Recommendations for diagnosis, treatment and prevention of community-acquired pneumonia in immunocompetent adults

Introducción En nombre de las Asociaciones Colombianas de Neumología y Cirugía del Tórax, de Medicina Crítica y Cuidado Intensivo, de Medicina Interna y de Infectología, es un placer presentar las “Recomendaciones para el diagnóstico, tratamiento y prevención de la neumonía adquirida en la comunidad en adultos inmunocompetentes”. Este el fruto de un trabajo en conjunto durante tres años, en los cuales profesionales de las 4 asociaciones contribuyeron en el desarrollo de este documento que actualiza la versión previa de la guía del 2003. En este documento, no solo se tuvo en cuenta la mejor evidencia disponible publicada mediante la evaluación de guías existentes y búsquedas primarias, sino que también se incluyó información valiosa publicada localmente, especialmente datos epidemiológicos relacionados con etiología y resistencia bacteriana, entre otros.Guía de práctica clínica1-3

Associated factors for mortality in a COVID-19 colombian cohort : is the third wave relevant when Mu variant was predominant epidemiologically?

Q1Q1Pacientes con COVID-19Objectives: To evaluate the association between Colombia's third wave when the Mu variant was predominant epidemiologically (until 75%) in Colombia and COVID-19 all-cause in-hospital mortality. Methods: In this retrospective cohort, we included hospitalized patients ≥18 years with SARS-CoV-2 infection between March 2020 to September 2021 in ten hospitals from three cities in Colombia. Description analysis, survival, and multivariate Cox regression analyses were performed to evaluate the association between the third epidemic wave and in-hospital mortality. Results: A total of 25,371 patients were included. The age-stratified time-to-mortality curves showed differences according to epidemic waves in patients ≥75 years (log-rank test p = 0.012). In the multivariate Cox analysis, the third wave was not associated with increased mortality relative to the first wave (aHR 0.95; 95%CI 0.84–1.08), but there was an interaction between age ≥75 years and the third wave finding a lower HR for mortality (aHR 0.56, 95%CI 0.36–0.86). Conclusions: We did not find an increase in in-hospital mortality during the third epidemic wave in which the Mu variant was predominant in Colombia. The reduced hazard in mortality in patients ≥75 years hospitalized in the third wave could be explained by the high coverage of SARS-CoV-2 vaccination in this population and patients with underlying conditions.https://orcid.org/0000-0003-1833-1599https://orcid.org/0000-0001-5363-5729https://orcid.org/0000-0001-6964-2229https://orcid.org/0000-0003-3975-2835https://orcid.org/0000-0001-9441-4375Revista Internacional - IndexadaA1N

Alternativas de desarrollo agropecuario con proyección sostenible para el distrito de riego del Zulia y su zona de influencia

La asociación de usuarios del Distrito de Adecuación de Tierras de Gran Escala del Río Zulia (ASOZULIA) Norte de Santander, con un área de influencia de 45.536 hectáreas, está interesada en la planificación productiva de su territorio. Dentro de sus actividades agropecuarias se encuentran el arroz (12.000 a 17.000 ha), la palma de aceite (1.534 ha), cítricos (limón, naranja; 346 ha), caña de azúcar (100 ha) y la ganadería. Su principal sistema de producción durante más de 50 años es el cultivo de arroz, sistema que presenta reducción de la productividad (7 a 3 tha), degradación del suelo y problemas de plagas y enfermedades, debido entre otros al uso continuo del fangueo como sistema de preparación de suelos. Adicionalmente, a pesar de tener el distrito de riego del río Zulia una concesión de 13,5 m3.s1, en épocas de verano la oferta hidrica es mucho menor como, por ejemplo, la correspondiente a los meses de febrero a marzo de 2016, con un caudal en la bocatoma del distrito de 10,8 m3s'y una captación real del distrito de solo 6 m.s' Asimismo, la construcción del nuevo acueducto para el área metropolitana de la ciudad de Cúcuta tomará 2,95 m3s del caudal antes de la bocatoma que provee agua al distrito, lo que disminuirá aún más la disponibilidad de agua para riego en esa región. Por lo anterior, se requiere la recuperación de los suelos para el establecimiento de nuevos sistemas productivos que demanden un menor consumo de agua y sean una alternativa viable para los productores.Acelga-Remolacha de hoja, Beta vulgaris var. Cicl

Hipertensión pulmonar y trasplante

El trasplante pulmonar es un procedimiento reciente. En el caso de la hipertensión pulmonar idiopática, están mejorándose las indicaciones, los criterios de remisión temprana y los cuidados posteriores al trasplante. La sobrevida después de un trasplante a causa de hipertensión arterial pulmonar es reducida en los primeros tres meses, en comparación con otras etiologías, pero quienes sobreviven tienen tasas muy similares a los pacientes con otras patologías. Los pacientes deben ser remitidos de manera temprana a centros que tengan la disponibilidad de realizar un trasplante pulmonar de acuerdo con las recomendaciones de la Sociedad internacional de trasplante de corazón y de pulmón

