Clonal chromosomal mosaicism and loss of chromosome Y in elderly men increase vulnerability for SARS-CoV-2

The pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2, COVID-19) had an estimated overall case fatality ratio of 1.38% (pre-vaccination), being 53% higher in males and increasing exponentially with age. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, we found 133 cases (1.42%) with detectable clonal mosaicism for chromosome alterations (mCA) and 226 males (5.08%) with acquired loss of chromosome Y (LOY). Individuals with clonal mosaic events (mCA and/or LOY) showed a 54% increase in the risk of COVID-19 lethality. LOY is associated with transcriptomic biomarkers of immune dysfunction, pro-coagulation activity and cardiovascular risk. Interferon-induced genes involved in the initial immune response to SARS-CoV-2 are also down-regulated in LOY. Thus, mCA and LOY underlie at least part of the sex-biased severity and mortality of COVID-19 in aging patients. Given its potential therapeutic and prognostic relevance, evaluation of clonal mosaicism should be implemented as biomarker of COVID-19 severity in elderly people. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, individuals with clonal mosaic events (clonal mosaicism for chromosome alterations and/or loss of chromosome Y) showed an increased risk of COVID-19 lethality

Análisis de la percepción de los investigadores de las Universidades Jorge Tadeo Lozano y la Sabana, sobre los recursos y servicios que prestan sus bibliotecas universitarias

233 páginasEl presente trabajo analiza la percepción de los investigadores de las universidades sobre los recursos y servicios que prestan las bibliotecas universitarias. La percepción de las bibliotecas se definió a partir de las siguientes categorías: Conocimiento y uso de la biblioteca, necesidades, satisfacción, confianza y relacionamiento; con base en estas se diseñó un instrumento el cual fue aplicado de manera virtual y facilitando la aplicación de manera anónima. Se contó con la participación de 164 investigadores de las universidades Jorge Tadeo Lozano y La Sabana. Se realizó un análisis global de todas las preguntas del instrumento obteniendo resultados del total de la muestra y por institución. Posteriormente, se definieron dos variables: la edad y la antigüedad de los investigadores en la institución a la que pertenecen, las cuales permitieron identificar si afectan o no la percepción de los encuestados. El análisis de los resultados permitió generar la propuesta de un plan de mejoramiento y recomendaciones, con el fin de mejorar la percepción de los investigadores con respecto a su biblioteca. Se concluye que la biblioteca universitaria es percibida por los investigadores como centro de apoyo a los procesos de investigación, sin embargo, estos desconocen el alcance actual de las bibliotecas y los bibliotecarios

Preservación y difusión del Fondo Histórico de la Universidad de la Sabana

Higher education institutions are asked to expand repositories and preservation management capabilities beyond scientific and academic publication management, such as History Collections. This communication presents the work done in the repository Intellectum of La Sabana University, when in 2005 incorporated a History Collection of exceptional importance, receiving two collections of approximately 40,000 pages of the eighteenth, nineteenth and twentieth centuries, corresponding to the documentary fund of Manuel Maria Mosquera and David Mejia Velilla. These collections were integrated in the Historical Archive Cipriano Rodriguez Santa Maria. Intellectum adaptation was focused on balancing the highest quality and maximum exposure (access) of preservation copies, consultation copies and additional representations for different users and access devices. For this, it has been made an approach in which specific preservation solutions coexist with, equally specific, visualization solutions, for a variety of users and access devices. A part of the ingest system in Intellectum is oriented towards the deposit of high quality jpeg copies resulting from the process of digitization of historical collections. These scanned copies are the main objects of the preservation systems incorporated to DSpace. For its size, derived from its high definition, these files are not available to general users, and are stored in a specific DSpace bundle. Subsequently a set of automated curation tasks assemble, from those copies, different versions and representations of each object. In Intellectum the preservation files are assembled into a single multipage pdf file, suitable for download by all users (stored in an accesible bundle), and also stored in flash format suitable for a pseudo-streaming viewer, or a copy apt for devices that support HTML4

Preservación y difusión del Fondo Histórico Universidad de La Sabana

16 diapositivasLa presentación muestra el contexto de las instituciones de educación superior donde es necesario que los repositorios amplíen sus objetivos y capacidades de gestión y preservación más allá de las publicaciones científicas y académicas, hacia la conservación de los Fondos Antiguos e Históricos

Poster V Conferencia Internacional BIREDIAL-ISTEC 2015

1 imagenEl poster ilustra la función de los repositorios hoy en día. Estos constituyen una fuente importante de información que permite a los ciudadanos acceder a documentación de calidad de forma libre. Estas iniciativas desarrollan aplicativos donde se conservan, almacenan, y disponen materiales producto de investigaciones provenientes del desarrollo académico y de la vida investigativa de las instituciones

