Leaf-, panel- and latex-expressed sequenced tags from the rubber tree (Hevea brasiliensis) under cold-stressed and suboptimal growing conditions: the development of gene-targeted Functional markers for stress response.

Hevea brasiliensis is a native species of the Amazon Basin of South America and the primary source of natural rubber worldwide. Due to the occurrence of South American Leaf Blight disease in this area, rubber plantations have been extended to suboptimal regions. Rubber tree breeding is time-consuming and expensive, but molecular markers can serve as a tool for early valuation, thus reducing time and costs. In this work, we constructed six different cDNA libraries with the aim of developing gene-targeted molecular markers for the rubber tree. A total of 8,263 reads were assembled, generating 5,025 unigenes that were analyzed; 912 expressed sequence tags (ESTs) represented new transcripts, and two sequences were highly up-regulated by cold stress. These unigenes were scanned for microsatellite (SSR) regions and single nucleotide polymorphisms (SNPs). In total, 169 novel EST-SSR markers were developed; 138 loci were polymorphic in the rubber tree, and 98 % presented transferability to six other Hevea species. Locus duplication was observed in H. brasil-iensis and other species. Additionally, 43 SNP markers in 13 sequences that showed similarity to proteins involved in stress response, latex biosynthesis and developmental processes were characterized. cDNA libraries are a rich source of SSR and SNP markers and enable the identification of new transcripts. The new markers developed here will be a valuable resource for linkage mapping, QTL identification and other studies in the rubber tree and can also be used to evaluate the genetic variability of other Hevea species, which are valuable assets in rubber tree breeding

Dissimilaridade genética de clones de Brachiaria ruziziensis baseada em características morfológicas e de produção de forragem.

Em programas de melhoramento tem-se sempre o interesse de conhecer melhor a variabilidade disponível para os principais caracteres morfoagronômicos. Nesse trabalho objetivou-se realizar a caracterização morfológica e da produção de forragem de clones de B. ruziziensis do programa de melhoramento genético da Embrapa Gado de Leite visando quantificar a variabilidade genética entre eles e ainda determinar a importância relativa desses caracteres para fins avaliativos. O experimento foi conduzido no Campo Experimental de Coronel Pacheco (MG). Foram avaliados 81 clones de B. ruziziensis, mais quatro testemunhas (?Comum? (B. ruziziensis), ?Basilisk? (B. decumbens), ?Marandu? (B. brizantha) e a população do primeiro ciclo de seleção (C0)). O delineamento foi de blocos casualisados, com três repetições e parcela de dois metros quadrados. Procedeu-se ao teste dos efeitos e estimação das herdabilidades (h2 c) com base na análise de variância dos caracteres em separado e posteriormente estimou-se a dissimilaridade entre os clones pela distância de Mahalanobis. O agrupamento dos clones foi feito pelo método de Tocher e a importância dos caracteres pelo método de Singh. Foram detectadas diferenças significativas (P<0,05) entre os clones avaliados para a maioria dos caracteres, demonstrando a existência de variabilidade genética. Verificou-se que sete caracteres de produção apresentaram uma contribuição relativa de 65,60% de toda a divergência genética, enquanto os reprodutivos e vegetativos contribuíram com apenas 34,40%, com destaque para as características VIG, PV e PS que apresentaram as maiores contribuições relativas. Os clones foram agrupados em nove grupos, sendo que 83,53% desses ficaram alocados no primeiro grupo formado. Em síntese, evidencia-se que há divergência entre os clones testados pelo programa de melhoramento genético de B. ruziziensis da Embrapa Gado de Leite e que é possível gerar populações com potencial para o desenvolvimento de cultivares superiores

tert-Butyl 2-{[2,8-bis­(trifluoro­meth­yl)quinolin-4-yl](hy­droxy)meth­yl}piperidine-1-carboxyl­ate

The title mol­ecule, C22H24F6N2O3, adopts a folded conformation whereby the carboxyl­ate residue lies over the quinolinyl residue, with the dihedral angle between the carbamate and quinoline planes being 41.64 (7)°. Helical supra­molecular C(7) chains sustained by O—H⋯O hydrogen bonds propagating along the a-axis direction feature in the crystal packing. The F atoms of one of the CF3 groups are disordered over two orientations; the major component has a site occupancy of 0.824 (7)

Determinação, avaliação e monitoramento da borracha natural crua dos novos clones da série IAC 300.

