Caracterização genética de região endêmica de malária da Amazônia Ocidental Brasileira : Descrição de frequências gênicas e genotípicas dos Locos CCR5, ACP1 e das enzimas de metabolismo de xenobióticos GSTT1, GSTP1 e CYP2E1

Tese apresentada ao Programa de Pós- Graduação: Doutorado em Biologia Experimental (PGBIOEXP) da Fundação Universidade Federal de Rondônia (UNIR) como requisito final para a obtenção do título de Doutor em Biologia Experimental. Orientadora: Profa. Dra. Vera Engracia Gama de OliveiraDoenças infecciosas têm sido consideradas, nas últimas décadas, como um forte fator seletivo no modelamento da resposta genética humana aos xenobióticos. Numerosos genes podem estar envolvidos na regulação deste processo e, apesar dos avanços tecnológicos envolvendo análises genômicas poucos genes foram identificados como exercendo o papel de modelador desta individualidade. Analisamos a distribuição dos genes CCR5, ACP1, GSTT1, GSTP1 e CYP2E1 em cinco amostras coletadas em duas localidades do estado de Rondônia, Amazônia Ocidental Brasileira, região endêmica para malária e outras doenças, algumas reemergentes. Foram também investigadas, em todas as amostras, as associações entre alelos dos genes investigados com fenótipos clínicos resultantes der infecção por Plasmodium. Quatro amostras foram coletadas na capital Porto Velho, sendo duas representativas da população geral, uma de um bairro com altos índices de infecção por malária e uma ambulatorial, de pacientes com infecção por Plasmodium. A quinta amostra foi coletada no vilarejo de Pedras Negras, localizada no Vale do rio Guaporé, região de origem quilombola, quase um isolado, com pouca influência de povoamento por ondas migracionais. O DNA foi extraído seguindo a metodologia por digestão com Proteinase K. As amostras foram genotipadas com amplificação via PCR das regiões alvos conforme o protocolo indicado para a região gênica. A visualização ocorreu em PAGE 10% corado com nitrato de prata 10%. As análises estatísticas foram realizadas com os programas GENEPOP (versão 3.4). O nível de significância adotado foi de 5%. Os resultados obtidos indicam que as distribuições gênicas e genotípicas destes locos gênicos são semelhantes às de outras populações brasileiras e estão associadas ao padrão étnico das populações estudadas. No loco CCR5, o alelo CCR5Δ32, considerado marcador caucasoide, foi detectada em todas as amostras, inclusive na amostra do vilarejo quilombola de Pedras Negras, indicando a introdução de genes Europeus em uma comunidade quilombola. Este alelo CCR5Δ32 poderá ser um agente modulador da disseminação do vírus HIV-1 nesta região, dado o aumento do índice de pessoas infectadas pelo vírus. O alelo ACP1*C foi observado no grupo de Mâes do Hospital de Base, de Porto Velho, em associação com infecção por P. vivax e mista, mas não por P. falciparum exclusivamente. Não foi possível estabelecermos uma base biológica nas associações entre os genes estudados e fenótipos clínicos de malária. Nenhuma associação estatisticamente significante foi observada

Taxonomia e ecologia da fauna parasitária de Colossoma macropomum (Cuvier, 1818) (Characidae) criados em tanques no município de Rolim de Moura, RO

