Distribuição de elementos transponíveis em cromossomos de coffea arabica

Nos últimos anos o Brasil vem se destacando na pesquisa genética de cafeeiros, principalmente na área de melhoramento. Recentemente, a pesquisa em biotecnologia de cafeeiros vem ganhando espaço devido aos trabalhos em genômica, estes trabalhos juntamente com estudos citogenéticos têm contribuído muito para o entendimento da organização genômica em algumas espécies de Coffea. Neste gênero com mais de 100 espécies, as mais importantes economicamente são Coffea arabica e C. Canephora. A primeira espécie é a única e tetraplóide (2n = 44) do gênero, enquanto as demais são auto-incompatíveis e diplóides. Apesar das análises citogenéticas e moleculares indicarem que C. arabica é um anfidiplóide, ainda existe dificuldade para se confirmar os seus parentais. Isto se deve possivelmente a alta similaridade do genoma entre estas espécies de Coffea, uma possível consequência da presença de famílias repetitivas de DNA comuns a essas espécies. Porém, ainda são escassos os estudos sobre a distribuição e caracterização de famílias de DNA repetitivos em Coffea. Estes estudos limitam-se a identificar regiões heterocromáticas e localização de sítios de DNA ribossômico (DNAr) 45S e 5S. Com relação aos elementos transponíveis (TEs), foi encontrado um predomínio de retrotransposons Copia e Gypsy. Uma vez que a identificação e localização destes elementos transponíveis pode auxiliar a compreensão da organização genômica das espécies de Coffea, o objetivo deste estudo foi identificar a distribuição cromossômica em C. arabica de três elementos transponíveis. Para isso sondas de três clones contendo as sequências de elementos transponíveis, dois transposons MuDR e Tip100 (Ca_TE-009, Ca_TE-050) e um retrotransposon LTR deal (Ca_TE-079), foram hibridadas em Coffea arabica. Os resultados indicam uma distribuição co-localizada entre os transposons analisados e regiões terminais heterocromáticas, contudo o retroelemento possui uma distribuição mais dispersa. Estudos futuros serão feitos para identificar a distribuição destes elementos transponíveis nas espécies consideradas progenitoras de C. arabica

Holocentric Chromosomes of Luzula elegans Are Characterized by a Longitudinal Centromere Groove, Chromosome Bending, and a Terminal Nucleolus Organizer Region

The structure of holocentric chromosomes was analyzed in mitotic cells of Luzula elegans. Light and scanning electron microscopy observations provided evidence for the existence of a longitudinal groove along each sister chromatid. The centromere-specific histone H3 variant, CENH3, colocalized with this groove and with microtubule attachment sites. The terminal chromosomal regions were CENH3-negative. During metaphase to anaphase transition, L. elegans chromosomes typically curved to a sickle-like shape, a process that is likely to be influenced by the pulling forces of microtubules along the holocentric axis towards the corresponding microtubule organizing regions. A single pair of 45S rDNA sites, situated distal to Arabidopsis-telomere repeats, was observed at the terminal region of one chromosome pair. We suggest that the 45S rDNA position in distal centromere-free regions could be required to ensure chromosome stability. Copyright (C) 2011 S. Karger AG, Base

Water quality in a small catchment of Piracicaba River, SP

A microbacia do Ribeirão dos Marins, fluente do Rio Piracicaba, é importante ao município de Piracicaba, São Paulo, haja vista que concentra a maior área de produção de hortaliças, as quais são irrigadas com as águas do ribeirão. Com o objetivo de avaliar a qualidade da água, coletaram-se amostras de fevereiro a dezembro de 2005 em sete pontos ao longo do ribeirão, considerando-se o uso e ocupação do solo. As variáveis de qualidade de água analisadas foram: físicas e químicas: sedimentos em suspensão, pH, condutividade elétrica, alcalinidade, turbidez, potássio, cálcio, magnésio, cobre, ferro, manganês, zinco, sódio, fósforo, sulfato, cloreto, nitrogênio amoniacal e nitrato. As análises foram realizadas no Laboratório de Ecologia do Instituto de Estudos Florestais e no Laboratório de Água do Departamento de Engenharia Rural, ambos pertencentes à ESALQ-USP. Os resultados obtidos foram comparados com a Resolução nº 357 de 17 março de 2005, do Conselho Nacional de Meio Ambiente (CONAMA) que estabelece a classificação das águas brasileiras. As águas do ribeirão dos Marins apresentaram-se fora do padrão estabelecido pela Resolução 357/2005 do CONAMA, para a irrigação de hortaliças._________________________________________________________________________________________ ABSTRACT: The Marins creek watershed is important to the Piracicaba municipal district because it concentrates a large area of horticultural production, which is irrigated with the creek water. With the aim to evaluate the water quality, samples were collected from February to December 2005 at seven points along the creek according to land use. The parameters of quality analyzed were physical and chemical: suspended sediments, pH, electrical conductivity, alkalinity, turbidity, potassium, calcium, magnesium, copper, iron, manganese, zinc, sodium, phosphorus, sulfate, chloride, ammonia nitrogen, and nitrate. The analyses were made at the Ecology Laboratory of Forest Studies Institute and Water Laboratory at the Rural Engineering Department, both belonging to the Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz”, Universidade de São Paulo. The results were compared with the Brazilian legislation (Resolution nº 357 of March 17, 2005 of National Concil of Environment) which establishes the Brazilian water classification. The Marins water did not meet the limits established by the Brazilian legislation to irrigate the horticultural productio