Quality of care in acute coronary syndromes: a critical path implementation

Antecedentes En los últimos años se han realizado avances importantes en el manejo del síndrome coronario agudo, lo cual se ha traducido en una disminución de la mortalidad en este grupo de pacientes. Objetivo Describir los resultados de la implementación de una ruta crítica para el manejo de los síndromes coronarios agudos en el Servicio de Urgencias del Hospital San José de Bogotá, entre el 1 de marzo de 2012 y el 28 de febrero de 2013. Métodos Se realizó un estudio observacional descriptivo prospectivo. La ruta crítica fue estructurada mediante el consenso de los servicios de Medicina Interna, Urgencias y Cardiología, para ser aplicada en las primeras 24 horas del tratamiento del paciente con síndrome coronario agudo definitivo. Resultados Se reclutaron 156 pacientes, de los cuales 25 correspondieron a síndrome coronario agudo con elevación del ST y 131 a síndrome sin elevación del ST. De los síndromes coronarios agudos con elevación del ST el 96% fue sometido a alguna estrategia de reperfusión; 2 (9,5%) pacientes fallecieron. En cuanto al síndrome coronario agudo sin elevación del ST, 33 (25,1%) pacientes presentaron infarto, 98 (74,9%) angina inestable, y 4 (3,2%) fallecieron. El uso de aspirina, betabloqueador, estatina e inhibidor de la enzima convertidora de angiotensina o antagonistas de los receptores de angiotensina II durante las primeras 24 horas fue superior al 90% en toda la muestra. Conclusiones Se alcanzó un nivel superior de cumplimiento de las medidas de desempeño de la atención de los síndromes coronarios agudos después de la implementación de una ruta crítica.Background In recent years there have been important advances in acute coronary syndrome (ACS) management, which translates into a drop in mortality in this group of patients. Objective To describe the results of the implementation of a critical path for the management of ACS, at the emergency service of the Hospital San José in Bogotá, between March 1st, 2012 and February 28th, 2013. Methods A prospective descriptive observational study was carried out. The critical pathway was structured upon consensus among the services of internal medicine, emergency, and cardiology. This pathway was structured to be applied within the first 24hours of the patient's treatment with the final ACS. Results 156 patients were selected, 25 had ST segment elevation ACS and 131 had ACS non-ST segment elevation. 96% of ST segment elevation ACS underwent some reperfusion strategy, 2 (9.5%) patients died. As far as non-ST segment elevation ACS patients are concerned, 33 (25.1%) patients exhibited infarction and 98 (74.9%) unstable angina, with a mortality of 4 (3.2%) patients. The use of aspirin, betablockers, statin, and ACEI or ARA II during the first 24hours was above 90% in the totality of the sample. Conclusions It is demonstrated that a higher level of fulfillment is achieved for the performance measures for ACS care upon a critical pathway implementation

Clonal chromosomal mosaicism and loss of chromosome Y in elderly men increase vulnerability for SARS-CoV-2

The pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2, COVID-19) had an estimated overall case fatality ratio of 1.38% (pre-vaccination), being 53% higher in males and increasing exponentially with age. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, we found 133 cases (1.42%) with detectable clonal mosaicism for chromosome alterations (mCA) and 226 males (5.08%) with acquired loss of chromosome Y (LOY). Individuals with clonal mosaic events (mCA and/or LOY) showed a 54% increase in the risk of COVID-19 lethality. LOY is associated with transcriptomic biomarkers of immune dysfunction, pro-coagulation activity and cardiovascular risk. Interferon-induced genes involved in the initial immune response to SARS-CoV-2 are also down-regulated in LOY. Thus, mCA and LOY underlie at least part of the sex-biased severity and mortality of COVID-19 in aging patients. Given its potential therapeutic and prognostic relevance, evaluation of clonal mosaicism should be implemented as biomarker of COVID-19 severity in elderly people. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, individuals with clonal mosaic events (clonal mosaicism for chromosome alterations and/or loss of chromosome Y) showed an increased risk of COVID-19 lethality

