Statewide evaluation of infection control measures for preventing coronavirus disease 2019 in hemodialysis facilities

OBJECTIVE: This study aimed to evaluate the occurrence of coronavirus disease 2019 (COVID-19) in hemodialysis facilities and the occurrence of and risk factors for clustering of COVID-19 cases. METHODS: We conducted a cross-sectional online survey between March and July 2020, in all dialysis facilities in São Paulo state, using Google Forms. The online questionnaire contained questions addressing specific components of infection prevention and control practices and the number of cases during the COVID-19 pandemic. RESULTS: A total of 1,093 (5%) COVID-19 cases were reported among 20,984 patients; approximately 56% of the facilities had ≥1 cluster. Most facilities implemented various measures (such as allocation of dedicated COVID-19 areas/shifts, symptom screening, environmental disinfection, and maintenance of adequate ventilation) to prevent the transmission of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2. Clustering of COVID-19 cases was suspected in only 7% of dialysis facilities. The only variable associated with this event was the performance of aerosol-generating procedures (odds ratio: 4.74; 95% confidence interval: 1.75-12.86). CONCLUSION: Attention should be paid to avoiding the performance of aerosol-generating procedures in dialysis facilities and monitoring the clustering of cases

Evaluation of bacterial infections in organ transplantation

Hospital das Clinicas da Faculdade de Medicina da Universidade de Sao PauloHospital das Clinicas da Faculdade de Medicina da Universidade de Sao Paul

Frequency and factors associated with hospital readmission after COVID-19 hospitalization: the importance of post-COVID diarrhea

Purpose: The aim of this study was to describe the incidence and risk factors for hospital readmission and infection during the months after COVID-19 hospital admission. Methods: This prospective study included adult patients who were hospitalized due to COVID-19 and had been discharged from April 2020 to August 2020. All patients had a medical evaluation with a structured questionnaire 6 to 11 months after hospital admission. The authors included only patients with confirmed COVID-19 by RT-PCR. Patients with pregnant/postpartum women, with a proven COVID-19 reinfection or incapable of answering the questionnaire were excluded. Results: A total of 822 patients completed the follow-up assessment, and 68% reported at least one recurrent symptom related to COVID-19. The most frequent symptom was myalgia (42%). Thirty-two percent of patients visited an emergency room after COVID-19 hospitalization, and 80 (10%) patients required re-hospitalization. Risk factors for hospital readmission were orotracheal intubation during COVID-19 hospitalization (p = 0.003, OR = 2.14), Charlson score (p = 0.002, OR = 1.21), congestive heart failure (p = 0.005, OR = 2.34), peripheral artery disease (p = 0.06, OR = 2.06) and persistent diarrhea after COVID-19 hospitalization discharge (p = 0.02, OR = 1.91). The main cause of hospital readmission was an infection, 43 (54%). Pneumonia was the most frequent infection (29%). Conclusions: The presence of symptoms after six months of COVID-19 diagnosis was frequent, and hospital readmission was relatively high

Impact of COVID-19 on healthcare-associated infections: Antimicrobial consumption does not follow antimicrobial resistance

Background: This study aimed to analyze the Healthcare-Associated Infections (HAI) rates and antimicrobial consumption in Intensive Care Units (ICU) in São Paulo city during the COVID-19 pandemic and compare them with the pre-pandemic period. Methods: This cohort included all hospitals that reported HAI rates (Central-Line-Associated Bloodstream Infection ‒ CLABSI and Ventilator-Associated Pneumonia ‒ VAP), the proportion of microorganisms that caused CLABSI, the proportion of resistant microorganisms, and antimicrobial consumption from January 2017 ‒ December 2020. Hospitals were stratified by the number of beds, Central Venous Catheter (CVC) utilization rate, Mechanical-Ventilation (MV) utilization rate, and type of funding. Statistical analyses were based on time-series plots and regression models. Results: 220 ICUs were included. The authors observed an abrupt increase in CLABSI rates after the pandemic onset. High CLABSI rates during the pandemic were associated with hospital size, funding (public and non-profit private), and low CVC use (≤ 50%). An increase in VAP rates was associated with public hospitals, and high MV use (> 35%). The susceptibility profile of microorganisms did not differ from that of the pre-pandemic period. polymyxin, glycopeptides, and antifungal use increased, especially in COVID-19 ICUs. Conclusions: HAI increased during COVID-19. The microorganisms’ susceptibility profile did not change with the pandemic, but the authors observed a disproportionate increase in large-spectrum antimicrobial drug use

