Integración de bases de creencias manteniendo coherencia y consistencia con criterio unificado de credibilidad

Esta línea de I+D propone desarrollar frameworks para la integración de bases de conocimientos provenientes de diferentes fuentes. Estos frameworks modelan escenarios de Revisión de Creencias en entornos de múlti-agentes, con mecanismos para solucionar conflictos de inconsistencia e incoherencia recurrentes al integrar varios repositorios masivos locales y de gestión diferente. Se pretende que el proceso de integración, logre consensuar un criterio unificado de credibilidad que refleja la confianza global en cada fuente; y posteriormente, efectivice la integración como una vista unificada de la información des repositorios locales, basándose en el orden de credibilidad establecido.Eje: Agentes y Sistemas Inteligentes.Red de Universidades con Carreras en Informátic

Integración de bases de creencias manteniendo coherencia y consistencia con criterio unificado de credibilidad

Esta línea de I+D propone desarrollar frameworks para la integración de bases de conocimientos provenientes de diferentes fuentes. Estos frameworks modelan escenarios de Revisión de Creencias en entornos de múlti-agentes, con mecanismos para solucionar conflictos de inconsistencia e incoherencia recurrentes al integrar varios repositorios masivos locales y de gestión diferente. Se pretende que el proceso de integración, logre consensuar un criterio unificado de credibilidad que refleja la confianza global en cada fuente; y posteriormente, efectivice la integración como una vista unificada de la información des repositorios locales, basándose en el orden de credibilidad establecido.Eje: Agentes y Sistemas Inteligentes.Red de Universidades con Carreras en Informátic

Integración de bases de creencias manteniendo coherencia y consistencia con criterio unificado de credibilidad

Esta línea de I+D propone desarrollar frameworks para la integración de bases de conocimientos provenientes de diferentes fuentes. Estos frameworks modelan escenarios de Revisión de Creencias en entornos de múlti-agentes, con mecanismos para solucionar conflictos de inconsistencia e incoherencia recurrentes al integrar varios repositorios masivos locales y de gestión diferente. Se pretende que el proceso de integración, logre consensuar un criterio unificado de credibilidad que refleja la confianza global en cada fuente; y posteriormente, efectivice la integración como una vista unificada de la información des repositorios locales, basándose en el orden de credibilidad establecido.Eje: Agentes y Sistemas Inteligentes.Red de Universidades con Carreras en Informátic

Structural and functional aspects of mannuronic acid–specific PL6 alginate lyase from the human gut microbe Bacteroides cellulosilyticus

Alginate is a linear polysaccharide from brown algae consisting of 1,4-linked β-D-mannuronic acid (M) and α-L-guluronic acid (G) arranged in M, G, and mixed MG blocks. Alginate was assumed to be indigestible in humans, but bacteria isolated from fecal samples can utilize alginate. Moreover, genomes of some human gut microbiome–associated bacteria encode putative alginate-degrading enzymes. Here, we genome-mined a polysaccharide lyase family 6 alginate lyase from the gut bacterium Bacteroides cellulosilyticus (BcelPL6). The structure of recombinant BcelPL6 was solved by X-ray crystallography to 1.3 Å resolution, revealing a single-domain, monomeric parallel β-helix containing a 10-step asparagine ladder characteristic of alginate-converting parallel β-helix enzymes. Substitutions of the conserved catalytic site residues Lys-249, Arg-270, and His-271 resulted in activity loss. However, imidazole restored the activity of BcelPL6-H271N to 2.5% that of the native enzyme. Molecular docking oriented tetra-mannuronic acid for syn attack correlated with M specificity. Using biochemical analyses, we found that BcelPL6 initially releases unsaturated oligosaccharides of a degree of polymerization of 2–7 from alginate and polyM, which were further degraded to di- and trisaccharides. Unlike other PL6 members, BcelPL6 had low activity on polyMG and none on polyG. Surprisingly, polyG increased BcelPL6 activity on alginate 7-fold. LC–electrospray ionization–MS quantification of products and lack of activity on NaBH4-reduced octa-mannuronic acid indicated that BcelPL6 is an endolyase that further degrades the oligosaccharide products with an intact reducing end. We anticipate that our results advance predictions of the specificity and mode of action of PL6 enzymes

Astatine: Halogen or Metal;

International audienc

Rational enzyme design without structural knowledge: a sequence-based approach for efficient generation of transglycosylases

International audienceGlycobiology is dogged by the relative scarcity of synthetic, defined oligosaccharides. Enzyme-catalysed glycosylation using glycoside hydrolases is feasible but is hampered by the innate hydrolytic activity of these enzymes. Protein engineering is useful to remedy this, but it usually requires prior structural knowledge of the target enzyme, and/or relies on extensive, time-consuming screening and analysis. Here we describe a straightforward strategy that involves rational rapid in silico analysis of protein sequences. The method pinpoints 6‒12 single mutant candidates to improve transglycosylation yields. Requiring very little prior knowledge of the target enzyme other than its sequence, the method is generic and procures catalysts for the formation of glycosidic bonds involving various D/L-, α/β-pyranosides or furanosides, and exo- and endoaction. Moreover, mutations validated in one enzyme can be transposed to others, even distantly related enzymes