Relación evolutiva y estructural de las subunidades de los receptores ionotrópicos nmda, ampa y kainato en cuatro especies de primates

El glutamato es uno de los principales neurotransmisores del sistema nervioso central (SNC), actúa a través de receptores ionotrópicos y metabotrópicos siendo esencial para procesos que estimulan el aprendizaje y la memoria así como diversas patologías. El estudio de los receptores sensibles al glutamato ha permitido contribuir al conocimiento de diversos procesos que se llevan a cabo en el SNC, en ese sentido la bioinformática se ha convertido en una herramienta indispensable en la colección, organización, almacenamiento y recuperación de la información biológica que se encuentra en bases de datos relacionada con los receptores y que ha permitido dar respuesta o generar nuevas ideas en el contexto biológico. El objetivo de este proyecto fue analizar la influencia que tienen los cambios que se presentan en las secuencias proteicas de las subunidades de los receptores NMDA, AMPA Y KAINATO en la estructura secundaria para las especies Homo sapiens, Pan troglodytes, Pongo Pigmeus y Macaca mulata y en la relación evolutiva que se pueda establecer para las mismas. Empleando herramientas computacionales se encontró que las subunidades GluR5, GluR6, NR2A y NR3A presentan cambios que involucran los dominios de unión a ligando S1 y S2 y sugieren variaciones en la interacción con el glutamato o en la estabilización del bolsillo de unión al ligando. Por otra parte las subunidades GLUR5, NR2A, NR2C y NR3A se destacaron por presentar una mayor proporción de cambios en la región C-terminal, los cuales generan cambios en la predicción de estructura secundaria y proponen variaciones en las interacciones con las proteínas que se unen a dominios ubicados en esta región y que están involucradas en los procesos de direccionamiento, tráfico y anclaje de los receptores en las posiciones intracelulares. Lo anterior se relaciona con la predicción de sitios de fosforilación que aparecen o se pierden en la región Cterminal en las subunidades GluR5 (especies Homo sapiens y Pan troglodytes), NR2A (especies Macaca mulata y Rattus norvegicus), NR2C (especies Pan troglodytes y Rattus norvegicus) y NR3A (especie Rattus norvegicus), que nos plantean cambios en la interacción de estas subunidades con proteínas quinasas y con proteínas con dominios PDZ que se unen a los dominios PDZ en la región Cterminal de los iGluRs y actúan como complejos moleculares que se puede asociar a otras proteínas en la zona intracelular. Por último las inferencias filogenéticas por subunidad nos permitieron observar relaciones más estrechas entre las especies Homo sapiens, Pan troglodytes y Pongo Pigmeus en las subunidades NR2A y B, y entre las especies Pan troglodytes, Pongo Pigmeus y Macaca mulata en las subunidades AMPA 1 y 2. Para las demás subunidades la información en el alineamiento no fue suficiente para establecer relaciones significativas de parentesco.Magíster en Ciencias BiológicasMaestrí

La experiencia de aprender a sentir: relatos de maestras y maestros en torno a la relación técnicas somáticas y socioemocionalidad

111 páginasEn la investigación Corporeidad, técnicas somáticas y socioemocionalidad, desarrollada en 2021 por el IDEP, se invitó a maestras y maestros a relatar la experiencia encarnada y emocionada durante el proceso investigativo. La idea fue que reflexionaran, organizaran sus ideas, dialogaran consigo mismos y con el mundo y, de esta manera, hicieran su aporte particular a la innovación educativa a partir de recrear en los escritos su propio crecimiento y experiencia específica vivida en/desde el componente formativo de la investigación. También, para que estos relatos motiven a otras maestras y maestros a crecer como personas en su acto de enseñar, en su didáctica o a reconocer a sus estudiantes como auténticos(as) otros(as)

Estudo computacional das relações evolutivas dos receptores ionotrópicos NMDA, AMPA e cainato em quatro espécies de primatas.