Surto policlonal de infecção de corrente sanguínea causada pelo complexo Burkholderia cepacia em unidades de hospital-dia de hematologia e transplante de medula óssea

Aim: The objective was to describe an outbreak of bloodstream infections by Burkholderia cepacia complex (Bcc) in bone marrow transplant and hematology outpatients. Methods: On February 15, 2008 a Bcc outbreak was suspected. 24 cases were identified. Demographic and clinical data were evaluated. Environment and healthcare workers' (HCW) hands were cultured. Species were determined and typed. Reinforcement of hand hygiene, central venous catheter (CVC) care, infusion therapy, and maintenance of laminar flow cabinet were undertaken. 16 different HCWs had cared for the CVCs. Multi-dose heparin and saline were prepared on counter common to both units. Findings: 14 patients had B. multivorans (one patient had also B. cenopacia), six non-multivorans Bcc and one did not belong to Bcc. Clone A B. multivorans occurred in 12 patients (from Hematology); in 10 their CVC had been used on February 11/12. Environmental and HCW cultures were negative. All patients were treated with meropenem, and ceftazidime lock-therapy. Eight patients (30%) were hospitalized. No deaths occurred. After control measures (multidose vial for single patient; CVC lock with ceftazidime; cleaning of laminar flow cabinet; hand hygiene improvement; use of cabinet to store prepared medication), no new cases occurred. Conclusions: This polyclonal outbreak may be explained by a common source containing multiple species of Bcc, maybe the laminar flow cabinet common to both units. There may have been contamination by B. multivorans (clone A) of multi-dose vials.O objetivo foi descrever um surto de infecções da corrente sanguínea por complexo B. cepacia (Bcc) nos ambulatórios de hematologia e transplante de medula óssea. Métodos: Em 15/02/2008, um surto de Bcc foi suspeitado. 24 casos foram identificados. Os dados demográficos e clínicos foram avaliados. Mãos de profissionais da saúde e ambiente foram cultivadas. Espécies foram determinadas e tipadas. Reforço da higiene das mãos, cuidados com cateteres, terapia de infusão e manutenção da câmara de fluxo laminar foram realizadas. 16 profissionais de saúde (PS) diferentes manipularam os cateteres. Heparina multidoses e soro eram preparadas em um balcão comum a ambas as unidades. Resultados: 14 pacientes tiveram B. multivorans (um paciente teve também B. cenopacia), 6 Bcc não-multivorans e um teve um agente não pertencente a Bcc. Clone A de B. multivorans ocorreu em 12 pacientes (da Hematologia), em 10 o cateter havia sido utilizado nos dias 11 ou 12 de fevereiro. Culturas ambientais e de PS foram negativos. Todos os pacientes foram tratados com meropenem e selo de ceftazidima. Oito pacientes (30%) foram hospitalizados. Não ocorreram mortes. Após as medidas de controle, nenhum novo caso ocorreu. Conclusões: Este surto policlonal pode ser explicado por uma fonte comum contendo várias espécies de Bcc, talvez a câmara de fluxo laminar comum a ambas as unidades. Pode ter havido contaminação por B. multivorans (clone A) de frascos multi-dose

Statement of Second Brazilian Congress of Mechanical Ventilarion : part I

Resumo não disponíve

Multidrug-resistant Gram-negative bacteria acquired before liver transplantation: the impact on the outcome

