent en mĂ©tropole, face Ă des collĂšgues ou Ă des membres de leur hiĂ©rarchie Ă qui ils tentent dâexpliquer la nature et lâampleur des problĂšmes de lâĂ©ducation dans le contexte guyanais, et leur discours ne passe pas. Leurs interlocuteurs tendent toujours Ă ramener la question Ă un retard historique, ou, le plus souvent, Ă la problĂ©matique des langues rĂ©gionales mĂ©..
Variabilité génétique des écotypes sympatriques migrateurs et sédentaires de truite commune (Salmo trutta L.) des lacs alpins
*INRA Laboratoire de génétique des poissons 78352 Jouy-en-Josas (FRA) Diffusion du document : INRA Laboratoire de génétique des poissons 78352 Jouy-en-Josas (FRA)National audienc
Isolation and characterization of microsatellite loci from chub Leuciscus cephalus (Pisces : Cyprinidae)
International audienceTwelve microsatellite markers were isolated from chub Leuciscus cephalus Linné, 1766 (Cyprinidae), a freshwater fish widely distributed in Europe. We assessed the level of genetic diversity for these loci in 24 individuals sampled in the Rhone river watershed. Nine loci were polymorphic, displaying from two to 13 alleles per locus with expected heterozygosity ranging from 0.160 to 0.887. Simultaneous migration of different polymerase chain reaction products was developed for routine analysis of L. cephalus population
Ecotypes sympatriques migrateurs et sédentaires de truite commune (Salmo trutta L.) : différentiation génétique et effet des repeuplements
National audienceSympatric lake-run and resident brown trout (Salmo trutta L.) populations:genetic differenciation and stocking impact. This project aims to investigate the genetic diversity of sympatric lake-run migrant and resident populations of brown trout (Salmo trutta L.) in subalpine lakes. The area studied is the Lac LĂ©man basin, where the wild populations belong to the main two evolutionary lineages of the species: the Mediterranean lineage (natural, ancient origin) and the Atlantic lineage (recent origin through restocking with hatchery individuals, but maybe also natural, ancient origin through migrations from the Rhine basin, during the Quaternary glaciations). Seven tributaries of the Lac LĂ©man (in France and Switzerland), where both ecotypes (lake-run and resident) were present in sympatry, were sampled. The genetic variability was analysed using 9 molecular markers (among which 3 were specific of the two lineages). There is no significant correlation between the evolutionary linage where a population belongs to, and its migratory behaviour. Actually, most of the populations, either migrant or resident, have a majority of alleles of Atlantic origin. Resident populations are genetically closer to hatchery populations (used for restocking) than migrant populations. One hypothesis is that hatchery individuals that become migrants do not survive well in a fluctuating environment such as met by migrating populations. Both recent and ancient origin would then be present, the resident populations being more introgressed by hatchery individuals than the lake-run migrant populations. The analysis of historical samples (scales) will help clarifying the origin of Atlantic alleles, and the impact of restocking events on the temporal evolution of Atlantic alleles frequencies.Le projet vise Ă analyser la diversitĂ© gĂ©nĂ©tique de populations sympatriques migratrices et sĂ©dentaires de truite (Salmo trutta) en systĂšme lacs subalpins-affluents. La zone retenue est celle du Lac LĂ©man, oĂč les populations se rattachent Ă deux rameaux Ă©volutifs majeurs de lâespĂšce : le rameau mĂ©diterranĂ©en (dâorigine naturelle) et le rameau atlantique (dâorigine rĂ©cente via le repeuplement mais peut-ĂȘtre Ă©galement ancienne via des migrations de populations depuis le bassin du Rhin). Sept affluents suisses et français prĂ©sentant les deux Ă©cotypes (migrateur et sĂ©dentaire) en sympatrie ont Ă©tĂ© Ă©chantillonnĂ©s, et la variabilitĂ© gĂ©nĂ©tique analysĂ©e Ă lâaide de 9 marqueurs molĂ©culaires (dont 3 spĂ©cifiques des deux rameaux Ă©volutifs). Les rĂ©sultats montrent quâil nây a pas de corrĂ©lation entre rameau dâorigine et Ă©cotype, les populations se rattachant toutes trĂšs majoritairement au rameau atlantique. Par contre, les populations sĂ©dentaires sont gĂ©nĂ©tiquement plus proches des populations de piscicultures (utilisĂ©es pour le repeuplement) que les populations migratrices. Une hypothĂšse serait que les individus de repeuplement sont contre-sĂ©lectionnĂ©s dans un environnement changeant, comme celui que rencontrent les populations migratrices. Il pourrait donc y avoir coexistence des deux origines atlantiques, les populations sĂ©dentaires Ă©tant plus introgressĂ©es par les individus de pisciculture, et les populations migratrices ayant davantage conservĂ© des caractĂ©ristiques gĂ©nĂ©tiques ancestrales. Lâanalyse dâĂ©chantillons anciens devrait permettre de faire des hypothĂšses sur lâorigine prĂ©cise (repeuplement ou migration ancienne) des allĂšles atlantiques
Microsatellite genetic variation reveals extensive introgression between wild and introduced stocks, and a new evolutionary unit in French pike <em>(Exos lucius L.)</em>
National audienc
Colonization of a new environment by a migratory fish is conditioned by introduction history and landscape parameters: dispersion of the brown trout <em>(Salmo trutta L.)</em> in the Kerguelen islands
National audienc
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