Detection of cucumber mosaic virus (cucumber mosaic virus, cmv) causing natural ınfection on some cultured plants in Marmara Region

Bu çalışmada 2013 yılı Haziran ve Temmuz aylarında Çanakkale (Ezine)’den 48 domates, Bursa (İznik, Orhangazi, Yenişehir)’dan 15 domates, 25 biber, 35 glayöl, Yalova (Merkez)’dan 12 hıyar, 8 kabak, 16 biber, İstanbul (Pendik)’dan 25 biber, Bilecik (Osmaneli)’den 14 domates, 15 biber ve Sakarya (Pamukova)’dan 22 biber olmak üzere toplam 235 adet bitki yaprak örneği toplanmıştır. Örnekler DAS-ELISA yöntemiyle analiz edilmiştir. Toplanan biber örneklerinin % 69’u, domates örneklerinin % 87’si, kabak örneklerinin % 75’i, salatalık örneklerinin % 58’i ve glayöl örneklerinin % 69’u Cucumber mosaic virus (CMV) ile enfekteli bulunmuştur. Real-Time PCR analizinde glayöl, biber, domates, kabak ve hıyar örnekleri 84.0-88.7 değerleri arasında pik verirken negatif kontrol 76.0 değerinde pik vermiştir. PCR analizi sonucunda 540 bp’lik DNA bantları % 1’ lik agaroz jel elektroforezde gözlenmiştir. Moleküler ve serolojik analizler paralellik göstermiştir. Bu çalışma, CMV’nin glayöl bitkisinde tespitinin Türkiye’deki ilk kaydıdır.In this study, a total of 235 plant leaf samples were collected from 48 tomatoes from Çanakkale (Ezine), 15 tomatoes, 25 peppers and 35 gladiolus from Bursa (İznik, Yenişehir, Orhangazi), 12 cucumbers, 8 zucchini and 16 peppers from Yalova (Center), 25 peppers from Istanbul (Pendik), 14 tomatoes and 15 peppers from Bilecik (Osmaneli) and from 22 peppers from Sakarya (Pamukova) in June and July 2013. Samples were analysed by DAS-ELISA technique. 69 % of pepper samples, 87 % of tomato samples, 75 % of zucchini samples, 58 % of cucumbers sample and 69 % of gladiolus samples were found to be infected with Cucumber mosaic virus (CMV). Real-Time PCR analysis in the gladiolus, peppers, tomatoes, zucchini and cucumber samples revealed peak values between 84.0-88.7, while the negative control gave a peak value of 76.0. The expected amplicon sizes of 540 bp were observed after electrophoresis of PCR products in 1% agarose gel. The results of ELISA and PCR showed parallelism. This study is the first report of CMV in gladiolus in Turkey

Identifications of some virus diseases on major pome fruits in Marmara region of Turkey