As infecções em pacientes submetidos a transplantes de órgãos sólidos são importante causa de morbidade, além de serem definidoras da sobrevida desta população. A maioria das infecções que ocorre nos dois primeiros meses pós-transplante é relacionada à assistência à saúde (IRAS). O objetivo deste trabalho é identificar fatores de risco para IRAS por bactérias Gram-negativas (BGN) multi-droga resistentes (MDR) em pacientes submetidos a transplante de fígado (TF), nos dois primeiros meses após o transplante. Os objetivos secundários são: identificar fatores de risco para aquisição por MDR GNB em pacientes submetidos a TF, e determinar o impacto das IRAS por MDR GNB na sobrevida desses pacientes. Foram avaliados os TF consecutivos realizados em pacientes adultos no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (HCFMUSP) no período de novembro de 2009 a novembro de 2011. A vigilância microbiológica foi realizada no dia do TF, e semanalmente até a alta hospitalar ou 60 dias após o transplante. Os sítios de coleta foram swab de orofaringe ou secreção traqueal, swab retal e swab axilar. Foram pesquisadas as seguintes bactérias: A. baumannii. P. aeruginosa e Enterobactérias resistentes a carbapenêmico, e K. pneumoniae e E. coli produtoras de betalactamase de espectro estendido (ESBL). Posteriormente, as amostras clínicas foram comparadas com as cepas da mesma espécie isoladas em culturas de vigilância por tipagem molecular. A análise de fatores de risco foi realizada por tipo de infecção e espécie de bactéria. Na análise estatística utilizou-se o teste qui-quadrado ou teste exato de Fisher para variáveis dicotômicas, e teste de Mann-Whitney para variáveis ordenáveis. A análise multivariada foi realizada por regressão logística. A análise de sobrevida foi realizada por regressão de Cox. O nível de significância de P considerado foi 0,05. Foram realizados, no período, 229 transplantes em 202 pacientes, e analisados 214 transplantes em 195 pacientes. O motivo de indicação do transplante mais frequente foi cirrose pelo vírus C, 33%. Foram identificados no período do estudo 110 pacientes (56,4%) com IRAS pós-TF, e um total de 201 infecções. Em 76,3% dos pacientes com IRAS (84/110) foi isolado MDR GNB em alguma amostra clínica relacionada à infecção. Os dois principais sítios de infecção foram infecção de sitio cirúrgico (32%) e infecção primária de corrente sanguínea (27%). Os dois microrganismos mais frequentemente isolados das IRAS foram A. baumannii e K. pneumoniae, e a proporção de infecções por cepas resistentes a carbapênemico foi, respectivamente, 100% e 48,9%. Os fatores de risco para infecções por MDR GNB pós-TF foram: retransplante precoce, volume de concentrados de hemácias transfundidos no intra-operatório da cirurgia do TF, colonização por MDR GNB no pré-transplante, tempo prolongado de internação em UTI e tempo prolongado de isquemia fria. Cento e cinco pacientes adquiriram algum MDR GNB nos 60 dias pós-TF, e o único fator de risco detectado para aquisição de MDR GMB no pós-TF foi tempo prolongado de sonda vesical de demora. A análise de clonalidade demonstrou que as cepas de MDR identificadas pré-TF eram fortemente relacionadas às cepas isoladas das infecções no pós-TF para A. baumannii e K. pneumoniae resistente a carbapenêmico. As infecções por MDR GNB apresentaram uma tendência a aumentar o risco de óbito nos 60 primeiros dias pós-TF, mas estaBacterial infections among patients submitted to liver transplantation (LT) are an important cause of morbidity and have huge impact on patients\' survival. The majority of infections in the first two months after LT are related to healthcare assistance. The aim of this study has been to identify risk factors for healthcare-associated infections (HAI) caused by multidrug-resistant Gram-negative bacteria (MDR GNB) in liver transplant patients in the first two months after LT. The secondary aims have been to identify risk factors for acquisition of MDR BGN among liver transplant patients and analyze the survival rate during the first two months after LT. We analyzed consecutive liver transplantations performed at Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (HCFMUSP) from November 2009 to November 2011. Surveillance cultures were performed on a weekly basis, starting on the day of the LT until the hospital discharge or 60 days after the LT. We collected surveillance cultures through swab from oropharynx (or tracheal secretion), axillary and inguinal rectal sites. We surveyed the following bacteria: carbapenem-resistant A. baumanni, P. aeruginosa, Enterobacteriaceae, ESBL-producing K. pneumoniae, and E. coli. The strains isolated from surveillance culture were compared to strains isolated from clinical cultures through PFGE. The risk factor analysis was performed for each type of MDR bacterium for risk of colonization and infection. The statistical analysis was carried out for dichotomous variables using chi-square tests or Fisher\'s exact tests when appropriate; Mann-Whitney tests were used for continuous variable and step-wise logistic regression was used for multivariate analysis. The survival rate analysis was performed using Cox regression. The significant value of P was 0.05. During the study period, 229 liver transplantations were performed in 202 patients and we analyzed 214 LT performed in 195 patients. The main baseline disease that warranted LT was virus C cirrhosis, 33%. 110 (56.4%) patients developed healthcare-associated infections after the LT and a total of 201 infections were identified; 84 (76.3%) patients had MDR GNB isolated from clinical cultures related to HAI. Surgical wounds (31%) and primary bloodstream (27%) were the most prevalent infection sites. The risk factors for HAI by MDR GNB after the LT were: re-transplantation, volume of blood units transfused during the LT surgery, colonization by MDR GNB before the LT, prolonged time of ICU stay, and prolonged time of cold ischemia. 105 patients acquired MDR GNB during the first 60 days after the LT; the only risk factor identified was the prolonged use of urinary drain. The clonal analysis showed that strains isolated in the period before the LT were closely related to strains isolated from clinical culture after the LT for carbapenem-resistant A. baumannii e K. pneumoniae. The infections by MDR GNB have been shown to increase the risk of death in the first 60 days after L

