The Pseudomonas aeruginosa biofilm matrix and cells are drastically impacted by gas discharge plasma treatment: A comprehensive model explaining plasma-mediated biofilm eradication

Biofilms are microbial communities encased in a protective matrix composed of exopolymeric substances including exopolysaccharides, proteins, lipids, and extracellular DNA. Biofilms cause undesirable effects such as biofouling, equipment damage, prostheses colonization, and disease. Biofilms are also more resilient than free-living cells to regular decontamination methods and therefore, alternative methods are needed to eradicate them. The use of non-thermal atmospheric pressure plasmas is a good alternative as plasmas contain reactive species, free radicals, and UV photons well-known for their decontamination potential against free microorganisms. Pseudomonas aeruginosa biofilms colonize catheters, indwelling devices, and prostheses. Plasma effects on cell viability have been previously documented for P. aeruginosa biofilms. Nonetheless, the effect of plasma on the biofilm matrix has received less attention and there is little evidence regarding the changes the matrix undergoes. The aim of this work was to study the effect plasma exerts mostly on the P. aeruginosa biofilm matrix and to expand the existing knowledge about its effect on sessile cells in order to achieve a better understanding of the mechanism/s underlying plasma-mediated biofilm inactivation. We report a reduction in the amount of the biofilm matrix, the loss of its tridimensional structure, and morphological changes in sessile cells at long exposure times. We show chemical and structural changes on the biofilm matrix (mostly on carbohydrates and eDNA) and cells (mostly on proteins and lipids) that are more profound with longer plasma exposure times. We also demonstrate the presence of lipid oxidation products confirming cell membrane lipid peroxidation as plasma exposure time increases. To our knowledge this is the first report providing detailed evidence of the variety of chemical and structural changes that occur mostly on the biofilm matrix and sessile cells as a consequence of the plasma treatment. Based on our results, we propose a comprehensive model explaining plasma-mediated biofilm inactivation.Fil: Soler Arango, Juliana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; ArgentinaFil: Fígoli, Cecilia Beatríz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; ArgentinaFil: Muraca, Giuliana Sabrina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; ArgentinaFil: Bosch, María Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; ArgentinaFil: Brelles Mariño, Graciela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentin

Espectroscopía nir como técnica exploratoria rápida para detección de amarillamiento hojas crisantemo (dendranthema grandiflora var. zembla) / nir spectroscopy as quick exploratory technique for detection of chrysanthemum leaf yellowing (dendranthema

Resumen. El diagnóstico seguro de enfermedades en lasplantas depende de técnicas costosas, que requieren de tiempo y entrenamiento especializado. Esta investigación evaluó el uso de espectroscopia infrarroja cercana NIR (por sus siglas en ingles near-infrared) para la detección rápida del “amarillamiento de hojas de crisantemo”, una enfermedad de etiología incierta que genera pérdidas económicas importantes. En este experimento se tomaron espectros infrarrojos en hojas con niveles de amarillamiento diferentes según la clasificación empleada por los agricultores (asintomáticas, síntomas intermedios y hojasdeformadas con síntomas avanzados). Mediante un análisis de componentes principales y con los valores de los espectros de esas muestras, se desarrolló un modelo de clasificación de hojas. Ese modelo aplicado en espectros de hojas tomados al azar separó adecuadamente el grupo de espectros NIR de hojas asintomáticas de un grupo indiferenciado de espectros obtenidos de hojas consíntomas intermedios o avanzados. Los resultados sugieren que para esta enfermedad es posible desarrollar un modelo de detección en muestras problema. Para ello, se requerirá incorporar al modelo un mayor número de muestras en rangos de enfermedad bien definidos. Estos resultados permiten vislumbrar las posibilidades del uso de esta técnica no destructiva, para detección temprana de los síntomas del amarillamiento foliar en crisantemo y como herramienta para el diseño de estrategias oportunas y efectivas demanejo de esta y otras enfermedades en las plantas. / Abstract. The safe diagnostic of plant diseases depends on expensive techniques which require time and specialized training. This study evaluated the use of near-infrared spectroscopy (NIR) for the rapid detection of “chrysanthemum leaf yellowing”, a disease of unknown etiology causing important economic losses in Antioquia’s chrysanthemum main producing areas. Spectral NIR data from intact leaves showing different levels of yellowing (healthy leaves, slightly deformed leaves or highly deformed leaves with advanced yellowing), used in conjunction with multivariate statistical analysis of NIR spectra, were used to build a descriptive model for chrysanthemum leaf yellowing classification. The descriptive model indicated the presence of two groups of NIR spectra belonging to asymptomatic or symptomatic leaves, with no further differentiation of NIR spectra from leaves showing mild or severe yellowing symptoms. Not without the drawbacks of a low number of NIR spectra, these results suggests that it is possible to develop a fast, accurate and nondestructive, spectroscopic based system to detect this disease on blind plant samples. Improvements to the sensitivity of this model in detecting multiple stages of this disease will depend on obtaining and adding new NIR leaf spectra obtained from clearly defined ratings of the disease. Due to its sensitivity and wide application, NIR spectroscopy appear to be a core technique to further develop new systems for the early detection of chrysanthemum leaf yellowing and other plant diseases. This in turn may result in the design of opportune and timely systems for plant disease control

