Variabilidad genética de genotipos de ñame (Dioscorea trifida) en la región Ucayali, Perú

The aim of this research was to assess genetic variability of yam Dioscorea trifida genotypes using morphological descriptors for the germplasm collection conserved in the Agricultural Experiment Station in Ucayali, Peru. Thirty-eight morphological traits were evaluated for 30 D. trifida genotypes over ten years; from the data we estimated the Shannon-Weaver diversity index (H’) and the coefficient of variation and performed principal component analysis and cluster analysis. Qualitative traits with high phenotypic diversity index were: petiole anthocyanin (0.86), internal tuber color (0.86), petiole color (0.81) and stem color (0.80). The quantitative traits with the highest coefficient of variation were: tuber weight per plant (33.01) and tuber yield (32.99). Seventy-six percent of the morphological variability is explained by four principal components, the first component is constituted by the characters tuber width, tuber weight per plant, and tuber yield (29%). Five groups of genotypes were also identified with statistically significant differences, where group B stands out for its higher yield in fewer days to harvest. This research reveals wide morphological diversity in genotypes of D. trifida; these results can be used to strengthen the conservation, management, and genetic improvement initiatives of this important species in the Peruvian Amazon

Diversidade biológica de aves em uma mata ciliar do distrito de Yarinacocha, Ucayali, Peru

RESUMEN Por su proximidad a las fuentes de agua, los bosques ribereños vienen siendo presionados por actividades antropogénicas como la agricultura, construcción, deforestación, entre otros (Kutschker et al., 2020), con el objetivo de determinar la diversidad biológica de aves durante la época climática lluviosa en un bosque ribereño del distrito de Yarinacocha, Ucayali, Perú, se ubicaron tres parcelas de muestreo a lo largo de la quebrada Cashibococha, las cuales fueron georrefereciadas. La técnica de muestreo fue a través de transecto en franja (MINAM, 2015), la evaluación se realizó en la época lluviosa (febrero-marzo) se recorrió en bote, el horario de muestreo: 6:00 – 7:00 am, 11:00 am – 12:00 pm y 3:00 – 4:00 pm, el esfuerzo de muestreo fue 27 horas/hombre, las observaciones se realizaron con binoculares 10X, se fotografiaron a las aves y se anotaron la cantidad de aves en un formato, se realizó un registro fotográfico de aves, el cual fue remitido a un especialista para su identificación taxonómica, se realizó el análisis de datos utilizando el índice de diversidad de Shannon y Simpson, abundancia y riqueza de aves. En la época lluviosa se encontraron 329 individuos, 39 especies, agrupados en 23 familias, la especie más abundante fue Cacicus cela (Icteridae), el índice de diversidad Shannon-Wiener H’ = 4.88 e índice de diversidad de Simpson 1-D = 0,91, indican alta diversidad de especies en el bosque ribereño.Por su proximidad a las fuentes de agua, los bosques ribereños vienen siendo presionados por actividades antropogénicas como la agricultura, construcción, deforestación, entre otros (Kutschker et al., 2020), con el objetivo de determinar la diversidad biológica de aves durante la época climática lluviosa en un bosque ribereño del distrito de Yarinacocha, Ucayali, Perú, se ubicaron tres parcelas de muestreo a lo largo de la quebrada Cashibococha, las cuales fueron georrefereciadas. La técnica de muestreo fue a través de transecto en franja (MINAM, 2015), la evaluación se realizó en la época lluviosa (febrero-marzo) se recorrió en bote, el horario de muestreo: 6:00 – 7:00 am, 11:00 am – 12:00 pm y 3:00 – 4:00 pm, el esfuerzo de muestreo fue 27 horas/hombre, las observaciones se realizaron con binoculares 10X, se fotografiaron a las aves y se anotaron la cantidad de aves en un formato, se realizó un registro fotográfico de aves, el cual fue remitido a un especialista para su identificación taxonómica, se realizó el análisis de datos utilizando el índice de diversidad de Shannon y Simpson, abundancia y riqueza de aves. En la época lluviosa se encontraron 329 individuos, 39 especies, agrupados en 23 familias, la especie más abundante fue Cacicus cela (Icteridae), el índice de diversidad Shannon-Wiener H’ = 4.88 e índice de diversidad de Simpson 1-D = 0,91, indican alta diversidad de especies en el bosque ribereño.Por sua proximidade a las fuentes de agua, los bosques ribereños vienen siendo presionados por atividades antropogênicas como la agricultura, construción, deforestación, entre outros (Kutschker et al., 2020), com o objetivo de determinar la diversidad biológica de durante la época Iluviosa em um bosque ribeirinho do distrito de Yarinacocha, Ucayali perto do Peru, se ubicaron três parcelas do museu até o largo da quebrada Cashibococha, os quatro fueron georreferenciados. A técnica de muestreo fue a través de transecto en franja (MINAM, 2015), a avaliação se realizada na época lluviosa (febrero-marzo) se recorrió em bote, no horário de muestreo: 6:00 – 7:00 am, 11 :00 am – 12:00 pm e 3:00 – 4:00 pm, o esfuerzo de muestreo fue 27 hours/hombre, las observaciones se realizaron con binoculares 10X, se fotografiaron a las aves y se anotaron la cantidad de aves en un formato, se percebeu um registro fotográfico de aves, a fonte cual enviada a um especialista para sua identificação taxonómica, realizou a análise de dados usando o índice de diversidade de Shannon e Simpson, abundância e riqueza de aves. Na época ilusória se encontrar 329 indivíduos, 39 espécies, agrupados em 23 famílias, a espécie mais abundante fue Cacicus cela (Icteridae), o índice de diversidade Shannon-Wiener H' = 4,88 e índice de diversidade de Simpson 1-D = 0 ,91, indica alta diversidade de espécies no bosque ribereño

