Gömülü sistem tabanlı elektrokardiyogram holter cihazının tasarlanması ve yapay sinir ağıgenetik algoritma hibrit modeli ile aritmi tespiti

06.03.2018 tarihli ve 30352 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan “Yükseköğretim Kanunu İle Bazı Kanun Ve Kanun Hükmünde Kararnamelerde Değişiklik Yapılması Hakkında Kanun” ile 18.06.2018 tarihli “Lisansüstü Tezlerin Elektronik Ortamda Toplanması, Düzenlenmesi ve Erişime Açılmasına İlişkin Yönerge” gereğince tam metin erişime açılmıştır.Ülkemizde ve dünyada, insan nüfusunun giderek yaşlanması ve kalp rahatsızlıkları görülme oranının artışı, bu hayati önem taşıyan organımızın faaliyetlerini sürekli olarak kontrol altında tutma, tedavi süresi boyunca ve tedavi öncesinde tüm etkileri gözlemleme gibi ihtiyaçları doğurmaktadır. Çalışmanın temel amacı, gömülü sistem tabanlı taşınabilir bir Elektrokardiyografi (EKG) Holter cihazını gerçekleştirmek, sinyal işleme metotları uygulayarak alınan sonuçlara adaptif çözümler üretmek ve yapay sinir ağı, genetik algoritma hibrit modeli oluşturularak, atriyal fibrilasyon kalp aritmisinin tespit edilmesidir. Yapmış olduğumuz çalışma üç aşamadan meydana gelmektedir: İlk aşamada, bireyin EKG sinyalleri elektrotlar yardımı ile alınıp, tasarlamış olduğumuz biyoenstrümantasyon yükseltici devresi ile 251 kat kuvvetlendirilmiştir. EKG sinyallerine etki eden çevresel etmenler ve şebeke gürültüsünün olumsuz etkisini bastırmak için 50 Hz'lik çentik filtre ve 0,01-132 Hz frekans aralığında bant geçiren filtre uygulanmıştır. Filtrelenen EKG işareti analog dijital çeviriciler (ADC) kullanılarak sayısallaştırılıp SPI haberleşme protokolü kullanılarak gömülü sistem kartı ile bağlantısı kurulmuştur. İlk ara yüz yazılımı çok sayıda kütüphane desteği içerdiği için Python dilinde geliştirilmiş. Fakat Python dili gerçek zamanlı çalışırken, sinyal işleme algoritmalarını ve sinyali ara yüzde çizdirme işlemini gerçekleştirirken hızı yeterli olmadığı için C++ dilinde programlama yapılmıştır. Algoritmalar Raspberry Pi, Odroid ve Beaglebone black gömülü sistem kartlarında çalıştırılıp performans analizleri karşılaştırılıp sonuçları incelenmiştir. Beaglebone black gömülü sistem kartının örnekleme hızı 40 Hz'i geçemediği için EKG Holter cihazı için uygun değildir. Raspberry Pi gömülü sistem kartının örnekleme hızı 80 Hz civarındadır, nabız ve basit sinyal işleme algoritmalarını çalıştırmak için kullanılabileceği tespit edilmiştir. Odroid gömülü sistem kartında örnekleme hızı 260 Hz'lere kadar çıkabildiği için EKG analizleri, sinyal işleme algoritmaları ve yapay zekâ uygulamaları için kullanılabilir en uygun mikrobilgisayar olduğu belirlenmiştir. İkinci aşamada, sayısallaştırılmış olan EKG sinyalini analiz etmek için Fourier dönüşümü uygulanmıştır ve frekans analizi yapılmıştır. R tepesini güçlendirmek ve nabız hesaplamasında adaptif eşik değeri ayarlamak için sinyal işleme metotları uygulanarak sonuçları karşılaştırılmıştır. En uygun R bulma algoritması olarak sinyal enerjisi yöntemi olarak