P2: Image Analysis and Quantification of 3D Cancer Cell Migration

Metastatic tumors are known for their ability to migrate toward circulatory apparatus and detach from the primary tumor. Generally, metastasis is quantified in vitro using migration assays that are normally measured in two dimensions (2D). Threedimensional (3D) migration assays can better mimic cancers by providing similar microenvironments to those observed in vivo. Imaging 3D cell cultures requires multiple 2D images stacked along a Z-axis; however, imaged cells would be in-focus at varied z-positions at different time points due to the characteristics of cell migration. Our goal in this study was to analyze in-focus cell images and quantify cell migration in 3D in high throughput. Briefly, Hep3B human hepatoma cell line in alginate was printed on top of a layer of chemoattractants in a microwell chip and cultured over time to model hepatocellular carcinoma. Acquired cell images were analyzed using a Fast Fourier Transform (FFT) to create a histogram of pixel brightness variation within an image. We selected a specific frequency range that would correspond to a sharp change in pixel brightness, a spheroid\u27s edge, while the rest was subtracted to delete out-of-focus cells. In-focus cell images were recreated by reverse FFT, and ImageJ macros have been used to calculate the brightness of each corrected image in our 3D culture. By correlating pixel brightness to cell number, it allowed us to calculate the average position of all the cells in our 3D culture, based on brightness and z-position of the cell image. By measuring the change in average position over time, we created a quantifiable method to measure cell migration in 3D.https://engagedscholarship.csuohio.edu/u_poster_2017/1054/thumbnail.jp

Çukurova koşullarında farklı ekim ve biçim zamanlarının bazı adi fiğ ve tüylü fiğ çeşitlerinin arpa ile karışımlarında verim ve verimle ilgili özellikleri etkisi üzerinde bir araştırma

TEZ3286Tez (Doktora) -- Çukurova Üniversitesi, Adana, 1999.Kaynakça (s. 97-106) var.vii, 106 s. ; 30 cm.

Buğday başağında büyüme ve gelişme süreçleri ile verim arasındaki ilişkiler üzerine bir araştırma

TEZ1317Tez (Yüksek Lisans) -- Çukurova Üniversitesi, Adana, 1993.Kaynakça (s. 61-64) var.v, 64 s. ; 30 cm.

In Vitro Gaz Üretim Tekniği Kullanarak Bazı Makarnalık Buğday(Triticum durum L.) Çeşitlerinin Besleme Değerinin Tespiti

Bu &ccedil;alışma, Doğu Akdeniz Tarımsal Araştırma Enstit&uuml;s&uuml;nde bulunan 5 farklı makarnalık buğday &ccedil;eşitinin besin değerinin in vitro gaz &uuml;retim tekniği kullanılarak tespit edilmesi amacıyla ger&ccedil;ekleştirilmiştir. 5 farklı makarnalık buğday &ccedil;eşidinin in vitro gaz &uuml;retimleri, 0 ve 24. saat ink&uuml;basyon zamanında saptanmıştır. 5 makarnalık buğday &ccedil;eşidi Amanos, Sarıbaşak, Ayzer, Fuatbey ve Eker&rsquo;dir. Araştırma sonucunda, makarnalık buğday &ccedil;eşitleri arasında ham k&uuml;l (HK), ham protein (HP), ham yağ (HY), Asit deterjan fiber i&ccedil;erikleri (ADF), N&ouml;tral deterjan fiber (NDF), hemisel&uuml;loz (HES) ve in vitro organik madde sindirim derecesi (OMSD) i&ccedil;erikleri istatistiki a&ccedil;ıdan &ouml;nemli bulunmuştur (P&lt;0.05). Kuru madde (KM) ise değişmemiştir (P&gt;0.05). En y&uuml;ksek HP i&ccedil;eriği %12.71 ile Amanos &ccedil;eşidinden elde edilirken; en d&uuml;ş&uuml;k değer ise %11.56 ile Fuatbey &ccedil;eşidinden elde edilmiştir. HY i&ccedil;eriği %1.47 (Sarıbaşak) ile %1.90 (Amanos) arasında değişim g&ouml;stermiştir. En d&uuml;ş&uuml;k ve en y&uuml;ksek ADF değerleri Eker (%3.24) ve Amanos (%3.90) &ccedil;eşitlerinde saptanmıştır. En d&uuml;ş&uuml;k ve en y&uuml;ksek NDF değerleri Sarıbaşak (%15.02) ve Ayzer (%16.86) &ccedil;eşitlerinden elde edilmiştir. En y&uuml;ksek HES değeri KM bazında, %13.51 ile Ayzer &ccedil;eşidinde saptanmıştır. Makarnalık buğday &ccedil;eşitlerinin gaz &uuml;retim miktarları 62.50 ile 72.50 ml/200 mg KM arasında değişmiştir. Metabolik enerji ve net enerji laktasyon i&ccedil;erikleri ise sırasıyla 11.45-12.79 MJ/kg KM ve 6.94-7.95 MJ/kg KM arasında saptanmıştır.&nbsp;</p