Preservación y difusión del Fondo Histórico de la Universidad de la Sabana

En el contexto de las instituciones de educación superior la excelente acogida y utilización de los repositorios digitales han generado multitud de nuevos/as requerimientos/necesidades de incorporación de contenidos digitales. Esta circunstancia explica, entre otras, que los repositorios de viejo cuño, originariamente concebidos como sistemas de captura, preservación y difusión del patrimonio científico-académico de las instituciones, se hayan visto forzados a gestionar material digital que a menudo exceden sus capacidades funcionales. Un caso especial que tratamos en el presente estudio es la incorporación de los Fondos Antiguos e Históricos. Este tipo de material digital presenta particularidades digitales muy específicas derivadas principalmente de los propios fondos y el proceso de obtención de la copia digital. A menudo este hecho genera desencuentros entre las políticas de conservación y divulgación institucionales. Como es conocido, la denominada copia digital de preservación, producto de una primera fase de ese proceso de digitalización, se traduce en archivos de mucha definición, calidad y por lo tanto de enorme tamaño para ser gestionados correctamente desde el punto de vista de su accesibilidad. En el polo opuesto, sin embargo, las copias de consulta han sacrificado la calidad de los archivos en favor de su acceso. Recientemente, además, otra derivada se ha añadido a esta problemática, a saber, la “movilización” de contenidos y los nuevos requerimientos a sus futuras representaciones (e.g., la adaptación a su visualización por dispositivos móviles, etc.). El dilema de este modo está servido, ¿preservación y difusión son incompatibles? Creemos que no. En adelante presentaremos a lo largo de la comunicación los trabajos realizados en el repositorio intellectum de la Universidad de la Sabana. Todos ellos muestran las soluciones implementadas ad hoc para solucionar los problemas anteriormente mencionados, a saber: la incorporación de un Fondo Histórico de especial importancia y tamaño con arreglo a los requerimientos de máxima calidad y difusión (acceso) de las copias de preservación, copias de consulta y representaciones adicionales para diferentes usuarios y dispositivos de acceso. El Instituto de Humanidades de la Universidad de la Sabana recibió el año 2005 en donación dos colecciones con aproximadamente 40.000 folios de los siglos XVIII, XIX y XX, correspondientes a los fondos documentales Manuel María Mosquera y David Mejía Velilla. El proyecto, con importantes actuaciones de infraestructura en la Biblioteca Octavio Arizmendi Posada de la Universidad, integró estos fondos en el Archivo Histórico Cipriano Rodríguez Santa María. Como fase ya ejecutadas podemos mencionar actuaciones de identificación, clasificación, descripción, elaboración de herramientas de consulta y control de calidad. En la fase actual se está procediendo progresivamente a la digitalización, catalogación, microfilmación y subida al repositorio institucional intellectum. Esta subida se efectúa mediante procedimientos de metadatación y creación de paquetes de ingesta específicamente diseñados para optimizar los flujos de trabajo de los agentes del proceso. En intellectum, repositorio construido con el software DSpace, se ha realizado un enfoque en el que coexisten las soluciones específicas de preservación de los fondos documentales antedichos con las igualmente específicas de difusión y visualización, de forma amplia, para una variedad de usuarios y dispositivos de acceso. El sistema de ingesta de intellectum está orientado al depósito de las digitalizaciones en formato jpeg de alta calidad resultantes del proceso de digitalización por los responsables de los fondos históricos. Estas digitalizaciones son los objetos principales de los sistemas de preservación que incorpora DSpace en la actualidad (y los que adicionalmente se incorporen en el futuro). Por su gran tamaño, derivado de su alta definición, estos ficheros no se ponen a disposición de los usuarios generales, almacenándose en un bundle específico exclusivamente accedidos por las funcionalidades de preservación del DSpace y por los usuarios administradores de intellectum. Posteriormente un conjunto de tareas automáticas de curación ensamblan a partir de esas copias de preservación diversas versiones o representaciones de cada objeto. En concreto, en la versión actual de intellectum, se ensamblan los ficheros de preservación en un único fichero en formato pdf multipágina apto para su descarga por todo tipo de usuarios (almacenado en un bundle accesible) o como representación en formato flash apta para un visor pseudo-streming (específico de intellectum). La ventaja de este enfoque reside en generar en tiempo nuevas copias o representaciones de cada objeto digital sin necesidad de realizar una re-ingesta de los ficheros. De este modo, la adaptabilidad y flexibilidad del sistema son máximas al facilitar el acceso y representación de los objetos digitales con un mínimo esfuerzo, sea cual sea la evolución tecnológica o la opción de acceso de los usuarios. Una última virtud de este modelo es la posibilidad de desechar representaciones que devengan obsoletas, ya que las copias maestras, las realmente valiosas a efectos de preservación, seguirán existiendo en DSpace. Las posibilidades son múltiples y están imbricadas precisamente en el enfoque multinivel de almacenamiento descrito