Theoretical and experimental study of a new thiosulfonate derivative: Methyl trifluoromethanethiosulfonate, CF3SO2SCH3. Conformational transferability in CX3SO2S-R compounds

Methyl trifluoromethanethiosulfonate, CF3SO2SCH3, was synthesized and characterized by 13C NMR, 19F NMR, and vibrational spectroscopy. This structural study was supported by MP2 and DFT (B3LYP and MPW1PW91) calculations, which revealed a strong dependence of the theoretical structure on the polarization of the basis set. Theoretical data indicate that only one conformer, gauche, is predicted by rotating around the S–S bond. This conformational preference was studied using the total energy scheme and natural bond orbital partition scheme. These results evidence that electron delocalization and especially LP S → σ∗ C(1)-S interactions play an interesting role in the reactivity-structure connection of oxoesters and thioesters. Gas and liquid infrared and liquid Raman spectra were recorded and assigned. The experimental vibrational data along with theoretical force constants (B3LYP) were used to define a scaled quantum mechanical force field, which enabled the reproduction of the measured frequencies with a final root-mean-square deviation of 8.06 cm−1.Fil: Galván, Jorge Edgardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; ArgentinaFil: Contreras Aguilar, Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Química Inorgánica ; ArgentinaFil: Defonsi Lestard, Maria Eliana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; ArgentinaFil: Tuttolomondo, María Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; ArgentinaFil: Ulic, Sonia Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Química Inorgánica ; Argentina. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; ArgentinaFil: Ben Altabef, Aída. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; Argentin

A conformational and vibrational study of CF₃COSCH₂CH₃

The molecular structure and conformational properties of S -ethyl trifluorothioacetate, CF3 COSCH2 CH3, were determined in the gas phase by electron diffraction and vibrational spectroscopy (IR and Raman). The experimental investigations were supplemented by ab initio (Møller Plesset of second order) and density functional theory quantum chemical calculations at different levels of theory. Both experimental and theoretical methods reveal two structures with Cs (anti, anti) and C1 (anti, gauche) symmetries, although there are disagreements about which is more stable. The electron diffraction intensities are best interpreted with a mixture of 51(3)% anti, anti and 49(3)% anti, gauche conformers. This conformational preference was studied using the total energy scheme and the natural bond orbital scheme. In addition, the infrared spectra of CF3 COSCH2 CH3 are reported for the gas, liquid and solid phases as well as the Raman spectrum of the liquid. Using calculated frequencies as a guide, evidence for both Cs and C1 structures is obtained in the IR spectra. Harmonic vibrational frequencies and scaled force fields have been calculated for both conformers.Fil: Defonsi Lestard, Maria Eliana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Física; ArgentinaFil: Tuttolomondo, María Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Física; ArgentinaFil: Wann, Derek A.. University of Edinburgh; Reino UnidoFil: Robertson, Heather E.. University of Edinburgh; Reino UnidoFil: Rankin, David W. H.. University of Edinburgh; Reino UnidoFil: Ben Altabef, Aída. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Física; Argentin

Refinamiento simulado a partir de patrones de difracción de rayos-X de polvos y cálculos químico-cuánticos como herramientas para el estudio estructural y espectroscópico de derivados de 1-(2furoil)tioureay sus complejos con Hg2+

La tiourea y sus derivados tienen una amplia aplicación en los campos de la medicina, la agricultura y la química analítica. Todo este amplio espectro de aplicaciones potenciales tiene su origen en la estructura molecular y cristalina. El trabajo que se presenta consiste en la determinación y el refinamiento simulado de las estructuras cristalinas a partir de patrones de difracción de rayos-X de polvos de 5 derivados de la 1-(2-furoil)tiourea (3 tioureas y 2 complejos con Hg2+), así como el estudio de la estructura molecular y espectroscópico de otros dos derivados de la 1-(2-furoil)tiourea a partir de cálculos químico-cuánticos. Estos resultados son fruto de la colaboración complementaria entre nuestro grupo de trabajo del IMRE e investigadores de la Universidad Nacional de Tucumán en Argentina, y han dado lugar a la publicación durante el año de 5 artículos científicos en revistas de la Web of science. El resultado debe considerarse un estudio básico en Química y su principal contribución corresponde al conocimiento de la estructura cristalina de los derivados de tiourea y sus complejos con cloruro de mercurio.Fil: Estévez Hernández, Osvaldo. Universidad de La Habana. Instituto de Ciencia y Tecnología de Materiales; CubaFil: Duque Rodríguez, Julio. Universidad de La Habana. Instituto de Ciencia y Tecnología de Materiales; CubaFil: Reguera Ruiz, Ediso. Instituto Politécnico Nacional; MéxicoFil: Rodríguez Hernández, Joelis. Centro de Investigaciones en Química Aplicada; CubaFil: Gil, Diego Mauricio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; ArgentinaFil: Defonsi Lestard, Maria Eliana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; ArgentinaFil: Yee Madeira, Hernani. Instituto Politécnico Nacional; MéxicoFil: Erben, Mauricio Federico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Química Inorgánica "Dr. Pedro J. Aymonino". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Química Inorgánica "Dr. Pedro J. Aymonino"; Argentin