Concordancia entre el gram y el cultivo del lavado broncoalveolar en pacientes con neumonía asociada al ventilador

La neumonía asociada a ventilador (NAV) es una entidad de incidencia creciente en cuidado intensivo con grandes dificultades en la estandarización de pruebas diagnósticas, generando altos costos en su manejo. Realizar un abordaje diagnóstico apropiado para cada institución y conocer la flora causante permite un mejor desenlace clínico y ahorro significativo para el sistema. Métodos diagnósticos sencillos como la tinción gram de muestras respiratorias son ampliamente usados para NAV, pero se observa variabilidad con el cultivo, prueba microbiológica definitiva. El objetivo de este estudio fue determinar el grado de acuerdo entre la tinción de gram inicial de una muestra de lavado broncoalveolar, con el resultado del cultivo. Se realizó muestreo consecutivo secuencial incluyendo los pacientes con diagnostico clínico de neumonía asociada a ventilador y que por protocolo institucional se llevaron a fibrobroncoscopia y lavado del cual se tomaron muestras para tinción de gram y cultivo de gérmenes comunes. Se realizó análisis de concordancia por índice kappa para determinar el acuerdo entre los resultados de la tinción de gram y el informe del cultivo. Adicionalmente se analizaron otras variables descriptivas de importancia. El indica kappa de 16,8% muestra mala concordancia entre el gram y el cultivo del lavado broncoalveolar, sin embargo, esto puede tener relación con el uso de antibióticos previo ocurrido en un 69%. Los diagnósticos mas frecuentes son sepsis y enfermedad neurológica, predominó la baja probabilidad clínica de neumonía; hay mayor trastorno de oxigenación el día de diagnostico de NAV. La mortalidad en UCI fue 27.5% y 29% al día 28.Ventilator associated pneumonia is an entity of growing incidence in intensive care units worldwide. Doing an appropriate diagnosis, specially when using cost effective tests, allows better clinical results and costs savings. Simple tests as the gram stain of respiratory samples, like the bronchoalveolar lavage are used, but the variability with the final diagnostic procedure, the culture of the respiratory sample, is high. The early use of appropriate antibiotics using the information from microbiological studies available has important impact in the clinical result. The aim of this study was to determine the overall agreement between the gram stain from a respiratory sample obtained through bronchoalveolar lavage and the final result from the culture. A retrospective analysis of 69 patients in a mixed intensive care unit of a single center, with a clinical diagnosis of ventilator associated pneumonia, and bronchoalveolar lavage obtained through fiberoptic bronchoscopy was made. The overall correlation between the gram stain and the culture of the respiratory sample from bronchoalveolar lavage was poor, with a kappa score of 0,16. It is possible that this deficient correlation is secondary to the previous use of antibiotics in 69% of the patients. The most frequent diagnoses in this group of patients were sepsis and neurological pathologies. Oxygenation abnormalities were more frequent at the diagnosis of the pneumonia. Mortality was 27,5% as of ICU stay, and 29% at the 29th day

Concordancia entre el gram y el cultivo del lavado broncoalveolar en pacientes con neumonía asociada al ventilador

