Microbial load of reprocessable trocars after gynecological videolaparoscopy

PURPOSE: to identify the microbial charge present in reusable trocars used in gynecological laparoscopies. METHODS: a descriptive exploratory study. An amount of 57 trocars, 30 with 10 mm of diameter and 27 with 5 mm, have been collected from the surgical unit, immediately after the surgery and placed in a sterilized recipient, in which 250 mL of sterile distilled water was added. Then, the trocars were agitated for the drainage of particles and to obtain a wash-out fluid to be analyzed. After being filtered through 0.22 µm cellulose membrane, the residue was placed on blood agar plates with a sterilized forceps. Following incubation, microbiological analysis has been done to count the number of colonies and further identify the microorganisms, using standard laboratorial techniques. RESULTS: microbial charge was recovered from 47.4% of the trocars analyzed. Among those, 45.6% presented 1 to 100 growing colonies. Fourteen types of microorganisms have been identified, among which the more frequently isolated were coagulase-negative Staphylococcus (28%) and Bacillus sp (21%), Aeromonas hydrophila, Alcaligenes sp, Candida parapsilosis, and enterobacteries were also identified. CONCLUSIONS: the study has demonstrated that the microbial challenge faced by the technician responsible for the cleaning and sterilization of trocars is low, as compared to the challenge imposed by biological markers. Nevertheless, it may be not inferred that the risks for infectious complications for patients are minimal.OBJETIVO: identificar a carga microbiana presente em trocartes reprocessáveis usados nas laparoscopias ginecológicas. MÉTODOS: estudo exploratório descritivo. Um total de 57 trocartes, sendo 30 com 10 mm de diâmetro e 27 com 5 mm, foram recolhidos na sala de operação, imediatamente após o ato cirúrgico, e colocados em recipiente esterilizado onde foram adicionados 250 mL de água destilada estéril. Foi feita agitação dos trocartes para desprendimento de partículas e obtenção do lavado a ser analisado. Realizou-se filtração por meio de membrana de celulose 0,22 µm, colocadas, com pinça esterilizada, em placas ágar sangue. Após incubação, foi feita a análise microbiológica para contagem de unidades formadoras de colônias e posterior identificação do micro-organismo, usando-se técnicas laboratoriais padronizadas. RESULTADOS: a carga microbiana foi recuperada em 47,4% dos trocartes analisados. Destes, 45,6% apresentou crescimento de 1 a 100 unidades formadoras de colônias. Foram identificados 14 tipos de micro-organismos, dentre os quais, Staphylococcus coagulase negativo (28%) e Bacillus sp (21%) foram isolados com maior frequência. Identificou-se também Aeromonas hydrophila, Alcaligenes sp, Candida parapsilosis e enterobactérias. CONCLUSÕES: o estudo demonstrou que o desafio microbiano enfrentado pelos operadores responsáveis pela limpeza e esterilização dos trocartes é baixo quando comparado com o desafio imposto pelos indicadores biológicos; no entanto, não se pode inferir que os riscos de complicações infecciosas sejam mínimos para pacientes.58659

Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a Specialized Diazotrophic Endophyte of Tropical Grasses

The molecular mechanisms of plant recognition, colonization, and nutrient exchange between diazotrophic endophytes and plants are scarcely known. Herbaspirillum seropedicae is an endophytic bacterium capable of colonizing intercellular spaces of grasses such as rice and sugar cane. The genome of H. seropedicae strain SmR1 was sequenced and annotated by The Paraná State Genome Programme—GENOPAR. The genome is composed of a circular chromosome of 5,513,887 bp and contains a total of 4,804 genes. The genome sequence revealed that H. seropedicae is a highly versatile microorganism with capacity to metabolize a wide range of carbon and nitrogen sources and with possession of four distinct terminal oxidases. The genome contains a multitude of protein secretion systems, including type I, type II, type III, type V, and type VI secretion systems, and type IV pili, suggesting a high potential to interact with host plants. H. seropedicae is able to synthesize indole acetic acid as reflected by the four IAA biosynthetic pathways present. A gene coding for ACC deaminase, which may be involved in modulating the associated plant ethylene-signaling pathway, is also present. Genes for hemagglutinins/hemolysins/adhesins were found and may play a role in plant cell surface adhesion. These features may endow H. seropedicae with the ability to establish an endophytic life-style in a large number of plant species