Determination of the Nutritive Value of Some Durum Wheat (Triticum durum L.) Varieties Developed Using In Vitro Gas Production Technique

Bu çalışma, Doğu Akdeniz Tarımsal Araştırma Enstitüsünde bulunan 5 farklı makarnalık buğday çeşitinin besin değerinin in vitro gaz üretim tekniği kullanılarak tespit edilmesi amacıyla gerçekleştirilmiştir. 5 farklı makarnalık buğday çeşidinin in vitro gaz üretimleri, 0 ve 24. saat inkübasyon zamanında saptanmıştır. 5 makarnalık buğday çeşidi Amanos, Sarıbaşak, Ayzer, Fuatbey ve Eker'dir. Araştırma sonucunda, makarnalık buğday çeşitleri arasında ham kül (HK), ham protein (HP), ham yağ (HY), asit deterjan fiber içerikleri (ADF), nötral deterjan fiber (NDF), hemiselüloz (HES) ve in vitro organik madde sindirim derecesi (OMSD) içerikleri istatistiki açıdan önemli bulunmuştur (P0.05). En yüksek HP içeriği %12.71 ile Amanos çeşidinden elde edilirken; en düşük değer ise %11.56 ile Fuatbey çeşidinden elde edilmiştir. HY içeriği %1.47 (Sarıbaşak) ile %1.90 (Amanos) arasında değişim göstermiştir. En düşük ve en yüksek ADF değerleri Eker (%3.24) ve Amanos (%3.90) çeşitlerinde saptanmıştır. En düşük ve en yüksek NDF değerleri Sarıbaşak (%15.02) ve Ayzer (%16.86) çeşitlerinden elde edilmiştir. En yüksek HES değeri KM bazında, %13.51 ile Ayzer çeşidinde saptanmıştır. Makarnalık buğday çeşitlerinin gaz üretim miktarları 62.50 ile 72.50 ml/200 mg KM arasında değişmiştir. Metabolik enerji (ME) ve net enerji laktasyon (NEL) içerikleri ise sırasıyla 11.45-12.79 MJ/kg KM ve 6.94-7.95 MJ/kg KM arasında saptanmıştırThis study was carried out to determine the feed value of five different durum wheat varieties by chemical analysis and in vitro gas production technique and to compare feed values. In vitro gas productions of five durum wheat varieties were determined at 0 and 24 hours incubation times. The five durum wheat varieties were Amanos, Sarıbaşak, Ayzer, Fuatbey and Eker. The results of analysis of variance indicating that the level of significance differences in the contents of crude ash (CA), crude fat (CF), crude protein (CP), acid detergent fiber (ADF), neutral detergent fiber (NDF), hemisellulose (HEM) and in vitro organic matter digestibility (IVOMSD) between several varieties of durum wheat (P0.05). The highest CP content was obtained from the variety of Amanos with a value of 12.71%, whereas the lowest value was obtained from the Fuatbey variety with a value of 11.56%. Crude fat (CF) contents varied from a 1.47% (Sarıbaşak) to 1.90% (Amanos). The lowest and highest ADF values were changed from Eker (3.24%) and Amanos (3.90%) varieties. The lowest and highest NDF contents were obtained from Sarıbaşak (15.02%) and Ayzer (16.86%) varieties. The highest HEM value was obtained from Ayzer variety with a value of 13.51% DM. The gas production rate of durum wheat varieties ranged from 62.50 to 72.50 ml/200 mg DM. The metabolisable energy (ME) and net energy lactation (NEL) contents of durum wheat varieties ranged from 11.45 to 12.79 MJ/kg DM and 6.94 to 7.95 MJ/kg DM, respectivel