DELLA MUTATIONS IN PLANTS WITH SPECIAL EMPHASIS ON WHEAT

DELLA proteins are a subfamily of transcriptional regulators from the GRAS protein family. They act as growth repressors. Gibberellins (GA) promote growth by overcoming the DELLA-mediated growth restraint. A number of dominant mutations in highly conserved orthologous DELLA genes are known in various plant species. These mutations reduce plant height owing to production of more active forms of growth repressors. The aim of the current study is to estimate the genetic similarity of DELLA nucleotide and amino acid sequences stored in GenBank and to identify mutant and wild type alleles that encode DELLAs in modern Ukrainian winter bread wheat varieties. We have performed nucleotide and amino acid sequence search and alignment of the Rht-D1 wheat dwarfing gene and DELLA-encoding genes of other plant species with BLAST and MUSCLE software. A dendrogram illustrating phylogenetic relations among DELLA sequences of 35 plant species has been constructed using MEGA v5. In addition, PCR-based genotyping for the major wheat dwarfing genes Rht-B1 and Rht-D1 has been performed in wheat cultivars from different regions of Ukraine. It is shown that the mutant Rht-D1b allele is the commonest dwarfing allele among those tested in Ukrainian wheat cultivars (68 %), but its distribution over Ukraine is not random

Practical Aspects of Clinical Manifestations, Pathogenesis and Therapy of Alcoholic Liver Disease and Non-alcoholic Fatty Liver Disease: Expert Opinion

Aim: to present the results of an expert discussion of modern aspects of the clinical manifestations, pathogenesis and treatment of alcoholic liver disease (ALD) and non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD).Key points. ALD and NAFLD are characterized by high prevalence and have a significant impact on public health. For the diagnosis of liver pathology, it is important to determine the stage of fibrosis and the severity of the exacerbation of the disease. In the treatment of ALD, it is recommended to achieve abstinence, proper nutrition, the appointment of B vitamins, drugs with cytoprotective activity. In severe hepatitis, corticosteroids may be prescribed. In the treatment of NAFLD, diet and lifestyle modification, weight loss, the use of insulin sensitizers, vitamin E, statins (in the presence of hyperlipidemia) and drugs with metabolic activity are effective.Currently, a point of view is being actively expressed about the synergism of the action of alcohol and the metabolic syndrome on the development of fibrosis, cirrhosis, and hepatocellular carcinoma. The current international consensus recommends a change in the nomenclature of NAFLD and ALD and proposes the terms “metabolically associated steatotic liver disease” and “metabolically associated alcoholic liver disease”.Conclusion. The closeness of the clinical manifestations and pathogenesis of NAFLD and ALD justifies attention to drugs with metabolic activity, which are recommended by the Russian Gastroenterological Association and Russian Scientific Liver Society for the treatment of these diseases. The experts support the suggestion to quantify alcohol consumption in patients with NAFLD in order to change the management of patients, if necessary

Патогенетическое значение нарушения нейромедиаторной передачи при черепно-мозговой травме

Проаналізовані дані сучасної літератури стосовно патогенетичної ролі окремих нейромедіаторних систем – системи збуджуючих амінокислот, моноамінергічних систем та ГАМК-ергічної системи - за умов травматичного ушкодження мозку, ЧМТ та післятравматичних ускладнень. Автори наголошують, що патогенез ЧМТ є ланцюговою реакцією, до якої залучені складні патобіохімічні, морфологічні, імунологічні та пероксидні реакції. Одним із провідних в патогенезі ЧМТ та розвитку її ускладнень є порушення з боку нейромедіаторних систем, урахування яких повинно стати підгрунтям для формування нових складових схем комплексної патогенетичної терапії ЧМТ. Модуляція активності ендогенної нейротрансмісії є вельми важливою з точки зору залучення до складу комплексної патогенетичної терапії сполук, які здатні спричиняти модулюючий вплив на активність певної нейромедіаторної системи з метою покращення післятравматичного стану за умов травматичного ушкодження мозку.Modern literature data have been analyzed taking into consideration certain neurotrasmitter systems – excitatory aminoacids, monoaminergic systems and GABA-ergic system – pathogenetic role in conditions of brain trauma and posttraumatic complications. Authors showed that BT represents chain reactions involved complex pathobiochemic, morphologic, immunologic and peroxide reactions. Neurotransmiter systems failure seems to be the prominent in BT pathogenesis. This should be taken into account in case of new BT complex pathogenetic therapy schemes performing. Endogenous neurotransmission modulation is important mechanism that has to be positive in finding the new compound that could modulate certain neurotransmitter systems for involvement into BT complex pathogenetic therapy.Проанализированы данные современной литературы о патогенетической роли некоторых нейромедиаторных систем – системы возбуждающих аминокислот, моноаминергических систем и ГАМК-ергической системы – в условиях травматического повреждения мозга, ЧМТ и посттравматических осложнений. Авторы показывают, что патогенез ЧМТ – это цепная реакция, в опосредовании которой принимают участие сложные патобиохимические, морфологические, иммунологические и пероксидные реакции. Одними из ведущих в патогенезе ЧМТ и развитии её осложнений являются нарушения со стороны нейромедиаторных систем, учет которых должен быть основой формирования новых составных схем комплексной патогенетической терапии ЧМТ. Модуляция активности эндогенной нейротрансмиссии крайне важен с точки зрения включения в состав комплексной патогенетической терапии веществ, способных модулировать активность определенных нейромедиаторных систем с целью улучшения посттравматического состояния в условиях травматического повреждения мозга