Inactivación de biofilms de Pseudomonas aeruginosa mediante plasma frío a presión atmosférica

Los métodos convencionales de destrucción de bacterias en vida libre, tales como agentes antimicrobianos y desinfección, suelen ser inefectivos con bacterias que forman un biofilm. Por lo tanto, la capacidad de destruir estas estructuras demanda el desarrollo de nuevas técnicas.La hipótesis de trabajo es que el plasma de descarga de gases es útil para la inactivación de biofilms bacterianos. Como objetivo general, se espera dilucidar algunos de los aspectos del mecanismo o los mecanismos que explica/n la inactivación de biofilm por plasma. Resultados del grupo de la Dra. Brelles-Mariño en la Universidad del Estado de California demostraron la eficacia del plasma para la inactivación de biofilms. Sin embargo, poco se sabe acerca de los mecanismos que explican el fenómeno. Para que el método sea aplicable a distintos microorganismos y superficies, es preciso conocer las condiciones y los mecanismos a través de los cuales las bacterias son inactivadas. Además, en los experimentos preliminares se utilizó solo un sistema de producción de plasma y es posible que otros sean económicamente más ventajosos. En colaboración con los Dres. Kelly y Grondona (INFIP- UBA/CONICET) se desarrolló una fuente de plasma que opera en aire comprimido y se probó con los biofilms de Pseudomonas aeruginosa. Los objetivos específicos de este trabajo son: 1) Estudiar la adhesión de biofilms bacterianos en distintas superficies abióticas y condiciones de crecimiento. 2) Estudiar la arquitectura de los biofilms bacterianos en combinaciones selectas superficie abiótica-condición de crecimiento. 3) Estudiar la cinética de inactivación de biofilms luego del tratamiento con plasma. 4) Estudiar la fisiología del biofilm luego del tratamiento con plasma. 5) Evaluar el efecto del plasma frío a presión atmosférica sobre la penetración de antibióticos en biofilms de P. aeruginosa.Fil: Soler Arango, Juliana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentin

Selección y evaluación de microorganismos promisorios para el biocontrol del patógeno Spongospora subterranea, causante de la sarna polvosa de la papa.

