Next-generation sequencing and its new possibilities in medicine

Next-Generation Sequencing (NGS) originally refers to high-throughput, massively parallel sequencing methods that allow the sequencing of up to billions of small (50-1000 bp), amplified DNA fragments at the same time but nowadays, there are NGS techniques that determine the sequence of long (up to 50 kbp) single molecules. Over the past years, NGS technologies become widely available with increasing throughput and decreasing sequencing costs per base making them more cost effective than the previously used capillary sequencing methods based on Sanger biochemistry. Nowadays, high-throughput DNA sequencing is routinely used on a wide range of important fields of biology and medicine enabling large-scale sequencing projects like analysis of complete genomes, disease association studies, whole transcriptomes, methylomes and provide new insights into complex biological systems. In addition, more and more NGS-based diagnostic tools are being introduced into the clinical practice, for example, on the fields of oncology, inherited and infectious diseases or pre-implantation and prenatal genetic screenings

Búza transzformáció | Wheat transformation

Az elmúlt évtizedben a növényi biotechnológiában bekövetkezett módszertani fejlődés eredményeként lehetővé vált gyökeresen új növénynemesítési programok tervezése és elindítása. A transzgénikus növények előállítása komplex folyamat, ami magában foglalja az idegen DNS molekulák bejuttatását a sejtekbe, ezen nukleotid szekvenciák integrációját a gazdasejt DNS-ébe és a bevitt gén követhető kifejeződését. A transzformáció módszere lehetőséget kínál többek között olyan gazdaságilag fontos gének bevitelére a búzanövénybe, melyekkel növelhető a rezisztencia biotikus és abiotikus stresszel szemben, a felhasználói igényeknek megfelelően változtatható a tészta technológiai minősége, javítható a búzafehérjék táplálkozástani értéke, továbbá amelyekkel növelhető a növényekben a vitaminok, vagy olyan mikroelemek mennyisége is, mint pl. a vas, vagy a cink. A számos módszertani nehézség és a fogyasztói reakciók miatt, a növényi transzformáció módszerében még további jelentős fejlődés várható a közeljövőben. Ez a szemle a szerzők angol nyelven megjelent összefoglalójának (Rakszegi et al. 2001) a legújabb eredményekkel bővített változata. | Plant biotechnology offers many new opportunities for breeders to solve certain breeding problems at the molecular level. The tissue culture methodology and the molecular genetic modification of economically important monocotyledons have undergone a revolution in the last decade. As the production of transgenic plants is a complex procedure including the uptake of DNA molecules into the cells, the integration of these nucleotide sequences into the host DNA and the expression of new genes in a controlled way, and as there are still many unsolved questions, further development is necessary. The methodology opens up the possibility of introducing novel genes that may induce resistance to diseases and abiotic stresses, allow the modification of dough quality and the dietetic quality of proteins, and increase the levels of micronutrients such as iron, zinc and vitamins. The present review is an updated Hungarian version of the summary of the most important advances in wheat transformation published by the authors in English (Rakszegi et al. 2001)

In vitro micropropagation of 4 Hungarian bryophytes as potential sources for pharmacologically active substances

The plant kingdom is a rich source of pharmacologically active biomolecules, and bryophytes represent a relatively unexploited taxon within plants. From this point of view, Hungarian mosses are very promising, since only a small percent of the 659 species has been studied in detail. The aim of this project is to analyse Hungarian bryophyte species as potential sources of molecules for anticancer drug and antibiotic research. Important steps during the research are to identify bryophyte species with bioactivity, to isolate and to identify their active components and to characterize their effects in detail. Based on an in vitro screening of 58 species, the most promising species are further studied. In order to ensure sustainability of further research, in vitro micropropagation studies - of species regarded as the most promising - are being carried out. Optimization of surface sterilization (using 10% CaCl2O2 or 10% commercial Domestos) of Brachythecium rutabulum, Oxyrrhynchium hians, Tortula muralis and Campylopus introflexus is completed. In the selected bryophytes selection of appropriate explants (shoot tips or lateral shoots), optimization of substrates (1/2 MS without sucrose) for in vitro cultivation were carried out. Various explants of bryophyte species, different surface sterilization methods, various culture media with different plant hormone combinations and without hormones (1 mg l-1 NAA/ 1 mg l -1 BA/ 1 mg l-1 2, 4 D/ 1 mg l-1 BA+ 0.1 mg l-1 NAA/ 2 mg l-1 BA/ 1 mg l-1 NAA) were tested for optimal growth and morphogenesis. New moss shoots or protonema developments, depending on the hormonal supply, were observed. Growth response was recorded in every selected species during in vitro cultivation. The research was supported by the grant NKFI OTKA 115796 (supervisor Dezső Csupor, “Hungarian bryophytes as potential sources for pharmacologically active substances”). Work of Boglárka Tóth was supported by the ÚNKP-17-2 New National Excellence Program of the Ministry of Human Capacities