INFLUENCIA DE LA DESINFECCIÓN, MEDIOS DE CULTIVO Y FITOHORMONAS EN EL DESARROLLO MORFOGÉNICO IN VITRO DE GERMOPLASMA DE Guazuma crinita Mart.

The objective of this study was to determine the influence of disinfection processes, culture medium and phytohormones on the in vitro morphogenic development of explants obtained from biological seed of the species Guazuma crinita Mart (Bolaina), which was carried out in the tissue culture and meristems laboratory of the National University of Ucayali. The seeds were disinfected with 2% sodium hypochlorite for 0, 5, 10, 15 and 20 minutes (T1, T2, T3, T4, T5). To promote germination, culture media and combinations of Phytogel, Phytogel + Sucrose, Phytogel + Sucrose + Murashige and Skoog (MS) and Phytogel + Sucrose + ½ MS (M1, M2, M3, M4) were used; and for morphogenesis, five homogenized auxin and cytokinin concentration treatments were applied (AC1, AC2, AC3, AC4, AC5). From the study it was obtained that T5 (disinfection with 2% sodium hypochlorite with exposure of 20 minutes) had a 95% survival rate; while in germination, the M1 medium (Phytogel) presented the highest with 72.55%; Finally, in morphogenesis, it was determined that the best treatment for inducing callus formation was AC4 (Kin 12 ppm + AIB 12 ppm), for root primordia the best treatment was AC5 (Kin 4 ppm + AIB 12 ppm) and the same number of shoots was achieved with all the combinations of phytohormones used.El presente estudio, tuvo como objetivo determinar la influencia de procesos de desinfección, medio de cultivo y fitohormonas en el desarrollo morfogénico In vitro de explantes obtenidas a partir de semilla biológica de la especie Guazuma crinita Mart (Bolaina), el mismo que se realizó en el laboratorio de cultivo de tejidos y meristemas, de la Universidad Nacional de Ucayali. Para ello se desinfectaron las semillas con hipoclorito de sodio al 2%, por un espacio de 0, 5, 10, 15 y 20 minutos (T1, T2, T3, T4, T5). Para promover la germinación se utilizaron medios de cultivo y combinaciones de Fitogel, Fitogel + Sacarosa, Fitogel + Sacarosa + Murashige and Skoog (MS) y Fitogel + Sacarosa + ½ MS (M1, M2, M3, M4); y para la morfogénica se aplicaron cinco tratamientos de concentración de auxinas y citoquininas homogenizadas (AC1, AC2, AC3, AC4, AC5). Del estudio se obtuvo que el T5 (desinfección con hipoclorito de sodio al 2% con exposición de 20 minutos) tuvo un 95% de sobrevivencia; mientras que en la germinación, el medio M1 (Fitogel) presentó el más alto con un 72,55%; finalmente en la morfogénica se determinó que el mejor tratamiento para inducir la formación de callos es el tratamiento AC4 (Kin 12 ppm + AIB 12 ppm), para primordios radiculares el mejor tratamiento AC5 (Kin 4 ppm + AIB 12 ppm) y se logró igual cantidad de brotes con todas las combinaciones de fitohormonas utilizadas.&nbsp