Transposon based tagging: IRAP, REMAP, and iPBS

Retrotransposons are a major component of virtually all eukaryotic genomes, which makes them useful as molecular markers. Various molecular marker systems have been developed that exploit the ubiquitous nature of these genetic elements and their property of stable integration into dispersed chromosomal loci that are polymorphic within species. To detect polymorphisms for retrotransposon insertions, marker systems generally rely on PCR amplification between the retrotransposon termini and some component of flanking genomic DNA. The main methods of IRAP, REMAP, RBIP, and SSAP all detect the polymorphic sites at which the retrotransposon DNA is integrated into the genome. Marker systems exploiting these methods can be easily developed and are inexpensively deployed in the absence of extensive genome sequence data. Here, we describe protocols for the IRAP, REMAP and iPBS techniques, including methods for PCR amplification with a single primer or with two primers, agarose gel electrophoresis of the product using optimal electrophoresis buffers, we also describe iPBS techniques for the rapid isolation of retrotransposon termini and full-length elements.Peer reviewe

IDENTIFICATION OF A (1B)1R SUBSTITUTION AND 1BL.1RS TRANSLOCATION IN WINTER WHEAT INTROGRESSION LINES BY CYTOGENETIC AND MOLECULAR METHODS

The (1B) 1R wheat-rye chromosome substitution and 1BL.1RS translocation have been identified in original introgression stocks using cytological and molecular marker analysis. The pairing between short arms of chromosomes 1BL.1RS and bread wheat chromosome 1B is observed at a very low frequency (in 0,2–0,3 % of pollen mother cells). The translocation stocks are resistant to leaf and stem rusts, and the substitution stocks are susceptible because of the different origins of the chromosomes 1R involved in the translocation or substitution. The Hg1 gene for glume hairiness, inherited from cv. Hostianum 237, has been detected in some introgression stocks. Several stocks show hairiness on the leaf upper surface, lower surface and leaf margin. The character, probably originating from Ae. tauschii, was inherited from the synthetic wheat T. timopheevii Zhuk./Aegilops tauschii Coss

Генетичні аспекти антибіотикорезистентності збудників гнійно-септичних захворювань

Підкреслена актуальність проблеми гнійно-септичних захворювань. Незважаючи на значний арсенал засобів, летальність залишається досить високою. За допомогою ПЛР-детекції визначений і проаналізований сукупний геном, що характеризує антибіотикорезистентність золотистого та епідермального стафілококів до ряду препаратів. Отримані результати дозволяють дійти висновку, що резистентність до досліджуваних антибіотиків у золотистого та епідермального стафілококів носить полігенний характер. Сукупна генетична інформація щодо системи захисту від антибактеріальних засобів специфічна у кожного виду мікроорганізмів. Продемонстрована доцільність дослідження структури ДНК для розробки ефективних методів боротьби з патогенними мікроорганізмами

Інтрамолекулярна гетерогенність і внутрішньовидова варіабельність ДНК збудників гнійно-септичних захворювань

Останнім часом відмічається значний ріст гнійних захворювань, спричинюваних стафілококами та стрептококами. Здебільшого це обумовлено розповсюдженням мікроорганізмів, стійких до антибактеріальних препаратів. Виділення й ідентифікація цих збудників на ранніх термінах захворювання є важливим напрямком медичної мікробіології. Для вирішення цього питання є багатий арсенал методичних розробок, починаючи з класичних методів мікробіологічного тестування і закінчуючи імунохімічними та молекулярно-біологічними методами. В кожному випадку характер і складність діагностичних технологій залежать від властивостей збудника захворювання