Műszaki-, agrár,- és informatikus diplomák értéke a munkaerőpiacon

Nowadays the rising unemployment rate for newly graduated students poses a considerable problem. Although obtaining a degree and a certificate is not enough on the labour market, it is a fact that college graduates' unemployment rates overall are still lower than the national average. In this paper we focus on the value of engineering and technology degrees, agricultural degrees and the informatics degree on the labour market.Napjainkban a pályakezdők növekvő munkanélküliségi rátája komoly problémát jelent. A diploma és bizonyítvány már nem elegendő a munkaerőpiacon, ugyanakkor tény, hogy a munkanélküliségi ráta alacsonyabb a diplomások korében, mint a nemzetgazdaság átlagos értéke. Írásunk a műszaki,- agrár,- és informatikai diplomák munkaerőpiaci értékét mutatja be

Műszaki-, agrár,- és informatikus diplomák értéke a munkaerőpiacon

Nowadays the rising unemployment rate for newly graduated students poses a considerable problem. Although obtaining a degree and a certificate is not enough on the labour market, it is a fact that college graduates' unemployment rates overall are still lower than the national average. In this paper we focus on the value of engineering and technology degrees, agricultural degrees and the informatics degree on the labour market.Napjainkban a pályakezdők növekvő munkanélküliségi rátája komoly problémát jelent. A diploma és bizonyítvány már nem elegendő a munkaerőpiacon, ugyanakkor tény, hogy a munkanélküliségi ráta alacsonyabb a diplomások korében, mint a nemzetgazdaság átlagos értéke. Írásunk a műszaki,- agrár,- és informatikai diplomák munkaerőpiaci értékét mutatja be

Munkaerő - piaci kutatáson alapuló képzésinnováció a Szolnoki Főiskolán

A Szolnoki Főiskola a TÁMOP-4.1.1/A-10/1/KONV-2010-19 azonosítószámú „Munkaerő-piaci igényekhez al-kalmazkodó hallgatói és intézményi szolgáltatásfejlesztés a Szolnoki Főiskolán" EU pályázat keretében kiemelt célként fogalmazta meg a munkaerő-piaci elvárásokhoz igazodó képzési portfolió kialakítását, a képzés fejleszté-sét és az oktatás gyakorlatorientációjának javítását. Ennek megvalósítása érdekében kiterjedt szekunder és pri-mer kutatást folytattunk, amelynek során lakossági és szervezeti megkérdezés során tártuk fel a vállalkozások pályakezdőkkel szembeni elvárásait, annak szakmaspecifikus sajátosságait és a várható keresletet. Végzett hall-gatóink megkérdezése a diploma munkaerő-piaci értékének és a tanulmányok során megszerzett kompetenciák hasznosíthatóságának feltárására irányult. Kutatásunk eredményei a Szolnoki Főiskola képzésfejlesztésében jól hasznosíthatók, kiemelt tekintettel a tantervek struktúrájára, a tantárgyak tartalmára, az oktatás módszertanára és a szakmai gyakorlat rendszerére. E tanulmány bemutatja a többlépcsős primer kutatás eredményeit és annak hatását a képzés korszerűsítésére, valamint a gyakorlati rendszer átalakítására. | College of Szolnok drew up the formation of a programme portfolio, its development and the improvement of education’s practice-orientation aligning to labor market expectations as a priority within the framework of TÁMOP-4.1.1/A-10/1/KONV-2010-19 project „Student and institutional service development aligned to labor force market needs in College of Szolnok”. To achieve this goal we conducted an extended desk and field re-search, whereby we revealed during the consumer and organizational survey the expectations of companies against entrants, its profession-specific characteristics and the potential demand. Surveying our graduates aimed at revealing the labor force market value of the diploma and the expedience of competencies acquired during their studies. Results of our research can be well utilized in programme innovation of College of Szolnok, with special emphasis on the structure of syllabi, the methodology of education, the content of different subjects and the system of work placement. This study introduces the results of our staggered field research and its effect on programme modernization and transformation of work-placement system

Ligand-Specific Regulation of the Endogenous Mu-Opioid Receptor by Chronic Treatment with Mu-Opioid Peptide Agonist

Since the discovery of the endomorphins (EM), the postulated endogenous peptide agonists of the mu-opioid receptors, several analogues have been synthesized to improve their binding and pharmacological profiles. We have shown previously that a new analogue, cis-1S,2R-aminocyclohexanecarboxylic acid2-endomorphin-2 (ACHC-EM2), had elevated mu-receptor affinity, selectivity, and proteolytic stability over the parent compound. In the present work, we have studied its antinociceptive effects and receptor regulatory processes. ACHC-EM2 displayed a somewhat higher (60%) acute antinociceptive response than the parent peptide, EM2 (45%), which peaked at 10 min after intracerebroventricular (icv) administration in the rat tail-flick test. Analgesic tolerance developed to the antinociceptive effect of ACHC-EM2 upon its repeated icv injection that was complete by a 10-day treatment. This was accompanied by attenuated coupling of mu-sites to G-proteins in subcellular fractions of rat brain. Also, the density of mu-receptors was upregulated by about 40% in the light membrane fraction, with no detectable changes in surface binding. Distinct receptor regulatory processes were noted in subcellular fractions of rat brains made tolerant by the prototypic full mu-agonist peptide, DAMGO, and its chloromethyl ketone derivative, DAMCK. These results are discussed in light of the recently discovered phenomenon, that is, the “so-called biased agonism” or “functional selectivity