Manual de manejo agronómico de raíces y tubérculos tropicales

El Instituto Nacional de Innovación Agraria (INIA) a través del Manual “Manejo agronómico de raíces y tubérculos tropicales” presenta los resultados obtenidos en el manejo agronómico del Banco de Germoplasma de Raíces y Tubérculos Tropicales, durante más de 20 años de conservación e investigación en estos importantes cultivos. Esta información relevante permitirá incrementar su producción, conservación, mejoramiento genético y valoración

Estructura y composición florística de un bosque ribereño en el distrito de Yarinacocha, Ucayali, Perú

El objetivo en este estudio fue determinar la estructura y composición florística de un bosque ribereño en el distrito de Yarinacocha, Ucayali, Perú, para ello, se utilizó la base gráfica de la zona, ubicado en el caserío 7 de junio, seguidamente, fue georreferenciado las cinco parcelas para ser censadas, en cada parcela fue registrado los datos: nombre común, fue medido el DAP (m), y altura total de todos los árboles en pie (m). Con los datos se analizaron la composición florística, estructura del bosque y los índices de importancia ecológica por especie y familias. Las especies en estudio forman parte de 12 familias, 19 géneros y 266 individuos, destacando las familias Euphorbiaceae y Fabaceae como dominantes. La especie Laetia americana L, fue la más abundante e importante desde el punto de vista ecológico, debido a la provisión de alimento para la fauna del bosque ribereño, así mismo, los índices de Shannon-Wiener mostraron alto grado de diversidad florística (H’ = 2.599) en el bosque ribereño del distrito de Yarinacocha

Mophological and molecular diversity of a tropical tree species Guazuma crinita in the Peruvian Amazon

Fast growing tree species Guazuma crinita (Malvaceae) was selected as a priority species for domestication in the Peruvian Amazon due its important contribution to the livelihood of local farmers. Its domestication process is still in an early age as for many tropical tree species little is known about its genetic variability and we dont know anything about the impact of domestication on its genetic resources. The main objective of this research was to assess the genetic variability of G. crinita within and among populations in the Peruvian Amazon by the use of morphological (wood physical traits) and molecular (ISSR and AFLP) markers. Wood physical properties among six G. crinita provenances were evaluated. Wood samples were drilled from the base middle and top of the stem of 12 randomly selected eight-years-old trees for determination of wood measurement. Pearson correlations between physical properties were also determined. All wood physical properties except green density differed significantly among provenances. We also found statistically significant variation due to stem level position. The moderately dense wood and the coefficient of anisotropy (1.6) suggested that G. crinita has stable wood; they represent important advantages in terms of costs for transport and transformation process. The results suggested potential to select provenances with desirable wood properties for further breeding and domestication. Due to the variation found even in limited tree samples it is recommended further analysis with more extensive number of samples from different provenances and planting zones. This research presents the first assessment of genetic variability based on inter-simple sequence repeat (ISSR) markers for 44 G. crinita genotypes from a clonal garden multiplication established in the Peruvian Amazon Research Institute (IIAP) in Ucayali region. Ten ISSR primers amplified a total of 65 bands of which 61 were polymorphic (93.8%). The range of DNA amplification varied from 260 to 2200 bp. Among the provenances overall genetic differentiation (Gst) was 0.03 indicating 97% of genetic diversity within provenances. Gene flow (Nm) was 12.9 alleles per generation. Cluster analysis was not related with geographic origin suggesting a common gene pool which was supported by calculation of weak positive correlation was found between genetic and geographic distance. With the use of AFLP markers an insight on how domestication process does impact G. crinita genetic resources is also reported on this research work. I was able to generate fingerprint for 58 leaf samples representing eight provenances and three population types, 19 from a natural regenerated population 15 cultivated in home garden nursery and 24 from a collection of genotypes considered as semi-domesticated population. Seven selective AFLP primer combinations were used. A total of 171 fragments were amplified with 99.42% of polymorphism at species level. Each type of population generated fragments with 72.51% 49.12% and 54.39% of polymorphic fragments respectively. Neis genetic diversity and Shannon index information were found to be higher in the population of natural regeneration compared to overall semi-domesticated population (He = 0.10 and 0.9; I = 0.19 and 0.16 respectively). The analysis of molecular variation (AMOVA) showed higher variation within provenances rather than among (84% and 4% respectively). UPGMA clusters analysis and PCoA did not showed correspondence between genetic and geographic distance in addition their correlation was not significant. There was a significant genetic differentiation among types of population suggesting slight genetic bottleneck in semi-domesticated populations yet with relatively high levels of genetic variation. In situ conservation for populations with high levels of genetic diversity was recommended. In addition proper management of natural regeneration and ex situ genotype collections might be a good conservation strategy to maintain G. crinita genetic resources. The use of morphological (wood physical traits) and molecular markers were successful to reveal genetic variability of G. crinita and they could be used for other tropical tree species. For further researches it is emphasis to extent the number of samples and geographic scale

