Engrailed and polyhomeotic maintain posterior cell identity through cubitus-interruptus regulation

AbstractIn Drosophila, the subdivision into compartments requires the expression of engrailed (en) and hedgehog (hh) in the posterior cells and of cubitus-interruptus (ci) in the anterior cells. Whereas posterior cells express hh, only anterior cells are competent to respond to the hh signal, because of the presence of ci expression in these cells. We show here that engrailed and polyhomeotic (ph), a member of the Polycomb Group (PcG) genes, act concomitantly to maintain the repression of ci in posterior compartments during development. Using chromatin immunoprecipitation (ChIP), we identified a 1 kb genomic fragment located 4 kb upstream of the ci coding region that is responsible for the regulation of ci. This genomic fragment is bound in vivo by both Polyhomeotic and Engrailed. In particular, we show that Engrailed is responsible for the establishment of ci repression early during embryonic development and is also required, along with Polyhomeotic, to maintain the repression of ci throughout development

Buildings as landscapes: The analysis of corporate designed landscapes of the 1970s and 1980s

This dissertation uses a case-study approach to examine the design rationale for landscapes associated with corporate architecture of the 1970s and 1980s, and determines whether their design was influenced by government policies or the designers' contextual response to the site

Regulation of nestin expression by thrombin and cell density in cultures of bone mesenchymal stem cells and radial glial cells

BACKGROUND: Bone marrow stromal cells and radial glia are two stem cell types with neural phenotypic plasticity. Bone marrow mesenchymal stem cells can differentiate into osteocytes, chondrocytes and adipocytes, but can also differentiate into non-mesenchymal cell, i.e. neural cells in appropriate in vivo and in vitro experimental conditions. Likewise, radial glial cells are the progenitors of many neurons in the developing cortex, but can also generate astrocytes. Both cell types express nestin, an intermediate filament protein which is the hallmark of neural precursors. RESULTS: In this study, we demonstrate that thrombin, a multifunctional serine protease, stimulates the growth of radial glial cells (RG) and mesenchymal stem cells (MSCs) in a dose-dependent manner. In RG, the mitogenic effect of thrombin is correlated with increased expression of nestin but in MSCs, this mitogenic effect is associated with nestin down-regulation. Both cell types express the PAR-1 type receptor for Thrombin and the effect of Thrombin on both cell types can be mimicked by its analogue TRAP-6 activating specifically this receptor subtype or by serum which contains various amount of thrombin. Moreover, we also demonstrate that serum deprivation-induced expression of nestin in MSCs is inhibited by high cell density (> 50,000 cells/cm2). CONCLUSION: This work shows that thrombin stimulates the growth of both RG and MSCs and that nestin expression by MSCs and RG is regulated in opposite manner by thrombin in vitro. Thrombin effect is thus associated in both cell types with a proliferating, undifferentiated state but in RG this involves the induction of nestin expression, a marker of immaturity for neural progenitors. In MSCs however, nestin expression, as it corresponds to a progression from the mesenchymal "undifferentiated", proliferating phenotype toward acquisition of a neural fate, is inhibited by the mitogenic signal

« Des collections en partage » au musée de Bretagne. Quand la notion de « commun » entre au musée

L’objectif du projet présenté ici était de faire connaître, partager, permettre la réutilisation gratuite, dans le respect des droits des collections et ressources patrimoniales du musée de Bretagne grâce à un outil numérique simple et intuitif pour les utilisateurs. Les responsables présentent les différentes étapes de mise en place et dressent un premier bilan d’utilisation de ce portail qui s’inscrit dans une démarche militante d’ouverture des données culturelles

