Incidence and Distribution of Microfungi in a Treated Municipal Water Supply System in Sub-Tropical Australia

Drinking water quality is usually determined by its pathogenic bacterial content. However, the potential of water-borne spores as a source of nosocomial fungal infection is increasingly being recognised. This study into the incidence of microfungal contaminants in a typical Australian municipal water supply was carried out over an 18 month period. Microfungal abundance was estimated by the membrane filtration method with filters incubated on malt extract agar at 25 °C for seven days. Colony forming units were recovered from all parts of the system and these were enumerated and identified to genus level. The most commonly recovered genera were Cladosporium, Penicillium, Aspergillus and Fusarium. Nonparametric multivariate statistical analyses of the data using MDS, PCA, BEST and bubble plots were carried out with PRIMER v6 software. Positive and significant correlations were found between filamentous fungi, yeasts and bacteria. This study has demonstrated that numerous microfungal genera, including those that contain species which are opportunistic human pathogens, populate a typical treated municipal water supply in sub-tropical Australia

Progressive myoclonus epilepsies-Residual unsolved cases have marked genetic heterogeneity including dolichol-dependent protein glycosylation pathway genes

Progressive myoclonus epilepsies (PMEs) comprise a group of clinically and genetically heterogeneous rare diseases. Over 70% of PME cases can now be molecularly solved. Known PME genes encode a variety of proteins, many involved in lysosomal and endosomal function. We performed whole-exome sequencing (WES) in 84 (78 unrelated) unsolved PME-affected individuals, with or without additional family members, to discover novel causes. We identified likely disease-causing variants in 24 out of 78 (31%) unrelated individuals, despite previous genetic analyses. The diagnostic yield was significantly higher for individuals studied as trios or families (14/28) versus singletons (10/50) (OR = 3.9, p value = 0.01, Fisher's exact test). The 24 likely solved cases of PME involved 18 genes. First, we found and functionally validated five heterozygous variants in NUS1 and DHDDS and a homozygous variant in ALG10, with no previous disease associations. All three genes are involved in dolichol-dependent protein glycosylation, a pathway not previously implicated in PME. Second, we independently validate SEMA6B as a dominant PME gene in two unrelated individuals. Third, in five families, we identified variants in established PME genes; three with intronic or copy-number changes (CLN6, GBA, NEU1) and two very rare causes (ASAH1, CERS1). Fourth, we found a group of genes usually associated with developmental and epileptic encephalopathies, but here, remarkably, presenting as PME, with or without prior developmental delay. Our systematic analysis of these cases suggests that the small residuum of unsolved cases will most likely be a collection of very rare, genetically heterogeneous etiologies.Peer reviewe

Wplyw chronionego [naturalnego] koryta Gornej Narwi na jakosc jej wod

Analiza zmian jakości wody przeprowadzona na podstawie średnich z pięciu lat (1997-2001) stężeń wskaźników biogennych wykazała zależności wynikające ze zmiennego charakteru koryta rzecznego. Stwierdzono, że w anastomozującym odcinku rzeki nastąpiło obniżenie przeciętnych stężeń, które dla P-P0₄³ˉ, P og. i chlorofilu a wynosiło odpowiednio po 8,9; 21,6 i 60,0%. Wzrost dotyczył wapnia, magnezu, potasu, azotu amonowego i azotanowego, co należy przypisać dostawie składników ze zlewni. W odcinku poniżej Parku, gdzie Narew płynie sztucznie wyprofilowanym korytem, odnotowano wzrost wszystkich przeciętnych wartości omawianych parametrów. Wpływ na jakość wód Narwi w tym odcinku ma dopływ silnie zanieczyszczonych wód Horodnianką oraz wzrost oddziaływań gospodarczych w dolinie rzecznej i na terenach do niej przyległych.The analysis of water quality based on the five-year (1997-2001) average concentrations of nutrients showed changes in water quality as the result of changing character of a river bed. The decrease in average values of P-P0₄³ˉ, total phosphorus and chlorophyll a concentrations was stated in the anastomosing section of the river which amounted respectively to 8.9; 21.6 and 60.0%. The increase concerned calcium, magnesium, potassium, ammonia and nitrate nitrogen what resulted from the input of the elements form the area of the river basin. Average values of all of the studied parameters increased beneath the Park, in the section where the Narew River flows along the formed bed. The water quality of the Narew River is influenced by strongly polluted waters of the Horodonianka River as well as the increase in economical activities in the river valley and its surroundings