Redes neuronales en el diagnóstico del infarto agudo de miocardio

Introducción: El infarto agudo de miocardio representa la primera causa de muerte no trasmisible en el mundo. Una de las herramientas que sirven como soporte a las decisiones en su diagnóstico son las redes neuronales, de las cuales se ha demostrado un buen nivel de precisión. Métodos: Se realizó el entrenamiento y la prueba de varias redes neuronales, con diferentes arquitecturas para el diagnóstico del infarto, a partir de los datos de la escala de clasificación de la probabilidad de angina de Braunwald en un grupo de pacientes que ingresaron por dolor torácico al servicio de urgencias del Hospital San José de Bogotá. Resultados: Se generaron 40 redes que fueron probadas en 5 experimentos de los cuales se obtuvo mayor precisión diagnóstica con el modelo de 5 entradas electrocardiográficas más troponina, aunque el mejor valor predictivo negativo se alcanzó en el modelo con 10 variables clínicas, electrocardiográficas y troponina. Varias de las redes diseñadas tuvieron una sensibilidad y una especificidad del 100%. Se requiere un estudio de validación para comprobar estos hallazgos. Conclusiones: Con los resultados encontrados para las redes neuronales en la literatura y en este estudio se puede considerar el uso de esta estrategia de inteligencia computacional en la práctica

Estructuración e implementación de una ruta crítica para el manejo de pacientes con síndrome coronario agudo en el Servicio de Urgencias del Hospital San José de Bogotá

el síndrome coronario agudo es una patología de alto impacto clínico en nuestro medio y en el mundo. A pesar de la evidencia de un número de medidas que benefician el resultado de estos pacientes, se ha demostrado que su utilización no es la mejor. Una de las estrategias diseñadas para mejorar esta situación, es la utilización de las rutas críticas (critical pathways), que consisten en una secuencia óptima y guiada por tiempo de intervenciones realizadas por los miembros del equipo de salud, para un diagnóstico o procedimiento particular, con el objetivo de minimizar retrasos, mejorar la utilización de recursos y maximizar la calidad del cuidado de la salud. Método: como parte de un proceso de mejoramiento de la calidad de la atención, se decidió realizar la estructuración e implementación de una ruta crítica en el manejo del síndrome coronario agudo durante las primeras 24 horas de atención. Para su realización se tuvo en cuenta la información observada en la literatura luego de una revisión amplia del tema. Resultados: posterior al proceso de diseño, divulgación y concertación con los servicios implicados en el manejo de los eventos coronarios, y con base en las guías institucionales, se estructuró una ruta crítica que consta de tres documentos: el primero para la evaluación inicial del dolor torácico, el segundo para el manejo de los eventos coronarios con elevación del segmento ST y el tercero para eventos coronarios sin elevación del segmento ST. Conclusiones: las rutas críticas se han posicionado en el mundo como herramientas que impactan en un alto grado la calidad de la atención de los pacientes con síndrome coronario agudo, ya que minimizan los retrasos, optimizan la utilización de los recursos y controlan las variaciones de dicha atención. Se describe la estructuración e implementación de una ruta crítica para el manejo de estos pacientes en un hospital de cuarto nivel en Colombia

Calidad de la atención de los síndromes coronarios agudos: implementación de una ruta crítica