Spongospora subterranea f. sp. subterranea es un patógeno obligado que se replica en raíces y tubérculos de papa, causando la enfermedad conocida como sarna polvosa de la papa en las principales zonas productoras del mundo. Debido a la falta de tratamientos efectivos contra este patógeno y al comercio de tubérculos-semilla infectados, esta enfermedad disminuye el crecimiento de la planta, el área foliar efectiva y la producción hasta un 40%. El control biológico de patógenos del suelo con otros microorganismos ha sido ampliamente estudiado y puede tener un papel muy importante sobre el control de enfermedades de la papa. En esta investigación inicialmente se aislaron microorganismos y se estimó la biodiversidad en el interior de las raíces, la rizósfera, el suelo y la superficie de tubérculos de plantas de papa Solanum tuberosum variedad Diacol Capiro. Para seleccionar aislamientos con potencial biocontrolador y con capacidad promotora de crecimiento vegetal, a las bacterias se les evaluó la producción de indoles totales y de quitinasas. La mayor producción de indoles totales y quitinasas se encontró en bacterias aisladas a partir de raíz y rizósfera, comparada con las aisladas de tubérculos y suelo. A nueve aislamientos bacterianos con producción de diferentes niveles de indoles totales se les evaluó en el laboratorio la capacidad para incrementar el crecimiento de brotes en tubérculos de papa (Solanum tuberosum); se encontró que la mayoria de bacterias seleccionadas presentaron incremento en la longitud del brote de los tubérculos. En un estudio paralelo en invernadero y en macetas con suelo altamente infestado con quistosoros de Spongospora subterranea se realizó un ensayo de estimulación de crecimiento vegetal y biocontrol del patógeno por diez bacterias productoras de indoles totales y/o quitinasas en plántulas de papa variedad Diacol Capiro; se encontró que dos aislamientos incrementaron el crecimiento de las plantas. Pruebas serológicas con raíces sugirieron biocontrol de la enfermedad por algunos aislamientos./Abstract.Spongospora subterranea f. sp. Subterranea is an obligated pathogen that replicates in potatoes roots and tubers. This pathogen causes the powdery scab disease of potato in the main producing regions of the world, because there is not a completely effective and available control method against the disease, and due to the trading of infested seed tubers. This disease reduces plant growth, effective leaf area and yield up to a 40%. The biological control of soilborne pathogens using other microorganisms has been widely studied and it could have an important role on the control of potato diseases. Along this research, in a first study, culture media were prepared for isolation and diversity estimation of microorganisms from inside the roots, rhizosphere, tuber peel or bulk soil of potato plants (Solanum tuberosum var.Diacol Capiro). In a second study, in order to select potential biocontrol and plant growth-promoting bacteria, the collection of bacterias was tested for total indoles production and chitinases. Bacterias isolated from inside the roots and rhizosphere, showed the highest production of total indoles and chitinases compared to microorganisms isolates from tuber peel and bulk soil Finally, in the third study nine bacterial isolates at the extreme range of these PGPR activities were tested for its capacity to stimulate excised tubers sprout length (Solanum tuberosum), it was found that most of the selected strains producing of total indoles, showed an increase in the length of the tubers sprouts. In parallel study in the greenhouse, ten bacterial isolates at the extreme range of these PGPR activities were tested for its capacity promote potato plantlets growth and biocontrol in a soil heavily infested with Spongospora subterranea; it was found that two isolates showed plant growth promotion and some potential biocontrol or mitigation of the disease. In general, these results suggest a great potential for the selection of biocontrol microorganisms and the development of bioproducts from local microbial resources.Maestrí

Evaluación de microorganismos con potencial de promoción de crecimiento vegetal y biocontrol de Spongospora subterranea