Zapalenie mięśnia sercowego u dzieci i młodzieży — przegląd piśmiennictwa

Myocarditis is defined by the World Health Organization as an inflammatory disease involving cardiomyocytes, interstitial tissue, vessels and occasionally the pericardium. In this article, literature from the past 5 years regarding epidemiology, diagnostic tests, treatment and prognosis in myocarditis in young children and adolescents was analyzed. For this purpose the Pubmed database was screened using the key words “myocarditis” and “children”, yielding 117 articles. This list of was narrowed down to those in which the study group consisted of at least 5 people and included information about: symptoms and signs, abnormalities in additional tests, etiology, treatment, length of hospitalization and mortality. Finally, the review included 17 studies, describing 1891 children with a diagnosis of myocarditis. The analysis shows that myocarditis is a rare disease. Two peaks of the disease are observed: the first in newborns and infants, the second one in adolescents. Age less than 2 years is a predictor of severe prognosis. In reported cases the most common symptoms were: fatigue, chest pain, palpitations or irregular heart rhythm. Tachycardia, tachypnoe, hypotension and hepatomegaly dominated among findings in physical examination. The interview, the result of physical examination and additional tests (troponin levels, electrocardiogram, echocardiogram) are helpful in making a diagnosis. Cardiac magnetic resonance imaging is used to confirm the diagnosis. In the analyzed group, 65–90% of children were treated in the Intensive Care Unit. Extracorporeal membrane oxygenation was used in 168 cases, a ventricular assist device was implanted in 35 children and 38 children underwent heart transplantation. The mortality rate in myocarditis remains high (25–35% in analyzed studies). Up to 25% of children may develop chronic heart failure. Due to the unpredictable course of this disease, patients in the acute period of the disease should be hospitalized, and after being discharge from the hospital undergo further cardiological check-up.Zapalenie mięśnia sercowego (ZMS) według Światowej Organizacji Zdrowia definiuje się jako chorobę zapalną obejmującą kardiomiocyty, tkankę śródmiąższową, naczynia, a czasem również osierdzie. W poniższym opracowaniu przeanalizowano piśmiennictwo z ostatnich 5 lat dotyczące epidemiologii, badań diagnostycznych, leczenia i rokowania w ZMS u dzieci i młodzieży. W tym celu dokonano przeglądu medycznej bazy danych Pubmed, używając słów/zwrotów kluczowych: „dzieci” (ang. ‘children’), „zapalenie mięśnia sercowego” (ang. ‘myocarditis’) — strategia ta pozwoliła uzyskać łącznie 117 artykułów. Spośród nich wyodrębniono prace, w których badana grupa obejmowała co najmniej 5 dzieci, a w opisie zawarto dane dotyczące objawów klinicznych, odchyleń w badaniach laboratoryjnych oraz badaniach obrazowych, identyfikacji czynników etiologicznych, zastosowanego leczenia oraz czasu hospitalizacji i liczby zgonów. Do analizy końcowej włączono 17 artykułów; zestawienie obejmuje łącznie 1891 dzieci, u których rozpoznano ZMS. Z analizy wynika, że ZMS jest chorobą rzadką. Obserwuje się dwa szczyty zachorowań: w wieku noworodkowym i wczesnoniemowlęcym oraz w okresie dojrzewania, przy czym wiek poniżej 2. rż. jest niekorzystnym czynnikiem rokowniczym. W raportowanych przypadkach najczęstszymi objawami podmiotowymi były: osłabienie, ból w klatce piersiowej, kołatania serca. Wśród objawów przedmiotowych dominowały: tachypnoe, tachykardia, hipotensja, hepatomegalia. Wywiad, wynik badania przedmiotowego oraz wyniki badań dodatkowych (stężenia troponin, elektrokardiogram, echokardiogram) przybliżają do rozpoznania, natomiast „złotym standardem” do ustalenia diagnozy jest badanie rezonansu magnetycznego serca. W analizowanej grupie 65–90% dzieci wymagało leczenia na oddziale intensywnej terapii, u 168 dzieci zastosowano ciągłe pozaustrojowe natlenianie krwi, a 35 dzieciom wszczepiono tak zwane sztuczne komory. U 38 pacjentów wykonano przeszczepienie serca. Śmiertelność w ZMS jest wysoka (w przeanalizowanym piśmiennictwie wyniosła 25–35%). U około 25% dzieci dysfunkcja mięśnia sercowego pozostała trwała. Ze względu na nieprzewidywalny przebieg choroby pacjent w ostrym okresie choroby powinien być hospitalizowany, a po wypisaniu ze szpitala podlegać dalszej kontroli kardiologicznej

