Versailles project on advanced materials and standards (VAMAS) interlaboratory study on measuring the number concentration of colloidal gold nanoparticles

We describe the outcome of a large international interlaboratory study of the measurement of particle number concentration of colloidal nanoparticles, project 10 of the technical working area 34, "Nanoparticle Populations" of the Versailles Project on Advanced Materials and Standards (VAMAS). A total of 50 laboratories delivered results for the number concentration of 30 nm gold colloidal nanoparticles measured using particle tracking analysis (PTA), single particle inductively coupled plasma mass spectrometry (spICP-MS), ultraviolet-visible (UV-Vis) light spectroscopy, centrifugal liquid sedimentation (CLS) and small angle X-ray scattering (SAXS). The study provides quantitative data to evaluate the repeatability of these methods and their reproducibility in the measurement of number concentration of model nanoparticle systems following a common measurement protocol. We find that the population-averaging methods of SAXS, CLS and UV-Vis have high measurement repeatability and reproducibility, with between-labs variability of 2.6%, 11% and 1.4% respectively. However, results may be significantly biased for reasons including inaccurate material properties whose values are used to compute the number concentration. Particle-counting method results are less reproducibile than population-averaging methods, with measured between-labs variability of 68% and 46% for PTA and spICP-MS respectively. This study provides the stakeholder community with important comparative data to underpin measurement reproducibility and method validation for number concentration of nanoparticles

Versailles project on advanced materials and standards (VAMAS) interlaboratory study on measuring the number concentration of colloidal gold nanoparticles

We describe the outcome of a large international interlaboratory study of the measurement of particle number concentration of colloidal nanoparticles, project 10 of the technical working area 34, "Nanoparticle Populations" of the Versailles Project on Advanced Materials and Standards (VAMAS). A total of 50 laboratories delivered results for the number concentration of 30 nm gold colloidal nanoparticles measured using particle tracking analysis (PTA), single particle inductively coupled plasma mass spectrometry (spICP-MS), ultraviolet-visible (UV-Vis) light spectroscopy, centrifugal liquid sedimentation (CLS) and small angle X-ray scattering (SAXS). The study provides quantitative data to evaluate the repeatability of these methods and their reproducibility in the measurement of number concentration of model nanoparticle systems following a common measurement protocol. We find that the population-averaging methods of SAXS, CLS and UV-Vis have high measurement repeatability and reproducibility, with between-labs variability of 2.6%, 11% and 1.4% respectively. However, results may be significantly biased for reasons including inaccurate material properties whose values are used to compute the number concentration. Particle-counting method results are less reproducibile than population-averaging methods, with measured between-labs variability of 68% and 46% for PTA and spICP-MS respectively. This study provides the stakeholder community with important comparative data to underpin measurement reproducibility and method validation for number concentration of nanoparticles

Quantum Spacetime Phenomenology

I review the current status of phenomenological programs inspired by quantum-spacetime research. I stress in particular the significance of results establishing that certain data analyses provide sensitivity to effects introduced genuinely at the Planck scale. And my main focus is on phenomenological programs that managed to affect the directions taken by studies of quantum-spacetime theories.Comment: 125 pages, LaTex. This V2 is updated and more detailed than the V1, particularly for quantum-spacetime phenomenology. The main text of this V2 is about 25% more than the main text of the V1. Reference list roughly double

Versailles project on advanced materials and standards (VAMAS) interlaboratory study on measuring the number concentration of colloidal gold nanoparticles

