Analysis of the transcriptional activation and cross-regulatory functions of the p53 family members in tumour suppression by functional genomics

Kutatásainkat kiterjesztettük nem csak az emlős p53 család tagjaira, hanem a Drosophila melanogaster p53-ra (Dmp53) is. Kimutattuk, hogy a Dmp53 hiányos Drosophilák ultraibolya (UV) sugárzásra fokozottan érzékenyek. Dmp53 által indukált géneket azonosítottunk cDNS microarray technológiával, majd e célgének sugárzás általi indukcióját vizsgáltuk kvantitatív ""real time PCR"" technikával. Míg egyes gének (pl. hid) mind ionizáló, mind UV sugárzás hatására Dmp53-függő módon indukálódtak, más gének expressziója csak UV (pl. Ark) vagy csak ionizáló sugárzás esetén (pl. reaper) emelkedett meg. Eredményeink elsőként mutatják ki, hogy a Dmp53 különféle DNS károsodás hatására különféle célgéneket aktivál. A Dmp53-mal kölcsönható fehérjék azonosítására élesztő két-hibrid módszert alkalmaztunk. Az egyik azonosított kölcsönható partner a DLP (Daxx like protein). DLP mutáns állatokat előállítva megállapítottuk, hogy életképesek, de élettartamuk megrövidül, és csökkent fertilitástúak, továbbá, hogy a DLP részt vesz a Dmp53 transzkripciós és apoptotikus aktivitásának szabályozásában. Egy másik azonosított partner a TAF(II)155, melynek kölcsönhatását a humán p53-mal és p73-mal is kimutattuk. Megállapítottuk, hogy humán homológja, a TAF3 gátolja a humán p53 és p73 transzkripciós aktivitását és csökkenti a p53 fehérje szintjét. A Dmp53 új, evolúcionárisan konzervált szabályozóinak azonosításával új távlatokat nyitottunk meg a p53 tumor szupresszor és családtagjai szabályozásának megértésében. | We extended our studies not only to the mammalian family members of p53 but also to Drosophila melanogster p53 (Dmp53). We showed that Dmp53 deficient Drosophilas are highly sensitive to ultraviolet (UV) radiation. We identified genes induced by Dmp53 using cDNA microarray technology, then studied the radiation inducibility of these target genes employing quantitative real time PCR technique. While some genes (e.g. hid) were induced in a Dmp53-dependent way upon both ionizing and UV radiation, expression of other genes was elevated upon UV treatment only (e.g. Ark) or upon IR only (e.g. reaper). Our data are first to show that Dmp53 activates different target genes upon different types of DNA damage. In order to identify proteins interacting with Dmp53, we used the yeast two hybrid method. One of the identified interacting partners is DLP (Daxx like protein). We generated DLP mutant animals, and found that they are viable but have shortened lifespan, and reduced fertility. Furthermore, DLP participates in the regulation of the transcriptional and apoptotic activity of Dmp53. Another identified partner is TAF(II)155, and it can interact with human p53 and p73 as well. We showed that its human homolog, TAF3 inhibits the transcriptional activity of p53 and p73 and it reduces the level of the p53 protein. By identifying novel, evolutionarily conserved regulators of Dmp53, we opened new avenues to the understanding of the regulation of p53 tumor suppressor and its family members

Open-air schools in Hungary - A countrywide overview

Az elmúlt években többnyire fogalmi, támogatási, és jelentős szervezési, dokumentálási problémákkal fordultak egyesületünkhöz segítségért. Felmerült, hogy vajon ezek általános problémák? Vannak-e még olyan területek, ahol segítséget várnak a kollégák, intézményvezetők? Ezért egy kérdőíves felmérést végeztünk a KIR adatbázisában szereplő összes oktatási intézmény megkeresésével. A kérdéseket, úgy állítottuk össze, hogy adatokat tudjunk szolgáltatni a várható támogatási igényről, az erdei iskolázás szereplőinek összetételéről, szolgáltatások módjáról, és megismerjük a jelenlegi gondokat, azokat a területeket, ahol az intézmények segítséget várnak programjaik szervezéséhez, megvalósításához. Ebben a tanulmányban a felmérés azon tapasztalatait foglalom össze, melyek a módszer előnyeit, szervezési lépéseit és nehézségeit érintik.In the recent years a plenty colleagues and institution leaders reached out for help to us. The most frequent problems were in connection with documentation, organization, funding and the concepts of the open-air schooling. The question arose whether these problems are general or just specific and if there are such areas, where our colleagues expect assistance. In order to answer these questions we conducted a questionnaire-based survey with all of the Hungarian educational institution that are listed in the national educational database. The questionnaire is established in order to gather new information about the quantity of the demanded funds, the composition of the actors in open-air school movement, the different methods of the provided services. In this study I am going to summarize my experiences referring to the advantages of the open-air schooling educational method