Título en ingles: Evaluation of microorganisms  with potential  for plant  growth  promotion and biological control of    Spongospora subterranea Resumen: La sarna polvosa de la papa es causada por el patógeno Spongospora subterranea, que disminuye la calidad y producción de tubérculos y facilita la entrada de otros patógenos. Esta enfermedad afecta las principales zonas productoras del mundo, debido a la falta de tratamientos efectivos contra el patógeno y al comercio de tubérculos-semilla infectados. Algunas investigaciones indican que los agentes biocontroladores podrían contribuir a reducir la actividad de S. subterranea a través de efectos sobre la viabilidad de sus quistosoros o mediante efectos estimulantes del crecimiento de la planta. En este estudio se emplearon bacterias aisladas del interior de raíz, rizósfera y superficie de tubérculos de un cultivo de papa (Solanum tuberosum variedad Diacol Capiro) y seleccionadas por su capacidad para producir indoles totales y quitinasas. En estudios paralelos se determinó su capacidad para promover la velocidad de germinación en brotes de tubérculos o para controlar  S. subterranea en raíces y promover el crecimiento vegetal de plántulas en invernadero. La mayoria de los aislamientos evaluados incrementraron la longitud de brotes de tubérculos en el laboratorio. En el invernadero, en suelo no estéril y en presencia del patógeno, se encontró que 2 de los 10 aislamientos seleccionados por su capacidad para producir indoles totales y quitinasas, presentaron promoción de crecimiento vegetal y posible biocontrol del patógeno. Estos resultados sugieren un gran potencial para la selección de microorganismos biocontroladores y desarrollo de bioproductos a partir de recursos microbiológicos locales. Palabras clave: sarna polvosa de la papa; indoles totales; quitinasas; control biológico. Abstract: The powdery scab of potato is caused by the pathogen Spongospora subterranea which reduces the quality and yield of tubers and facilitates the establishment of other pathogens. This disease affects main potato production zones in the world, because there is not a completely effective and available control method against the disease, and due to the trading of infested seed tubers. Some research suggests that biological control agents could reduce the activity of S. subterranea through effects on the viability of their cystosoris or zoospores or by stimulating plant growth. In this research, bacteria previously isolated, from inside the roots, the rhizosphere and tuber peel of potato plants (Solanum tuberosum var. Diacol Capiro), were used, and then selected according to their capacity for producing total indoles and chitinases. Here was tested in parallel studies the capacity of nine bacterial isolates differing in total indole and chitinase production, for its capacity at increasing tuber sprout length and in promoting plant growth and biocontrol of S. subterranea. Inoculated in excised minitubers in laboratory most indole producing isolates tested resulted in increased tuber sprout length. In the greenhouse assay, in non-sterile soil and under a high pathogen pressure, two of the ten isolates selected because for their ability to produce total indoles and chitinases, showed plant growth promotion and possible biocontrol of the pathogen. These results suggest a great potential for the selection of biocontrol microorganisms and the development of new bioproducts from local microbial resources. Key words: powdery scab of potato; total indole; chitinases; biological control; PGPR

Evaluación de microorganismos con potencial de promoción de crecimiento vegetal y biocontrol de spongospora subterranea

Título en ingles: Evaluation of microorganisms  with potential  for plant  growth  promotion and biological control of    Spongospora subterranea Resumen: La sarna polvosa de la papa es causada por el patógeno Spongospora subterranea, que disminuye la calidad y producción de tubérculos y facilita la entrada de otros patógenos. Esta enfermedad afecta las principales zonas productoras del mundo, debido a la falta de tratamientos efectivos contra el patógeno y al comercio de tubérculos-semilla infectados. Algunas investigaciones indican que los agentes biocontroladores podrían contribuir a reducir la actividad de S. subterranea a través de efectos sobre la viabilidad de sus quistosoros o mediante efectos estimulantes del crecimiento de la planta. En este estudio se emplearon bacterias aisladas del interior de raíz, rizósfera y superficie de tubérculos de un cultivo de papa (Solanum tuberosum variedad Diacol Capiro) y seleccionadas por su capacidad para producir indoles totales y quitinasas. En estudios paralelos se determinó su capacidad para promover la velocidad de germinación en brotes de tubérculos o para controlar  S. subterranea en raíces y promover el crecimiento vegetal de plántulas en invernadero. La mayoria de los aislamientos evaluados incrementraron la longitud de brotes de tubérculos en el laboratorio. En el invernadero, en suelo no estéril y en presencia del patógeno, se encontró que 2 de los 10 aislamientos seleccionados por su capacidad para producir indoles totales y quitinasas, presentaron promoción de crecimiento vegetal y posible biocontrol del patógeno. Estos resultados sugieren un gran potencial para la selección de microorganismos biocontroladores y desarrollo de bioproductos a partir de recursos microbiológicos locales. Palabras clave: sarna polvosa de la papa; indoles totales; quitinasas; control biológico. Abstract: The powdery scab of potato is caused by the pathogen Spongospora subterranea which reduces the quality and yield of tubers and facilitates the establishment of other pathogens. This disease affects main potato production zones in the world, because there is not a completely effective and available control method against the disease, and due to the trading of infested seed tubers. Some research suggests that biological control agents could reduce the activity of S. subterranea through effects on the viability of their cystosoris or zoospores or by stimulating plant growth. In this research, bacteria previously isolated, from inside the roots, the rhizosphere and tuber peel of potato plants (Solanum tuberosum var. Diacol Capiro), were used, and then selected according to their capacity for producing total indoles and chitinases. Here was tested in parallel studies the capacity of nine bacterial isolates differing in total indole and chitinase production, for its capacity at increasing tuber sprout length and in promoting plant growth and biocontrol of S. subterranea. Inoculated in excised minitubers in laboratory most indole producing isolates tested resulted in increased tuber sprout length. In the greenhouse assay, in non-sterile soil and under a high pathogen pressure, two of the ten isolates selected because for their ability to produce total indoles and chitinases, showed plant growth promotion and possible biocontrol of the pathogen. These results suggest a great potential for the selection of biocontrol microorganisms and the development of new bioproducts from local microbial resources. Key words: powdery scab of potato; total indole; chitinases; biological control; PGPR