Zmiany zawartosci rteci w wodach Narwi i wybranych jej doplywow

Although some small amounts of mercury in surface water come from natural environment, much higher quantities originate from anthropogenic sources, including industry and agriculture. Mercury readily accumulates in bottom sediments, from which it can return to water, which can be a serious cause of mercury pollution even after other mercury sources are removed from a river’s drainage basin. Concentration of mercury was examined in river waters flowing from basins characterised by different land use and population density. Samples of water were collected from two right tributaries of the Narew River, called the Pisa and the Biebrza, and at six sites in the middle section of the main river. The areas drained by these three rivers lie within the ecosystem known as the Green Lungs of Poland. It was found that the average mercury concentration in the waters of the Narew and its tributaries ranged between 0.3 and 0.9 pg dm-3, being only slightly higher than the concentrations typical of unpolluted territories. The highest mercury content occurred in spring and in the waters from agricultural-forested basins with large towns. Changes in the mercury outflow were associated with accumulation of household pollutants downstream, atmospheric conditions as well as the content of organic matter and suspended solids in the river waters. Low concentration of mineral suspension and organic substance carried by the Pisa River significantly depressed the mercury content in the water of this river. In the Biebrza River, the concentration of both organic and mineral substance was directly proportional to the content of mercury.Niewielkie ilości rtęci w wodach powierzchniowych pochodzą ze źródeł przyrodniczych. Wielokrotnie więcej tego metalu pochodzi ze źródeł antropogenicznych, w tym z przemysłu i rolnictwa. Rtęć łatwo gromadzi się w osadach, skąd może powracać do wód, co może stać się istotnym jej źródłem po usunięciu zagrożeń w zlewni. Badano zawartość rtęci w wodach rzecznych odpływających ze zlewni o zróżnicowanym użytkowaniu i zaludnieniu. Próbki wody pobrano z dwóch prawostronnych dopływów Narwi, tj.: Pisy i Biebrzy, oraz w sześciu punktach środkowego odcinka rzeki głównej. Tereny odwadniane przez badane cieki położone są w zasięgu ekosystemu „zielonych płuc” Polski. Stwierdzono, że średnie stężenie rtęci w wodach Narwi i jej dopływów mieściło się w granicach od 0,3 do 0,9 pg dm-3 i były niewiele wyższe od stężeń charakterystycznych dla obszarów niezanieczyszczonych. Najwyższe stężenie rtęci wykazano wiosną w wodach ze zlewni rolniczo-leśnych z dużymi ośrodkami miejskimi. Średni roczny odpływ rtęci wyniósł 0,3-3,3 g z 1 ha, średnio ok. 1 g z 1 ha zlewni. Na różnice w odpływie rtęci miały wpływ kumulacja zanieczyszczeń bytowych z biegiem rzeki, warunki atmosferyczne oraz zawartość materii organicznej i zawiesin w wodach rzecznych. Niska zawartość zawiesiny mineralnej i substancji organicznej w wodach Narwi nie wpływała istotnie na stężenia Hg. Stwierdzono, że mineralna część substancji niesionych wodami Pisy miała istotny wpływ na obniżenie stężenia rtęci w wodzie tej rzeki. W wodach Biebrzy zarówno stężenia substancji organicznych, jak i mineralnych wykazywały wprost proporcjonalną zależność w stosunku do zawartości rtęci

Wplyw uzytkowania zlewni na zanieczyszczenie wod rzecznych na przykladzie Narwi i jej doplywow. Czesc III. Fosfor