Objective. To identify the influence of changes on the secondary structure and evolutionary relationship of NMDA, AMPA and kainate receptors in Homo sapiens, Pan troglodytes, Pongo pygmaeus and Macaca mulatta. Materials and methods. We identified 91 sequences for NMDA, AMPA and kainate receptors and analyzed with software for predicting secondary structure, phosphorylation sites, multiple alignments, selection of protein evolution models and phylogenetic prediction. Results. We found that subunits GLUR5, NR2A, NR2C and NR3A showed structural changes in the C-terminal region and formation or loss of phosphorylation sites in this zone. Additionally the phylogenetic prediction suggests that the NMDA NR2 subunits are the closest to the ancestral node that gives rise to the other subunits. Conclusions. Changes in structure and phosphorylation sites in GLUR5, NR2A, NR2C and NR3A subunits suggest variations in the interaction of the C-terminal region with kinase proteins and with proteins with PDZ domains, which could affect the trafficking and anchoring of the subunits. On the other hand, the phylogenetic prediction suggests that the changes that occurred in the NR2 subunits gave rise to the other subunits of glutamate ionotropic receptors, primarily because the NMDA and particularly the NR2D subunits are the most closely related to the ancestral node that possibly gave rise to the iGluRs. Key words: glutamate ionotropic receptors, iGluRs, NMDA, NR1, NR2A, NR2C, NR3A, AMPA, GluR5.Objetivo.Identificar la influencia de los cambios respecto a la estructura secundaria y a la relación evolutiva de los receptores NMDA, AMPA Y KAINATO en las especies Homo sapiens,Pan troglodytes, Pongo pygmaeus, y Macaca mulata. Materiales y Métodos. Se recopilaron 91 secuencias correspondientes a los receptores NMDA, AMPA y Kainato y se sometieron a los programas de predicción de estructura secundaria, sitios de fosforilación, alineamientos múltiples, selección del modelo de evolución y predicción filogenética. Resultados.Se encontróque las subunidades GLUR5, NR2A, NR2C y NR3A presentaron cambios de estructura en la región C-terminal y aparición o pérdida de sitios de fosforilación en esta zona. Adicionalmente la predicción filogenética nos propone que las subunidades NR2 de NMDA son las más cercanas al nodo ancestral que da origen a los demás subunidades. Conclusiones. Los cambios de estructura y sitios de fosforilación en las subunidades GLUR5, NR2A, NR2C y NR3A nos sugieren variaciones en la interacciónde la región C-terminal con proteínas quinasas y con proteínas con dominios PDZ lo cual podría afectar el tráfico y anclaje de las subunidades.Por otra parte la predicción filogenética nos propone que los cambios que se presentaron en las subunidades NR2 dieron origen a las demás subunidades de los receptores ionotrópicos de glutamato, básicamente porque son las subunidades de NMDA y en particular NR2D las que se encuentran más estrechamente relacionadas con el nodo ancestral que posiblemente dio origen a los iGluRs.Palabras clave: receptores ionotrópicos de glutamato, iGluRs, NMDA, NR1, NR2A NR2C, NR3A, AMPA, GluR5.Objetivo. Identificar a influência das mudanças da estrutura secundária e da relação evolutiva dos receptores NMDA, AMPA e cainato nas espécies Homo sapiens, Pan troglodytes, Pongo pygmaeus e Macaca mulatta. Materiais e métodos. Foram recopiladas 91 seqüências correspondentes aos receptores NMDA, AMPA e cainato e foram submetidos a programas de predição de estrutura secundária, sítios de fosforilação, alinhamentos múltiplos, seleção do modelo de evolução e predição da filogenia. Resultados. Descobrimos que as subunidades GLUR5, NR2A, NR2C e NR3A apresentaram alterações estruturais na região C-terminal e aparecimento ou perda de sítios de fosforilação nesta área. Além disso, a predição filogenética sugere ainda que as subunidades NR2 de NMDA são as mais próximas ao nó ancestral que dá origem às demais subunidades. Conclusões. As mudanças na estrutura e nos sítios de fosforilação nas subunidades GLUR5, NR2A, NR2C e NR3A sugerem variações na interação da região C-terminal com proteínas quinase e com proteínas de domínios PDZ que poderia afetar o tráfego e fixação das subunidades. Além disso, a predição filogenética sugere que as mudanças ocorridas nas subunidades NR2 deram origem às outras subunidades de receptores ionotrópicos de glutamato, principalmente porque são subunidade NMDA e particularmente NR2D aquelas que são mais estreitamente relacionadas com o nó ancestral que provavelmente deu origem aos iGluRs. Palavras-chave: receptores ionotrópicos de glutamato, iGluRs, NMDA, NR1, NR2A NR2C, NR3A, AMPA, GluR5

Estudio computacional de las relaciones evolutivas de los receptores ionotrópicos NMDA, AMPA y kainato en cuatro especies de primates

Computational study of the evolutionary relationships of the ionotropic receptors NMDA, AMPA and kainate in four species ofprimates. Objective. To identify the influence of changes on the secondary structure and evolutionary relationship of NMDA, AMPA andkainate receptors in Homo sapiens, Pan troglodytes, Pongo pygmaeus and Macaca mulatta. Materials and methods. We identified 91sequences for NMDA, AMPA and kainate receptors and analyzed with software for predicting secondary structure, phosphorylation sites,multiple alignments, selection of protein evolution models and phylogenetic prediction. Results. We found that subunits GLUR5, NR2A,NR2C and NR3A showed structural changes in the C-terminal region and formation or loss of phosphorylation sites in this zone.Additionally the phylogenetic prediction suggests that the NMDA NR2 subunits are the closest to the ancestral node that gives rise to theother subunits. Conclusions. Changes in structure and phosphorylation sites in GLUR5, NR2A, NR2C and NR3A subunits suggestvariations in the interaction of the C-terminal region with kinase proteins and with proteins with PDZ domains, which could affect thetrafficking and anchoring of the subunits. On the other hand, the phylogenetic prediction suggests that the changes that occurred in the NR2subunits gave rise to the other subunits of glutamate ionotropic receptors, primarily because the NMDA and particularly the NR2D subunitsare the most closely related to the ancestral node that possibly gave rise to the iGluRs