Antecedentes: En los últimos años se han realizado avances importantes en el manejo del síndrome coronario agudo, lo cual se ha traducido en una disminución de la mortalidad en este grupo de pacientes. Objetivo: Describir los resultados de la implementación de una ruta crítica para el manejo de los síndromes coronarios agudos en el Servicio de Urgencias del Hospital San José de Bogotá, entre el 1 de marzo de 2012 y el 28 de febrero de 2013. Métodos: Se realizó un estudio observacional descriptivo prospectivo. La ruta crítica fue estructurada mediante el consenso de los servicios de Medicina Interna, Urgencias y Cardiología, para ser aplicada en las primeras 24 horas del tratamiento del paciente con síndrome coronario agudo definitivo. Resultados: Se reclutaron 156 pacientes, de los cuales 25 correspondieron a síndrome coronario agudo con elevación del ST y 131 a síndrome sin elevación del ST. De los síndromes coronarios agudos con elevación del ST el 96% fue sometido a alguna estrategia de reperfusión; 2 (9,5%) pacientes fallecieron. En cuanto al síndrome coronario agudo sin elevación del ST, 33 (25,1%) pacientes presentaron infarto, 98 (74,9%) angina inestable, y 4 (3,2%) fallecieron. El uso de aspirina, betabloqueador, estatina e inhibidor de la enzima convertidora de angiotensina o antagonistas de los receptores de angiotensina II durante las primeras 24 horas fue superior al 90% en toda la muestra. Conclusiones: Se alcanzó un nivel superior de cumplimiento de las medidas de desempeño de la atención de los síndromes coronarios agudos después de la implementación de una ruta crítica

GWAS and meta-analysis identifies 49 genetic variants underlying critical COVID-19

