Bilimsel Araştırma Projeleri Başvuru Ve Değerlendirme Süreçlerinde Otomasyona Yönelik Alt Yapı Projesi

Namık Kemal Üniversitesi bünyesinde yer alan Bilimsel Araştırma Projeleri (BAP) Komisyonu bilimsel araştırma projelerinin idari ve mali işlemlerini mevcut yasal düzenlemeler ve kaynaklar dâhilinde gerçekleştirerek; üniversitenin toplumsal etkinliğini arttırmayı, gelişmiş araştırma alt yapısının oluşturulması ve bunun verimli bir şekilde kullanılmasına katkı sağlamayı amaçlamaktadır. Bu bağlamda Bilimsel ve Teknolojik Araştırmalar ödeneğinden destek alarak yürütülen araştırma projeleri şu şekildedir:Genel Amaçlı Projeler: Genel amaçlı projeler, doğrudan bir akademik dereceye yönelik olmayan, evrensel ve ulusal bilime, ülkenin teknolojik, ekonomik, sosyal ve kültürel kalkınmasına katkıda bulunabilecek özgün çalışmalardır.Tez Projeleri: Tez projeleri bir akademik dereceye yönelik çalışmalardır. Yüksek lisans, doktora, tıpta uzmanlık ve sanatta yeterlik tezlerini kapsayan, bir öğretim üyesinin yürütücülüğünde öğrencileri ile yürüttükleri projelerdir. Üniversite Özel Sektör, Sanayi Katılımlı İşbirliği Projeleri: Namık Kemal Üniversitesi öğretim üyelerinin kamu veya özel bir sanayi kuruluşu ile müşterek yürüttükleri, bütçesinin en az P si ilgili sanayi kuruluşu tarafından karşılanan, uygulamaya ve ürün geliştirmeye yönelik projelerdir.Güdümlü ve Çok Disiplinli Araştırma Projeleri: BAP Komisyonu'nun gerekli gördüğü alanlarda hazırlayacağı/ hazırlatacağı projelerdir. BAP Komisyonu tarafından belirlenmiş öncelikli alanlarda, diğer destek programlarından daha yüksek alt yapı yatırımlarına olanak veren bütçe ile desteklenebilen, farklı disiplinlerin bir araya gelerek önerdikleri projelerdir.Ulusal Destekli Araştırma Projeleri: DPT (Kalkınma Bakanlığı), TÜBİTAK, SANTEZ, TAGEM ve diğer ulusal kurumlar tarafından desteklenmesi amacıyla verilen, ödeneği kısmen Devlet Planlama Teşkilatı Müsteşarlığı tarafından tahsis edilen ve yatırım programında yer alan araştırma projeleridir.Alt Yapı Geliştirme Projeleri: Namık Kemal Üniversitesi bünyesinde bulunan birimlerinin eğitim ve öğretimde kullanılan laboratuar altyapısının araç ve yöntemlerin geliştirilmesi ve iyileştirilmesi ile bilimsel alt yapı ile sosyo-kültürel faaliyetlere de hizmet edebilecek ve tanıtım amaçlı olan doğrudan bir akademik dereceye yönelik olmayan, kurumun tanıtımı teknolojik, ekonomik, sosyal ve kültürel kalkınmasına katkıda bulunabilecek özgün projelerdir.Üniversitemiz tarafından desteklenen bilimsel araştırma projelerinin niteliğinin ve niceliğinin artması üniversitemizin ülke ve dünya genelindeki sıralamasında önemli katkı yapacağı kuşkusuzdur. Bu açıdan proje başvurularının artması ve söz konusu projelerin hızlı bir şekilde değerlendirilip desteklenmesi ve buna bağlı olarak proje çıktılarının hızlı bir şekilde yayına dönüşmesi üniversitemize önemli bir katkı yapacaktır. Proje başvurularında yaşanan sıkışıklığı ortadan kaldırmak ve projelerini hızlı bir şekilde değerlendirilebilmesi için üniversitemiz Bilgi İşlem Daire Başkanlığı ve BAP Komisyonu tarafından bir yazılım oluşturulmuş ve bu yazılım sayesinde bilimsel araştırma projeleri ile ilgili tüm süreçler elektronik ortamda takip edilecektir. Bilindiği üzere TÜBİTAK 2016 yılı Ocak ayı itibariyle ARDEB, BİDEP ve TEYDEP gibi tüm bilimsel araştırma projelerine başvuruda başvuru süreçlerini kısaltmak ve kolaylaştırmak amacıyla elektronik imzanın kullanılacağını belirtmiştir. Benzer şekilde Namık Kemal Üniversitesi BAP Komisyonu 2016 yılı itibariyle başvuru süreçlerinde elektronik imza kullanımını dikkate alacaktır. Bu nedenle üniversitemiz bünyesinde bulunan öğretim üyelerinin bilimsel araştırma projelerine başvuru yapabilmesi için Nitelikli Elektronik Sertifikaya ihtiyacı olacaktır. Buna ek olarak BAP Komisyonu üyelerinin proje değerlendirmelerini yazılım üzerinden süratli bir şekilde yapabilmeleri için tablet ve bilgisayara ihtiyaç duyulmaktadır. Bu sayede komisyon üyeleri proje değerlendirme süreçlerini daha hızlı, zaman ve mekandan bağımsız şekilde yapabilecek ve bu da verimliliklerinin artmasına neden olacaktır