O consumo mundial e brasileiro da borracha natural (BN) tende a aumentar mais do que a capacidade produtiva. No ano de 2007, o Brasil colaborou com apenas 1,1% da produção mundial da BN, sendo insuficiente, inclusive, para atender a demanda do mercado interno, onde houve a necessidade da importação de 67% da BN consumida. Tal situação desfavorável deve ser remediada com o aumento da área plantada da seringueira, o que pode levar o Brasil a autossuficiência na produção da BN. Para tanto, o país necessitará desenvolver novos clones aptos às diferentes regiões propícias ao cultivo da seringueira e, esses novos clones, deverão produzir em grande quantidade e com qualidade da BN. A Embrapa Instrumentação Agropecuária realiza estudos de avaliação, de monitoramento e de caracterização da BN agregando os resultados tecnológicos aos dados agronômicos obtidos pelo Instituto Agronômico de Campinas (Campinas/SP) para a seleção de novos clones de seringueira a serem recomendados ao plantio no Estado de São Paulo com o intuito de aumentar a produção e tornar o país autossuficiente. O objetivo deste trabalho foi apresentar os resultados da avaliação e do monitoramento da % de N da BN de novos clones da série IAC 300. As BN cruas foram obtidas dos látices sangrados entre os meses de outubro/2006 a agosto/2008 dos novos clones da série IAC 300 (328, 329, 330, 331, 332, 333, 335 e 337) e dos clones testemunha do experimento GT 1 e RRIM 600. Os coágulos foram obtidos por coagulação com solução de ácido acético a 10%. Os coágulos de BN foram triturados em uma calandra de cilindros raiados, seguida da laminação em uma calandra de cilindros lisos para obtenção de mantas finas para facilitar a secagem. Essas foram secas à 60ºC por 48 horas. Uma massa de 200 mg de BN é pesada e misturada com solução digestora contendo CuSO4, K2SO4 e H2SO4 concentrado, sendo em seguida digerida em bloco digestor à temperatura de 380 ºC. Após a digestão da BN, o extrato é levado ao equipamento Kjeltec auto 1035/38 e inicia-se a destilação. A destilação é feita por arraste a vapor. O (NH4)2SO4 é tratado com solução de NaOH 40% em excesso, o qual ocorre liberação da NH3. A NH3 é recebida e reage com H3BO3 + indicador de pH. O borato ácido de amônio formado é titulado com solução de H2SO4 0,05 mol L-1. A % de N é calculada levando-se em consideração o volume de H2SO4 gasto na titulação e a massa de amostra utilizada para digestão. Dos resultados obtidos da % de N, observa-se que o clone IAC 335 possui a maior % de N média (0,45%) e a maior variabilidade foi obtida pelo clone IAC 328 (CV=34,15%); o clone IAC 332 possui o menor valor médio (0,39%). Em relação às testemunhas GT 1 e RRIM 600, os clones IAC 300 obtiveram valores % de N média equivalentes. Houve variação entre clones e coletas e os valores médios obtidos da % de N estão de acordo com as especificações da norma NBR 11597 da ABNT para uma BN de boa qualidade

Benzyl 2-{[2,8-bis­(trifluoro­meth­yl)quinolin-4-yl](hy­droxy)meth­yl}piperidine-1-carboxyl­ate

The title mol­ecule, C25H22F6N2O3, adopts an open conformation whereby the quinoline and carboxyl­ate ester groups are orientated in opposite directions but to the same side of the piperidine ring so that the mol­ecule has an approximate U-shape. The piperidine ring adopts a distorted boat conformation. In the crystal, inversion dimers linked by pairs of O—H⋯O hydrogen bonds generate R 2 2(14) loops