Hospital Infection in liver transplantation

As infecções após transplante de fígado são uma importante causa de morbidade e mortalidade. O risco de transmissão de infecção pelo doador é descrito, principalmente quando esta infecção não é detectada ou tratada. O diagnóstico das infecções no doador é difícil e pouco disponível, portanto dados indiretos destas infecções podem ser úteis na escolha ou descarte do órgão, principalmente considerando-se a escassez de órgãos disponíveis para transplante. O objetivo deste estudo é Identificar os fatores de risco relacionados ao doador e ao receptor para infecção hospitalar bacteriana e fúngica (IH) em pacientes submetidos a transplante de fígado, no primeiro mês após o transplante. Foram avaliados os pacientes submetidos a transplante de fígado no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP, no período de janeiro de 2002 a junho de 2005. Os critérios de exclusão foram: óbito com menos de 48 horas, transplante intervivos, retransplante em menos de 5 dias e receptor de transplante dominó. Foram avaliados fatores de risco relacionados ao doador e ao receptor. A análise univariada foi feita por X2 e teste exato de Fisher para variáveis dicotômicas, e teste de Mann-Whitney para variáveis ordenadas. A análise multivariada foi realizada por regressão logística tipo stepwise. No período foram realizados 130 transplantes; desses 30 foram excluídos, sendo analisados 100 transplantes realizados em 94 pacientes. Foram identificadas 104 infecções em 59 transplantes. Os dois sítios de infecção mais freqüente foram: infecção de sitio cirúrgico (IFC, 35%) e infecção primária de corrente sanguínea (ICS, 30%). O agente mais frequentemente isolado foi o S. aureus (18% dos agentes), no entanto as bactérias gram-negativas foram o grupo mais freqüente (47%). Os fatores de risco identificados para infecção no primeiro mês após o transplante foram: uso de antibiótico no doador por mais de três dias (p 0,003), hepatite fulminante (p 0,006), pulso de corticóide no receptor por rejeição celular aguda (p 0,01), realização de diálise póstransplante (p 0,02) e realização de outro procedimento cirúrgico após o transplante (p 0,02). Os agentes mais isolados em ISC foram bactérias Gram positivas (56%). Os fatores de risco identificados para ISC foram: uso de antibiótico no doador por mais de três dias (p 0,04), realização de diálise pelo receptor (p 0,002) e transfusão de mais de quatro concentrados de hemácias durante o transplante (p 0,001). Entre as ICS, os dois agentes mais isolados foram A. baumanni (21%) e Staphylococcus coagulase negativo (21%). Os fatores de risco identificados para ICS foram: hepatite fulminante (p 0,0006) e realização de diálise pelo receptor (p 0,01). O S. aureus foi o agente mais freqüente e responsável por 17 infecções, 42% dos pacientes com infecção por este agente evoluíram para óbito durante a internação. Os fatores de risco identificados para infecção por S. aureus foram uso de noradrenalina pelo doador (p 0,02) e unidades de concentrados de hemácias transfundidas durante o transplante (p 0,04).Early infection after liver transplantation is an important cause for morbidity and mortality. The risk of transmission of microorganisms from the donor to the receptor is reported and is more probable when neither donor nor receptor are treated for the infection. The detection of infection in donors is difficult and usually not available, so indirect information about that infection may be useful at the time the liver is selected or denied, especially in light of lack of organs available for transplantation. We analyzed patients who underwent liver transplantation at the Clinics Hospital of School of Medicine of USP, from January 2002 to June 2005. The exclusion criteria were: death with less then 48 hours, living-donor transplant, re-transplant in less then 5 days and domino transplant. The risk factors evaluated were related to donor and receptor features. The univariate analysis was performed using chisquared test and Fisher exact test for dichotomic variables and Mann-Whitney test for continuous variables. The multivariate analysis was made by stepwise logistic regression. In this period 130 transplants were performed, from which 30 were excluded. A total of 100 transplants in 94 patients were analyzed. We identified 104 infections in 59 transplants. The two most frequent sites of infection were surgical site infection (SSI) - 35% - and primary bloodstream infections (BSI) - 30%. The most prevalent agent was S.aureus - 18% of the agents, but the Gram negatives bacteria were the most common group. The risk factors identified for infection in liver transplant patients in the first month were: antibiotic use by donor for more than 3 days, reoperation post-transplant, dialysis post-transplant, fulminant hepatitis and corticoid treatment for rejection. The microorganisms most frequently isolated in SSI were Gram positive bacteria (56%). The risk factors associated to SSI were: antibiotic use by donor for more than 3 days, transfusion of more than 4 units of blood during the surgery and dialysis post-transplant. The two microorganisms most frequently isolated in BSI were A. baumanni (21%) and coagulase negative Staphylococcus (21%). The risk factors identified for this specific infection site were fulminant hepatitis and dialysis post-transplant. The S. aureus was the most frequent agent, found in 17 cases. 42% of the patients with infection for this bacteria died during the hospitalization. The risk factors associated to S. aureus infection were norepinephrine use by donor and number of blood units transfused

