Reprogramming of lysosomal gene expression by interleukin-4 and Stat6.

BACKGROUND: Lysosomes play important roles in multiple aspects of physiology, but the problem of how the transcription of lysosomal genes is coordinated remains incompletely understood. The goal of this study was to illuminate the physiological contexts in which lysosomal genes are coordinately regulated and to identify transcription factors involved in this control. RESULTS: As transcription factors and their target genes are often co-regulated, we performed meta-analyses of array-based expression data to identify regulators whose mRNA profiles are highly correlated with those of a core set of lysosomal genes. Among the ~50 transcription factors that rank highest by this measure, 65% are involved in differentiation or development, and 22% have been implicated in interferon signaling. The most strongly correlated candidate was Stat6, a factor commonly activated by interleukin-4 (IL-4) or IL-13. Publicly available chromatin immunoprecipitation (ChIP) data from alternatively activated mouse macrophages show that lysosomal genes are overrepresented among Stat6-bound targets. Quantification of RNA from wild-type and Stat6-deficient cells indicates that Stat6 promotes the expression of over 100 lysosomal genes, including hydrolases, subunits of the vacuolar H⁺ ATPase and trafficking factors. While IL-4 inhibits and activates different sets of lysosomal genes, Stat6 mediates only the activating effects of IL-4, by promoting increased expression and by neutralizing undefined inhibitory signals induced by IL-4. CONCLUSIONS: The current data establish Stat6 as a broadly acting regulator of lysosomal gene expression in mouse macrophages. Other regulators whose expression correlates with lysosomal genes suggest that lysosome function is frequently re-programmed during differentiation, development and interferon signaling

Raça Somalis brasileira: origem, características reprodutivas e desenvolvimento ponderal.

bitstream/item/31710/1/UMT-Documentos-99.pd

Estimation of sediment production in oil palm expansion areas in the Amazon.

Atualmente, uma atividade que se tornou estratégica a nível nacional é o cultivo da palma de óleo (Elaeis guineensis) na região nordeste do estado do Pará, na Amazônia oriental brasileira. Entretanto, se conhece pouco ainda dos impactos da expansão dessa cultura sobre o ciclo hidrossedimentológico. Por isso, este trabalho estimou os impactos da expansão da cultura da palma de óleo sobre produção de sedimentos em uma sub-bacia de uso consolidado dessa cultura. Aplicou-se o modelo hidrossedimentológico Soil and Water Assessment Tool (SWAT) na Sub-Bacia do Rio Mariquita, PA, calibrando o modelo utilizando a técnica de regionalização de vazão, a partir de dados medidos em campo com o molinete hidrométrico. Os resultados das simulações indicaram um aumento da produção de sedimentos entre os anos de 2008 e 2013, podendo ser atribuído à grande redução de áreas de vegetação secundária que foram substituídas pelos cultivos de pastagem, palma de óleo e agricultura geral. As áreas de palma de óleo tiveram uma produção média mensal de sedimentos menor no período mais chuvoso em todos os anos simulados, se comparadas às áreas de agricultura geral e pastagem

Levantamento dos dados de passaporte e caracterização de acessos do banco ativo de germoplasma de capsicum da Embrapa clima temperado.

O Brasil é um importante centro secundário de espécies domesticadas de pimentas do gênero Capsicum. Muitos agricultores cultivam as variedades crioulas de Capsicum, que são resultados de vários ciclos de seleção por eles realizada. Estes recursos genéticos vêm sofrendo ação da erosão genética, devido à substituição de culturas ou abandono da atividade agrícola. Em função da grande importância de conservar esse germoplasma, a Embrapa Clima Temperado (Pelotas, RS) vem desde 2002 realizando o resgate de variedades locais de Capsicum, as quais são conservadas no Banco Ativo de Germoplasma (BAG) de Capsicum. O presente trabalho tem como objetivo apresentar a situaçãoatual do Banco Ativo de Germoplasma de Capsicum da Embrapa Clima Temperado, com base no levantamento dos dados de passaporte e de caracterização dos acessos. O BAG de Capsicum da Embrapa Clima Temperado mantém em seu acervo 324 acessos, a maioria deles proveniente de coletas realizadas no Rio Grande do Sul. Fazem parte do acervo do banco acessos de C. annuum, C. baccatum, C. frutescens, C. chinense, C. pubescens, C. galapagoense e C. lanceolatum. Foram submetidos à caracterização morfológica 51,2 % dos acessos, à caracterização química 14,8% e à caracterização molecular 6,1%. Foram avaliados agronomicamente 5,5% dos acessos. Os resultados obtidos demonstram que o BAG de Capsicum da Embrapa Clima Temperado reúne importante diversidade genética de variedades crioulas de pimentas, o que evidencia a importância desse banco

Parâmetros genéticos de características estimadas da curva de crescimento de ovinos da raça Santa Inês.