Türkiye İstanbul İlinde Yetiştirilen İtalyan Orijinli Manda Sürülerinde Farklı Modeller ile Laktasyon Eğrilerinin Karşılaştırılması

This study was aimed to investigate biometry of lactation curve for Italian origined water buffalo in Istanbul province of Turkey. Total 72 heads Italian origined water buffalo were used at first lactation and three calving seasons as animal material. Wood, Wilmink and Cobby and Le Du models were chosen in this study. The general average lactation length, total lactation milk yield average and average daily milk yield were found 234 days, 1607.4 kg and 6.86 kg, respectively. Determination coefficient was calculated for Wood, Wilmink and Cobby and Le Du models for summer calving season as 0.94, 0.92 and 0.93, respectively. Wood model was found the highest coefficient of determination in general. Moreover, persistency (S) and maximum milk yields (Ymax) for Wood model were calculated. These values were found as 5.89 and 9.76 for first lactation in general group, respectively. Finally, this study is showed that the Wood model has the best fitted model among all models for all groups for first lactation for Italian origined water buffalo,Bu çalışmada Türkiye’de İstanbul ilinde yetiştirilen İtalyan orijinli mandalarda laktasyon eğrilerinin biyometrisi araştırılması amaçlanmıştır. Hayvan materyali olarak üç malaklama mevsiminde ve ilk laktasyonda olan 72 baş İtalyan orijinli manda kullanılmıştır. Sunulan çalışmada Wood, Wilmink ve Cobby ve Le Du modelleri seçilmiştir. Genel ortalama laktasyon süresi, toplam süt verim ortalaması ve günlük ortalama süt verimi sırasıyla 234 gün, 1607,4 kg ve 6.86 kg olarak bulunmuştur. Yazın malaklayan hayvanlarda Wood, Wilmink ve Cobby ve Le Du modelleri için belirleme katsayıları sırasıyla 0.94, 0.92 ve 0.93 olarak bulunmuştur. Genel olarak Wood modeli en yüksek belirleme katsayısına sahip olmuştur. Bunun yanında, Wood modeli için persistens (S), maksimum süt verimi (Ymax) değerleri hesaplanmıştır. Bu değerler ilk laktasyon için sırasıyla 5.89 ve 9.76 olarak bulunmuştur. Sonuç olarak çalışma göstermiştir ki ilk laktasyondaki İtalyan orijinli mandalarda tüm gruplar için diğer modeler içinde en iyi uyum Wood modelinde görülmüştür

Determination of genetic distance between East Anatolian Red, Brown Swiss, Holstein and Simmental breeds of cattle using polymorphic systems

