Marmara Bölgesi’nde Bazı Sebze ve Süs Bitkilerinde Orthotospovirus’ların Biyolojik,Serolojik ve Moleküler Karakterizasyonu

Abstract

Bu çalışma, 2012-2016 yılları arasında Marmara Bölgesi’nde (Bilecik, Bursa, Çanakkale, Edirne, Kocaeli, Kırklareli, İstanbul, Sakarya, Tekirdağ, Yalova il ve ilçeleri) domates, marul, kasımpatı, gerbera ve glayöl üretim alanlarında gerçekleştirilmiştir. Çalışma, bu alanlarda zarara neden olan ve Orthotospovirusgenusunda yer alan Groundnut bud necrosis virus (GBNV), Watermelon silver mottle virus (WSMoV),Groundnut ringspot virus (GRSV), Impatiens necrotic spot virus (INSV), Tomato chlorotic spot virus(TCSV), Chrysanthemum stem necrosis virus (CSNV) ve Tomato spotted wilt virus’un (TSWV) saptanması, toplanan örneklerde enfeksiyon oranlarının ortaya konması ve virüslerin moleküler karakterizasyonlarının yapılarak, flogenetik akrabalıklarının belirlenmesi amacıyla yürütülmüştür. Toplanan 1034 adet örneğin tamamı serolojik olarak DAS-ELISA yöntemine göre testlenmiştir. Domates bitkilerine ait 562 adet örneğin %41.10’unun TSWV ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. Marul bitkilerine ait 332 adet, glayöl, gerbera ve kasımpatı bitkilerine ait 140 adet yaprak örneğinde araştırılan Orthotospovirus’lar açısından enfeksiyon tespit edilmemiştir. BST1 numaralı izolat otsu indikatörlerden Capsicum annuum L., Datura stramonium L.,Nicotiana tabacum cv. Samsun ve N. glutinosa L., BST2 numaralı izolat Petuia hybrida L., BYA4 numaralı izolat Solanum lycopersicum L. ve Arachis hypogaea L. bitkilerinde klorotik/nekrotik leke, mozaik, deformasyon ve bodurluk gibi belirtilerin oluşmasına neden olmuştur. Yerel TSWV izolatlarına ait nükleotit ve amino asit dizilerinin benzerlik oranları NCBI gen bankasında kayıtlı referans izolatlarlarla oldukça yüksek bulunmuştur

    Similar works

    Full text

    thumbnail-image