Trente années d'observation des micro-algues et des toxines d'algues sur le littoral

Rephy and Rephytox are coastal monitoring networks created by Ifremer. Their purpose is to observe the phytoplankton and associate hydrological parameters and to detect the algal toxins accumulating in shellfish. This work describes these networks before providing a global vision of data acquired during the last three decades. It shows the importance of series of environmental data acquired in the long term.rticulier aux scientifiques travaillant sur les écosystèmes littoraux, maisaussi à tout public intéressé par ces problématiques

8. Phytoplankton and microbial plankton of the Bay of Biscay and western Iberian shelf.

Publicad

Application de modèles dynamiques bayésiens à la prévision des efflorescences à Dinophysis à Antifer (Baie de Seine)

L'objectif de ce travail était de mettre en place un outil mathématique permettant de prévoir les concentrations en Dinophysis cf. acuminata, micro-algue toxique. Nous avons décidé d'utiliser des méthodes dynamiques de prévision bayésienne : modèles polynomiaux du premier, second et troisième ordre, modèle polynomial du premier ordre avec intervention, et modèle de régression multilinéaire. Les modèles polynomiaux du premier, second et troisième ordre se sont avérés inadaptés. Le modèle de régression multilinéaire a été testé avec les variables concentrations en phosphate (PO4) et en nitrate (NO3). Ce modèle est insatisfaisant du fait de l'inconstance des relations entre la concentration en Dinophysis cf. acuminata et les régresseurs. Le modèle polynomial du premier ordre avec intervention, testé avec les données de la plage Benoît en baie du Pouliguen, donne de bons résultats qualitatifs, mais commet parfois d'importantes erreurs quantitatives. Les résultats obtenus sont insatisfaisants du point de vue de l'objectif que nous nous étions fixé. Mais les modèles dynamiques bayésiens, du fait de leurs comportements, restent des méthodes encourageantes. Il existe des modèles permettant de modéliser des processus issus de lois de la famille exponentielle  (exponential famüy dynamic models), ainsi que des modèles plus complexes (multi-process models, mixture models). Ces raffinements ne peuvent masquer le manque de connaissances fondamentales concernant la miao-algue (mode de nutrition, variabilités spatiales et temporelles)

Évaluation DCE décembre 2008, Éléments d’expertise - Élément de qualité : phytoplancton, Agence de l’eau : Adour-Garonne

La Directive Cadre sur l’Eau (DCE 2000/60/CE) du 23 octobre 2000 définit un cadre pour la gestion et la protection des eaux par grand bassin hydrographique au plan européen. Elle fixe un objectif de bon état écologique et chimique pour les eaux superficielles. La Directive s’appuie sur l’évaluation d’un certain nombre d’éléments de qualité pour définir l’état global d’une masse d’eau. La liste des éléments de qualité à prendre en compte varie selon la catégorie d’eau superficielle. Le phytoplancton figure parmi les éléments de qualité biologiques retenus pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales, c’est à dire les eaux côtières et de transition. Il est évalué à partir de trois composantes : biomasse, abondance et composition selon les termes mêmes de la DCE. Un document général d’évaluation a été réalisé sur les masses d’eaux retenues au titre du contrôle de surveillance, à partir des données disponibles dans Quadrige sur la période 2002-2007 et en l’état des décisions. Les résultats présentés se limitent strictement à ceux de l’évaluation assortis d’un commentaire d’expertise. Le présent document donne des éléments supplémentaires pour les masses d’eau de l’Agence de l’Eau : Adour-Garonne

Comparison of microbiological contamination level between different species of shellfish

The French microbiological monitoring network (REMI) has been carried out since 1989 in order to assess faecal contamination levels (Escherichia coli) of shellfish production areas. It has been shown that species growing at the same site may show differences in microbiological contamination. The aim of this study is to investigate these differences and to examine how it can be used in the context of monitoring networks, notably in identifying indicator species. We would expect an indicator species to yield results at least as high as those of the other species present. Of the 372 monitoring points defined in the REMI in 2011, 20 points are sampled at the same time for at least two different species of shellfish, usually on a monthly basis. This study was organised in three stages : - identification of the results obtained in parallel at the same point, and the same time of sampling for at least two species. All data stored in the national data bank Quadrige² since 1989 have been extracted. - data treatment : our primary parameter is the logarithm of E. Coli concentration. Descriptive statistics completed with a non parametric tests have been performed. The comparison was done per couple of shellfish : Mytilus edulis / Cerastoderma edule, Mytilus galloprovincialis / Cerastoderma edule, Crassostrea gigas / Cerastoderma edule. - furthermore, as the classification in France is done per group of shellfish : Group 1 : gastropod, echinoderm, group 2 : filter-feeding burrowing bivalves (cockles, clams…), Group 3 : non burrowing filter-feeding bivalves (oysters, mussels), data treatment consisted in comparison of the difference between the groups. This data treatment confirmed that burrowing shellfish were significantly more contaminated than non burrowing bivalves and pointed out differences between species that will be more detailed in the presentation

Synthèse bibliographique relative à la notion d'indicateur dans le contexte de la Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM)