Genetic distances were determined according to Nei, Cavalli-Sforza and Reynolds methods between the Brown Swiss (173), Simmental (80), Holstein (18) and East Anatolian Red (51) cattle breeds using milk protein (as) and blood protein types (Hb and Tf). The distribution of phenotypic frequencies in all the four breeds for all systems except alpha s(1)-Cn was significant (P<0.01) using chi-square test. Phylogenetic trees based on the polymorphic systems of the populations obtained by three different methods of Nei, Cavalli-Sforza and Reynolds were found to be similar. According to the phylogenetic trees Brown Swiss and Simmental cattle breeds fall in one group and dairy (Holstein) and Native (East Anatolian Red) breeds in different groups

The Comparison of Physical Characteristics of Anatolian Native Goat Down Fibers With Cashmere

Very fine and soft down fibers of native goats can have a potential as a valuable raw-material source for high-quality products. Therefore, down fibers were collected from native goats raised in different regions of Turkey, then their physical properties were analyzed and results were compared with cashmere fibers. Along with fiber diameter and fiber length, which are the most important parameters regarding spinnability of a textile fiber, fiber scale characteristics of Anatolian native goat down fibers were reported for the first time. In this respect, scale pattern, mean scale density, cuticle scale height, curvature, visual fiber crimp were analyzed as well as fiber tenacity and breaking elongation properties. The economical potential of these fibers in Turkey were also investigated. The findings of this work showed that average fiber fineness changed between 14-19 mu m while the single fiber length varied as 33.0-61.0 mm. The mean scale density and cuticle scale height were between 6-7 scales/100 mu m and 0.41-0.55 mu m, respectively while the visual crimp frequency was 5-6 crimps/cm. On the other hand, the average tenacity and breaking elongation was above 12 cN/tex and 28%, respectively. These results show that these native goat down fibers, that have been wasted mostly, have very similar properties to cashmere fibers with adequate properties for spinnability, hence they have a potential for high-quality textile products as a substitute for cashmere fiber

Identification of novel single nucleotide polymorphisms in the growth hormone (GH) gene in Anatolian water buffalo (Bubalus bubalis) populations in Turkey

This study was conducted to investigate the growth hormone (GH; somatotropin-like) gene polymorphisms in 150 water buffalo (Bubalus bubalis) from different regions of Turkey. 404 bp long partial intron 4, exon 5, 3’ UTR regions of the GH gene (also called GH/AluI locus) and 347 bp long exon-intron 3 and partial exon 4 regions of the GH gene (also called GH/MspI locus) were amplified, and their PCR products analyzed via DNA sequencing method. Seven genotypes due to twenty single nucleotide polymorphisms (SNP) and one deletion/insertion were identified in a 347 bp long region of the GH/MspI locus. A missense mutation from glycine to glutamate amino acid and four silent mutations in the serine, threonine, and asparagine amino acids were determined in the exon 3 region of the GH gene. Four genotypes due to eight SNP were identified in a 404 bp long region of the GH/AluI locus. A missense mutation from lysine to arginine amino acid and six silent mutations in Leucine, aspartate, histidine, lysine, arginine, and cysteine amino acids were revealed in the exon 5 region of the GH gene. The partial DNA sequence of the GH gene in water buffalos was reported, and these sequences were deposited at the NCBI Genbank database with the accession numbers MN266903-MN266909 and MN530973-MN530976. These SNP may have an effect on economic (such as body composition) and carcass traits, reproduction, and milk yield and content in water buffalo populations and may prove to be useful for water buffalo breeding. © 2020 All Rights ReservedAR.14.32, NKUBAP.00.24; Tarimsal Araştirmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğü, Türkiye Cumhuriyeti Tarim Ve Orman Bakanliği: TAGEM ??AR -GE/ ??This research was supported by the Scientific Research Projects Coordination Unit of Nam?k Kemal University, under project number NKUBAP.00.24.AR.14.32, and the Republic of Turkey Ministry of Agriculture and Forestry General Directorate of Agricultural Research and Policies, under project number TAGEM 13/AR-GE/29.This research was supported by the Scienti ?ic Research Projects Coordination Unit of Namık Kemal University, under project number NKUBAP. ??????AR. ?????? and the Republic of Turkey Ministry of Agriculture and Forestry General Directorate of Agricultural Research and Policies, under project number TAGEM ??AR -GE/ ??