Bu çalısma, Güneydogu Marmara Bölgesi’nde yumusak çekirdekli meyveciligin yogun olarak yapıldıgı 4 il ve 11 ilçede gerçeklestirilmistir. Çalısma elma, armut ve ayva yetistiriciliginin yogun olarak yapıldıgı Bursa ilinin Merkez, znik, Kestel, Gürsu; Kocaeli ilinin hsaniye, Esme; Sakarya ilinin Pamukova, Geyve ve Yalova ilinin Merkez, Altınova ve Çınarcık ilçelerini kapsamıstır. 2006 ile 2007 yıllarında gerçeklestirilen çalısmada, elma, armut ve ayva üretimini olumsuz yönde etkileyen Apple Mosaic Virus (ApMV), Apple Chlorotic Leaf Spot Virus (ACLSV) ve Apple Stem Grooving Virus (ASGV)’ leri, karakteristik simptomlar sergileyen agaçlardan toplanan yaprak ve çiçek örneklerinde tanılanmıstır. Yapraklarda kloroz, damarda renk açılması, mozayik deseni, kıvrılma, çiçeklerde renk kırılması gözlenen agaçlar virüs içerigi bakımından degerlendirilmislerdir. Bu amaçla 170 meyve bahçesi ziyaret edilerek 2006 yılında 164 elma, 103 armut, 104 ayva agacından toplam 371 yaprak örnegi alınmıstır. 2007 yılında ise aynı bölgeden 316 elma, 251 armut ve 152 ayva agacından toplam 719 yaprak ve çiçek örnegi toplanmıstır. Bu örnekler mekanik inokulasyon yöntemi ile biyolojik ve Double antibody sandwich enzyme linked immunosorbent assay (DAS-ELISA) yöntemi ile serolojik teste tabi tutulmuslardır. ki yıllık çalısma sonucu 12 farklı elma çesidinden alınan 480 yaprak ve çiçek örneginin % 5’inin Apple Mosaic Virus (ApMV), % 25’inin Apple Chlorotic Leaf Spot Virus (ACLSV) ve % 0.6’sının Apple Stem Grooving Virus (ASGV) ile enfekteli oldugu saptanmıstır. Çalısmada 18 farklı armut çesidinden alınan örneklerin % 7’sinde ApMV, %2.5 ACLSV infeksiyonu saptanırken, 12 çesit ayvadan alınan örneklerin % 9’unun ApMV, %14’ ünün ACLSV ile enfekteli oldugu belirlenmistir. Virüs içeren en önemli çesitler, elmada Starking Delicious ve Golden Delicious, armutta Santa Maria, Akça ve Deveci, ayvada ise Esme çesidi olarak saptanmıstır. Sürvey yapılan yumusak çekirdekli meyve bahçelerinde en yaygın virüsün ACLSV oldugu ve bunu ApMV’nun izledigi görülmüstür.This study was conducted in 11 districts of 4 provinces of South Eastern Marmara region pome fruit production is intensive. It covers apple, pear and quince producing Central, Kestel and Gürsu districts of Sakarya and Central, Altınova and Çınarcık distircts of Yalova province and in 2006 and 2007 some important viruses were identified on leaf and flower samples collected from symptomatic apple, pear and quince trees which affect pome fruit production negatively in the region. Those fruit trees exhibited cholorosis, vein banding, mosaic, leaf rolling on leaves and color breaking on flowers were investigated for their virus content. For this purpose 170 fruit orchards were visited and from 164 apple, 103 pear and 104 quince trees totally 371 leaf samples were collected in 2006. In 2007 from 316 apple, 251 pear and 152 quince trees totally 719 leaf and flowers were obtained from same Region. All samples were tested biologically by mechanical inoculations to indicator test plants and serologically by employing Double antibody sandwich enzyme linked immunosorbent assay (DAS-ELISA). As a result of this two year study, 5% of Apple Mosaic Virus (ApMV), 25% of Apple Chlorotic Leaf Spot Virus (ACLSV) and 0.6% of Apple Stem Grooving Virus (ASGV) of 480 leaf and flower samples taken from 12 different apple variety were soiled. n this study, while in saples of 7 % that 18 different pear variety, in that of 25 % ACLSV is found; it is mentioned that samples of 9 % which take 12 different quince variety ApMV, in 14 % ACLSV were soild. The most important varieties of soiled virus were Starking Delicious and Golden Delicious in apple, Santa Maria, Akça and Deveci in pear and Esme in quince. The most wide spread virus was ACLSV and was seen ApMV

MARMARA BÖLGESİ'NDE BAZI KÜLTÜR BİTKİLERİNDE DOĞAL ENFEKSİYONA NEDEN OLAN HIYAR MOZAİK VİRÜSÜ (CUCUMBER MOSAIC VIRUS, CMV)'NÜN TESPİTİ