Zapalenie mięśnia sercowego u dzieci i młodzieży — przegląd piśmiennictwa

Zapalenie mięśnia sercowego (ZMS) według Światowej Organizacji Zdrowia definiuje się jako chorobę zapalną obejmującą kardiomiocyty, tkankę śródmiąższową, naczynia, a czasem również osierdzie. W poniższym opracowaniu przeanalizowano piśmiennictwo z ostatnich 5 lat dotyczące epidemiologii, badań diagnostycznych, leczenia i rokowania w ZMS u dzieci i młodzieży. W tym celu dokonano przeglądu medycznej bazy danych Pubmed, używając słów/zwrotów kluczowych: „dzieci” (ang. ‘children’), „zapalenie mięśnia sercowego” (ang. ‘myocarditis’) — strategia ta pozwoliła uzyskać łącznie 117 artykułów. Spośród nich wyodrębniono prace, w których badana grupa obejmowała co najmniej 5 dzieci, a w opisie zawarto dane dotyczące objawów klinicznych, odchyleń w badaniach laboratoryjnych oraz badaniach obrazowych, identyfikacji czynników etiologicznych, zastosowanego leczenia oraz czasu hospitalizacji i liczby zgonów. Do analizy końcowej włączono 17 artykułów; zestawienie obejmuje łącznie 1891 dzieci, u których rozpoznano ZMS. Z analizy wynika, że ZMS jest chorobą rzadką. Obserwuje się dwa szczyty zachorowań: w wieku noworodkowym i wczesnoniemowlęcym oraz w okresie dojrzewania, przy czym wiek poniżej 2. rż. jest niekorzystnym czynnikiem rokowniczym. W raportowanych przypadkach najczęstszymi objawami podmiotowymi były: osłabienie, ból w klatce piersiowej, kołatania serca. Wśród objawów przedmiotowych dominowały: tachypnoe, tachykardia, hipotensja, hepatomegalia. Wywiad, wynik badania przedmiotowego oraz wyniki badań dodatkowych (stężenia troponin, elektrokardiogram, echokardiogram) przybliżają do rozpoznania, natomiast „złotym standardem” do ustalenia diagnozy jest badanie rezonansu magnetycznego serca. W analizowanej grupie 65–90% dzieci wymagało leczenia na oddziale intensywnej terapii, u 168 dzieci zastosowano ciągłe pozaustrojowe natlenianie krwi, a 35 dzieciom wszczepiono tak zwane sztuczne komory. U 38 pacjentów wykonano przeszczepienie serca. Śmiertelność w ZMS jest wysoka (w przeanalizowanym piśmiennictwie wyniosła 25–35%). U około 25% dzieci dysfunkcja mięśnia sercowego pozostała trwała. Ze względu na nieprzewidywalny przebieg choroby pacjent w ostrym okresie choroby powinien być hospitalizowany, a po wypisaniu ze szpitala podlegać dalszej kontroli kardiologicznej

Criticality Analysis of Activity Networks under Interval Uncertainty

Dedicated to the memory of Professor Stefan Chanas - The extended abstract version of this paper has appeared in Proceedings of 11th International Conference on Principles and Practice of Constraint Programming (CP2005) ("Interval Analysis in Scheduling", Fortin et al. 2005)International audienceThis paper reconsiders the Project Evaluation and Review Technique (PERT) scheduling problem when information about task duration is incomplete. We model uncertainty on task durations by intervals. With this problem formulation, our goal is to assert possible and necessary criticality of the different tasks and to compute their possible earliest starting dates, latest starting dates, and floats. This paper combines various results and provides a complete solution to the problem. We present the complexity results of all considered subproblems and efficient algorithms to solve them

Computational fragment-based drug design to explore the hydrophobic subpocket of the mitotic kinesin Eg5 allosteric binding site

International audienceEg5, a mitotic kinesin exclusively involved in the formation and function of the mitotic spindle has attracted interest as an anticancer drug target. Eg5 is co-crystallized with several inhibitors bound to its allosteric binding pocket. Each of these occupies a pocket formed by loop 5/helix alpha2 (L5/alpha2). Recently designed inhibitors additionally occupy a hydrophobic pocket of this site. The goal of the present study was to explore this hydrophobic pocket with our MED-SuMo fragment-based protocol, and thus discover novel chemical structures that might bind as inhibitors. The MED-SuMo software is able to compare and superimpose similar interaction surfaces upon the whole protein data bank (PDB). In a fragment-based protocol, MED-SuMo retrieves MED-Portions that encode protein-fragment binding sites and are derived from cross-mining protein-ligand structures with libraries of small molecules. Furthermore we have excluded intra-family MED-Portions derived from Eg5 ligands that occupy the hydrophobic pocket and predicted new potential ligands by hybridization that would fill simultaneously both pockets. Some of the latter having original scaffolds and substituents in the hydrophobic pocket are identified in libraries of synthetically accessible molecules by the MED-Search software

Controlled overexpression of Pax6 in vivo negatively autoregulates the Pax6 locus, causing cell-autonomous defects of late cortical progenitor proliferation with little effect on cortical arealization

Levels of expression of the transcription factor Pax6 vary throughout corticogenesis in a rostro-lateral(high) to caudo-medial(low) gradient across the cortical proliferative zone. Previous loss-of-function studies have indicated that Pax6 is required for normal cortical progenitor proliferation, neuronal differentiation, cortical lamination and cortical arealization, but whether and how its level of expression affects its function is unclear. We studied the developing cortex of PAX77 YAC transgenic mice carrying several copies of the human PAX6 locus with its full complement of regulatory regions. We found that PAX77 embryos express Pax6 in a normal spatial pattern, with levels up to three times higher than wild type. By crossing PAX77 mice with a new YAC transgenic line that reports Pax6 expression (DTy54), we showed that increased expression is limited by negative autoregulation. Increased expression reduces proliferation of late cortical progenitors specifically, and analysis of PAX77↔wild-type chimeras indicates that the defect is cell autonomous. We analyzed cortical arealization in PAX77 mice and found that, whereas the loss of Pax6 shifts caudal cortical areas rostrally, Pax6 overexpression at levels predicted to shift rostral areas caudally has very little effect. These findings indicate that Pax6 levels are stabilized by autoregulation, that the proliferation of cortical progenitors is sensitive to altered Pax6 levels and that cortical arealization is not