Microbial load of reusables trocars after gynecology laparoscopy

Orientador: Maria Isabel Pedreira de FreitasDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias MedicasResumo: A transmissão de infecções hospitalares está relacionada à sobrevivência de microrganismos nas superfícies ambientais e no instrumental cirúrgico. Nos últimos anos, o Brasil tem se deparado com um cenário disperso em relação à validação do processo de limpeza e esterilização de instrumentos cirúrgicos utilizados em acessos minimamente invasivos, principalmente os procedimentos realizados por vídeo. Para implantação de medidas eficazes no reprocessamento é necessário saber como está o material em termos de contaminação e verificar se a carga microbiana trazida por esse instrumental é superior ao desafio microbiano imposto pelos indicadores biológicos. Deste modo, espera-se que a análise quanti-qualitativa dos microrganismos presentes em instrumentos cirúrgicos laparoscópicos após o uso clínico possa nortear a tomada de decisão pelos profissionais de saúde a contribuir para a melhoria do processo de trabalho visando à segurança do paciente. Objetivo: Identificar a carga microbiana presente nos trocartes reprocessáveis de 5 mm e 10 mm, usados para realização de laparoscopias ginecológicas. Material e Método: Tratase de um estudo exploratório descritivo. Um total de 57 trocartes de 5 mm e 10 mm de diâmetro foi recolhido na sala de operação, imediatamente após o uso na paciente, sendo acondicionados separadamente em embalagem plástica esterilizada, acrescentado 250 ml de água destilada estéril, lacrado e agitado a 120 rpm por 10 minutos. Com técnica asséptica, os trocartes foram retirados da embalagem e o lavado obtido foi levado ao Laboratório de Microbiologia onde foi filtrado por um filtro contendo uma membrana de celulose de 0,22 µm que foi colocada em placa Petri contendo ágar sangue. As placas foram incubadas em estufa e encaminhadas para contagem de microrganismos, expressa em unidades formadoras de colônias (UFC) e identificação seguindo técnicas laboratoriais padrão. Resultados: Em 52,63% dos trocartes não foram recuperados microrganismos viáveis, 45,62% apresentaram crescimento microbiano de 1-100 UFC, e somente em 1,75% dos trocartes recuperou-se carga microbiana maior que 100 UFC. Os microrganismos mais frequentemente isolados foram o Staphylococcus coagulase negativo (28%) e o Bacillus sp (22%). Outros microrganismos de importância clínica conhecida incluíram: Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli e Aeromonas hidrophyla. Discussão: O estudo demonstrou que o desafio microbiano enfrentado pelos Centros de Material e Esterilização é baixo quando comparado com o desafio imposto pelos indicadores biológicos que monitoram os ciclos de esterilização, correspondentes a 106 UFC de bacilos esporulados. Além disso, apesar dos trocartes, utilizados em laparoscopias ginecológicas consideradas limpas, apresentarem baixa carga microbiana, não se pode inferir que os riscos de complicações infecciosas sejam mínimos. Conclusão: Os trocartes aparoscópicos utilizados em laparoscopias ginecológicas limpas apresentaram carga microbiana baixa (?10 a ?102 UFC)Abstract: The transmission of hospital infections is related to survival of microorganisms on environmental surfaces and surgical instruments. In recent years, Brazil has been facing a scenario scattered on the validation of cleaning and sterilizing surgical instruments used in minimally invasive procedures performed primarily for video. For implantation of effective reprocessing and need to know how this stuff in terms of contamination and whether the microbial load brought by this instrument is superior to the microbial challenge imposed by biological indicators. Thus, it is expected that the quantitative and qualitative analysis of microorganisms in laparoscopic surgical instruments after use to guide the surgical decision-making by health professionals to contribute to the improvement of the work aimed at patient safety. Objective: To identify the microbial load present in reprocessable trocars of 5 mm and 10 mm, used for realization of gynecological laparoscopy. Material and Method: This is an exploratory descriptive study. A total of 57 trocars of 5 mm and 10 mm in diameter was collected in the operating room, immediately after use in the patient, and packed separately in sterile plastic bag, added 250 ml of sterile distilled water, sealed and shaken at 120 rpm for 10 minutes. With aseptic technique, the trocars were removed from the pack and washed obtained was taken to the microbiology laboratory where it was filtered through a filter containing a cellulose membrane of 0,22µm which was placed in Petri dishes containing blood agar. The plates were incubated in and sent to the microorganism counts expressed as colony forming units (CFU) and identification following standard laboratory techniques. Results: In 52.63% of the trocars were not recovered microorganisms, 45.62% had microbial growth of 1-100 UFC, and only 1.75% of the trocars recovered microbial counts greater than 100 CFU. The microorganisms most frequently isolated were coagulase negative Staphylococcus (28%) and Bacillus sp (22%). Other organisms known clinically important included: Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli and Aeromonas hidrophyla. Discuss: The study showed that the microbial challenge faced by the Centers for Sterilization is low compared with the challenge posed by biological indicators that monitor the sterilization cycle, corresponding to 106 CFU of sporulated bacilli. Moreover, despite the trocars used during gynecological laparoscopy considered clean, have lower microbial load, one can not infer that the risk of infectious complications are minimal. Conclusion: The laparoscopic trocars used during gynecological laparoscopy showed microbial clean low (?10 a ?102 UFC)MestradoEnfermagem e TrabalhoMestre em Enfermage