Data availability: Downloadable summary data are available through the GenOMICC data site (https://genomicc.org/data). Summary statistics are available, but without the 23andMe summary statistics, except for the 10,000 most significant hits, for which full summary statistics are available. The full GWAS summary statistics for the 23andMe discovery dataset will be made available through 23andMe to qualified researchers under an agreement with 23andMe that protects the privacy of the 23andMe participants. For further information and to apply for access to the data, see the 23andMe website (https://research.23andMe.com/dataset-access/). All individual-level genotype and whole-genome sequencing data (for both academic and commercial uses) can be accessed through the UKRI/HDR UK Outbreak Data Analysis Platform (https://odap.ac.uk). A restricted dataset for a subset of GenOMICC participants is also available through the Genomics England data service. Monocyte RNA-seq data are available under the title ‘Monocyte gene expression data’ within the Oxford University Research Archives (https://doi.org/10.5287/ora-ko7q2nq66). Sequencing data will be made freely available to organizations and researchers to conduct research in accordance with the UK Policy Framework for Health and Social Care Research through a data access agreement. Sequencing data have been deposited at the European Genome–Phenome Archive (EGA), which is hosted by the EBI and the CRG, under accession number EGAS00001007111.Extended data figures and tables are available online at https://www.nature.com/articles/s41586-023-06034-3#Sec21 .Supplementary information is available online at https://www.nature.com/articles/s41586-023-06034-3#Sec22 .Code availability: Code to calculate the imputation of P values on the basis of SNPs in linkage disequilibrium is available at GitHub (https://github.com/baillielab/GenOMICC_GWAS).Acknowledgements: We thank the members of the Banco Nacional de ADN and the GRA@CE cohort group; and the research participants and employees of 23andMe for making this work possible. A full list of contributors who have provided data that were collated in the HGI project, including previous iterations, is available online (https://www.covid19hg.org/acknowledgements).Change history: 11 July 2023: A Correction to this paper has been published at: https://doi.org/10.1038/s41586-023-06383-z. -- In the version of this article initially published, the name of Ana Margarita Baldión-Elorza, of the SCOURGE Consortium, appeared incorrectly (as Ana María Baldion) and has now been amended in the HTML and PDF versions of the article.Copyright © The Author(s) 2023, Critical illness in COVID-19 is an extreme and clinically homogeneous disease phenotype that we have previously shown1 to be highly efficient for discovery of genetic associations2. Despite the advanced stage of illness at presentation, we have shown that host genetics in patients who are critically ill with COVID-19 can identify immunomodulatory therapies with strong beneficial effects in this group3. Here we analyse 24,202 cases of COVID-19 with critical illness comprising a combination of microarray genotype and whole-genome sequencing data from cases of critical illness in the international GenOMICC (11,440 cases) study, combined with other studies recruiting hospitalized patients with a strong focus on severe and critical disease: ISARIC4C (676 cases) and the SCOURGE consortium (5,934 cases). To put these results in the context of existing work, we conduct a meta-analysis of the new GenOMICC genome-wide association study (GWAS) results with previously published data. We find 49 genome-wide significant associations, of which 16 have not been reported previously. To investigate the therapeutic implications of these findings, we infer the structural consequences of protein-coding variants, and combine our GWAS results with gene expression data using a monocyte transcriptome-wide association study (TWAS) model, as well as gene and protein expression using Mendelian randomization. We identify potentially druggable targets in multiple systems, including inflammatory signalling (JAK1), monocyte–macrophage activation and endothelial permeability (PDE4A), immunometabolism (SLC2A5 and AK5), and host factors required for viral entry and replication (TMPRSS2 and RAB2A).GenOMICC was funded by Sepsis Research (the Fiona Elizabeth Agnew Trust), the Intensive Care Society, a Wellcome Trust Senior Research Fellowship (to J.K.B., 223164/Z/21/Z), the Department of Health and Social Care (DHSC), Illumina, LifeArc, the Medical Research Council, UKRI, a BBSRC Institute Program Support Grant to the Roslin Institute (BBS/E/D/20002172, BBS/E/D/10002070 and BBS/E/D/30002275) and UKRI grants MC_PC_20004, MC_PC_19025, MC_PC_1905 and MRNO2995X/1. A.D.B. acknowledges funding from the Wellcome PhD training fellowship for clinicians (204979/Z/16/Z), the Edinburgh Clinical Academic Track (ECAT) programme. This research is supported in part by the Data and Connectivity National Core Study, led by Health Data Research UK in partnership with the Office for National Statistics and funded by UK Research and Innovation (grant MC_PC_20029). Laboratory work was funded by a Wellcome Intermediate Clinical Fellowship to B.F. (201488/Z/16/Z). We acknowledge the staff at NHS Digital, Public Health England and the Intensive Care National Audit and Research Centre who provided clinical data on the participants; and the National Institute for Healthcare Research Clinical Research Network (NIHR CRN) and the Chief Scientist’s Office (Scotland), who facilitate recruitment into research studies in NHS hospitals, and to the global ISARIC and InFACT consortia. GenOMICC genotype controls were obtained using UK Biobank Resource under project 788 funded by Roslin Institute Strategic Programme Grants from the BBSRC (BBS/E/D/10002070 and BBS/E/D/30002275) and Health Data Research UK (HDR-9004 and HDR-9003). UK Biobank data were used in the GSMR analyses presented here under project 66982. The UK Biobank was established by the Wellcome Trust medical charity, Medical Research Council, Department of Health, Scottish Government and the Northwest Regional Development Agency. It has also had funding from the Welsh Assembly Government, British Heart Foundation and Diabetes UK. The work of L.K. was supported by an RCUK Innovation Fellowship from the National Productivity Investment Fund (MR/R026408/1). J.Y. is supported by the Westlake Education Foundation. SCOURGE is funded by the Instituto de Salud Carlos III (COV20_00622 to A.C., PI20/00876 to C.F.), European Union (ERDF) ‘A way of making Europe’, Fundación Amancio Ortega, Banco de Santander (to A.C.), Cabildo Insular de Tenerife (CGIEU0000219140 ‘Apuestas científicas del ITER para colaborar en la lucha contra la COVID-19’ to C.F.) and Fundación Canaria Instituto de Investigación Sanitaria de Canarias (PIFIISC20/57 to C.F.). We also acknowledge the contribution of the Centro National de Genotipado (CEGEN) and Centro de Supercomputación de Galicia (CESGA) for funding this project by providing supercomputing infrastructures. A.D.L. is a recipient of fellowships from the National Council for Scientific and Technological Development (CNPq)-Brazil (309173/2019-1 and 201527/2020-0)