belirlenmiştir. EKG sinyaline dalgacık dönüşümü uygulanarak farklı Daubechies (db) dalgacık aileleri kullanılarak özellik çıkartımı gerçekleştirilmiştir ve yapay zekânın sonuçları tablo oluşturularak karşılaştırılmıştır. Üçüncü aşamada, istatistiksel özellik çıkarımı yapılarak yapay sinir ağının giriş katmanı oluşturularak yapay sinir ağı eğitilmiştir ve yapay sinir ağının ağırlık katsayıları genetik algoritma kullanılarak hata oranı azaltılmıştır.The main goal of the study is to realize the embedded system based portable ECG Holter Device and by applying signal processing methods to provide adaptative solutions to the results and by the formation of artificial network of neurons, to determine the atrial fibrillation heart arythmia. The study herein, consists of threeparts. In the first part, the individual's Electro Cardiography (ECG) signals being obtained by the use of the electrodes, the bio-instrumentation booster circuit, has been reinforced 251 fold. The surrounding elements in effect on ECG signals and the ambient ones and in order to repress the network's noise, 50 Hz notch filter and 0,01132 Hz frequency space, band permeating filter has been put to use. The filtered ECG signal, for the analog- digital converters (ADC) through this, a connection between the system card has been set up. The algorithms Raspberry Pi Odroid and Beagle bone black embedded system cards have hosted these algorithms, the comparison of performance analyses and the results have been examined. The embedded Beagle bone black system card's reading can not exceed the 40 Hz frequency, for that matter it is not convenient for the ECG Holter device. Raspberry Pi embedded card's sampling rate is around 80 Hz, the pulse and simple signal processing algorithms can be put to good use. In the Odroid embedded system card's sampling rate can raise to 260 Hz. For that matter, the ECG analyses and the signal processing algorithms and for he artificial intelligence applications convenient stature, the most possible tool has been found out to be he micro-computer. During the sophomore stage, the digitalized ECG signals have been put to analysis by the applications of the Fourier Transform and the frequency analysis has been realised. To reinforce the R Crest and in the calculation of pulse rate, the threshold value have been applied to compare the results by the use of processing methods. The most convenient R Finding Algorithm has been found out to be the signal energy method. To the ECG signal, a wavelet transform has been applied and the feature documentation has been realized by the aid of discrete Daubechies (db) and the artificial intelligence results have been compared and contrasted on tabular data. During the third stage by statistical feature determination and theformation of the artificial network's entery layer, the neural network has been rectified and the neural network's weighted coefficients have been used by the genetic algorithm and thus the error possibilities have been decreased