Individuality, cooperation, community: a guideline for organizing open-air schools

Sok éves tapasztalatom, hogy gyakran még az idősebb kollégák sincsenek tisztában, az erdei iskola fogalmával, szervezési lépéseivel, a benne rejlő tehetségfelismerési, közösségfejlesztési lehetőségekkel. Ezzel az írásommal kívánok segítséget nyújtani a téma iránt fogékony pedagógusoknak.According to my professional experiences, I observed that in many cases even the older colleges do not know the exact notion of the open-air schools. Besides that they also often lack the knowledge about the steps of the organisational process and many of the educators are not aware of the opportunities that the open-air schools have like the potential to build a strong community and to realize the hidden talents of the students. In my writing I intend to give a guidance and help for those who are interested in the topic of open-air schools and alternative educational methods

A comparison of self-assessment tendencies of full-time and part-time university students

L

The Role of MicroRNAs upon Epithelial-to-Mesenchymal Transition in Inflammatory Bowel Disease

Increasing evidence suggest the significance of inflammation in the progression of cancer, for example the development of colorectal cancer in Inflammatory Bowel Disease (IBD) patients. Long-lasting inflammation in the gastrointestinal tract causes serious systemic complications and breaks the homeostasis of the intestine, where the altered expression of regulatory genes and miRNAs trigger malignant transformations. Several steps lead from acute inflammation to malignancies: epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) and inhibitory microRNAs (miRNAs) are known factors during multistage carcinogenesis and IBD pathogenesis. In this review, we outline the interactions between EMT components and miRNAs that may affect cancer development during IBD

ADA2 tartalmú hiszton acetiltranszferáz komplexek szerepe a génműködés szabályozásában = The role of ADA2-containing histone acetyltransferase complexes in gene

A projekt eredményei hiszton módosító komplexek szerepét és együttműködését bizonyítják a génműködés és a kromoszóma szerkezet szabályozásában. Jellemeztük két rokon szerkezetű ADA2 fehérje faktort tartalmazó acetiltranszferáz komplex működését, melyek (SAGA és ATAC), szigorúan specifikusan módosítják a nukleoszóma hiszton komponenseit. A SAGA a hiszton 3 lizin 9 és 14, az ATAC a hiszton 4 lizin 5 és lizin 12 oldalláncokat acetilálja. Egy harmadik általunk jelemzett faktor (ADA3) mindkét komponens esszenciális része. A SAGA és ATAC komplexek egyes gének működését specifikus transzkripciós faktorokon át szabályozzák, az ATAC komplex pedig az aktív kromatin szerkezet kialakításán keresztül az általános génműködés szabályozásban is fontos szerepet játszik. Az ATAC működésével létrejövő hiszton 4 acatiláció hiányában csökken a JIL-1 hiszton kináz aktivitása és ez a transzkripciósan inaktív heterokromatin kialakulásának irányába tolja el a kromatin szerkezet változásokat. Ehhez kapcsolódva azt is kimutattuk, hogy a hiszton 4 ATAC-al történő acetilációjához egy másik nukleoszóma módosító komplex, az ATP energiájával a nukleoszómákat atrendező NURF működése szükséges. Adataink így a kromatin szerkezet kialakításában fontos szerepet játszó fehérje komplexek koordinált együtműködését bizonyítják. | The results of this project demonstrate the roles of different histone acetyltransferase complexes in the regulation of gene expression and chromatin structure and the interplay of different histone modifying and nucleosome remodeling complexes. We showed that in Drosophila melanogaster two related ADA2 proteins participate in the SAGA and ATAC GCN5-containing histone acetyltransferase complexes which have distinct specificity for different histone tails. The dADA2b-containing dSAGA complex is involved in histone H3 lysine 9 and lysine 14 acetylation, while the dADA2a-containing ATAC complex modifies histone H4 lysine 5 and lysine 12. Both of these complexes harbor the ADA3 factor which we have also identified and characterized. The loss of function of these complexes results in changes both in global gene expression and on the transcription of specific genes. The reduced level of histone H4 lysine 12 acetylation by the ATAC histone acetyltransferase complex also leads to chromatin structural changes by decreasing the phosphorylation level of histone H3 serine 10 by the JIL-1 kinase. The acetylation of histone H4 is dependent on the function of NURF chromatin remodeling complex which activity provides access ATAC to the chromatin. Altogether these data demonstrate an interdependence and delicate balance among the action of chromatin remodeling and modifying complexes in regulating chromatin organization and function

RNA-DNA hybrid (R-loop) immunoprecipitation mapping: an analytical workflow to evaluate inherent biases

K