Synthesis, characterization and crystal structure of 2-chloroethyl(methylsulfonyl)methanesulfonate

The aim of this study was to evaluate the structural and vibrational properties and biological activity of 2-chloroethyl(methylsulfonyl)methanesulfonate, CH3SO2CH2SO2OCH2CH2Cl (clomesone). The solid-state molecular structure has been isolated and characterized using experimental (X-ray diffraction) and theoretical (DFT method) methodologies. The molecules are packed through C-H⋯O bifurcated interactions and Cl⋯Cl interactions. The experimental investigations are supplemented by quantum chemical calculations and Hirshfeld surface calculations. Furthermore, the infrared and Raman spectra of the solid phase have been obtained, and the observed bands are assigned to the vibrational normal modes. This study is completed using the atoms-in-molecules (AIM) theory and natural bond orbital (NBO) analysis. Finally, we studied the function of clomesone in biofilm formation and investigated a methanesulfonate complex with respect to QS activity.Centro de Química InorgánicaInstituto de Física La Plat

Synthesis, characterization and crystal structure of 2-chloroethyl(methylsulfonyl)methanesulfonate

The aim of this study was to evaluate the structural and vibrational properties and biological activity of 2-chloroethyl(methylsulfonyl)methanesulfonate, CH3SO2CH2SO2OCH2CH2Cl (clomesone). The solid-state molecular structure has been isolated and characterized using experimental (X-ray diffraction) and theoretical (DFT method) methodologies. The molecules are packed through C-H⋯O bifurcated interactions and Cl⋯Cl interactions. The experimental investigations are supplemented by quantum chemical calculations and Hirshfeld surface calculations. Furthermore, the infrared and Raman spectra of the solid phase have been obtained, and the observed bands are assigned to the vibrational normal modes. This study is completed using the atoms-in-molecules (AIM) theory and natural bond orbital (NBO) analysis. Finally, we studied the function of clomesone in biofilm formation and investigated a methanesulfonate complex with respect to QS activity.Fil: Galván, Jorge Edgardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; ArgentinaFil: Defonsi Lestard, Maria Eliana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; ArgentinaFil: Piro, Oscar Enrique. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Física La Plata. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Física La Plata; ArgentinaFil: Echeverría, Gustavo Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Física La Plata. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Física La Plata; ArgentinaFil: Molina, Rocío Daniela Inés. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto de Biotecnología Farmacéutica y Alimentaria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Biotecnología Farmacéutica y Alimentaria; ArgentinaFil: Arena, Mario Eduardo. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto de Biotecnología Farmacéutica y Alimentaria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Biotecnología Farmacéutica y Alimentaria; ArgentinaFil: Ulic, Sonia Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Química Inorgánica "Dr. Pedro J. Aymonino". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Química Inorgánica "Dr. Pedro J. Aymonino"; Argentina. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; ArgentinaFil: Tuttolomondo, María Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; ArgentinaFil: Ben Altabef, Aída. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; Argentin

Refinamiento simulado a partir de patrones de difracción de rayos-X de polvos y cálculos químico-cuánticos como herramientas para el estudio estructural y espectroscópico de derivados de 1-(2furoil)tioureay sus complejos con Hg2+

La tiourea y sus derivados tienen una amplia aplicación en los campos de la medicina, la agricultura y la química analítica. Todo este amplio espectro de aplicaciones potenciales tiene su origen en la estructura molecular y cristalina. El trabajo que se presenta consiste en la determinación y el refinamiento simulado de las estructuras cristalinas a partir de patrones de difracción de rayos-X de polvos de 5 derivados de la 1-(2-furoil)tiourea (3 tioureas y 2 complejos con Hg2+), así como el estudio de la estructura molecular y espectroscópico de otros dos derivados de la 1-(2-furoil)tiourea a partir de cálculos químico-cuánticos. Estos resultados son fruto de la colaboración complementaria entre nuestro grupo de trabajo del IMRE e investigadores de la Universidad Nacional de Tucumán en Argentina, y han dado lugar a la publicación durante el año de 5 artículos científicos en revistas de la Web of science. El resultado debe considerarse un estudio básico en Química y su principal contribución corresponde al conocimiento de la estructura cristalina de los derivados de tiourea y sus complejos con cloruro de mercurio.Facultad de Ciencias Exacta

Vibrational spectroscopy and conformation of S-ethyl thioacetate: CH3COSCH2CH3 and comparison with AC(O)SA and AC(O)OA compounds