Arıburnu yalıtaşının (Gelibolu Yarımadası, Türkiye) kökeni ve yaşı üzerine

The beachrock formation on the Ariburnu coast situated in the Gelibolu Peninsula has been studied by field observation, thin-section interpretation, physicochemical analyses including ICP-AES and SEM/EDS, and OSL dating. These analyses reveal the presence of different amounts of major (Si, Ca, Mg, K, Fe, Al and Na) and trace elements within the beachrock cement with Si (36.2%) and Ca (32.68%) dominating the overall composition. Beachrocks composed of highly-fractured and friable beds reach a total thickness of 80 cm extending from + 60 cm at the uppermost level down to-1 m at their most seaward extent and grade from conglomerate to lithic arkose in vertical section. The total amount of CaCO(3) ranges between 59.08% and 36% and the cement consists of high-Mg calcite based on EDS analysis. From SEM examination, four main morphologies were identified in cement material: (1) micritic coatings, (2) cryptocrystalline pore-filling cement, (3) meniscus cement and (4) microbial cement and suggest the presence of marine phreatic conditions with the exception of meniscus bridges, which imply that cementation may have been dominated by carbonate-rich meteoric waters at any successive stage of cementation. Five buried beachrock samples under unconsolidated beach sand were sampled for Optically Stimulated Luminescence (OSL) dating and show that the minimum and maximum ages of beachrock are 1.42 +/- 0.20 ka and 2.28 +/- 0.28 ka BP, respectively.Bu çalışmada Gelibolu Yarımadası’nda, Arıburnu kıyılarındaki yalıtaşı oluşumu arazi verileri, ince kesit yorumlamaları, ICP-AES, EDS ve SEM analizleri ve OSL yaşlandırması ile ele alındı. Analizler yalıtaşı çimentosu içinde Si, Ca, Mg, K, Fe, Al ve Na gibi ana ve iz elementlerin nispeten farklı oranlarda bulunduğunu göstermektedir. Bileşimde Si (36.2%) ve Ca (32.68%) egemendir. Yalıtaşları bol kırıklı ve kırılgan, toplam 80 cm tabaka kalınlığına sahip olup, en yüksek seviyede +60 cm’den deniz içinde –1 m’ye kadar takip edilirler. Düşey kesitte çakıltaşlarından litik arkoza geçişlidirler. Toplam CaCO3 miktarı 59.08% ve 36% arasında değişir. EDS analizlerine gore çimento maddesi yüksek magnezyum kalsittir. SEM analizlerine göre çimento maddesinde 4 ana morfoloji tanımlanmıştır; (1) mikritik tabakalar, (2) kriptokristalin boşluk dolgusu çimento, (3) menisküs çimento ve (4) mikrobial çimento. Bu çimentolar, çimentolanmanın izleyen bir devresinde karbonat bakımından zengin meteorik sularca meydana getirildiğini gösteren menisküs çimento hariç, denizel freatik koşullarda geliştiğini göstermektedir. Kıyı çizgisi gerisindeki plaj kumları altından çıkarılan 5 örneğin ‘optik uyarımlı ışınım tekniği (OSL)’ yöntemi ile yaşlandırması yapıldı. Analizler yalıtaşının oluşum yaşı için minimum 1.42±0.20 bin yıl ve maksimum 2.28±0.28 bin yıl yaşlarını vermektedir.Publisher's Versio

A rare entity bilateral first rib fractures accompanying bilateral scapular fractures

First rib fractures are scarce due to their well-protected anatomic locations. Bilateral first rib fractures accompanying bilateral scapular fractures are very rare, although they may be together with scapular and clavicular fractures. According to our knowledge, no case of bilateral first rib fractures accompanying bilateral scapular fractures has been reported, so we herein discussed the diagnosis, treatment, and complications of bone fractures due to thoracic trauma in bias of this rare entity

The presence of hydronephrosıs ın stagıng bladder cancer: an omınous sıgn

Objective: We investigated whether the presence of unilateral or bilateral upper tract obstruction could accurately predict advanced cancer stage. Methods: Six hundred and ten patients with bladder cancer entered into the tumor registries of our institutions between January 1990 and December 1994. The median patient age was 64 years (range 35 to 80). A total 75 (12%) patients had unilateral or bilateral hydronephrosis on an IVP at the time of initial diagnosis of the bladder cancer. Preoperative screening included physical examination, chest radiograph, complete blood count, blood urea nitrogen, creatinin, electrolyte analysis and IVP. Furthermore, patients were usually evaluated by bone scan and computerized tomography (CT). The diagnosis of transitional cell carcinoma was made by cystoscopy and transurethral resection of the tumor. Staging transurethral resection was done in all cases. Results: During a 5-year period 75 of 610 patients with carcinoma of the bladder had ureteral obstruction on excretory urography at the time of the initial diagnosis. Preoperative IVP revealed unilateral and bilateral hydronephrosis in 55 (73%) and 20 (27%) patients, respectively. Pathological staging revealed predominantly pT1 lesions for patients with unilateral obstruction. There were 30 (55%) patients with pT1, 10 (18%) with pT2, and 15 (27%) with pT3. Pathological staging revealed predominantly pT2 lesions for patients with bilateral obstruction. Pathological stage was pT2 in 10 (50%) cases, pT3 in 5 (25%), and pT4 in 5 (25%). Conclusion: IVP can be used in staging because hydronephrosis may Indicate the presence of a muscle-invasive bladder cancer, especially, bilateral hydronephrosis was strongly associated with advanced stage disease

Farklı BAP konsantrasyonlarının soya fasulyesinde (Glycine max L. Merrill) adventif sürgün rejenerasyonu üzerine etkileri