Caracterização de frutos de variedades de manga (Mangifera indica) conservadas no Peru

The department of Piura is the main mango producer in Peru accounting for 66.7% of the national crop. The objective of the study was to characterize the fruits of forty varieties of mango preserved since 1969 in northwestern Peru. The fruits were harvested at the El Chira Agrarian Experimental Station, Department of Piura from December 2019 to January 2020. Thirteen quantitative fruit variables were evaluated: width, thickness, length, weight, seed width, seed thickness, seed length, percentage of seed, percentage of fresh skin, percentage of pulp, texture, °Brix, and pulp / seed ratios. The varieties with the highest percentage of pulp were Tommy Atkins, Haden x carabao 1, Irwin, and Jaffra, the latter was also the variety with the highest pulp / seed ratio (17.0). The varieties with the highest ° Brix were Blacman (21.3 ° Brix) and Julie (22.0 ° Brix). Knowledge of the fruit characteristics is essential for proper selection and use by the industry, especially those with a higher pulp weight to obtaining higher yields in processing

Preliminary Evidence for Domestication Effects on the Genetic Diversity of Guazuma crinita in the Peruvian Amazon

Guazuma crinita, a fast-growing timber tree species, was chosen for domestication in the Peruvian Amazon because it can be harvested at an early age and it contributes to the livelihood of local farmers. Although it is in an early stage of domestication, we do not know the impact of the domestication process on its genetic resources. Amplified fragment length polymorphic (AFLP) fingerprints were used to estimate the genetic diversity of G. crinita populations in different stages of domestication. Our objectives were (i) to estimate the level of genetic diversity in G. crinita using AFLP markers, (ii) to describe how the genetic diversity is distributed within and among populations and provenances, and (iii) to assess the genetic diversity in naturally regenerated, cultivated and semi-domesticated populations. We generated fingerprints for 58 leaf samples representing eight provenances and the three population types. We used seven selective primer combinations. A total of 171 fragments were amplified with 99.4% polymorphism at the species level. Nei’s genetic diversity and Shannon information index were slightly higher in the naturally regenerated population than in the cultivated and semi-domesticated populations (He = 0.10, 0.09 and 0.09; I = 0.19, 0.15 and 0.16, respectively). The analysis of molecular variation showed higher genetic diversity within rather than among provenances (84% and 4%, respectively). Cluster analysis (unweighted pair group method with arithmetic mean) and principal coordinate analysis did not show correspondence between genetic and geographic distance. There was significant genetic differentiation among population types (Fst = 0.12 at p < 0.001). The sample size was small, so the results are considered as preliminary, pending further research with larger sample sizes. Nevertheless, these results suggest that domestication has a slight but significant effect on the diversity levels of G. crinita and this should be considered when planning a domestication program

Manual técnico para la conservación y propagación de especies de algarrobo (Prosopis spp.)

El Ministerio de Desarrollo Agrario y Riego (MIDAGRI) a través del Instituto Nacional de Innovación Agraria (INIA) tiene la misión de conservar los recursos genéticos de uso agrario, y fomentar su puesta en valor y producción. Por lo tanto, se vienen desarrollando investigaciones enfocadas en mitigar la disminución poblacional de algarrobo y de esta forma, contribuir en la recuperación de los ecosistemas de bosques secos del Perú. El presente manual proporciona información relevante sobre la propagación y conservación de las especies de algarrobo, se ha elaborado en base a literatura científica referida a las especies identificadas como P. pallida, P. chilensis, P. alba, P. laevigata, P. flexuosa, P. kuntzei, P. limensis, P. nigra, P. glandulosa, P. juliflora, P. tamarugo y P. spicigera. Asimismo, se ha tomado en cuenta información generada en los trabajos de conservación, micropropagación e identificación de plagas, que se han venido realizando en el INIA. En este manual se describen las características botánicas y agroecológicas del algarrobo, se proporciona información relevante respecto a las plagas asociadas a esta planta, y se describen las técnicas de selección, propagación y conservación de las semillas, que permite asegurar el mantenimiento de material vegetal representativo de su variabilidad genética, para su conservación