Microbial load of trocars gynecological laparoscopy, possible source of contamination and clinical significance

Orientadores: Maria Isabel Pedreira de Freitas, Carlos Emílio LevyTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de EnfermagemResumo: Introdução: Instrumentos cirúrgicos utilizados em cirurgias minimamente invasivas podem oferecer risco de infecção cruzada. Identificar sua fonte de contaminação contribui para prevenção de infecção e prestação do cuidado com qualidade e segurança. Contudo, a infecção de sítio cirúrgico é complexa, multifatorial e pode ser subnotificada se não houver programa de vigilância pós-alta efetivo. Objetivos: avaliar a relação entre carga microbiana de trocartes e microbiota da paciente, bem como a ocorrência de infecção de sítio cirúrgico após laparoscopia ginecológica; validar um instrumento de vigilância pós-alta por contato telefônico para cirurgias vídeo-assistidas. Método: estudo realizado em hospital público especializado em saúde da mulher. Fase I - estudo longitudinal prospectivo, 2011-2012, no qual amostras da microbiota da paciente foram coletadas no dia da internação por esfregaço com zaragatoa nas regiões da pele, ponto de McBurney esquerdo, cicatriz umbilical e fundo de saco vaginal. Após laparoscopia, trocartes foram coletados com técnica asséptica, obtendo-se o lavado microbiológico por adição de água destilada estéril e agitação, filtrados por membrana. As amostras foram incubadas para análise microbiológica. Após alta hospitalar, realizou-se vigilância por retorno ambulatorial e por contato telefônico. Realizada análise descritiva dos dados e aplicação dos testes de concordância de Kappa e Mc Nemar com nível de significância de 5%. Fase II - desenvolvida em duas etapas, a primeira 2011-2012, estudo metodológico com elaboração do instrumento de vigilância pós-alta por contato telefônico, para investigação de sinais e sintomas de infecção de sítio cirúrgico, seguida pela validação por peritos. O instrumento foi avaliado por cinco peritos quanto à pertinência, clareza e abrangência do conteúdo. A validação foi feita analisando-se a porcentagem de concordância entre peritos, sendo válidas as questões que obtiveram 80% de concordância. A segunda etapa, 2013, estudo transversal com aplicação do instrumento validado a pacientes submetidas aos procedimentos de histeroscopia e/ou laparoscopia ginecológica. Os dados foram analisados por estatística descritiva. Resultados: Fase I - a amostra foi composta por 24 pacientes, 68 esfregaços e 52 trocartes. Nos esfregaços encontrou-se predomínio de microbiota de pele Gram-positiva, mas também foram isoladas Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, dentre outros. Trocartes de 5 mm apresentaram crescimento bacteriano em 33,3% dos casos, com carga microbiana de 0-6 UFC. Trocartes de 10 mm apresentaram crescimento em 29,2%, com carga microbiana de 0-366 UFC. Observou-se grau de concordância pobre na comparação entre trocartes e microbiota da paciente (Kappa= 0,05; p= 0,08), exceto para Staphylococcus spp (p< 0,0001) e Corynebacterium spp (p= 0,0002). Não houve infecção decorrente da laparoscopia. Fase II - houve discordância entre peritos na primeira avaliação, o instrumento foi reformulado obtendo-se concordância na segunda avaliação. A amostra foi composta por 68 pacientes, sendo o contato telefônico possível em 86,36% dos casos. Queixas de dor abdominal, sangramento e edema incisional foram mais frequentes. Nenhuma apresentou infecção. Conclusão: Este estudo encontrou baixa contaminação nos trocartes, com a maioria das bactérias pertencentes à