Detection of Cucumber Mosaic Virus (Cucumber Mosaic Virus, Cmv) Causing Natural Infection on Some Cultured Plants in Marmara Region

Abstract

Bu çalışmada 2013 yılı Haziran ve Temmuz aylarında Çanakkale (Ezine)'den 48 domates, Bursa (İznik, Orhangazi, Yenişehir)'dan 15 domates, 25 biber, 35 glayöl, Yalova (Merkez)'dan 12 hıyar, 8 kabak, 16 biber, İstanbul (Pendik)'dan 25 biber, Bilecik (Osmaneli)'den 14 domates, 15 biber ve Sakarya (Pamukova)'dan 22 biber olmak üzere toplam 235 adet bitki yaprak örneği toplanmıştır. Örnekler DAS-ELISA yöntemiyle analiz edilmiştir. Toplanan biber örneklerinin % 69'u, domates örneklerinin % 87'si, kabak örneklerinin % 75'i, salatalık örneklerinin % 58'i ve glayöl örneklerinin % 69'u Cucumber mosaic virus (CMV) ile enfekteli bulunmuştur. Real-Time PCR analizinde glayöl, biber, domates, kabak ve hıyar örnekleri 84.0-88.7 değerleri arasında pik verirken negatif kontrol 76.0 değerinde pik vermiştir. PCR analizi sonucunda 540 bp'lik DNA bantları % 1' lik agaroz jel elektroforezde gözlenmiştir. Moleküler ve serolojik analizler paralellik göstermiştir. Bu çalışma, CMV'nin glayöl bitkisinde tespitinin Türkiye'deki ilk kaydıdır.In this study, a total of 235 plant leaf samples were collected from 48 tomatoes from Çanakkale (Ezine), 15 tomatoes, 25 peppers and 35 gladiolus from Bursa (İznik, Yenişehir, Orhangazi), 12 cucumbers, 8 zucchini and 16 peppers from Yalova (Center), 25 peppers from Istanbul (Pendik), 14 tomatoes and 15 peppers from Bilecik (Osmaneli) and from 22 peppers from Sakarya (Pamukova) in June and July 2013. Samples were analysed by DAS-ELISA technique. 69 % of pepper samples, 87 % of tomato samples, 75 % of zucchini samples, 58 % of cucumbers sample and 69 % of gladiolus samples were found to be infected with Cucumber mosaic virus (CMV). Real-Time PCR analysis in the gladiolus, peppers, tomatoes, zucchini and cucumber samples revealed peak values between 84.0-88.7, while the negative control gave a peak value of 76.0. The expected amplicon sizes of 540 bp were observed after electrophoresis of PCR products in 1% agarose gel. The results of ELISA and PCR showed parallelism. This study is the first report of CMV in gladiolus in Turkey