Resumo: Este trabalho foi realizado com os objetivos de estudar o ajuste das funções de Richards, Brody, Gompertz, Von Bertalanffy e Logística sobre a curva de crescimento de ovinos Santa Inês e estimar parâmetros genéticos para características calculadas a partir da função de melhor ajuste. Foram utilizadas apenas informações de fêmeas controladas entre os anos de 1993 e 2004, na Embrapa Tabuleiros Costeiros, e entre 1981 e 2004, na Embrapa Caprinos. Para o ajuste das curvas, as análises foram realizadas separadamente para cada rebanho, utilizando-se o procedimento NLIN do software Statistical Analysis System (SAS), por meio do método de GAUSS. Para determinar a função que melhor ajustava os dados, foram utilizados os critérios de coeficiente de determinação (R2), de quadrado médio residual (QMR) e o erro de predição médio (EM). No rebanho da Embrapa Tabuleiros Costeiros, todas as funções subestimaram os pesos, à exceção da curva de Richards. Diferentemente, todas as funções superestimaram o peso predito para o rebanho da Embrapa Caprinos. A curva de Richards foi a que promoveu melhor ajuste nos dois rebanhos. Os valores do peso adulto e da taxa de maturação estimados pela função de Richards foram de 54,38 kg e 0,00144/dia, respectivamente, para o rebanho da Embrapa Tabuleiros Costeiros, e 42,74 kg e 0,00260/dia, respectivamente, para o da Embrapa Caprinos. A função de Richards foi utilizada para estimar curvas individuais de crescimento dos animais. A partir destas curvas, foram estimadas várias características de interesse econômico. Os parâmetros genéticos e os componentes de (co) variância para estas características foram estimados pelo método da Máxima Verossimilhança Restrita Livre de Derivadas (DFREML), utilizando-se o software MTDFREML. As estimativas de herdabilidades direta e materna variaram, respectivamente, de 0,01 a 0,99 e de 0,00 a 0,13. É possível alterar o padrão da curva de crescimento destes animais por meio de seleção. Genetic parameters for traits estimated from the growth curve of Santa Inês hair sheep. Abstract: The aim of this work was to study the adjustment of Richards, Brody, Gompertz, Von Bertalanffy and Logistic functions on the growth curve of Santa Inês hair sheep and to estimate genetic parameters for the traits obtained from the best fitting function. Information from females of the Embrapa Tabuleiros Costeiros herd recorded between 1993 and 2004 and from the Embrapa Caprinos herd recorded between 1981 and 2004 was used. Functions were fitted for each herd, using NLIN procedure of Statistical Analysis System software (SAS), by GAUSS method. The coefficient of determination (R2), residual mean square (QMR) and mean prediction error (EM) were the criteria used to determine the best fitting function. For the Embrapa Tabuleiros Costeiros herd, all the functions subestimated the weights, except the Richards function. On the other hand, all the functions superestimated the weights of animals from the Embrapa Caprinos herd. The best fitting in the both herds was obtained using the Richards function. The respective values of mature weight and maturation rate estimated by Richards function were 54.38 kg and 0.00144/day for Embrapa Tabuleiros Costeiros herd and 42.74 kg and 0.00260/day for Embrapa Caprinos herd. The Richards function was used to estimate individual growth curves of animals in order to estimate genetic parameters and the (co)variance components for traits of economic importance using the Derivative Free Restricted Maximum Likelihood method (DFREML). The estimates of direct and maternal heritabilities ranged, respectively, from 0.01 to 0.99 and 0.00 to 0.13 suggesting the possibility of changing the growth curve of Santa Ines sheep by selection