We describe the outcome of a large international interlaboratory study of the measurement of particle number concentration of colloidal nanoparticles, project 10 of the technical working area 34, "Nanoparticle Populations" of the Versailles Project on Advanced Materials and Standards (VAMAS). A total of 50 laboratories delivered results for the number concentration of 30 nm gold colloidal nanoparticles measured using particle tracking analysis (PTA), single particle inductively coupled plasma mass spectrometry (spICP-MS), ultraviolet-visible (UV-Vis) light spectroscopy, centrifugal liquid sedimentation (CLS) and small angle X-ray scattering (SAXS). The study provides quantitative data to evaluate the repeatability of these methods and their reproducibility in the measurement of number concentration of model nanoparticle systems following a common measurement protocol. We find that the population-averaging methods of SAXS, CLS and UV-Vis have high measurement repeatability and reproducibility, with between-labs variability of 2.6%, 11% and 1.4% respectively. However, results may be significantly biased for reasons including inaccurate material properties whose values are used to compute the number concentration. Particle-counting method results are less reproducibile than population-averaging methods, with measured between-labs variability of 68% and 46% for PTA and spICP-MS respectively. This study provides the stakeholder community with important comparative data to underpin measurement reproducibility and method validation for number concentration of nanoparticles

Synteza sideroforów przez glebowe bakterie z rodzaju Pseudomonas w zmiennych warunkach hodowli

The ability of six strains belonging to the genus Pseudomonas isolated from the rhizosphere of wheat to produce pyoverdin was examined. The studied strains demonstrated a varied level of production of the siderophore, depending on the culture conditions. The highest level of pyoverdin was determined after 72 hours of growth at 20- 25°C in iron-free medium supplemented with succinate. The synthesis of pyoverdin by all the strains studied was strongly repressed by the addition of iron ions (III) to the growth medium. Calcium, cadmium and magnesium ions stimulated the synthesis of the siderophore examined, whereas zinc and lead ions partially decreased its level. Enrichment of the growth medium in cobalt ions completely inhibited the synthesis of siderophores as well as growth of the bacteria.Zbadano zdolność sześciu szczepów z rodzaju Pseudomonas wyizolowanych z ryzosfery pszenicy do produkcji piowerdyny (pyoverdin). Badane szczepy wykazywały zróżnicowany poziom produkcji tego sideroforu w zależności od warunków hodowli. Wykazano, że syntetyzowały one największą ilość piowerdyny w 72. godzinie hodowli i w temperaturze 20-25°C, na bezżelazowej bursztynianowej pożywce. Synteza piowerdyny u wszystkich badanych szczepów podlegała silnej represji po dodaniu do podłoża hodowlanego jonów żelaza (III). Jony wapnia, kadmu i magnezu w niewielkim stopniu stymulowały syntezę badanego sideroforu, natomiast jony cynku i ołowiu obniżały jej poziom. Wzbogacenie podłoża hodowlanego w jony kobaltu całkowicie zahamowało syntezę sideroforów i wzrost bakterii

Bioactive metabolites of the rhizosphere Pseudomonas bacteria

Celem badań było określenie, jakie metabolity, bioaktywne względem wybranych fitopatogenów zbóż, są syntetyzowane przez wyizolowane z ryzosfery pszenicy bakterie Pseudomonas. Do doświadczeń wybrano dwa różne szczepy bakterii Pseudomonas fluorescens, które charakteryzowały się w warunkach in vitro silnym antagonizmem w stosunku do fitopategenów zbóż z rodzaju Pyrenophora Alteria i Fusarium. Jak wykazały badania obydwa szczepy bakterii w warunkach doświadczeń intensywnie wydzielały cyjanowodór oraz siderofory, w tym piowerdynę. Kwas salicylowy lub jego pochodną wykryto w hodowli tylko jednego z badanych izolatów. Obydwa zastosowane w doświadczeniu szczepy P. fluorescens charakteryzowały się zdolnością do syntezy zewnątrzkomórkowych peptydaz o różnym poziomie aktywności. W hodowlach bekterii nie wykryto enzymów litycznych zdolnych do rozkładu wiązań glikozydowych - chitynazy i ß-1,3 glukanazy.The study was aimed at estimating which metabolites (bioactive towards selected cereal plant phatogens) are synthesized by Pseudomonas isolated from wheat rhizosphere. Two different strains of Pseudomonas fluorescens characterised by the strong in vitro antagonism in relation to cereal plant phatogens of the genera Pyrenophora , Alterial and Fusarium were selected for experiments. Both bacterial strains under experimental conditions intensively released hydrogen cyanide and siderophores including pyoverdine. Salicylic acid and its derivative were found in the culture of only one of analysed isolates. Both strains of P. fluoroscens were able to synthesize extracellular peptidases of different activity. No hydrolysing enzymes able to decompose glycoside bonds (chitinase and ß-1.3 gluconase) were found bacterial cultures