Polymorphism detection of DGAT1 and Lep genes in Anatolian water buffalo (Bubalus bubalis) populations in Turkey

Acyl-CoA: diacylglycerol-acyltransferase 1 (DGAT1) enzyme plays a key role in controlling the synthesis rate triglyceride from diacylglycerol. Leptin (LP, OB, obese) is an important hormone that synthesizes mostly from adipose tissue and regulates glucose metabolism and homeostasis. DGAT1 and Lep genes are closely related to reproduction, growth, milk yield and composition in water buffalo breeds. This study aimed to identify genetic variation in the DGAT1 and Lep gene regions in 150 water buffalo individuals from five different provinces of Turkey using DNA sequencing. A total of 38 nucleotide variations and indels have identified 761 bp long partial intron 2 and exon 3 and 5' UTR regions of the Lep gene in Anatolian water buffalo populations; 422 bp long partial exon 7-9 and exon 8 regions of DGAT1 gene were amplified and two mutations were defined in the point of 155 and 275 nucleotide that is three genotypes for S allele and Y allele of DGAT1 gene in intron 7 in Anatolian buffalo populations, respectively. These SNPs may have an effect on reproduction, growth, milk yield and composition in water buffalo populations and may prove to be useful for water buffalo breeding.Scientific Research Projects Coordination Unit of Namik Kemal University [NKUBAP.00.24.AR.14.32]; Republic of Turkey Ministry of Agriculture and Forestry General Directorate of Agricultural Research and Policies [TAGEM 13/AR-GE/29]This research was supported by the Scientific Research Projects Coordination Unit of Namik Kemal University, under project number NKUBAP.00.24.AR.14.32, and the Republic of Turkey Ministry of Agriculture and Forestry General Directorate of Agricultural Research and Policies, under project number TAGEM 13/AR-GE/29

Genetic relationships of Thrace and Yigilca honey bee populations based on microsatellite structure

Thrace and Yigilca honey bees, two important honey bee ecotypes in apicultural activity of Turkey, are the subject of genetic conservation effort. In this study, the genetic structure and diversity of honey bee populations from Thrace and Yigilca were investigated using 27 microsatellites. Except Kirklareli and Yigilca (Fst: 0.14), it was observed lower genetic divergence between the populations based on the value of pairwise Fst. Although Thrace populations (Edirne, Tekirdag and Kirklareli) were not fully separated from each other, Yigilca population was significantly separated from Kirklareli and separated slightly from the rest of other populations. The calculated gene diversity of the populations ranged from 0.44 in Kirklareli to 0.56 in Edirne and Tekirdag. Despite the high genetic diversity within the populations, the significant heterozygous deficiency found in Kirklareli may be due to repeated and controlled swarming of the selected colonies by beekeepers. These factors could have contributed the observed genotypic homogenization within Kirklareli honey bee population. Our results demonstrate that genetic differantiation of Thrace and Yigilca populations is still conserved, but gene flow is not prevented by the current management strategies, creating urgent demand for an improved conservation management of honey bee populations.Duzce UniversityDuzce University [20100501038]The research was supported by Duzce University Scientific Research fund through A research project (DUBAP Project no:20100501038). We thank beekeepers for providing the honey bee samples and their cooperation. We also thank Davud Gur for his support during the collection of some of the samples for this study