In this study, a total of 235 plant leaf samples were collected from 48 tomatoes from ;Ccedil;anakkale (Ezine), 15 tomatoes, 25 peppers and 35 gladiolus from Bursa (İznik, Yenişehir, Orhangazi), 12 cucumbers, 8 zucchini and 16 peppers from Yalova (Center), 25 peppers from Istanbul (Pendik), 14 tomatoes and 15 peppers from Bilecik (Osmaneli) and from 22 peppers from Sakarya (Pamukova) in June and July 2013. Samples were analysed by DAS-ELISA technique. 69 % of pepper samples, 87 % of tomato samples, 75 % of zucchini samples, 58 % of cucumbers sample and 69 % of gladiolus samples were found to be infected with Cucumber mosaic virus (CMV). Real-Time PCR analysis in the gladiolus, peppers, tomatoes, zucchini and cucumber samples revealed peak values between 84.0-88.7, while the negative control gave a peak value of 76.0. The expected amplicon sizes of 540 bp were observed after electrophoresis of PCR products in 1% agarose gel. The results of ELISA and PCR showed parallelism. This study is the first report of CMV in gladiolus in Turkey.Bu çalışmada 2013 yılı Haziran ve Temmuz aylarında Çanakkale (Ezine)'den 48 domates, Bursa (İznik, Orhangazi, Yenişehir)'dan 15 domates, 25 biber, 35 glayöl, Yalova (Merkez)'dan 12 hıyar, 8 kabak, 16 biber, İstanbul (Pendik)'dan 25 biber, Bilecik (Osmaneli)'den 14 domates, 15 biber ve Sakarya (Pamukova)'dan 22 biber olmak üzere toplam 235 adet bitki yaprak örneği toplanmıştır. Örnekler DAS-ELISA yöntemiyle analiz edilmiştir. Toplanan biber örneklerinin % 69'u, domates örneklerinin % 87'si, kabak örneklerinin % 75'i, salatalık örneklerinin % 58'i ve glayöl örneklerinin % 69'u Cucumber mosaic virus (CMV) ile enfekteli bulunmuştur. Real-Time PCR analizinde glayöl, biber, domates, kabak ve hıyar örnekleri 84.0-88.7 değerleri arasında pik verirken negatif kontrol 76.0 değerinde pik vermiştir. PCR analizi sonucunda 540 bp'lik DNA bantları % 1' lik agaroz jel elektroforezde gözlenmiştir. Moleküler ve serolojik analizler paralellik göstermiştir. Bu çalışma, CMV'nin glayöl bitkisinde tespitinin Türkiye'deki ilk kaydıdır

Identification of Apple mosaic ilarvirus (ApMV) on pome fruits in south eastern Marmara region of Turkey

Güneydogu Marmara Bölgesi’nde yumusak çekirdekli meyve üretimi yapılan Bursa, Kocaeli, Sakarya ve Yalova illeri ile bu 4 ile baglı 11 ilçedeki 170 bahçeden Apple mosaic virus (ApMV)’nu saptamak amacıyla yaprak örnekleri toplanmıstır. 2006 yılında yapılan sürveylerde 164 elma, 103 armut, 104 ayva agacından toplanan 371 yaprak örnegi DAS-ELISA testine tabi tutulmustur. DAS-ELISA testi sonucunda 11 farklı elma çesidinin %15.8, 12 farklı armut çesidinin %24, 7 farklı ayva çesidinin ise %21 oranında ApMV ile enfekteli oldugu saptanmıstır. Virüs ile enfekteli oldugu saptanan en önemli çesidin elmada; Starking delicious ve Golden delicious, armutta Santa maria, Akça ve Deveci, ayvada ise Esme çesidi oldugu belirlenmistir.In order to identify Apple mosaic virus (ApMV) on pome fruits, leaf samples were collected from 170 orchards in the 11 disticts of Bursa, Kocaeli, Sakarya and Yalova provinces in 2006. For this purpose leaf samples were collected from 164 apple, 103 pear and 104 symptomatic quince trees. Totally 371 samples were tested by DASELISA for the diagnosis of ApMV. As a result of ELISA 15.8% apple samples from 11 cultivar, 24.7% pear samples of 12 cultivar and 21% quince samples of 7 cultivars revealed ApMV. Starking delicious, Golden delicious of apple, Santa maria, Akca, Deveci of pear and Esme cultivar of quince were found the most susceptible cultivars for ApMV

Detection of Cucumber Mosaic Virus (Cucumber Mosaic Virus, Cmv) Causing Natural Infection on Some Cultured Plants in Marmara Region

