Cloning, expression and characterization of L-arabinose isomerise from thermophilic Anoxybacillus kestanbolensis AC26Sari strain: Bioconversation of L-arabinose to L-ribulose

343-350L-Arabinose isomerase (L-AI) is a pivotal enzyme in the microbial pentose phosphate pathway. It is considered as a significant biological catalyst in rare sugar production. This enzyme can isomerize L-arabinose into L-ribulose and also D-galactose into D-tagatose. Here, we cloned the araA gene encoding L-arabinose isomerase from Anoxybacillus kestanbolensis AC26Sari strain, sequenced and over-expressed in E. coli BL21 (DE3): pLysS. This gene is involved in L-arabinose operon in A. kestanbolensis AC26Sari. DNA sequence analysis revealed an open reading frame of 1,506 bp, capable of encoding a polypeptide of 502 amino acid residues with calculated molecular weight of 55.6776 kDa. The recombinant was purified by heat treatment and Ni-HisTaq chromatography. The purified enzyme showed maximal activity at pH 8.5 and 65ºC and required divalent cations such as Co2+ and Mn2+ for its activity and thermostability. The apparent Km value of the enzyme for L-arabinose was 6.5 mM (Vmax, 140.1002 U/mg) as determined in the precence of both 1 mM Co2+ and Mn2+

Cloning, expression and characterization of L-arabinose isomerisefrom thermophilic Anoxybacillus kestanbolensis AC26Sari strain:Bioconversation of L-arabinose to L-ribulose

L-Arabinose isomerase (L-AI) is a pivotal enzyme in the microbial pentose phosphate pathway. It is considered as asignificant biological catalyst in rare sugar production. This enzyme can isomerize L-arabinose into L-ribulose and alsoD-galactose into D-tagatose. Here, we cloned the araA gene encoding L-arabinose isomerase from Anoxybacilluskestanbolensis AC26Sari strain, sequenced and over-expressed in E. coli BL21 (DE3): pLysS. This gene is involved inL-arabinose operon in A. kestanbolensis AC26Sari. DNA sequence analysis revealed an open reading frame of 1,506 bp,capable of encoding a polypeptide of 502 amino acid residues with calculated molecular weight of 55.6776 kDa. Therecombinant was purified by heat treatment and Ni-HisTaq chromatography. The purified enzyme showed maximal activityat pH 8.5 and 65ºC and required divalent cations such as Co2+ and Mn2+ for its activity and thermostability. The apparent Kmvalue of the enzyme for L-arabinose was 6.5 mM (Vmax, 140.1002 U/mg) as determined in the precence of both 1 mM Co2+and Mn2+

Influenza Virus Associated Pediatric Acute Respiratory Distress Syndrome: Clinical Characteristics and Outcomes.

Background and Objective: The aim of this multicenter retrospective study was to determine the clinical characteristics, treatment approaches and the course of pediatric acute respiratory distress syndrome (PARDS) which developed associated with the influenza virus in the 2019-20 season

COVID-19 Hastalığı ile İlişkili Çoklu Sistemik İnflamatuvar Sendrom Tanılı Çocuk Olguların Değerlendirilmesi

Giriş: Nisan 2020 yılında, SARS-CoV-2 enfeksiyonu geçiren bazı çocuklarda ateş, karın ağrısı, inotrop desteği gerektiren hipotansiyon ve miyokardiyal disfonksiyona yol açan COVID-19 hastalığı ile ilişkili Çoklu Sistemik İnflamatuvar Sendrom(Multisystem Inflammatory Syndrome in Children-MIS-C) olarak adlandırılan hastalık tanımlanmıştır.Bu çalışmada ülkemizde görülen MIS-C tanılı olguların değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Materyal-Metod: Bu çalışmada retrospektif olarak Nisan2020-Ağustos2020 tarihleri arasında birden fazla merkezde MIS-C tanısıyla izlenen olguların sosyodemografik, klinik, laboratuvar bulgularıyla tedavi rejimleri ve izlem sonuçları irdelendi. Bulgular: Çalışmaya alınan 29 olgunun 16'sı(%55.2) erkekti ve ortanca yaşları 66 ay(2-208 ay) idi. Olguların 7'si fazla kilolu(vücut kitle indeksi persentili >=%85) olarak değerlendirildi. On bir olguda SARS-CoV-2 RT-PCR pozitifliği, 12'sinde antikor testlerinde pozitiflik saptanırken 4 olguda PCR ve antikor testlerinde pozitiflik görüldü. İki olgunun ise PCR negatif gelmekle birlikte COVID-19 tanılı olguyla temas öyküsü mevcuttu. Olguların tamamında ateş, 22'sinde (%75.9) gastrointestinal semptomlar ve yorgunluk, 20'sinde(%69) döküntü, 17'sinde(%58.6) bulbar konjoktivit ve el-ayaklarda renk değişikliği, 16'sında (%55.2) dudaklarda fissür, 14'ünde (%48.3) kas ağrısı ve çilek dil mevcuttu.Ateş süresinin ortanca değeri 7 (3-17gün) gün saptandı.Olguların 21'inde (%72.4) dehidratasyon, 14'ünde (%48.3) taşikardi, 11'inde hipotansiyon (%37.9) saptandı.Laboratuvar bulgularından ortanca lökosit sayısı 6365 mm³ (3300-31220 mm³), ortanca lenfosit sayısı 1135(570-5800 mm³), ortanca trombosit sayısı 160500 mm³ (46000-747000 mm³) saptandı. Ortalama CRP değeri 165±102 mg/L, ESH değeri 62.6±31.4 mm/s saptandı.Tedavide; olguların 23'üne (%79.3) IVIG, 15'ine (%51.7) asetil salisik asit, 11'ine (%37.9) steroid, 8'ine (%27.6) antikoagülan tedavi uygulandı.Antiviral tedavi 7 (%24.1) olguya uygulandı. 2 olguya tocilizumab tedavisi verildi.Ortanca yatış süreleri 10 gün(1-27) saptanırken 9 olguda yoğun bakım ihtiyacı geliştiği görüldü.3 olgu entübe edildi ve 2 olguda exitus gelişti.Sonuç: MIS-C; yeni tanımlanan, kesin bir tedavisi olmayan hayati tehlikeye neden olabilen organ tutulumu ve şok gelişimine yol açabilecek bir hastalıktır.Çalışmamızda MIS-C olgularında, 3 günden uzun süren ateş, gastrointestinal şikayetler ve yorgunluk en sık görülen yakınmalar olarak belirlendi.COVID-19 pandemi döneminde bu yakınmalarla gelen çocuklarda MIS-C akılda tutulmalı; hızlı tanı ve agresif tedavinin klinik olumlu etkileri unutulmamalıdır