Milk Yield And Reproductive Traits Of Holstein Cattle Population İn Turkey

Çalışmada Türkiye’de yetiştirilen Siyah Alaca sığırların süt ve döl verim kayıtları değerlendirilmiştir. Bu amaçla Türkiye Damızlık Sığır Yetiştiricileri Merkez Birliği’ne bağlı işletmelere ait 1992-2012 yıllarının ait verileri kullanılmıştır. Çalışmada, 10 ilden seçilen 194408 laktasyon kaydı değerlendirilmiş olup 305 gün süt verimi (305 GSV), laktasyon süresi (LS), kuruda kalma süresi (KKS) ve buzağılama aralığı (BA) özelliklerine ait parametreler ve doğum yılı, laktasyon sırası, buzağılama ayı, il ve buzağılama yaşının bu özelliklere etkileri incelenmiştir. Çalışmada 305 GSV, LS, KKS ve BA özellekliklerine ait ortalamalar sırasıyla 6010±3,480, 364,33±0,184, 61,78±0,067 ve 416,59±0,270 olarak bulunmuştur. Sonuç olarak, doğum yılı, laktasyon sırası, buzağılama ayı, il ve buzağılama yaşının 305 GSV, LS, KKS ve BA üzerine etkisi istatistik olarak önemli bulunurken (p0,05). Turkey Holstein Friesian dairy cattle population 305 GSV was increased to the years (p <0.01) and LS, KKS and BA were found to be not similar for years. These parameters could be used as selection criteria and to increase the success of the selection in breeding studies

Bal Arılarının Genetik Değişkenliği Üzerine Çalışmalarda Bir Araç Olarak Morfometri

This study was conducted to determine whether the classical morphometric method is a good tool for investigating biodiversity of honey bee or not. The research material was consisted of the worker bee samples collected from 55 apiaries in different locations in Turkey. They were surveyed for only two morphometric characters. Due to common characters exit in all morphometric studies of honey bee, the wing length and the cubital index were chosen. In our study, phylogenetic tree obtained and the results given in graphics showed that morphometric method was a good tool for studying of morphological genetic variability. But it may be better if it should be replaced by modern geometrik morphometric method. A review concerning the concept of classical and modern morphometric methods were also been emphesized.Bu çalışma yalnızca iki morfometrik karekter aracılığıyla Türkiye bal arısı biyoçeşitliliğini belirlemek, elde edilen sonuçları benzer çalışmaların verileriyle karşılaştırmak ve böylece klasik morfometrik methodun bu tür çalışmalardaki etkinliğini irdelemek amacıyla düzenlenmiştir. Çalışma için Türkiye?nin farklı yerlerindeki 55 arılıktan işçi arı örnekleri toplanmıştır. Örnekler şimdiye kadar yapılan çalışmaların çoğunda ele alındığı gibi, kubital index ve ön kanat uzunluğu bakımından incelenmiştir. Elde edilen verilerin istatistiki analiz sonuçları klasik morfometrik methodun çeşitli yerel sonuçları karşılaştırmak konusundaki etkinliği bakımından hala geçerli bir araç olduğunu, fakat modern geometrik morfometrik method ile değiştirilirse çok daha etkin bir araç olabileceğini göstermiştir. Eserde klasik ve modern morfometrik metodlara ilişkin genel bir değerlendirme de yapılmıştır

Identification of novel genetic variants for KAP1.1, KAP1.3 and K33 genes in some of indigenous goat breeds of Turkey

The animal fibres such as mohair, cashmere and cashgora have a complex structure and affected by genetic variation of keratin associated protein genes as KAP 1.1 (Keratin Associated Protein 1.1, formerly known as B2A), KAP1.3 (Keratin Associated Protein 1.3, formerly known as B2C) and K33 (Keratin Intermediate Filaments Type I, formerly known as KRT1.2). Keratin-associated proteins play a significant role in identifying structural and mechanical properties of the hair and wool fibres. This study was conducted to detect genetic variation at the KAP1.1, KAP1.3 and K33 genes in indigenous Turkish goat populations using DNA sequencing method. The DNA of 100 individuals selected from 5 different native goat breeds (Hair, Honamli, Kilis, Norduz, and Angora) that reared different regions of Turkey were used as materials. A total of 59 nucleotide variations and indels (insertion/deletion) of KAP1.1 gene, 15 nucleotide variations and indels of KAP1.3 gene, 16 nucleotide variations of K33 gene were determined in the studied samples. These nucleotide variations and indels have been causing changes in the number and sequence of amino acids. It is necessary to determine the relationships with mohair yield, quality and polymorphisms that are determined in KAP1.1, KAP1.3 and KRT1.2 genes