Tese apresentada ao Programa de Pós- Graduação: Doutorado em Biologia Experimental (PGBIOEXP) da Fundação Universidade Federal de Rondônia (UNIR) como requisito final para a obtenção do título de Doutor em Biologia Experimental. Orientadora: Profa. Dra. Vera Engracia Gama de Oliveira.Colossoma macropomum (Cuvier 1818) é uma espécie nativa muito difundida em pisciculturas na Amazônia Ocidental. Foram investigadas duas pisciculturas (L180N e L204S) localizadas em Rolim de Moura, estado de Rondônia, Brasil, no período compreendido entre março de 2009 e março de 2010. Dos 80 espécimes coletados, 100% estavam parasitados por pelo menos uma espécie de parasito. Sete espécies de ectoparasitos foram registradas: Anacanthorus spathulatus, Mymarothecium (Mymarothecium sp. 1, Mymarothecium sp. 2 e Mymarothecium viatorum), Notozothecium sp. e Linguadactyloides brinkimanni, classificadas como dominantes e o copépode Perulernaea gamitanae, classificado com subordinado. Foi possível evidenciar que, apesar da alta prevalência, os parasitos foram pouco abundantes. Entre a abundância de parasitismo e o comprimento-padrão do hospedeiro a espécie A. spathulatus apresentou correlação positiva e significativa nas duas pisciculturas; Mymarothecium spp apresentou correlação negativa significativa na L180N e positiva e significativa na L204S; Notozothecium sp. apresentou correlação positiva significativa na L204S; L. brinkimanni apresentou correlação positiva significativa na L180N. Foram encontrados os Monogeneas formas jovens, parasitos que apresentaram características morfológicas de acordo com classe dos Monogeneas, mas não apresentavam órgãos internos desenvolvidos, como complexo copulatório masculino, estes tiveram correlação negativa na L180N e correlação negativa significativa na L204S. Os resultados do fator de condição relativo (Kn) em relação à abundância de parasitismo não foram significativos em nenhuma das espécies de parasitos registrados. Em relação a Relação Hepatossomática (RHS) e abundância, A. spathulatus apresentou correlação significativa negativa na L180N e positiva na L204S. As espécies de Mymarothecium spp. e Notozothecium sp. apresentaram correlação positiva significativa na L204S. Em relação à Relação Esplenossomática (RES) e abundância de parasitismo foi encontrada correlação significativa positiva na L180N e correlação negativa significativa na L204S para L. brinkimanni. Apesar da prevalência parasitaria de 100% , a boa qualidade da água contribuiu para que a infracomunidade parasitaria não fosse abundante o suficiente para provocar alterações nos valores do Kn, RHS e SSR, sendo este um fator importante para o desenvolvimento dos peixes

Mundos mesclados, espaços segregados: cultura material, mestiçagem e segmentação no sítio Aldeia em Santarém (PA)

This article discusses the processes of cultural exchange between Portuguese, Portuguese-Brazilian, Amerindians, and mestizos based on the analysis of the material culture from households of Santarém (PA), occupied during the eighteenth and nineteenth centuries,. Although these social groups manipulated material culture aiming to express different values, related to hierarchy, social segmentation, and affirmation of identities, ambiguity also characterizes these assemblages. This material ambiguity informs about the mixtures of both practices and cultural references that brought about the building of a mestizo society.Com base na análise da cultura material proveniente de unidades domésticas do núcleo urbano de Santarém (PA), ocupadas nos séculos XVIII e XIX, o presente artigo discute os processos de trocas culturais entre portugueses, luso-brasileiros, indígenas e mestiços. Embora esses grupos sociais tenham manipulado a cultura material visando expressar diferentes valores, relacionados à hierarquia, segmentação social e afirmação de identidades, a ambigüidade é uma característica das amostras analisadas, informando sobre as misturas de práticas e de referenciais culturais que levaram à construção de uma sociedade mestiça

Parasite-host relationship between the tambaqui (Colossoma macropomum Cuvier 1818) and ectoparasites, collected from fish farms in the city of Rolim de Moura, State of Rond\uf4nia, Western Amazon, Brazil

