Recherche de marqueurs génétiques et évaluation de la variabilité génétique dans le cadre d'un programme de sélection de l'huître plate Ostrea edulis au parasite Bonamia ostrea

Dans le cadre du projet de relance de l'huître plate en France, projet mené par l'IFREMER et soutenu par les régions Bretagne et Poitou-Charentes, un programme de sélection pour la recherche de résistance au Bonamia ostreae, protozoaire parasite ayant entraîné une diminution importante des stocks cultivés, a été engagé à partir de 1985. Deux populations ont ainsi été sélectionnées et présentent maintenant des signes de résistance (ou de tolérance) accrue par rapport aux témoins du milieu naturel. Dans le cadre de ce programme, l'identification de marqueurs moléculaires a été initiée à partir d'octobre 1993 (Naciri et al, 1995). Mon sujet de thèse s'inscrit dans cette continuité. Mon travail s'articule en 2 parties: -  Dans un premier temps, la recherche de marqueurs moléculaires du génome, essentiellement marqueurs microsatellites, basés sur l'utilisation de sondes monolocus pour des séquences correspondant à la répétition en tandem, et en n exemplaires, de deux paires de bases (par exemple (CA)n/(TG)n). Ces marqueurs sont potentie\1ement neutres, répartis dans tout le génome et en général fortement polymorphes. - Dans un deuxième temps, leur utilisation dans le cadre du programme de sélection: • En évaluant le taux de polymorphisme présent dans les populations sélectionnées. • En débutant une cartographie du génome de l'huître plate Ostrea edulis. En raison du nombre très important de marqueurs nécessaires pour un tel travail, l'objectif sera réduit à la mise en évidence de groupes de liaison. • En recherchant un éventuel marqueur de la résistance et/ou tolérance à la bonamiose par l'analyse d'individus de structures familiales appropriées ("F2" issues de croisement entre populations résistantes et populations sensibles). Au terme d'un an et demi de travail, les résultats portent sur deux points: • Production du matériel biologique. L'essentiel du matériel biologique nécessaire à cette étude, à savoir principalement les nouvelles générations de sélection et leur témoin, ainsi que les familles prévues pour la recherche d'un marqueur de résistance, a été produit à l'éc\oserie de La Tremblade et est actuellement en élevage dans différentes stations (La Tremblade, Bouin, La Trinité sur Mer). La menace d'Herpès virus qui pèse sur ces lots n'est cependant pas écartée. • Recherche de marqueurs. Un séjour de 4 mois au Laboratoire Génome et Populations, dans le cadre de l'URM N° 16, a permis la réalisation d'une nouvelle banque génomique partielle d'Ostrea edulis. L'exploitation de cette banque a conduit à l'identification de 33 nouveaux microsatellites, qui s'ajoute aux 12 identifiés par Naciri et al (1995). Les premiers essais d'amplification laisse espérer qu'une vingtaine au moins de marqueurs de ce type pourront être utilisés en routine. Les projets d'évaluation de la variabilité génétique et surtout de cartographie de liaison s'en trouvent consolidés

Quelle gestion génétique de la domestication chez les poissons ?