La neumonía asociada a ventilador (NAV) es una entidad de incidencia creciente en cuidado intensivo con grandes dificultades en la estandarización de pruebas diagnósticas, generando altos costos en su manejo. Realizar un abordaje diagnóstico apropiado para cada institución y conocer la flora causante permite un mejor desenlace clínico y ahorro significativo para el sistema. Métodos diagnósticos sencillos como la tinción gram de muestras respiratorias son ampliamente usados para NAV, pero se observa variabilidad con el cultivo, prueba microbiológica definitiva. El objetivo de este estudio fue determinar el grado de acuerdo entre la tinción de gram inicial de una muestra de lavado broncoalveolar, con el resultado del cultivo. Se realizó muestreo consecutivo secuencial incluyendo los pacientes con diagnostico clínico de neumonía asociada a ventilador y que por protocolo institucional se llevaron a fibrobroncoscopia y lavado del cual se tomaron muestras para tinción de gram y cultivo de gérmenes comunes. Se realizó análisis de concordancia por índice kappa para determinar el acuerdo entre los resultados de la tinción de gram y el informe del cultivo. Adicionalmente se analizaron otras variables descriptivas de importancia. El indica kappa de 16,8% muestra mala concordancia entre el gram y el cultivo del lavado broncoalveolar, sin embargo, esto puede tener relación con el uso de antibióticos previo ocurrido en un 69%. Los diagnósticos mas frecuentes son sepsis y enfermedad neurológica, predominó la baja probabilidad clínica de neumonía; hay mayor trastorno de oxigenación el día de diagnostico de NAV. La mortalidad en UCI fue 27.5% y 29% al día 28.Ventilator associated pneumonia is an entity of growing incidence in intensive care units worldwide. Doing an appropriate diagnosis, specially when using cost effective tests, allows better clinical results and costs savings. Simple tests as the gram stain of respiratory samples, like the bronchoalveolar lavage are used, but the variability with the final diagnostic procedure, the culture of the respiratory sample, is high. The early use of appropriate antibiotics using the information from microbiological studies available has important impact in the clinical result. The aim of this study was to determine the overall agreement between the gram stain from a respiratory sample obtained through bronchoalveolar lavage and the final result from the culture. A retrospective analysis of 69 patients in a mixed intensive care unit of a single center, with a clinical diagnosis of ventilator associated pneumonia, and bronchoalveolar lavage obtained through fiberoptic bronchoscopy was made. The overall correlation between the gram stain and the culture of the respiratory sample from bronchoalveolar lavage was poor, with a kappa score of 0,16. It is possible that this deficient correlation is secondary to the previous use of antibiotics in 69% of the patients. The most frequent diagnoses in this group of patients were sepsis and neurological pathologies. Oxygenation abnormalities were more frequent at the diagnosis of the pneumonia. Mortality was 27,5% as of ICU stay, and 29% at the 29th day

Mapping a hydrophysical soil property through a comparative analysis of local and global scale approximations

Current available soil information allows building baselines to improve research, such as sustainable resource management; however, its use requires analysis of accuracy and precision that describes specific variables on local and global scales. Therefore, this study evaluated differences in the spatial distribution of water retention capacity (WRC) of the soil at a depth of 0.3 m, calculated from local general soil surveys and the global gridded soil information system (SoilGrids), using detailed or semi-detailed soil surveys as a reference, in two regions of Colombia (A and B). The qualitative and statistical analyses evaluated differences in WRC surfaces generated by the information sources. Neither information sources described WRC accurately, achieving correlations between -0.15 and 0.49 and average absolute errors between 9.65 and 19.52 mm for zones A and B, respectively. However, studies on the local scale remain within the ranges observed in the most detailed local studies. The use of products on the global scale is subject to regional analyses; nevertheless, they can be included as a covariate in digital soil mapping studies on more detailed scales

Traqueobronquitis y neumonía asociadas a ventilación mecánica en unidades de cuidado intensivo de Latinoamérica: epidemiología, curso clínico y desenlaces (Estudio LATINAVE)

Resumen Introducción: Las infecciones asociadas a ventilación mecánica son causa importante de morbimortalidad en el paciente crítico. La diferenciación entre traqueobronquitis y neumonía no es siempre fácil, y es controvertida. Algunos trabajos describen aumento de mortalidad, mayor estancia en Unidades de Cuidado Intensivo (UCI), mayor requerimiento de ventilación mecánica e incremento de costos en pacientes con traqueobronquitis asociada a ventilador (TAV), sin diferencias significativas en pacientes con neumonía asociada a ventilador (NAV). Estos estudios no describen el comportamiento clínico y epidemiológico de la TAV y la NAV como 2 entidades independientes, por lo que es necesario describirlo. Métodos: Estudio multicéntrico de cohorte prospectiva, de pacientes adultos que desarrollaron TAV o NAV durante su estancia en UCI, entre noviembre de 2013 y octubre de 2014. A cada una de las variables demográficas, clínicas, de laboratorio y de desenlace, como tiempo de ventilación mecánica, estancia hospitalaria y muerte, se le realizó análisis descriptivo; para evaluar las diferencias entre los grupos se utilizó test de chi cuadrado, t de Student o U de Mann Whitney. Resultados: Se incluyó a 143 pacientes, con edad promedio de 55 años, 57% eran hombres, de 6 países en Latinoamérica; 63% con NAV y 37% con TAV. Las comorbilidades más frecuentes fueron cardiovascular (44%) y neurológica (30%); esta última fue más frecuente en TAV (41,5 vs. 23%; p = 0,02). No se encontró diferencia en APACHE II de ingreso. El índice SOFA fue mayor en NAV (8 vs. 5; p = 0,02). No hubo diferencias en el aislamiento microbiológico, ni en los patrones de resistencia bacteriana entre las 2 entidades. Se observó mayor número de complicaciones cardiovasculares y SDRA en pacientes con NAV. No se encontró diferencia entre los 2 grupos en estancia en UCI, los días de ventilación mecánica ni en mortalidad. Conclusiones: La prevalencia de TAV fue mayor a lo descrito hasta ahora en la literatura. No se encontraron diferencias significativas en el aislamiento microbiológico, la resistencia bacteriana ni el esquema antibiótico utilizado en los 2 grupos. Aunque la NAV cursó con mayor proporción de complicaciones médicas asociadas, el hallazgo de una estancia hospitalaria, tiempo de ventilación mecánica y mortalidad similares sustenta la importancia clínica de la TAV