microbiota de pele da paciente sugerindo ser esta, sua principal fonte de contaminação. O questionário de vigilância pós-alta para cirurgias vídeo-assistidas foi validado, aplicado e encontra-se disponível para utilizaçãoAbstract: Background: Surgical instruments used in minimally invasive surgery may offer risk of cross infection. Identify its source of contamination contributes to infection prevention and provision of quality and safety care. However, surgical site infection is complex, multifactorial and may be underreported if there is no post-discharge surveillance effective program. Aim: To evaluate the relationship between microbial load of trocars and patient flora as well as the occurrence of surgical site infection after gynecological laparoscopy; validate an instrument of post-discharge surveillance by telephone for video-assisted surgery. Method: study developed in public hospital specializing in women's health. Phase I - longitudinal prospective study, 2011-2012, in which the patient flora samples were collected with swabs the skin regions, left McBurney's point, umbilicus and vaginal fornix, on day of the admission. After the laparoscopy, trocars were collected using sterile technique, obtaining microbiological wash by addition of sterile distilled water and stirring, filtered through the membrane. The samples were incubated for microbiological analysis. After discharge, patients were followed up by outpatient and telephone call. Descriptive statistics, Kappa coefficient and McNemar¿s test were applied with significance level of 5%. Phase II - two stages, the first 2011-2012, methodological study with development of the post-discharge surveillance instrument for investigation of signs and symptoms of surgical site infection by telephone, addied with validation by experts. The instrument was evaluated by five experts on the relevance, clarity and completeness of contents. The validation was performed by analyzing the percentage of agreement among experts being considered valid the questions that have obtained 80% agreement. The second stage, in 2013, was a cross-sectional study with application of validated instrument to patients undergoing to hysteroscopy or gynecological laparoscopy. Data were analyzed using descriptive statistics. Results: Phase I - The sample consisted of 24 patients, 68 swabs and 52 trocars. In smears by swab there was a predominance of Gram-positive skin flora, but were also isolated Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, among others. The 5 mm trocars presented bacterial growth in 33.3% of cases with microbial load of 0-6 CFU. The 10 mm trocars presented bacterial growth in 29.2% with microbial load of 0-366 CFU. Noted poor agreement degree when comparing trocars and patient flora (Kappa= 0.05, p= 0.08), except for Staphylococcus spp (p<0.0001), and Corynebacterium spp (p= 0.0002). There was no infection resulting from laparoscopy. Phase II - there was disagreement among experts in the first evaluation, the instrument was redesigned obtaining agreement in the second evaluation. The sample consisted of 68 patients being telephone call possible in 86.36% of cases. Complaints of abdominal pain, bleeding and incisional edema were more frequent. No patient had infection. Conclusion: This study found low contamination in trocars, with most of the bacteria belonging to patient skin flora, their main source of contamination. The instrument of post-discharge surveillance for video-assisted surgery has been validated, implemented and is available for useDoutoradoEnfermagem e TrabalhoDoutora em Ciências da Saúd