Bu çalışmada 2013 yılı Haziran ve Temmuz aylarında Çanakkale (Ezine)'den 48 domates, Bursa (İznik, Orhangazi, Yenişehir)'dan 15 domates, 25 biber, 35 glayöl, Yalova (Merkez)'dan 12 hıyar, 8 kabak, 16 biber, İstanbul (Pendik)'dan 25 biber, Bilecik (Osmaneli)'den 14 domates, 15 biber ve Sakarya (Pamukova)'dan 22 biber olmak üzere toplam 235 adet bitki yaprak örneği toplanmıştır. Örnekler DAS-ELISA yöntemiyle analiz edilmiştir. Toplanan biber örneklerinin % 69'u, domates örneklerinin % 87'si, kabak örneklerinin % 75'i, salatalık örneklerinin % 58'i ve glayöl örneklerinin % 69'u Cucumber mosaic virus (CMV) ile enfekteli bulunmuştur. Real-Time PCR analizinde glayöl, biber, domates, kabak ve hıyar örnekleri 84.0-88.7 değerleri arasında pik verirken negatif kontrol 76.0 değerinde pik vermiştir. PCR analizi sonucunda 540 bp'lik DNA bantları % 1' lik agaroz jel elektroforezde gözlenmiştir. Moleküler ve serolojik analizler paralellik göstermiştir. Bu çalışma, CMV'nin glayöl bitkisinde tespitinin Türkiye'deki ilk kaydıdır.In this study, a total of 235 plant leaf samples were collected from 48 tomatoes from Çanakkale (Ezine), 15 tomatoes, 25 peppers and 35 gladiolus from Bursa (İznik, Yenişehir, Orhangazi), 12 cucumbers, 8 zucchini and 16 peppers from Yalova (Center), 25 peppers from Istanbul (Pendik), 14 tomatoes and 15 peppers from Bilecik (Osmaneli) and from 22 peppers from Sakarya (Pamukova) in June and July 2013. Samples were analysed by DAS-ELISA technique. 69 % of pepper samples, 87 % of tomato samples, 75 % of zucchini samples, 58 % of cucumbers sample and 69 % of gladiolus samples were found to be infected with Cucumber mosaic virus (CMV). Real-Time PCR analysis in the gladiolus, peppers, tomatoes, zucchini and cucumber samples revealed peak values between 84.0-88.7, while the negative control gave a peak value of 76.0. The expected amplicon sizes of 540 bp were observed after electrophoresis of PCR products in 1% agarose gel. The results of ELISA and PCR showed parallelism. This study is the first report of CMV in gladiolus in Turkey

Marmara Bölgesi’nde Bazı Sebze ve Süs Bitkilerinde Orthotospovirus’ların Biyolojik,Serolojik ve Moleküler Karakterizasyonu

Bu çalışma, 2012-2016 yılları arasında Marmara Bölgesi’nde (Bilecik, Bursa, Çanakkale, Edirne, Kocaeli, Kırklareli, İstanbul, Sakarya, Tekirdağ, Yalova il ve ilçeleri) domates, marul, kasımpatı, gerbera ve glayöl üretim alanlarında gerçekleştirilmiştir. Çalışma, bu alanlarda zarara neden olan ve Orthotospovirusgenusunda yer alan Groundnut bud necrosis virus (GBNV), Watermelon silver mottle virus (WSMoV),Groundnut ringspot virus (GRSV), Impatiens necrotic spot virus (INSV), Tomato chlorotic spot virus(TCSV), Chrysanthemum stem necrosis virus (CSNV) ve Tomato spotted wilt virus’un (TSWV) saptanması, toplanan örneklerde enfeksiyon oranlarının ortaya konması ve virüslerin moleküler karakterizasyonlarının yapılarak, flogenetik akrabalıklarının belirlenmesi amacıyla yürütülmüştür. Toplanan 1034 adet örneğin tamamı serolojik olarak DAS-ELISA yöntemine göre testlenmiştir. Domates bitkilerine ait 562 adet örneğin %41.10’unun TSWV ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. Marul bitkilerine ait 332 adet, glayöl, gerbera ve kasımpatı bitkilerine ait 140 adet yaprak örneğinde araştırılan Orthotospovirus’lar açısından enfeksiyon tespit edilmemiştir. BST1 numaralı izolat otsu indikatörlerden Capsicum annuum L., Datura stramonium L.,Nicotiana tabacum cv. Samsun ve N. glutinosa L., BST2 numaralı izolat Petuia hybrida L., BYA4 numaralı izolat Solanum lycopersicum L. ve Arachis hypogaea L. bitkilerinde klorotik/nekrotik leke, mozaik, deformasyon ve bodurluk gibi belirtilerin oluşmasına neden olmuştur. Yerel TSWV izolatlarına ait nükleotit ve amino asit dizilerinin benzerlik oranları NCBI gen bankasında kayıtlı referans izolatlarlarla oldukça yüksek bulunmuştur

First Report of Apple Stem Pitting Virus on Pear and Quince Orchards in Northern Turkey

[No Abstract Available