W latach 1997-2003 prowadzono badania wpływu użytkowania terenu zlewni na zawartość fosforu w wodach Narwi i wybranych jej dopływów. Stwierdzono, iż wzrost stężenia fosforu w wodach rzecznych powodują: intensywne rolnictwo, spływy zanieczyszczeń komunalnych i spływy ścieków burzowych. Odpływ fosforu ogólnego wynosił średnio 1,06 kg rocznie z 1 ha zlewni ze zróżnicowaniem od 0,42-1,29 kg. Stężenie fosforu ogółem w wodach wynosiło 0,42 mg·dm⁻³ z wahaniami od 0,16-0,92 mg·dm⁻³. Fosfor fosforanowy stanowiły średnio 64% ogólnej zawartości fosforu w wodach. Najniższe stężenia fosforu w wodach stwierdzono wiosną (średnio 0,27 mg P·dm⁻³ ), a najwyższe w okresie letnim, gdy odpływ ze zlewni przewyższał bioakumulację. Najwyższe stężenia i odpływy fosforu stwierdzono w zlewniach rolniczych (Rozoga, Ruż, Orz), mniejsze w zlewni leśnej (Omulew) oraz mieszanych (Biebrza i górna Narew), a najniższy w zlewni rolniczo-leśnej z jeziorami (Pisa). Odpływ fosforu z wodami rzecznymi był 3-krotnie wyższy od odpływu z opadami w zlewniach rolniczych, podczas gdy w zlewniach rolniczo-leśnych był 1,5-krotny. Istotny wpływ na odpływ fosforu ze zlewni, obok szaty roślinnej, miały właściwości gleby, w tym skład granulometryczny. Dlatego z piaszczystej zlewni Omulwi, mimo że zaliczono ją do leśnych, odpływ był większy niż ze zlewni rolniczo-leśnych.The influence of land use on phosphorus contents in water of the Narew river as well as its main tributaries, was studied in the period of 1997-2003. The research showed the increase of P concentrations resulted from intensive agriculture, municipal waste waters outflow and rainfall runoff. The average annual outflow of total phosphorus from 1 ha of basin area amounted to 1.06 kg (range of 0.42-1.29 kg·ha⁻¹). Average concentration of total phosphorus was 0.42 (range 0.16-0.92 mg·dm⁻³). Phosphate phosphorus amounted to 64% total P content in the tested water. The lowest concentrations were observed in spring (0.27 mg P·dm⁻³), whereas the highest in the summer, when the outflow exceeded bioaccumulation. Highest P concentrations and loads were stated in agricultural river basins (the Rozoga, Ruż, Orz), lower in forested (Omulew) and mixed (Biebrza and upper Narew) basins whereas the lowest values characterized agricultural- forested basins with the lakes (Pisa). The outflow of phosphorus with river water on agricultural areas was 3-times higher in comparison to its outflow with rain water; in case of agricultural-forested basin it was 1.5 times higher, respectively. An important factor limiting P outflow from the basins were soil properties especially grained structure. Thus, the sandy of basin Omulew river, although forested, showed the higher outflow than the agricultural-forested river basins

