Characterisation of erwinias causing blackleg and soft rot in Finland

Potato stems showing blackleg or wilting were collected during 2003-2004 and the erwinias were isolated based on cavity forming on pectate-containing media followed by anaerobic growth test. Bacteri were also isolated from rotting tubers and from water samples collected from rivers in southern and western Finland

Viability of Lactobacillus paraplantarum DSM 14485 in human gastrointestinal tract and its molecular and biochemical identification after fermented vegetable consumption

Abstract In this study the viability of a potentially probiotic Lactobacillus paraplantarum DSM 14485 in the intestinal tract of 22 healthy test subjects was qualitatively assessed in a randomised double blinded cross-over study design lasting 2 x 4 weeks (interventions I and II) with a 4-week washout period. The subjects were given in their diet either spontaneously fermented vegetables (SF) or vegetables fermented by starter bacteria which contained  Lb. paraplantarum DSM 14485 (P). The numbers of lactic acid bacteria (LAB) in fecal samples were at the level of 105 cfu g-1 in both groups. The presence of Lb. paraplantarum DSM 14485 was confirmed by biochemical and molecular methods. We were able to show that Lb. paraplantarum DSM 14485, isolated from spontaneously fermented cucumbers, was viable in the intestine of ten test subjects after taking P-diet when the numbers of LAB were sufficiently high in the product

Perunantyvi- ja märkämätää aiheuttavaa Erwinia-lajistoa kartoitetaan

Piilevä perunantyvi- ja märkämätä aiheuttaa ongelmia siemenperunan tuotannossa. MTT:n (Maa- ja elintarviketalouden tutkimuskeskus) ja Helsingin yliopiston välisessä yhteisprojektissa etsitään keinoja tyvi- ja märkämädän hallintaan bioteknisin menetelmin. Tutkimuksen tarkoituksena on selvittää, mikä on eri perunantyvi- ja märkämätää aiheuttavien Erwinia-bakteerilajien merkitys taudinaiheuttajana Suomessa ja mikä on mahdollisten luonnonkantojen rooli. Tyvi- ja märkämätää aiheuttavassa bakteerilajistossa on havaittu 2000-luvulla merkittäviä muutoksia Euroopan tärkeimmillä perunantuotantoalueilla. Projekti aloitettiin kartoittamalla Erwinia-lajistoa keräämällä näytteitä sairaista perunan varsista ja mukuloista sekä jokivesistä Etelä-Suomesta ja Etelä-Pohjanmaalta. Näytteistä eristettiin bakteerikantoja puhdasviljelmiksi käyttäen pektaattia sisältävää alustaa. Eristetyt bakteerikannat tunnistettiin Erwinia-spesifisin PCR-testein. Vuoden 2004 kartoitus osoitti, että Suomen oloihin tyypillinen Erwinia carotovora alalaji atroseptica (Eca) oli vielä vallitseva tyvimädän aiheuttaja ja Erwinia carotovora alalaji carotovora (Ecc) märkämädän aiheuttaja. Lisäksi kartoitus paljasti, että lämpimimmissä ilmastoissa tyvi- ja märkämätää aiheuttavaa E. chrysanthemi –lajia (Ech) esiintyy nyt Suomessa. Uuden tulokaslajin osuus oli merkittävä kaikissa näytetyypeissä, vaikka se olikin rajoittunut muutamaan siemenerään. Kaikki vesinäytteistä eristetyt kannat olivat Ech:ta. Yleisesti Ech:ta on pidetty lämpimien ilmasto-olojen lajina, mutta on mahdollista, että Ech-lajista on kehittynyt viileässä ilmastossa menestyviä kantoja. On kuitenkin ilmeistä, että aggressiivisia Ech-kantoja löytyy meillä sekä perunoista että jokivedestä, joten Ech on todennäköisesti pysyvä ongelma, joka on otettava diagnostiikassa ja siementarkastuksessa huomioon. Eristetyistä Erwinia-kannoista otettiin kattava otos ja ne sekvensoitiin 16S-23S rDNAvälialueelta käyttäen universaaleja alukkeita. Sekvensoidut kannat ryhmiteltiin fylogeneettisten puiden perusteella. Puiden estimointiin käytettiin Bayesiläisiä fylogenetiikan menetelmiä. Ryhmittely osoitti, että Eca-kannat olivat hyvin homologisia, kuten aikaisemmin on esitetty. Ecc- ja Ech-kannoissa oli enemmän vaihtelua. Tulkinnasta riippuen kummankin lajin kannat voitiin jaotella useampaan ryhmään.Jatkossa selvitetään, onko näillä ryhmillä yhteyttä taudinaiheuttamiskykyyn, jota tutkitaan mukula- ja varsimädätystesteillä kasvihuoneella sekä kenttäkokeissa. Mielenkiinnon kohteena on, voidaanko perunaerän tyvi- ja märkämädän puhkeamisriskiä ennakoida huomioiden bakteerikantojen geneettinen vaihtelu

Suomen kansantalouden materiaalivirrat ja niiden vaikutukset : Toteutunut kehitys ja kiertotalouden skenaariot vuodelle 2035

Tutkimuksen tavoitteena oli lisätä ymmärrystä kiertotalouden potentiaalista vaikuttaa Suomen luonnonvarojen käyttöön ja niistä aiheutuviin ympäristö- ja talousvaikutuksiin. Viimeaikaisen kehityksen lisäksi arvioitiin kolmea luonnonvarojen käytön skenaariota vuodelle 2035. Niihin lisättiin kiertotaloustoimenpiteitä vaiheittain siten, että kunniahimoisin skenaario pyrki saavuttamaan Suomen kiertotalouden strategisen ohjelman luonnonvaratavoitteiden lisäksi myös Suomen hiilineutraalisuustavoitteen. Tulosten perusteella kiertotalouden strategisessa ohjelmassa asetut luonnonvaratavoitteet ovat osin saavutettavissa. Tällöin Suomen raaka-aineiden kokonaiskulutus vuonna 2035 ei ylitä vuoden 2015 tasoa, ja materiaalien kiertotalousaste kaksinkertaistuu vuodesta 2015. Myös hiilineutraalisuus voidaan saavuttaa vuoteen 2035 mennessä työssä hahmoteltujen oletuksien ja lisätoimien toteutuessa. Puhdas energiasiirtymä vähentää Suomen päästöjä ja luonnonvarojen käyttöä merkittävästi jo nykyisten päätösten toteutuessa perusskenaariossa. Kiertotaloustoimenpiteet edistävät edelleen päästöjen laskua ja vahvistavat nieluja. Suomen raaka-aineiden kulutus asukasta kohden säilyy kiertotaloustoimenpiteistä huolimatta globaalisti erittäin korkealla tasolla ja resurssituottavuudessa jäädään kauas EU-maiden keskiarvosta. Kiertotalouden toteutukseen tarvitaan lisää kunnianhimoa ja toimintaa tukevia ohjauskeinoja. Julkaisu on päivitetty 22.3.2024, s. 21, 23, 43, 89

Perunantyvi- ja märkämätää aiheuttavien Erwinia-bakteerien lajisto luultua monimuotoisempi

vo

Differentiation of lactobacilli related to Lactobacillus plantarum from naturally fermented cucumbers and white cabbage

v2003okET

Diganostics of Erwinias on the seed potato production in Finland

vo

Identification of a gene cluster for the mevalonate pathway in Lactobacillus helveticus

vokETL, KS

Black leg and soft rot caused by Erwinia-species in Finland

vo

Management of major disease of potato in northern Europe

vo