Simulação dos estoques de carbono e nitrogênio pelo modelo Century em Latossolos, no cerrado brasileiro.

O uso de modelos matemáticos pode ser útil para o entendimento das alterações do uso e manejo do solo e fornecem subsídios para testar cenários futuros, possibilitando desenvolver estratégias de manejo menos impactantes ao meio ambiente. Os objetivos deste trabalho foram: (a) usar o modelo Century v4.5 para simular os efeitos dos usos e manejos sobre os estoques de carbono e nitrogênio do solo em diferentes compartimentos, (b) comparar os estoques medidos e simulados pelo Century, e (c) testar impacto de cenários futuros até o ano de 2100. Os tratamentos avaliados foram Pinus, plantio direto e plantio convencional, com histórico das áreas até o momento da coleta de solo (2004). Para o Pinus foram testados três cenários futuros, um deles simulando o mesmo manejo adotado até o momento da coleta de solo, outro reduzindo os eventos de fogo, além do uso sem preparo do solo para o replantio. Para o plantio direto e plantio convencional, simularam-se dois cenários futuros, um com rotação milho/soja e outro com monocultura de milho. O modelo Century foi sensível às mudanças de manejo adotadas, os compartimentos mais lábeis apresentam maior sensibilidade (ativo e lento), do que o mais estável (passivo). Em relação ao estoque de C, o modelo simulou estoques próximos aos medidos no campo, com um erro mínimo de 0,36%. Para os estoques de N, os valores simulados apresentaram erro de 5,71% para os compartimentos mais lábeis. Os cenários futuros mostraram a importância de se evitar queimadas no Pinus e o uso de monocultivo

Um software para extração de ESTs, CONTIGS e SINGLETS do CAFEST.

Uma das dificuldades encontrada atualmente para os usuários da base de dados do Projeto Brasileiro do Genoma Café (CafEST) é a dificuldade em extrair manualmente todas as sequências armazenadas em seus projetos, no sistema Gene Projects. A partir dessa necessidade, foi desenvolvido um software para fazer a automatização do processo. Desta forma, o usuário do CafEST passa a dispor da comodidade de apenas informar ao programa quais projetos ele deseja que tenham as ESTs, contigs ou singlets extraídos. O programa consiste em dois scripts, um para fazer a extração das ESTs e outro para fazer a extração dos contigs e dos singlets. Os dois scripts retiram do CafEST apenas as ESTs, os contigs e singlets e salvam cada um desses em um arquivo do tipo FASTA. Isto facilita o uso dos mesmos em outras bases de dados e/ou ferramentas de bioinformátic

Differential expression of molecular rust resistance components have distinctive profiles in Coffea arabica - Hemileia vastatrix interactions.

Countering the economic hurdle caused by coffee leaf rust disease is most appealing at this time as it has posed a major threat to coffee production around the world. Establishing differential expression profiles at different times following pathogen invasion in both innate and acquired immunities unlocks the molecular components of resistance and susceptibility. Suppression subtractive hybridization (SSH) was used to identify genes differentially over-expressed and repressed during incompatible and compatible interactions between Coffea arabica and Hemileia vastatrix. From 433 clones of expressed sequence tags (ESTs) sequenced, 352 were annotated and categorized of which the proportion of genes expressed during compatible interaction were relatively smaller. The result showed upregulation and downregulation of various genes at 12 and 24 h after pathogen inoculation in both interactions. The use of four different databases in searching for gene homology resulted in different number of similar sequences. BLASTx against EMBL-EBI (European Molecular Biology Laboratory-European Bioinformatics Institute) database being with the maximum (100%) hits for all the annotated sequences. RT-qPCR analysis of seven resistance-signaling genes showed similar expression patterns for most of the genes in both interactions, indicating these genes are involved in basal (nonspecific) defense during which immune reactions are similar. Using SSH, we identified different types of resistance related genes that could be used for further studies towards resistant cultivar development. The potential role of some of the resistance related proteins found were also discussed

Estimativa do carbono orgânico estocado na fitomassa do clone de seringueira IAN 873 em solos da região da Zona da Mata de Minas Gerais.