Stezenie Zn, Pb, Cu, Cd i Ni w wodach Narwi i wybranych jej doplywow

In the paper, the effects of differences in land use of a catchment and settlements on the variability of heavy metals concentrations (Zn, Pb, Cu, Cd, Ni) in the Narew River and some of its tributaries such as the Biebrza, upper Narew, Pisa, Omulew and Rozoga rivers were studied. The investigations continued from 1997 to 2002. The areas dewatered by the watercources differ considerably in terms of environmental features (forests, wetlands, bogs and water reservoirs), land use (arable lands, grasslands) and population (man-made areas). The total catchment of the Narew River at the cross-section in Zamski Kościelne was also taken into account. The urban areas make up from 0.5% of the Rozoga River to 2.5% of the upper Narew catchment. Water samples were collected quarterly (April, July, October and January) from four study sites located near the river mouth and were analyzed for Zn, Pb, Cu, Cd and Ni by the AAS method. The results showed that concentrations of Pb, Cu, Cd and Ni increased along the Narew River due to the accumulation of the elements in water. A significant influence on high heavy metal concentrations in water was produced by the town of Białystok, a source of large amounts of municipal pollutants discharged into the river. This mainly affected the content of Zn, as the highest pollution with this element was detected in the upper Narew River. The lowest Zn concentrations were observed in the Omulew River water, where forests dominated in the area, covering more than 48% of the catchment. The research showed that wetlands and lakes significantly decreased Pb, Cu, Cd and Ni concentrations in flowing water, but the presence of large inhabited areas with dense population and municipal pollution increased concentrations of heavy metals in river water.W pracy badano wpływ zróżnicowanego użytkowania obszaru zlewni oraz osadnictwa na zmienność stężenia metali ciężkich (Zn, Pb, Cu, Cd, Ni) w wodach Narwi i wybranych jej dopływów: Biebrzy, górnej Narwi, Pisy, Omulwi i Rozogi. Odprowadzają one wody z obszarów (zlewnie cząstkowe) znacząco zróżnicowanych pod względem warunków przyrodniczych (lasy, obszary podmokłe, bagna, zbiorniki wodne), sposobu użytkowania (grunty orne, użytki zielone) i zaludnienia terenu (tereny zantropogenizowane). Uwzględniono również zlewnię całkowitą Narwi po punkt pomiarowy w Zambskach Kościelnych. Na obszarze badań tereny zurbanizowane zajmują od 0,5% powierzchni w zlewni Rozogi do 2,5% w zlewni górnej Narwi. Badania obejmowały lata 1997-2002. Próbki wody pobierano z nurtu rzeki w punktach przyujściowych cztery razy w roku: wiosną (kwiecień), latem (lipiec), jesienią (październik) i zimą (styczeń). Oznaczenia Zn, Pb, Cu, Cd i Ni wykonano metodą absorpcyjnej spektrometrii atomowej. Wykazano, że wraz z biegiem rzeki Narwi, w wyniku kumulacji pierwiastków w wodzie, wzrastało stężenie Pb, Cu, Cd i Ni. Na wzrost stężenia metali ciężkich znaczący wpływ wywarła obecność w zlewni dużej jednostki osadniczej - miasta Białystok. Było to związane z dopływem większej ilości zanieczyszczeń bytowych powodujących wzrost stężenia Zn w górnej Narwi. Najniższe stężenie Zn stwierdzono w wodach odpływających Omulwią, w której zlewni dominowały lasy - ponad 48% powierzchni. Wykazano również, że występowanie terenów bagiennych, torfowych i zbiorników w zlewni wpływa na zmniejszenie stężenia Pb, Cu, Cd i Ni w wodach rzecznych, ale obecność dużych jednostek osadniczych i związany z tym dopływ zanieczyszczeń bytowych powoduje zwiększenie stężenia badanych metali ciężkich w wodzie rzecznej

Wplyw uzytkowania zlewni na zanieczyszczenie wod rzecznych na przykladzie Narwi i jej doplywow. Czesc I. Wskazniki tlenowe

