In Vivo Control of CpG and Non-CpG DNA Methylation by DNA Methyltransferases

The enzymatic control of the setting and maintenance of symmetric and non-symmetric DNA methylation patterns in a particular genome context is not well understood. Here, we describe a comprehensive analysis of DNA methylation patterns generated by high resolution sequencing of hairpin-bisulfite amplicons of selected single copy genes and repetitive elements (LINE1, B1, IAP-LTR-retrotransposons, and major satellites). The analysis unambiguously identifies a substantial amount of regional incomplete methylation maintenance, i.e. hemimethylated CpG positions, with variant degrees among cell types. Moreover, non-CpG cytosine methylation is confined to ESCs and exclusively catalysed by Dnmt3a and Dnmt3b. This sequence position–, cell type–, and region-dependent non-CpG methylation is strongly linked to neighboring CpG methylation and requires the presence of Dnmt3L. The generation of a comprehensive data set of 146,000 CpG dyads was used to apply and develop parameter estimated hidden Markov models (HMM) to calculate the relative contribution of DNA methyltransferases (Dnmts) for de novo and maintenance DNA methylation. The comparative modelling included wild-type ESCs and mutant ESCs deficient for Dnmt1, Dnmt3a, Dnmt3b, or Dnmt3a/3b, respectively. The HMM analysis identifies a considerable de novo methylation activity for Dnmt1 at certain repetitive elements and single copy sequences. Dnmt3a and Dnmt3b contribute de novo function. However, both enzymes are also essential to maintain symmetrical CpG methylation at distinct repetitive and single copy sequences in ESCs

Epigenetics Offer New Horizons for Colorectal Cancer Prevention

In recent years, colorectal cancer (CRC) incidence has been increasing to become a major cause of morbidity and mortality worldwide from cancers, with high rates in westernized societies and increasing rates in developing countries. Epigenetic modifications including changes in DNA methylation, histone modifications, and non-coding RNAs play a critical role in carcinogenesis. Epidemiological data suggest that, in comparison to other cancers, these alterations are particularly common within the gastrointestinal tract. To explain these observations, environmental factors and especially diet were suggested to both prevent and induce CRC. Epigenetic alterations are, in contrast to genetic modifications, potentially reversible, making the use of dietary agents a promising approach in CRC for the development of chemopreventive strategies targeting epigenetic mechanisms. This review focuses on CRC-related epigenetic alterations as a rationale for various levels of prevention strategies and their potential modulation by natural dietary compounds

Pouvoir et altruisme

Une conversation avec le Dalaï-Lama sur le grand défi du XXI e siècle : exercer le pouvoir avec bienveillance. Historiquement associée à la domination, l'instrumentalisation ou la souveraineté, la notion de pouvoir n'est pas neutre en Occident. Comme en témoignent les inégalités entre les peuples, entre les hommes et les femmes ou les écarts de richesses, le pouvoir dans les sphères politiques, sociales et interpersonnelles est trop souvent un pouvoir exercé sur autrui. De son côté, la notion d'altruisme qui convoque les idées d'interdépendance, de bienveillance et de responsabilité semble étrangère à celle de pouvoir. Dans ce livre, des chercheurs du monde entier et des acteurs de la société civile réunis autour du Dalaï-Lama montrent comment allier ces deux forces au lieu de les opposer. Ce dialogue, organisé par l'Institut Mind and Life Europe, est une invitation à un exercice bienveillant du pouvoir

Pouvoir et altruisme

Une conversation avec le Dalaï-Lama sur le grand défi du XXI e siècle : exercer le pouvoir avec bienveillance. Historiquement associée à la domination, l'instrumentalisation ou la souveraineté, la notion de pouvoir n'est pas neutre en Occident. Comme en témoignent les inégalités entre les peuples, entre les hommes et les femmes ou les écarts de richesses, le pouvoir dans les sphères politiques, sociales et interpersonnelles est trop souvent un pouvoir exercé sur autrui. De son côté, la notion d'altruisme qui convoque les idées d'interdépendance, de bienveillance et de responsabilité semble étrangère à celle de pouvoir. Dans ce livre, des chercheurs du monde entier et des acteurs de la société civile réunis autour du Dalaï-Lama montrent comment allier ces deux forces au lieu de les opposer. Ce dialogue, organisé par l'Institut Mind and Life Europe, est une invitation à un exercice bienveillant du pouvoir

Pouvoir et altruisme

Une conversation avec le Dalaï-Lama sur le grand défi du XXI e siècle : exercer le pouvoir avec bienveillance. Historiquement associée à la domination, l'instrumentalisation ou la souveraineté, la notion de pouvoir n'est pas neutre en Occident. Comme en témoignent les inégalités entre les peuples, entre les hommes et les femmes ou les écarts de richesses, le pouvoir dans les sphères politiques, sociales et interpersonnelles est trop souvent un pouvoir exercé sur autrui. De son côté, la notion d'altruisme qui convoque les idées d'interdépendance, de bienveillance et de responsabilité semble étrangère à celle de pouvoir. Dans ce livre, des chercheurs du monde entier et des acteurs de la société civile réunis autour du Dalaï-Lama montrent comment allier ces deux forces au lieu de les opposer. Ce dialogue, organisé par l'Institut Mind and Life Europe, est une invitation à un exercice bienveillant du pouvoir