Bu çalışmada soya fasulyesinin (Glycine max L. Merrill) Agrova SA88 çeşidi kullanılarak, farklı BAP konsantrasyonlarının adventif sürgün rejenerasyonu üzerine etkileri araştırılmıştır. Uygulamalarda kullanılan fideler in vitro koşullarda çimlendirilmiştir. Çimlendirilen fidelerden alınan gövde ucu, boğum, yaprak, petiyol, kök, kotiledon ve hipokotil eksplantları Murashige ve Skoog (MS) ortamında farklı konsantrasyonlarda Benzil Amino Pürin (BAP) ile muamele edilmiştir. Eksplantlara uygulanan BAP’ın 2 ve 3 mg/l konsantrasyonlarında en iyi adventif sürgün rejenerasyonu gözlenmiştir. Adventif sürgünlerin köklendirilmesi için Naftelen Asetik Asit (NAA) ve İndol-3-bütirik asit (IBA) uygulanmış ve 2 mg/l IBA’ nın kök gelişimini uyarmada en etkili Bitki Büyüme Düzenleyicisi (BBD) olduğu saptanmıştır. Gövde gelişimi ve köklendirilmesi tamamlanmış sürgünler gelişimini devam ettirebilmeleri için BBD içermeyen MS ortamına aktarılmıştır. Olgunlaşan bitkiler daha sonra saksılara transfer edilerek sağlıklı fideler elde edilmiştir.Effects on Adventitious Shoot Regeneration of Different BAP Concentrations in Soybean (Glycine max L. Merrill) Micropropagation of soybean (Glycine max L. Merrill); strain Agrova SA88 was investigated Seeds were surface sterilized and grown in vitro. The shoot tip, nod, leaf, petiole, root, cotyledon and hypocotyl explants from seedlings were incubated in Murashige and Skoog (MS) medium with different concentrations of Benzyl Amino Purine (BAP). 2-3 mg/l BAP was found to be most influential on adventitious shoot regeneration in soybean among the applications, The grown stem on explants were separated and incubated in MS medium with the Plant Growth Regulators (PGR)s of Naphthalene acetic acid (NAA) and Indole-3-butyric acid (IBA) for root development. 2 mg/l IBA was found to be more suitable for root development. The regenerated seedling were transferred PGRs-free MS medium for seedling development and the healthy individuals were aclimatised in pots and mature plants were provided

Relationship between Hba1c and blood glucose level in hemodialysis patients with diabetes mellitus

Within in the scope of this study, a researchwas aimed at the relationship between HbA1c markersand blood glucose levels with DM, chronic renal failureand receiving dialysis treatment.Methods: In this study, monthly glucose levels and quarterlyHbA1c markers of 131 patients (53 female, 78 male)receiving dialysis treatment in a private dialysis centerbetween January 1, 2009-July 31, 2010 were evaluatedretrospectively.Results: The average age of 131 cases was 63.3±11.2years (range, 30-91). Gender distribution of the cases: 53female (40.5%), 78 male (59.5%). While the age averageof the females was 62.2±11.2 and the males’ was64.1±11.2. The average glucose level of the females andmales have a correlation to average HbA1c (Female:p<0.001, r=0.761, Males: p<0.001, r=0.743). The averageglucose level of the both case groups have a correlationto average HbA1c (p<0.001, r=0.755). While 32.8%of the examined HbA1c results were observed underthe level 6,5%, and 67.2% of the examined results wereobserved above the level 6.5%. While 18.3% of the preprandialblood glucose levels were obtained under 126mg/dl level, and 81.3% of the results were obtained above126 mg/dl level. It has been observed that the mean bloodglucose level has a correlation to average HbA1c level.Conclusion: The measurement of HbA1c and blood glucose(pre-prandial and postprandial) and the correlationbetween them, by virtue of the fact that, are vitally importantin cardiovascular mortality and morbidity, monitorof DM for the dialysis patients with diabetic nephropathy.Key words: Hemodialysis, diabetes mellitus, HbA1