W pracy przedstawiono wybrane wyniki oceny jakości wód rzecznych w systemie Narwi. Badania te stanowią integralną część szerokiego projektu badawczego, którego celem było określenie wpływu użytkowania zlewni na transport substancji rozpuszczonych w wodach Narwi i wybranych jej dopływów. W pracy dokonano (a) rozpoznania środowiska przyrodniczego zlewni oraz źródeł dostawy substancji chemicznych do wód płynących; (b) analizy mechanizmów odpływu wód i substancji rozpuszczonych w warunkach zróżnicowanej gospodarki agrarnej oraz (c) określenia jakościowych i ilościowych zmian dokonujących się w chemizmie wód jako skutku warunków istniejących w badanych zlewniach. Przedstawione w pracy jakościowe charakterystyki są efektem procesów, które rządzą zasilaniem koryta rzecznego w systemie o zróżnicowanych warunkach przyrodniczych oraz rolniczej działalności człowieka. Występujące zmiany jakości wody wzdłuż profilu podłużnego Narwi są rezultatem bezpośrednich dostaw zanieczyszczeń oraz z systemów niższych rangą taksonomiczną. Ze względu na średnią zawartość wskaźników ogólnego zanieczyszczenia substancjami organicznymi (BZT₅, ChZT) jakość wód Narwi oraz dopływów (Biebrzy, Pisy, Rozogi i Omulwi) różnicowała się od I (bardzo dobrej) do IV (niezadowalającej) klasy jakości.Paper presented chosen results of the water quality assessment in the Narew river system. The study is an integral part of the wide research project aimed at the affect of land use on the transfer of dissolved substances with the Narew river and its tributaries. The paper contains: (a) recognition of natural environment of the basin and sub-basins and the sources of chemical substances entering flowing water; (b) analyses of outflows mechanisms of water and dissolved substances under conditions of diversified agricultural management; (c) seasonal changes in quality and quantity of water resulted from individual characteristics of the basins. Presented data concerning water quality are affected by the processes of riverbed supply with water under diversified environmental conditions and human agricultural activity. The changes in water quality occurring downstream the longitudinal profile of Narew river resulted from direct contamination, as well as from the water systems of lower taxonomical level. Due to average content of organic pollutants (BOD₅, COD), the water quality of Narew river and its tributaries (Biebrza, Pisa, Rozoga, Omulew) ranged from the Ist class of water purity (very good) to the IVth class (unsatisfactory)

Wplyw uzytkowania zlewni na zanieczyszczenie wod rzecznych na przykladzie Narwi i jej doplywow. Czesc II. Azot mineralny

W latach 1997-2003 przeprowadzono badania, mające na celu określenie jakościowych i ilościowych zmian dokonujących się w chemizmie wód Narwi i wybranych jej dopływów, jako skutku oddziaływań gospodarczych. Stwierdzono, że na wzrost stężenia oraz wielkości ładunku azotu wpływają: wzrost udziału terenów użytkowanych rolniczo, dopływ zanieczyszczeń komunalnych i spływy ścieków burzowych. Najniższe stężenia form azotu w wodach wystąpiły latem (średnio: 0,013 N·NO₂ 0,387 N-NO₃ i 0,309 N-NH₄ mg·dm⁻³), a najwyższe w porze zimowej. Zawartość N-NO₃ była o 71%, a N-NH₄ o 30% wyższa w stosunku do pory letniej. Odpływ azotu ze zlewni rolniczych (Orzą, Ruża i Rozogi) był o 68% wyższy od najniższego w zlewni rolniczo-leśnej z jeziorami (Pisy). We wszystkich badanych zlewniach dokonała się akumulacja azotu (w < 1). Istotny wpływ na wielkość odpływu składnika miała szata roślinna, właściwości gleby (skład granulometryczny) oraz struktura użytkowania zlewni, która warunkowała również formy występowania azotu w wodach rzecznych.The studies aimed at quantification and qualification of changes in water chemistry of the Narew river and its chosen tributaries as affected by human economic activities were conducted within 1997-2003. It was found that the increase in nitrogen concentrations and loads resulted from extended share of cropland areas, the inflow of municipal sewage and rain water runoff. The lowest concentrations of nitrogen compounds in water were observed in summer (0.013 mg N-NO₂·dm⁻³, 0.387 mg N-NO₃·dm⁻³ and 0.309 mg N-NH₄·dm⁻³), whereas the highest in the winter season. The content of N-NO₃ was higher by 71% and N- NH₄ by 30%, in comparison to the summer. The N outflow from agricultural areas (Orz, Ruż, Rozoga) was higher by 68% than the lowest outflow from the rural-forest basin with the lakes (Pisa). Accumulation of N was stated (w < 1) in all of the studied basins. The nitrogen outflow was significantly affected by vegetation cover, soil properties (texture) as well as the structure of land use, conditioned also N forms in river water