FATORES DE RISCO ASSOCIADOS A COLONIZAÇÃO E A INFECÇÃO POR ENTEROCOCCUS SPP. RESISTENTES À VANCOMICINA (VRE) EM PACIENTES TRANSPLANTADOS DE FÍGADO

Introdução: Enterococcus spp. resistentes à vancomicina (VRE) são microrganismos multidroga resistentes (MDRO) comumente isolados em pacientes submetidos a transplante de fígado (TF), e estão potencialmente associados a piores desfechos clínicos. Existem poucos dados sobre os fatores de risco para a colonização e infecção por VRE nessa população. Nosso objetivo é identificar os fatores de risco associados à colonização e infecção por VRE após TF. Métodos: Esse é um estudo de coorte retrospectivo que incluiu todos os adultos submetidos a TF entre 2010 e 2019 em um hospital de alta complexidade. O período de acompanhamento foi de 180 dias após TF. A análise estatística incluiu variáveis relacionadas às características dos pacientes, procedimentos e complicações pós transplante. Utilizamos o modelo de regressão de Cox para análises univariadas e multivariadas. Resultados: Foram incluídos 855 pacientes, a mediana de idade foi 54 anos (IQR 41 - 61) e escore de MELD no TF de 21 (IQR 13 - 29). 107 (13%) adquiriram VRE antes do TF. A colonização após o TF ocorreu em 144 pacientes (19%), sendo que 80 (9%) desenvolveram infecção por VRE. As infecções mais comuns foram infecção do sítio cirúrgico (36-45%) e infecção da corrente sanguínea relacionada ao cateter (22-28%), o tempo médio entre o TF e a infecção por VRE foi de 15 dias. Os fatores de risco para colonização por VRE identificados na análise multivariada foram CLIF-SOFA elevado no pré-TF (p < 0.001), ascite refratária no pré-TF (p = 0.03), tempo prolongado de internação no pré-TF (p = 0.005) e reoperação pós-TF (p < 0.001). A presença de doença hepática por HCV foi identificada como fator protetor (p = 0.03). Para infecção por VRE, as variáveis preditoras no modelo final foram colonização por VRE pré-TF (p < 0.001), colonização por VRE pós-TF (p < 0.001), hepatite fulminante (p = 002), reoperação (p < 0.001), retransplante (p < 0.001), sangramento intraoperatório (p = 0.04) e transplante combinado (p = 0.04). A mortalidade em 180 dias após o TF foi de 20%, 27% e 53% para pacientes não colonizados por VRE, pacientes colonizados por VRE, mas não infectados, e pacientes infectados por VRE, respectivamente. A infecção e colonização por VRE foram associadas à mortalidade em 180 dias após o TF. Conclusões: A colonização por VRE antes e após o TF é um dos principais fatores de risco para a ocorrência de infecção por VRE. A infecção por VRE diminui substancialmente a sobrevida dos receptores de TF