Cross-reacting of siderophores synthesized by Pseudomonas

Ze względu na swoje potencjalne zastosowanie w medycynie i różnych gałęziach przemysłu siderofory syntetyzowane przez bakterie cieszą się w ostatnich latach bardzo dużym zainteresowaniem badaczy. Głównym sideroforem wytwarzanym przez bakterie z rodzaju Pseudomonas w warunkach niedoboru żelaza jest piowerdyna. W niniejszej pracy wyizolowano i oczyszczono, metodą chromatografii chelatującej, piowerdyny trzech szczepów bakterii P. fluorescens - 5N, G i D oraz piowerdynę szczepu P. putida A. Zbadano wymienialność sideroforów między tymi szczepami. Krzyżową wymienialność piowerdyn zaobserwowano między szczepami 5N i D, D i G oraz 5N i A. Po porównaniu profili elektroforetycznych białek zewnętrznej błony komórkowej wykazano, że bakterie w warunkach niedoboru żelaza wytwarzają dodatkowe białka, których synteza może być indukowana niedoborem żelaza w podłożu.Interest in siderophores produced by bacteria seems to be increasing among researchers all over the world, mostly due to their potential applications in medicine and various branches of industry. Pyoverdine is a significant siderophore synthesized by bacteria under iron-deficient conditions. This paper describes isolation and purification of pyoverdines from three strains of Pseudomonas fluorescens (5N, G and D) and pyoverdine from P. putida A strain. The copper-chelate chromatography method was employed. Cross-reacting among Pseudomonas strains was analysed. Cross-reactivity was observed between the following strains: 5N and D, D and G, 5N and A. Moreover, we isolated outer membrane proteins from bacterial culture. The comparison of electrophoretic profiles of these proteins showed that bacteria produced additional proteins whose synthesis is probably induced by iron deficiency

Występowanie bakterii cyklu azotowego w wodach rzeki Biebrzy

This paper of the selected groups of nitrogen cycle bacteria in the Biebrza River was analysed. In the water samples the quantity of ammonifying bacteria, nitrifying bacteria, proteolitic bacteria was estimated and also selected water quality indicators were analysed. Large quantities of proteolitic bacteria and ammonifying bacteria were found while the quantity of nitrifying bacteria was very small. Water quality analyses proved high TOC concentrations and low nitrate as well as nitrite concentrations. It was found, that the mineral forms of nitrogen being the intensive product of organic matter degradation is not released (low concentrations of ammonia), but it is accumulated in microorganisms cells. Low concentrations of ammonia are limiting for the number of nitrifying bacteria. The seasonal character of the occurrence of all analysed bacteria groups was as well found. The analytical procedure used was adjusted for bacteriological research on rivers of low anthropopressure.W niniejszej pracy zbadano występowanie wybranych grup bakterii cyklu azotowego w rzece Biebrzy. W próbach wody oznaczono liczebność bakterii proteolitycznych, amonifi kacyjnych i nitryfi kacyjnych. Określono poziom wybranych wskaźników jakości chemicznej. Stwierdzono wysoką liczebność bakterii proteolitycznych i amonifi kacyjnych oraz bardzo niską bakterii nitryfi kacyjnych. Badania chemiczne potwierdziły wysokie stężenia OWO i niskie stężenia azotynów i azotanów. Stwierdzono, że mineralne formy azotu intensywnie powstające w wyniku degradacji materii organicznej nie są uwalniane do środowiska (niskie stężenia amoniaku), a kumulowane w komórkach mikroorganizmów. Niskie stężenia amoniaku działają hamująco na liczebność bakterii nitryfikacyjnych. Stwierdzono ponadto sezonowość występowania wszystkich badanych grup bakterii. Dostosowano procedurę analityczną do wykorzystania w badaniach bakteriologicznych rzek o niskiej antropopresji