The molecular structure and conformational properties of S-ethyl thioacetate, CH3COSCH2CH3, were determined in the gas phase by electron diffraction and vibrational spectroscopy (IR and Raman). The experimental investigations were supplemented by ab initio (MP2) and DFT quantum chemical calculations at different levels of theory. Theoretical methods reveal two structures with Cs (anti, anti) and C1 (anti, gauche) symmetries. The infrared and Raman spectra for different phases were also recorded and the bands observed assigned to the vibrational normal modes. Liquid Raman and infrared spectra in liquid and gaseous state measurements revealed the presence of two conformations anti, anti (Cs symmetry) and anti, gauche (C1 symmetry). The study was completed using natural bond orbital (NBO) analysis. We have also analyzed the internal rotation barrier about the C(O)SCC dihedral angle using a variety of computational approaches and natural bond orbital (NBO) analyses to understand the nature of the potential function and to explain the preferred conformation of the molecule.Fil: Defonsi Lestard, Maria Eliana. Universidad Nacional de Tucumán; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Quimica del Noroeste; ArgentinaFil: Tuttolomondo, Maria Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Quimica del Noroeste; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán; ArgentinaFil: Ben Altabef, Aida. Universidad Nacional de Tucumán; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Quimica del Noroeste; Argentin

Experimental and quantum chemical studies on the molecular structure of 3,3,3-trifluoropropane-1-sulfonyl chloride: CF3CH2CH2SO2Cl

The experimental and theoretical study on the molecular and vibrational analysis of CF3CH2CH2SO2Cl, 3,3,3-trifluoropropane 1-sulfonyl chloride is presented. The IR and Raman spectra were recorded in liquid state and compared with the spectral data obtained by the DFT/B3LYP method usingthe6-311G(3df) basis set. The influence of hyperconjugation effects of the lone pairs (LP) chlorine atom on the vibrational behavior of the group SO2 was determined. The TD-DFT approach was applied to assign the electronic transitions observed in the UV-visible spectrum.Fil: Galván, Jorge Edgardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Física; ArgentinaFil: Defonsi Lestard, Maria Eliana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Física; ArgentinaFil: Tuttolomondo, María Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Física; ArgentinaFil: Ben Altabef, Aída. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Química del Noroeste. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química del Noroeste; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Química Física; Argentin

Trimethylsilyl trichloroacetate vibrational, structural and electronic properties and their comparison with related acetates

The molecular structure of trimethylsilyl trichloroacetate, CCl3 C(O)OSi(CH3 )3 , was determined by ab initio (MP2) and DFT calculations using 6-31G(d), 6-311G(d,p), 6-311++G(d,p) and 6-311++G(3df,3pd) basis sets. The infrared and Raman spectra for the liquid phase were also recorded and the bands observed assigned to the vibrational normal modes. The study was completed using natural bond orbital (NBO) analysis and atoms in molecules (AIM) calculations. The comparison between the calculated molecular geometrical parameters, conformation and vibrational properties and those measured for CX3C(O)OR [X = F, Cl and R = CH3 , Si(CH3 )3 ] was of particular interest in order to check the behavior of the C   O and C  O with respect to the different substitutions. The experimental vibrational data, along with calculated theoretical force constants, were used to define a scaled quantum mechanical force field for the target system that enabled us to estimate the measured wavenumbers with a final root-mean-square deviation of 8.92 cm−1 .Fil: Defonsi Lestard, Maria Eliana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Quimica del Noroeste; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán; ArgentinaFil: Cobos Picot, Rafael Alejandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Quimica del Noroeste; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán; ArgentinaFil: Tuttolomondo, María Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Quimica del Noroeste; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán; ArgentinaFil: Ben Altabef, Aida. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Quimica del Noroeste; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán; Argentin

Quantum chemical studies on molecular structure, spectroscopic (IR, Raman, UV-Vis), NBO and HOMO-LUMO analysis of 1-benzyl-3-(2-furoyl) thiourea

Vibrational and electronic spectra for 1-benzyl-3-(2-furoyl) thiourea were calculated by using density functional method (B3LYP) with different basis sets. The complete assignment of all vibrational modes was performed on basis of the calculated frequencies and comparing with the reported IR and Raman spectra for that thiourea derivative. UV-visible absorption spectra of the compound dissolved in methanol were recorded and analyzed using time dependent density functional theory (TD-DFT). The calculated values for the geometrical parameters of the title compound are consistent with the ones reported from XRD studies. The stability of the molecule, related to hyper-conjugative interactions, and electron delocalization were evaluated using natural bond orbital (NBO) analysis. Intramolecular interactions were studied by AIM approach. The HOMO and LUMO analysis are used to determine the charge transfer within the molecule. Molecular electrostatic potential map was performed by the DFT method.Fil: Gil, Diego Mauricio. Universidad Nacional de Tucumán; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Quimica del Noroeste; ArgentinaFil: Defonsi Lestard, Maria Eliana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Quimica del Noroeste; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán; ArgentinaFil: Estevez Hernandez, O.. Universidad de la Habana; CubaFil: Duque, J.. Instituto Politécnico Nacional. Centro de Investigación en Ciencia Aplicada y Tecnología de Avanzada; MéxicoFil: Reguera, E.. Instituto Politécnico Nacional. Centro de Investigación en Ciencia Aplicada y Tecnología de Avanzada; Méxic