Vigilância pós-alta por telefone: validação e aplicação de instrumento para cirurgias vídeo-assistidas

RESUMOObjetivo:validar instrumento para vigilância pós-alta por contato telefônico de cirurgias vídeo-assistidas.Método:estudo multi-métodos com elaboração, validação e aplicação de instrumento. A validação foi realizada por peritos considerando pertinência, clareza e abrangência do conteúdo, sob cálculo do índice de validade de conteúdo, sendo válidas as questões com 80% de concordância. Para aplicação do instrumento, a amostra foi composta por 68 mulheres submetidas à cirurgia vídeo-assistidas sendo realizada análise descritiva.Resultados:houve discordância entre peritos na primeira avaliação e o instrumento foi reformulado obtendo-se concordância na segunda avaliação. A taxa de resposta ao contato telefônico foi de 88,2% (60/68). Queixas de dor abdominal, sangramento e edema incisional foram mais frequentes. Nenhuma apresentou infecção.Conclusão:o instrumento foi validado, aplicado e encontra-se disponível para utilização

[microbial Load Of Reprocessable Trocars After Gynecological Videolaparoscopy].

to identify the microbial charge present in reusable trocars used in gynecological laparoscopies. a descriptive exploratory study. An amount of 57 trocars, 30 with 10 mm of diameter and 27 with 5 mm, have been collected from the surgical unit, immediately after the surgery and placed in a sterilized recipient, in which 250 mL of sterile distilled water was added. Then, the trocars were agitated for the drainage of particles and to obtain a wash-out fluid to be analyzed. After being filtered through 0.22 microm cellulose membrane, the residue was placed on blood agar plates with a sterilized forceps. Following incubation, microbiological analysis has been done to count the number of colonies and further identify the microorganisms, using standard laboratorial techniques. microbial charge was recovered from 47.4% of the trocars analyzed. Among those, 45.6% presented 1 to 100 growing colonies. Fourteen types of microorganisms have been identified, among which the more frequently isolated were coagulase-negative Staphylococcus (28%) and Bacillus sp (21%), Aeromonas hydrophila, Alcaligenes sp, Candida parapsilosis, and enterobacteries were also identified. the study has demonstrated that the microbial challenge faced by the technician responsible for the cleaning and sterilization of trocars is low, as compared to the challenge imposed by biological markers. Nevertheless, it may be not inferred that the risks for infectious complications for patients are minimal.31586-9

Laryngoscopes: evaluation of microbial load of blades

Laryngoscope blades were analyzed, and the presence of blood, bodily fluids, and microorganisms was verified, indicating their potential as a source of cross contamination during clinical usage. The way in which the blades are cleaned and disinfected in daily practice may place the patient and health care team at risk. The aim of this study was to determine the bacterial and fungal load on this equipment. Descriptive cross-sectional study. A total of 83 laryngoscope blades, ready for use, were analyzed for their bacterial and fungal load at 2 university hospitals. The microbiologic analysis revealed the presence of microorganisms in 76.2% of cases at institution 1 and 92.7% of cases at institution 2, with microbial loads >10(1) colony forming units in 31.2% and 44.7% of cases, respectively. At both institutions, potentially pathogenic microorganisms were found, including Candida sp, Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis, Streptococcus agalactiae, extended-spectrum beta-lactamase-producing Klebsiella pneumoniae, multiresistant Acinetobacter baumannii, Pantoea sp, Enterobacter gergoviae, Escherichia coli, and Proteus mirabilis. These results indicate that the use of laryngoscope blades at these 2 institutions present a potential risk. Based on these findings, action needs to be taken so a higher level of safety can be offered to patients and health care professionals who have direct contact with this equipment44329429