Characteristics of the proteolytic properties of two selected strains of Myxococcales bacteria

Myksobakterie (rząd Myxococcales) należą do Gram-ujemnych bakterii, które stanowią ważny element mikroflory glebowej. W badaniach scharakteryzowano właściwości proteolityczne dwóch szczepów myksobakterii Sorangium cellulosum oraz Archangium gephyra. W doświadczeniach zoptymalizowano warunki hodowli oraz oznaczono dynamikę zmian w aktywności zewnątrzkomórkowych proteaz syntetyzowanych przez badane szczepy bakterii. Ponadto, po wstępnym oczyszczeniu badanych enzymów, dokonano ich charakterystyki pod względem optimum temperatury oraz pH, wyznaczono termostabilność oraz reakcję na wybrane inhibitory diagnostyczne. Hodowle badanych organizmów prowadzono na pożywce płynnej CY. Aktywność proteaz wykrywano na zymogramach, po uprzednich natywnych rozdziałach elektroforetycznych w warunkach niedenaturujących. Badania wykazały, że szczepy Sorangium cellulosum oraz Archangium gephyra są zdolne do syntezy proteaz zewnątrzkomórkowych o różnym poziomie aktywności oraz o różnych wartościach optimum temperatury i pH oraz termostabilności.Myxobacteria (order Myxococcales) belong to Gram-negative bacteria which are important komponent of soil microflora. In the present study the proteolytic properties of two myxobacterial strains Sorangium cellulosum and Archangium gephyra were characterised. In the performed experiments, culture conditions were optimised and the dynamics of changes in the activity of extracellular proteases synthesized by these bacteria was determined. Moreover, after the pretreatment of enzymes, they were characterised in terms of optimum temperature and pH. Their thermal stability and response to selected diagnostic inhibitors were also determined. Protease activity was detected with gelatin zymography after electrophoretic separation at non-denaturating conditions. The study showed that the Sorangium cellulosum and Archangium gephyra strains were capable of synthesizing extracellular protease of different activity and different values of optimum temperature, pH and thermal stability

Metabolic activity of Tuber aestivum/Tuber uncinatum Vittad mycellium

Celem prezentowanych badań było oznaczenie aktywności enzymów wydzielanych do podłoża przez dwie formy trufli letniej: Tuber aestivum i Tuber uncinatum Vittad. W pracy wykazano, że T. aestivum i T. uncinatum uwalniają do podłoża hodowlanego białka enzymatyczne o aktywności: lakazy, proteazy, lipazy oraz celulazy i ksylanazy. Analiza aktywności enzymatycznej w płynnych hodowlach obu form trufli letniej wykazała znaczne różnice biochemiczne pomiędzy nimi. Obserwowano zdecydowanie większą aktywność zewnątrzkomórkowych enzymów u T. aestivum, szczególnie lakazową i peptydazową. Wyniki badań wskazują na różną swoistość substratową lipaz wydzielanych przez te trufle: T. uncinatum syntetyzuje lipazy wykazujące aktywność tylko do octanu p-nitrofenolu, natomiast T. aestivum – także do palmitynianu p-nitrofenolu. W hodowlach obu form trufli wykryto niewielką aktywność celulolityczną i ksylanolityczną. Ksylanazy i celulazy oraz lakazy wydzielane przez grzybnię obu form tych trufli mogą brać udział w procesie zawiązywania symbiozy mykoryzowej.Truffle have long been appreciated for their culinary value. However, knowledge about their biochemical activity is still insufficient. Therefore, the aim of this study was to preliminarily assess the enzymatic activity of two forms of summer truffle (Tuber aestivum Vittad.). The results showed that studied fungi of the genus truffle (Tuber spp.) – T. aestivum and T. uncinatum secrete extracellular enzymatic proteins with activities of: laccase, protease lipase, cellulase and xylanase. The high activity of the enzyme was observed between 10th and 20th day of truffle cultivation in liquid culture. Higher activity of all tested enzymes was detected in the culture of T. aestivum. Significant differences observed in the level and kind of enzymatic activity might indicate different metabolic activity of studied forms of summer truffle