A produção nacional da seringueira vem contribuindo com apenas 0,95% da produção global de borracha natural, gerando a necessidade da importação de cerca de 66% para o consumo interno. Visando recuperar sua posição de destaque ou mesmo minimizar os volumes de importação, torna-se necessário expandir os plantios racionais e elevar sua produtividade. A seringueira pode ser considerada também como uma alternativa viável para a diminuição dos atuais problemas socioeconômicos e ambientais, por se tratar de uma cultura adequada a pequenos e médios produtores e que poderá contribuir com o sequestro de carbono. Este trabalho teve o objetivo de estimar o carbono orgânico estocado na fitomassa do clone IAN 873 da seringueira em solos da Região da Zona da Mata de Minas Gerais. O estudo foi realizado em Oratórios-Minas Gerais, onde determinou-se a biomassa por meio do método direto e destrutivo em árvores localizadas no terço superior, médio e inferior da encosta. A seleção das árvores foi baseada no perímetro médio representativo do caule, à altura de 1,30m. O levantamento do solo permitiu identificar o Latossolo presente no terço superior e médio e o Argissolo no terço inferior da encosta. Os resultados mostram que eles são ácidos, com baixos teores de carbono e capacidade de troca catiônica. A densidade aparente nos Latossolos diminui em profundidade, enquanto aumenta nos Argissolos. A maior quantidade de carbono encontra-se estocada nos galhos grossos, representando 57,5% do carbono total da parte aérea. O carbono orgânico da parte aérea totalizou, em média, 105,4kg árvore-1 e 52700kg ha.-1bitstream/CNPS/11591/1/clone_seringueira_ian_873.pd

Troubles with quantum anistropic cosmological models: Loss of unitarity

The anisotropic Bianchi I cosmological model coupled with perfect fluid is quantized in the minisuperspace. The perfect fluid is described by using the Schutz formalism which allows to attribute dynamical degrees of freedom to matter. A Schr\"odinger-type equation is obtained where the matter variables play the role of time. However, the signature of the kinetic term is hyperbolic. This Schr\"odinger-like equation is solved and a wave packet is constructed. The norm of the resulting wave function comes out to be time dependent, indicating the loss of unitarity in this model. The loss of unitarity is due to the fact that the effective Hamiltonian is hermitian but not self-adjoint. The expectation value and the bohmian trajectories are evaluated leading to different cosmological scenarios, what is a consequence of the absence of a unitary quantum structure. The consistency of this quantum model is discussed as well as the generality of the absence of unitarity in anisotropic quantum models.Comment: Latex file, 18 pages. To appear in General Relativity and Gravitatio

Dynamics of scalar perturbations in f(R, T) gravity [Phys. Rev. D 87, 103526 (2013), publisher's note]

Es una nota del editorDepto. de Física TeóricaFac. de Ciencias FísicasTRUEpu

Marcadores microssatélites para o cafeeiro.

O presente trabalho foi realizado com o objetivo de testar e adaptar marcadores microssatélites para serem rotineiramente utilizados nos trabalhos de genética e melhoramento do cafeeiro. Para isso, foram ajustadas as condições de amplificação de 24 primers microssatélites de café, disponibilizados na literatura. Estes primers, desenvolvidos para Coffea arabica, foram também testados em outras espécies de cafeeiro de importância para o melhoramento visando verificar sua utilidade como primer heterólogo. A adaptação das condições de reação e de amplificação permitiu o uso de 18 primers, sendo que a maioria deles amplificou as três espécies analisadas. O nível de polimorfismo desses microssatélites foi investigado pela amplificação de 60 genótipos, incluindo C. arabica, C. canephora, C. eugenioides e Híbrido de Timor (HT). Observou-se um alto polimorfismo e uma variação de 2 a 9 alelos por marcador. Metade dos primers testados apresentou polimorfismo em C. canephora e 33,3% deles foram polimórficos entre os HT. Foi possível discriminar todos os acessos de C. canephora analisados. Os HT, em geral, apresentaram padrão de bandas semelhante ao dos C. arabica, sendo que seis primers apresentaram polimorfismo, possibilitando a discriminação de 13 acessos, não diferenciados em estudos anteriores com marcadores RAPD. Os resultados demonstraram o potencial dos microssatélites para diferenciar indivíduos geneticamente próximos. Em trabalhos futuros, pretende-se desenvolver novos microssatélites a partir das ESTs do Genoma/Café. Esses novos marcadores, juntamente com os primers adaptados neste trabalho, constituirão em uma importante ferramenta para os estudos genéticos do café no Brasil