57 research outputs found

    Phospholipid dependent mechanism of smp24, an α-helical antimicrobial peptide from scorpion venom

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    Determining the mechanism of action of antimicrobial peptides (AMPs) is critical if they are to be developed into the clinical setting. In recent years high resolution techniques such as atomic force microscopy (AFM) have increasingly been utilised to determine AMP mechanism of action on planar lipid bilayers and live bacteria. Here we present the biophysical characterisation of a prototypical AMP from the venom of the North African scorpion Scorpio maurus palmatus termed Smp24. Smp24 is an amphipathic helical peptide containing 24 residues with a charge of + 3 and exhibits both antimicrobial and cytotoxic activity and we aim to elucidate the mechanism of action of this peptide on both membrane systems. Using AFM, quartz crystal microbalance-dissipation (QCM-D) and liposomal leakage assays the effect of Smp24 on prototypical synthetic prokaryotic (DOPG:DOPC) and eukaryotic (DOPE:DOPC) membranes has been determined. Our data points to a toroidal pore mechanism against the prokaryotic like membrane whilst the formation of hexagonal phase non-lamellar phase structures is seen in eukaryotic like membrane. Also, phase segregation is observed against the eukaryotic membrane and this study provides direct evidence of the same peptide having multiple mechanisms of action depending on the membrane lipid composition

    Exploration de la reconnaissance de la courbure membranaire par le motif ALPS

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    Some biological processes such as vesicular transport are regulated by motifs that guide proteins to curved membranes. One of them is the ALPS (Amphipathic Lipid Packing Sensor) motif that recognizes packing defects induced by the convex curvature of the membrane. In this work, we combine molecular dynamics (MD) simulations and circular dichroism (CD) experiments to understand this phenomenon at the molecular level. MD simulations allowed us to characterize and quantify lipid packing defects. We show that packing defects caused by the membrane curvature are similar to those caused by the introduction of conical lipids in a flat bilayer composed of cylindrical lipids. By examining the interaction of the ALPS motif with a membrane containing such defects, we show that the early insertion of this motif on the membrane surface is driven by the inserton of its bulky hydrophobic residues in pre-existing defects. CD experiments and replica exchange MD simulations indicate that defects facilitate the ALPS folding into a partial alpha-helix. Finally, CD experiments allowed us to explore the thermodynamics of ALPS motif insertion as a function of lipid composition. Our work suggests that the peculiar amino-acid composition of the ALPS motif, as well as, its low helicity play a role in the recognition of packing defects, therefore curvature.Certains processus biologiques tels que le transport vésiculaire sont régulés par des motifs qui guident les protéines vers les membranes courbées. L'un d'entre eux est le motif ALPS (Amphipathic Lipid Packing Sensor) qui reconnaßt les défauts de packing provoqués par la courbure convexe de la membrane. Dans ce travail, nous combinons des simulations de dynamique moléculaire (DM) et des expériences de dichroïsme circulaire (CD) pour comprendre ce phénomÚne à l'échelle moléculaire. Les simulations de DM nous ont permis de caractériser et de quantifier les défauts de packing entre les lipides. Nous montrons que les défauts de packing provoqués par la courbure membranaire sont similaires à ceux provoqués par l'introduction de lipides coniques dans une bicouche plate composée de lipides cylindriques. En examinant l'interaction du motif ALPS avec une membrane contenant de tels défauts, nous montrons que l'insertion précoce de ce motif à la membrane est guidée par l'insertion de ses gros résidus hydrophobes dans des défauts pré-existants. Les expériences de CD et les simulations de DM avec échanges de répliques indiquent que les défauts facilitent le repliement du motif ALPS en une hélice alpha partielle. Enfin, les expériences de CD nous ont permis d'explorer la thermodynamique d'insertion du motif ALPS en fonction de la composition lipidique. Notre travail suggÚre que la composition de séquence particuliÚre du motif ALPS ainsi que son faible taux d'hélicité jouent un rÎle dans la reconnaissance des défauts de packing, donc de la courbure

    Intelligence artificielle et assurance : vers un renversement du déséquilibre informationnel ?

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    International audienceGrĂące Ă  l’intelligence artificielle, les assureurs deviennent capables d’infĂ©rer des informations cachĂ©es Ă  partir des donnĂ©es obtenues, directement ou indirectement, de leurs assurĂ©s. L’asymĂ©trie d’information, qui penchait essentiellement en faveur de l’assurĂ©, dĂ©tenteur d’informations sur sa situation, son Ă©tat de santĂ©, etc., non partagĂ©es avec l’assureur, est peut-ĂȘtre en train de s’inverser. C’est dĂ©sormais l’assureur qui dispose potentiellement de plus d’informations sur l’assurĂ©, et donc sur ses risques, que l’assurĂ© lui-mĂȘme. Ce renversement du dĂ©sĂ©quilibre informationnel n’est pas sans poser la question du statut des informations infĂ©rĂ©es, et notamment du droit d’accĂšs des assurĂ©s Ă  ces informations

    Intelligence artificielle et assurance : vers un renversement du déséquilibre informationnel ?

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    International audienceGrĂące Ă  l’intelligence artificielle, les assureurs deviennent capables d’infĂ©rer des informations cachĂ©es Ă  partir des donnĂ©es obtenues, directement ou indirectement, de leurs assurĂ©s. L’asymĂ©trie d’information, qui penchait essentiellement en faveur de l’assurĂ©, dĂ©tenteur d’informations sur sa situation, son Ă©tat de santĂ©, etc., non partagĂ©es avec l’assureur, est peut-ĂȘtre en train de s’inverser. C’est dĂ©sormais l’assureur qui dispose potentiellement de plus d’informations sur l’assurĂ©, et donc sur ses risques, que l’assurĂ© lui-mĂȘme. Ce renversement du dĂ©sĂ©quilibre informationnel n’est pas sans poser la question du statut des informations infĂ©rĂ©es, et notamment du droit d’accĂšs des assurĂ©s Ă  ces informations

    How binding incorrect partners can lead to the prediction of correct interfaces: Results from a massive cross-docking study on proteins

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    29th Annual Symposium of the Protein-Society, Barcelona, SPAIN, JUL 22-25, 2015International audienceno abstrac

    Est-ce que les systÚmes de lutte contre le blanchiment d'argent (LCB-FT) sont illégaux au regard des droits fondamentaux européens?

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    International audienceMachine learning algorithms can improve the fight against money laundering and the financing of terrorism (AML/CFT) by better detecting suspicious activities by bank customers and improving the handling of AML/CFT alerts by human compliance teams. However, the introduction of machine learning in AML/CFT monitoring systems will require a careful review of their compatibility with European fundamental rights and the GDPR. This article examines how algorithmic-based monitoring systems would be analysed under European fundamental rights law, and in particular the CJEU’s case law on the processing of personal data for the purpose of fighting crime. We identified five problems: first, AML/CFT laws imposing transaction monitoring are not clear and precise enough to comply with CJEU case law and Article 23(2) of the GDPR; second, it is impossible to measure the effectiveness of algorithmic monitoring systems, thereby raising questions about their ‘strict necessity’; third, monitoring systems cover a broad a range of offences going from terrorism to tax fraud, violating the CJEU’s principle that intrusive monitoring should be used only for the most serious crimes; fourth, current transparency measures are insufficient because persons targeted by individual AML/CFT alerts are never informed that they have been targeted; finally, institutional oversight mechanisms need to be improved to ensure that questions of effectiveness of monitoring systems and compliance with fundamental rights are considered together. We suggest solutions for each of the fundamental rights problems, drawing in particular from legislation on cyber-security and intelligence gathering
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