Producción científica sobre la herpetología en Colombia: perspectivas desde los temas de investigación hacia la conservación biológica

La herpetología colombiana tiene más de 200 años de investigación, pero hasta el momento no se han sistematizado los documentos que conforman el estado del arte de esta disciplina. A partir de una revi-sión sistemática de literatura entre 1741 y 2020, encontramos 2199 documentos, de los cuales el 70,3 % se ha publicado desde el año 2000. De las 394 revistas científicas, las que han realizado mayores contri-buciones son la Revista de la Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, la Revista Caldasia, el Catálogo de Anfibios y Reptiles de Colombia y Zootaxa. La mayoría de las publicaciones contribuyen al conocimiento en historia natural, distribución geográfica, sistemática y taxonomía, princi-palmente en Anura y Squamata. Son necesarios más estudios en ecología y conservación de grupos como las cecilias y las salamandras. Resaltamos la necesidad de fortalecer los listados taxonómicos locales con análisis cuantitativos de ecología de comunidades, y los estudios de conservación con estudios pobla-cionales a largo plazo. Es urgente recopilar datos de distribución geográfica para proyectar modelos que evalúen periódicamente el riesgo de extinción de las especies, determinar su representatividad en áreas protegidas y priorizar redes de áreas de conservación. Se requiere incrementar estudios en etnobiología y educación ambiental para cambiar las percepciones negativas de las personas hacia la herpetofauna y generar apropiación en las comunidades locales mediante iniciativas de conservación del hábitat. Así mismo es esencial consolidar investigación sobre los sistemas de gobernanza para generar una apropiación del conocimiento científico dentro de los procesos de toma de decisiones

Producción científica sobre la herpetología en Colombia: perspectivas desde los temas de investigación hacia la conservación biológica

Colombian herpetology has more than 200 years of research, but so far, the state of the art of scientific publications that have shaped this discipline is unknown. Through a systematic review of the literature between 1741 and 2020, we found 2199 papers, of which 70,3 % have been published since 2000. Of the 394 scientific journals that have contributed to new knowledge on Colombian herpetofauna, those that have made the greatest contributions are Revista de la Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, Revista Caldasia, Catálogo de Anfibios y Reptiles de Colombia, and Zootaxa. Most of the publications are contributions to natural history, geographic distribution, systematics, and taxonomy, mainly in Anura and Squamata. More studies are needed on the ecology and conservation of groups such as caecilians and salamanders. We highlight the need to strengthen taxonomic lists with quantitative analyses of community ecology, and conservation studies with long-term population studies. It is urgent to compile data on the geographic localities of species to be able to project distribution remodels to evaluate the risk of extinction of species periodically, determine their representativeness in protected areas, and prioritize networks of conservation areas. More studies on ethnobiology and environmental education are needed to change people’s negative perceptions of herpetofauna and to generate local community ownership of habitat conservation initiatives. It is also essential to consolidate a line of research on governance systems in the country to generate the appropriation of scientific knowledge for decision-making processes.La herpetología colombiana tiene más de 200 años de investigación, pero hasta el momento no se han sistematizado los documentos que conforman el estado del arte de esta disciplina. A partir de una revisión sistemática de literatura entre 1741 y 2020, encontramos 2199 documentos, de los cuales el 70,3 % se ha publicado desde el año 2000. De las 394 revistas científicas, las que han realizado mayores contribuciones son la Revista de la Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, la Revista Caldasia, el Catálogo de Anfibios y Reptiles de Colombia y Zootaxa. La mayoría de las publicaciones contribuyen al conocimiento en historia natural, distribución geográfica, sistemática y taxonomía, principalmente en Anura y Squamata. Son necesarios más estudios en ecología y conservación de grupos como las cecilias y las salamandras. Resaltamos la necesidad de fortalecer los listados taxonómicos locales con análisis cuantitativos de ecología de comunidades, y los estudios de conservación con estudios poblacionales a largo plazo. Es urgente recopilar datos de distribución geográfica para proyectar modelos que evalúen periódicamente el riesgo de extinción de las especies, determinar su representatividad en áreas protegidas y priorizar redes de áreas de conservación. Se requiere incrementar estudios en etnobiología y educación ambiental para cambiar las percepciones negativas de las personas hacia la herpetofauna y generar apropiación en las comunidades locales mediante iniciativas de conservación del hábitat. Así mismo es esencial consolidar investigación sobre los sistemas de gobernanza para generar una apropiación del conocimiento científico dentro de los procesos de toma de decisiones