National audienceSince 1950, the number of fish species used in aquaculturehas increased from 42 to 186. Due to this greatdiversity, to the fact that most species have been bredfor a short time, and to the existence of wild geneticresources, domestication is a recurring question inaquaculture development. Genetic aspects of domesticationrelate to two main aspects : the initial setup ofbreeding techniques and creation of stocks, and themanagement of populations across generations, to provideboth production efficiency and animal welfare.Concerning the first aspect, the scarce existing studiesshow that it might be difficult to draw conclusionsregarding the ability of a particular population toadapt to a captive environment, based only on geneticvariability at neutral markers or on ecological observationsin the wild. A strain evaluation program may beconducted prior to the start of the breeding program. Itmust however be done under controlled conditions, asclose as possible to the future breeding conditions. Inany case, it is advisable to start the domestication processfrom a population with a large genetic basis, andto manage it in order to maintain suitable levels ofgenetic variability across generations. The domesticationprocess leads to important changes in many physical,ethological and/or physiological traits, but thegenetic mechanisms of these changes are not alwayscontrolled. It could be however possible to direct theevolution of adaptive traits, through targeted selectivebreeding programs.Depuis 1950, le nombre d’espèces de poissons en production est passée de 42 à 186. La grande diversité des espèces concernées, le caractère récent de la mise en élevage et l’existence de ressources génétiques sauvages pour la plupart des espèces font de la domestication une question récurrente en aquaculture. Les aspects génétiques de la domestication concernent deux aspects majeurs : la phase de mise au point des élevages et de création des souches de départ, et la gestion des populations au cours de l’élevage pour assurer à la fois l’efficacité de la production et le bien-être du poisson. Pour le premier aspect, les études existantes, peu nombreuses, indiquent qu’il est sans doute difficile de conclure sur les aptitudes d’une souche particulière à l’adaptation aux conditions d’élevage sur la simple base de sa variabilité génétique aux marqueurs neutres ou d’observations écologiques en milieu naturel. Un testage de souche peut être pratiqué avant la mise en élevage, mais, pour être pertinent, il doit être réalisé en conditions contrôlées, les plus proches possibles des conditions réelles d’élevage. Dans tous les cas, le choix d’une souche de départ ayant une base génétique la plus large possible et une bonne gestion des reproductions permet d’assurer le maintien de la variabilité génétique au cours des générations. Le processus de domestication s’accompagne de modifications d’un grand nombre de caractères, mais dont les mécanismes génétiques ne sont pas toujours maîtrisés. Il pourrait cependant être possible d’orienter volontairement l’évolution des caractères d’adaptation au milieu d’élevage, à l’aide de programmes de sélection artificielle dirigés

Former des enseignants dans un contexte plurilingue et pluriculturel.

Longtemps refusée au nom de l'égalitarisme républicain, qui cachait bien mal une vraie myopie intellectuelle, la réflexion sur les spécificités du contexte guyanais fait, depuis quelques années, l'objet d'une maturation lente mais consciente et convergente de divers acteurs et du système éducatif . C'est dans cette démarche intellectuelle que prend place le présent article, qui dressera un profil des professeurs des écoles en Guyane ainsi qu'un état des lieux de la formation des enseignants dans le département. Il en découlera une réflexion didactique sur les compétences à viser dans un contexte d'enseignement plurilingue et pluriculturel, ainsi que des propositions axées sur le contexte d'exercice des professeurs des écoles (P. E.) en Guyane1. Ces propositions aboutissent, pour conclure, à l'élaboration d'un référentiel de compétences, ainsi qu'à des suggestions concernant les contenus de formation, en direction des PE exerçant en Guyane. Le référentiel s'organise en trois volets, l'un sociolinguistique, l'autre linguistique, l'autre enfin didactique. Il décline pour chacun de ces trois domaines des savoirs, savoir-faire et savoir-être dont nous considérons qu'ils représentent des minima dans les compétences à mettre en œuvre pour un enseignant de primaire dans le département

Former des enseignants dans un contexte plurilingue et pluriculturel

Introduction Beaucoup de chercheurs et d’enseignants ayant exercé en Guyane peuvent témoigner de l’expérience suivante : ils se trouvent en métropole, face à des collègues ou à des membres de leur hiérarchie à qui ils tentent d’expliquer la nature et l’ampleur des problèmes de l’éducation dans le contexte guyanais, et leur discours ne passe pas. Leurs interlocuteurs tendent toujours à ramener la question à un retard historique, ou, le plus souvent, à la problématique des langues régionales mé..