Stakeholders of the Marine Strategy Framework Directive (MSFD) need scientific and technical support to assess ecological status of marine waters and to adopt management actions to achieve the objective of the directive, i.e. “to achieve or to maintain good environmental status in the [European] marine environment by the year 2020 at the latest”. This support involves especially the development of indicators. Studies about the concept of indicator exist, in particular since the implementation of legislations such as the Water Framework Directive (WFD) in Europe. Indeed, they provide a significant source of reports and scientific papers, representing essential information for the implementation of the MSFD. However, the generic nature of the concept of indicator and the multiplicity of proposed frameworks and steps of development led to the definition of a dense and sometimes redundant vocabulary as well as focused or synthesised and then incomplete processes, which overlap in part or in totality. It follows that the use of these documents is not easy in an operating context. This report seeks to make a state of the art about the concept of indicator, with the aim of providing support for the development of indicators, particularly in the framework of the MSFD. The realized synthesis allowed to propose an operational and generic procedure for the construction of indicators, which is composed of the following three stages: (i) identification of the question of interest and of its components; (ii) development of the indicator (i.e. vocabulary, expected qualities, candidates, selection et aggregation); (iii) evaluation and the feedback, i.e. the use of the indicator to answer to the question of interest and the use of newly acquired knowledge to update the various components (e.g. question, indicator) during the next identification – development - assessment cycle. In the framework of the MSFD, a proposition is done to define a common vocabulary about the concept of indicator and a lot of work remains to obtain a set of valid indicators.Les acteurs de la Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM) ont besoin d'un appui scientifique et technique pour évaluer l'état écologique du milieu marin et prendre les mesures permettant d'atteindre le but fixé par la directive, i.e. « réaliser ou maintenir un bon état écologique de l'environnement marin [européen] au plus tard en 2020 ». Cet appui passe en particulier par le développement d'indicateurs. Des travaux sur la notion d'indicateur ont été réalisés, notamment suite à la mise en place de cadres législatifs comme par exemple la Directive Cadre sur l'Eau (DCE) en Europe. Ils représentent un ensemble considérable d'articles et de rapports qui constituent une information essentielle pour la mise en œuvre de la DCSMM. En revanche, la généricité de la notion d'indicateur et la multiplicité des cadres et des étapes de développement proposés ont induit la définition d'un vocabulaire dense et parfois redondant ainsi que de processus ciblés ou synthétiques et ainsi incomplets, se recoupant en partie ou en totalité. Il s'ensuit que l'utilisation de ces documents n'est pas d'un usage aisé dans un contexte opérationnel. Ce rapport a pour objet de faire un état de l'art concernant les indicateurs, dans le but de fournir un appui pour leur développement, en particulier dans le cadre de la DCSMM. La synthèse réalisée a permis de proposer une marche à suivre opérationnelle générique pour le développement d'indicateurs, composée des trois phases suivantes : (i) identification de la question qui se pose et de ses composantes ; (ii) développement de l'indicateur (i.e. vocabulaire, qualités attendues, candidats, sélection et agrégation) ; (iii) évaluation et retour d'expérience, i.e. application de l'indicateur pour répondre à la question et utilisation des connaissances nouvellement acquises pour mettre à jour les différents éléments (e.g. question, indicateur) lors du prochain cycle identification – développement – évaluation. Cette marche à suivre est assortie d'exemples de travaux dans l'objectif de fournir des éléments facilitant son application. Dans le cadre de la DCSMM, une proposition est faite pour définir un vocabulaire commun sur la notion d'indicateur et un travail important est encore nécessaire pour obtenir un ensemble valide d'indicateurs

Evaluation DCE avril 2009 : élément de qualité oxygène. Document général pour l'ensemble des masses d'eaux de la France métropolitaine - Convention 2009 - Action 4

Le bilan d'oxygène figure parmi les éléments de qualités physico-chimiques retenus par la DCE pour la classification de l'état écologique des masses d'eaux littorales. Le présent document est un premier essai d'évaluation réalisées sur les masses d'eaux retenues au titre du contrôle de surveillance, à partir des données disponibles dans Quadrige² sur la période 2003-2008

Évaluation DCE décembre 2008, Éléments d’expertise - Élément de qualité : phytoplancton, Agence de l’eau : Rhône-Méditerranée-Corse

La Directive Cadre sur l’Eau (DCE 2000/60/CE) du 23 octobre 2000 définit un cadre pour la gestion et la protection des eaux par grand bassin hydrographique au plan européen. Elle fixe un objectif de bon état écologique et chimique pour les eaux superficielles. La Directive s’appuie sur l’évaluation d’un certain nombre d’éléments de qualité pour définir l’état global d’une masse d’eau. La liste des éléments de qualité à prendre en compte varie selon la catégorie d’eau superficielle. Le phytoplancton figure parmi les éléments de qualité biologiques retenus pour la classification de l'état écologique des masses d’eaux littorales, c’est à dire les eaux côtières et de transition. Il est évalué à partir de trois composantes : biomasse, abondance et composition selon les termes mêmes de la DCE. Un document général d’évaluation a été réalisé sur les masses d’eaux retenues au titre du contrôle de surveillance, à partir des données disponibles dans Quadrige sur la période 2002-2007 et en l’état des décisions. Les résultats présentés se limitent strictement à ceux de l’évaluation assortis d’un commentaire d’expertise. Le présent document donne des éléments supplémentaires pour les masses d’eau de l’Agence de l’Eau : Rhône-Méditerranée-Corse