Evaluación de microorganismos con potencial de promoción de crecimiento vegetal y biocontrol de Spongospora subterranea

La sarna polvosa de la papa es causada por el patógeno Spongospora subterranea, que disminuye la calidad y producción de tubérculos y facilita la entrada de otros patógenos. Esta enfermedad afecta las principales zonas productoras del mundo, debido a la falta de tratamientos efectivos contra el patógeno y al comercio de tubérculos-semilla infectados. Algunas investigaciones indican que los agentes biocontroladores podrían contribuir a reducir la actividad de S. subterranea a través de efectos sobre la viabilidad de sus quistosoros o mediante efectos estimulantes del crecimiento de la planta. En este estudio se emplearon bacterias aisladas del interior de raíz, rizósfera y superficie de tubérculos de un cultivo de papa (Solanum tuberosum variedad Diacol Capiro) y seleccionadas por su capacidad para producir indoles totales y quitinasas. En estudios paralelos se determinó su capacidad para promover la velocidad de germinación en brotes de tubérculos o para controlar S. subterranea en raíces y promover el crecimiento vegetal de plántulas en invernadero. La mayoria de los aislamientos evaluados incrementraron la longitud de brotes de tubérculos en el laboratorio. En el invernadero, en suelo no estéril y en presencia del patógeno, se encontró que 2 de los 10 aislamientos seleccionados por su capacidad para producir indoles totales y quitinasas, presentaron promoción de crecimiento vegetal y posible biocontrol del patógeno. Estos resultados sugieren un gran potencial para la selección de microorganismos biocontroladores y desarrollo de bioproductos a partir de recursos microbiológicos locales.The powdery scab of potato is caused by the pathogen Spongospora subterranea which reduces the quality and yield of tubers and facilitates the establishment of other pathogens. This disease affects main potato production zones in the world, because there is not a completely effective and available control method against the disease, and due to the trading of infested seed tubers. Some research suggests that biological control agents could reduce the activity of S. subterranea through effects on the viability of their cystosoris or zoospores or by stimulating plant growth. In this research, bacteria previously isolated, from inside the roots, the rhizosphere and tuber peel of potato plants (Solanum tuberosum var. Diacol Capiro), were used, and then selected according to their capacity for producing total indoles and chitinases. Here was tested in parallel studies the capacity of nine bacterial isolates differing in total indole and chitinase production, for its capacity at increasing tuber sprout length and in promoting plant growth and biocontrol of S. subterranea. Inoculated in excised minitubers in laboratory most indole producing isolates tested resulted in increased tuber sprout length. In the greenhouse assay, in non-sterile soil and under a high pathogen pressure, two of the ten isolates selected because for their ability to produce total indoles and chitinases, showed plant growth promotion and possible biocontrol of the pathogen. These results suggest a great potential for the selection of biocontrol microorganisms and the development of new bioproducts from local microbial resources

Characterization of an Air-Based Coaxial Dielectric Barrier Discharge Plasma Source for Biofilm Eradication