Variabilité génétique des écotypes sympatriques migrateurs et sédentaires de truite commune (Salmo trutta L.) des lacs alpins

*INRA Laboratoire de génétique des poissons 78352 Jouy-en-Josas (FRA) Diffusion du document : INRA Laboratoire de génétique des poissons 78352 Jouy-en-Josas (FRA)National audienc

Isolation and characterization of microsatellite loci from chub Leuciscus cephalus (Pisces : Cyprinidae)

International audienceTwelve microsatellite markers were isolated from chub Leuciscus cephalus Linné, 1766 (Cyprinidae), a freshwater fish widely distributed in Europe. We assessed the level of genetic diversity for these loci in 24 individuals sampled in the Rhone river watershed. Nine loci were polymorphic, displaying from two to 13 alleles per locus with expected heterozygosity ranging from 0.160 to 0.887. Simultaneous migration of different polymerase chain reaction products was developed for routine analysis of L. cephalus population

Ecotypes sympatriques migrateurs et sédentaires de truite commune (Salmo trutta L.) : différentiation génétique et effet des repeuplements

National audienceSympatric lake-run and resident brown trout (Salmo trutta L.) populations:genetic differenciation and stocking impact. This project aims to investigate the genetic diversity of sympatric lake-run migrant and resident populations of brown trout (Salmo trutta L.) in subalpine lakes. The area studied is the Lac Léman basin, where the wild populations belong to the main two evolutionary lineages of the species: the Mediterranean lineage (natural, ancient origin) and the Atlantic lineage (recent origin through restocking with hatchery individuals, but maybe also natural, ancient origin through migrations from the Rhine basin, during the Quaternary glaciations). Seven tributaries of the Lac Léman (in France and Switzerland), where both ecotypes (lake-run and resident) were present in sympatry, were sampled. The genetic variability was analysed using 9 molecular markers (among which 3 were specific of the two lineages). There is no significant correlation between the evolutionary linage where a population belongs to, and its migratory behaviour. Actually, most of the populations, either migrant or resident, have a majority of alleles of Atlantic origin. Resident populations are genetically closer to hatchery populations (used for restocking) than migrant populations. One hypothesis is that hatchery individuals that become migrants do not survive well in a fluctuating environment such as met by migrating populations. Both recent and ancient origin would then be present, the resident populations being more introgressed by hatchery individuals than the lake-run migrant populations. The analysis of historical samples (scales) will help clarifying the origin of Atlantic alleles, and the impact of restocking events on the temporal evolution of Atlantic alleles frequencies.Le projet vise à analyser la diversité génétique de populations sympatriques migratrices et sédentaires de truite (Salmo trutta) en système lacs subalpins-affluents. La zone retenue est celle du Lac Léman, où les populations se rattachent à deux rameaux évolutifs majeurs de l’espèce : le rameau méditerranéen (d’origine naturelle) et le rameau atlantique (d’origine récente via le repeuplement mais peut-être également ancienne via des migrations de populations depuis le bassin du Rhin). Sept affluents suisses et français présentant les deux écotypes (migrateur et sédentaire) en sympatrie ont été échantillonnés, et la variabilité génétique analysée à l’aide de 9 marqueurs moléculaires (dont 3 spécifiques des deux rameaux évolutifs). Les résultats montrent qu’il n’y a pas de corrélation entre rameau d’origine et écotype, les populations se rattachant toutes très majoritairement au rameau atlantique. Par contre, les populations sédentaires sont génétiquement plus proches des populations de piscicultures (utilisées pour le repeuplement) que les populations migratrices. Une hypothèse serait que les individus de repeuplement sont contre-sélectionnés dans un environnement changeant, comme celui que rencontrent les populations migratrices. Il pourrait donc y avoir coexistence des deux origines atlantiques, les populations sédentaires étant plus introgressées par les individus de pisciculture, et les populations migratrices ayant davantage conservé des caractéristiques génétiques ancestrales. L’analyse d’échantillons anciens devrait permettre de faire des hypothèses sur l’origine précise (repeuplement ou migration ancienne) des allèles atlantiques

Microsatellite genetic variation reveals extensive introgression between wild and introduced stocks, and a new evolutionary unit in French pike <em>(Exos lucius L.)</em>

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Colonization of a new environment by a migratory fish is conditioned by introduction history and landscape parameters: dispersion of the brown trout <em>(Salmo trutta L.)</em> in the Kerguelen islands

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