In this study we investigated the relationship between tambaqui fish (Colossoma macropomumi Cuvier 1818) and parasites in two fish farms (L204S and L180N) in the state of Rondônia, Brazil, during a 1-year period. The objective of the study was to describe the relationships between parasites, hosts and the environment. From the 80 fish specimens collected, 100% were parasitized by at least one parasite species. Seven ectoparasites species were recorded, six of the class Monogenea: Anacanthorus spathulatusi, Mymarothecium spp. (Mymarothecium sp. 1, Mymarothecium sp. 2 and M. viatorum), Notozothecium sp. and Linguadactyloides brinkimanni, classified as dominants, and the copepod Perulernaea gamitanae, classified as subordinate. Despite their high prevalence, the parasites were not abundant. A. spathulatus presented positive and significant correlations between the abundance of parasitism and the standard length of the hosts in the two fish farms; Mymarothecium spp. showed significant correlations, negative in L180N, and positive in L204S; significant positive correlations were observed for Notozothecium sp. in L204S, and for L.brinkimanni in L180N. Young monogeneans were found; these parasites presented a negative correlation in L180N and a significant negative correlation in L204S. The results of the correlation between the relative condition factor (Kn) and the abundance of parasites were not significant for the recorded parasite species. Regarding the hepatosomatic relation (HSR) of fish and the abundance of parasites, Anacanthorus spathulatusi showed a significant negative correlation with the HSR in L180N, and a positive correlation in L204S. Mymarothecium spp. and Notozothecium sp. presented significant positive correlations in L204S. Considering the correlation of the fish splenosomatic relation (SSR) and the abundance of parasites, L. brinkimanni presented significant correlations, positive in L180N and negative in L204S. Despite 100% prevalence, the high water quality contributes to infracommunities with low parasite abundance and good levels of Kn, HSR and SSR, allowing good tambaqui development

Distribution of the CCR5delta32 allele (gene variant CCR5) in Rondônia, Western Amazonian region, Brazil

Since around 1723, on the occasion of its initial colonization by Europeans, Rondonia has received successive waves of immigrants. This has been further swelled by individuals from northeastern Brazil, who began entering at the beginning of the twentieth century. The ethnic composition varies across the state according to the various sites of settlement of each wave of immigrants. We analyzed the frequency of the CCR5L32 allele of the CCR5 chemokine receptor, which is considered a Caucasian marker, in five sample sets from the population. Four were collected in Porto Velho, the state capital and the site of several waves of migration. Of these, two, from the Hospital de Base were comprised of HB Mothers and HB Newborns presenting allele frequencies of 3.5% and 3.1%, respectively, a third from the peri-urban neighborhoods of Candelária/Bate-Estaca (1.8%), whereas a fourth, from the Research Center on Tropical Medicine/CEPEM (0.6%), was composed of malaria patients under treament. The fifth sample (3.4%) came from the inland Quilombola village of Pedras Negras. Two homozygous individuals (CCR5Δ32/CCR5Δ32) were detected among the HB Mother samples. The frequency of this allele was heterogeneous and higher where the European inflow was more pronounced. The presence of the allele in Pedras Negras revealed European miscegenation in a community largely comprising Quilombolas

O desafio da malária: o caso brasileiro e o que se pode esperar dos progressos da era genômica The malaria challenge: the Brazilian case and what can be expected from progress in genomics

A área endêmica de malária no Brasil se estende atualmente à totalidade da região amazônica, com cerca de 500 mil casos anuais, em geral com situações de baixa e média endemicidade mas ainda apresentando focos de alto risco. Fatores demográficos e socioeconômicos são dominantes nos desafios que enfrentam os Serviços de Saúde Pública no controle da malária. No presente artigo são discutidos fatores determinantes da instabilidade da situação endêmica bem como a necessidade de ações permanentes de vigilância e de intervenção dos Serviços de Saúde para que se evitem surtos epidêmicos e alastramento das áreas endêmicas. No artigo, em seguida, apresenta-se uma síntese de progressos recentes nos estudos da era genômica e pós-genômica sobre o parasita, o vetor e o hospedeiro humano que podem favorecer, no futuro, o desenvolvimento e a melhoria dos métodos de controle da malária.<br>Malaria endemic areas in Brazil are restricted to the Amazon Region, with an average of 500 thousand new cases every year. The situation can be defined as unstable hipoendemic with, however, foci of high endemicity. Demographic and socio economic factors are main determinants in the malaria challenge for the Public Health System. In the present paper, biological and social factors responsible for the unstable endemic situation are discussed. The need for a permanent surveillance and intervention of Public Health Services are stressed to avoid the occurrence of local epidemics and spreading of endemic areas. In the paper, are also summarised recent lines of research developed in the post genomic era in the studies of parasite, vector and human molecular genetics that would favour the development, in the future, of new tools and procedures for malaria contro