Air-based atmospheric-pressure cold plasmas are a source of charged particles, excited species, radicals, and UV rays, known to induce degradation of biomaterials. In this work we characterize an air-based Dielectric Barrier Discharge plasma source designed for biofilm eradication, and study plasmas generated under different conditions by Optical Emission Spectroscopy. The main excited species in air-based plasmas are N2 (C3Πu) molecules and the gas temperatures never exceed 335 K, decreasing as air amounts increase in the feeding gas. Excited oxygen atoms and OH species are only detected in discharges generated in argon-containing gases. The temperature of the effluent remains below 308 K. Air-based plasmas are useful for biofilm eradication as they produce high amounts of ozone at a low gas temperature.Fil: Soler Arango, Juliana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; ArgentinaFil: Brelles Mariño, Graciela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; ArgentinaFil: Rodero, Antonio. Universidad de Córdoba; EspañaFil: Garcia, Maria. Universidad de Córdoba; Españ

Characterization of an air-based coaxial dielectric barrier discharge plasma source for biofilm eradication

Air-based atmospheric-pressure cold plasmas are a source of charged particles, excited species, radicals, and UV rays, known to induce degradation of biomaterials. In this work we characterize an air-based Dielectric Barrier Discharge plasma source designed for biofilm eradication, and study plasmas generated under different conditions by Optical Emission Spectroscopy. The main excited species in air-based plasmas are N2 (C3Πu) molecules and the gas temperatures never exceed 335 K, decreasing as air amounts increase in the feeding gas. Excited oxygen atoms and OH species are only detected in discharges generated in argon-containing gases. The temperature of the effluent remains below 308 K. Air-based plasmas are useful for biofilm eradication as they produce high amounts of ozone at a low gas temperature.Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriale

Distribución Diferencial de Bacterias con Potencial Biocontrolador de Spongospora subterranea en Plantas de Papa (Solanum tuberosum cv. Diacol Capiro) Differential Distrubution of Candidadate Biocontrol Bacteria against Spongospora subterranea in Potato Plants (Solanum tuberosum cv. Diacol Capiro)

Resumen. La búsqueda de microorganismos promisorios para biocontrol de patógenos de plantas en el suelo con frecuencia se ha orientado a la detección de productores de hormonas y enzimas líticas, condiciones asociadas a su capacidad para promover crecimiento vegetal. Sin embargo, el suelo es altamente variable en escalas pequeñas y se conoce poco sobre la distribución espacial de microorganismos que expresan esas funciones. Este estudio determinó la capacidad de producción de indoles totales y quitinasas en bacterias cultivables aisladas del interior de la raíz, la rizósfera, la superficie de los tubérculos o suelo de un cultivo de papa (Solanum tuberosum variedad Diacol Capiro). Las muestras se obtuvieron en un campo comercial en el municipio de la Unión en el departamento de Antioquia, Colombia, en plantas que presentaban síntomas de infección por Spongospora subterranea. Se encontró una producción diferencial de indoles o quitinasas según el sitio de aislamiento de las bacterias. No se encontró una alta producción de ambas actividades en un sólo aislamiento, la mayor producción de indoles totales y quitinasas se encontró en bacterias aisladas a partir de raíz y rizósfera, comparada con las aisladas de tubérculos y suelo. Estos resultados sugieren que en el suelo no es aleatoria la distribución de funciones deseables en controladores biológicos. Con estos resultados es posible orientar su búsqueda para optimizar el uso de recursos y el desarrollo de nuevos bioproductos.<br>Abstract. Searching for promising microorganisms to biocontrol soil-borne plant pathogens has been often focused on producers of hormone and lytic enzymes, since these traits are linked to plant growth promotion. However, the environment from inner roots to bulk soil is quite variable, and little is known about the spatial distribution of microorganisms expressing these desirable traits. Using potato plants (Solanum tuberosum var. Diacol Capiro) from a farmers field, in this research we obtained bacteria from inside roots, rhizosphere, tubers peel or bulk soil, and determined in them the production of indol and chitinases. In general, bacteria isolated form inside the roots showed the highest production of total indols and chitinases. Simultaneous high production of both compounds was not detected in these isolates, and the frecuency of bacteria producing both, indol and chitinases was higher in roots and rhizosphere, compared to tubers peel and bulk soil samples. These results suggest that in soil, the distribution of microorganisms and functions linked to biocontrol are not randomly distributed. These findings might be usefull to guide the search for biocontrol agents, optimize resource use and speed up the development of new bioproducts