Occurrence and genetic determination of Giardia in dogs from South Eastern Europe

Giardia duodenalis is a worldwide occurring protozoan with zoonotic potential infecting various mammals including humans. Giardia comprises the zoonotic assemblages A and B and the non-zoonotic assemblages C to H, which are characteristic for different host species. The role of pet animals in the transmission cycle of this parasite is still under debate. In order to identify Giardia assemblages in dogs from South Eastern Europe, 1645 faecal samples of household and shelter dogs from Albania, Bulgaria, Hungary, Macedonia, Romania and Serbia were tested for Giardia coproantigen by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). DNA was extracted from a subset of 107 faecal samples demonstrating Giardia cysts by direct immunofluorescence assay (IFA) or microscopy (15-22 per country) plus 26 IFA-positive canine faecal samples from Croatia. Multilocus sequence typing with nested PCRs was performed targeting five different gene loci: SSU rRNA, ITS1-5.8S-ITS2, beta giardin (bg), glutamate dehydrogenase (gdh) and triosephosphate isomerase (tpi). In 33.7 % of all dogs, Giardia antigen was detected by coproantigen ELISA. The prevalence was significantly higher in shelter dogs compared to household dogs (57.2 vs. 29.7 %, p < 0.01). The amplification rate at the different gene loci ranged from 1.5 (tpi) to 82.0 % (SSU rRNA). Sequencing of the PCR products revealed the dog-specific assemblages C and D in 50 and 68 samples, respectively. The results demonstrate that G. duodenalis should be considered as a common parasite in dogs from South Eastern Europe. However, there was no evidence for zoonotic Giardia assemblages in the investigated canine subpopulation

Occurrence and genetic determination of Giardia in dogs from South Eastern Europe

Giardia duodenalis is a worldwide occurring protozoan with zoonotic potential infecting various mammals including humans. Giardia comprises the zoonotic assemblages A and B and the non-zoonotic assemblages C to H, which are characteristic for different host species. The role of pet animals in the transmission cycle of this parasite is still under debate. In order to identify Giardia assemblages in dogs from South Eastern Europe, 1645 faecal samples of household and shelter dogs from Albania, Bulgaria, Hungary, Macedonia, Romania and Serbia were tested for Giardia coproantigen by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). DNA was extracted from a subset of 107 faecal samples demonstrating Giardia cysts by direct immunofluorescence assay (IFA) or microscopy (15-22 per country) plus 26 IFA-positive canine faecal samples from Croatia. Multilocus sequence typing with nested PCRs was performed targeting five different gene loci: SSU rRNA, ITS1-5.8S-ITS2, beta giardin (bg), glutamate dehydrogenase (gdh) and triosephosphate isomerase (tpi). In 33.7 % of all dogs, Giardia antigen was detected by coproantigen ELISA. The prevalence was significantly higher in shelter dogs compared to household dogs (57.2 vs. 29.7 %, p < 0.01). The amplification rate at the different gene loci ranged from 1.5 (tpi) to 82.0 % (SSU rRNA). Sequencing of the PCR products revealed the dog-specific assemblages C and D in 50 and 68 samples, respectively. The results demonstrate that G. duodenalis should be considered as a common parasite in dogs from South Eastern Europe. However, there was no evidence for zoonotic Giardia assemblages in the investigated canine subpopulation

Strukturelle und funktionelle Veränderungen der Glandula submandibularis der Wistar-Ratte nach intraglandlärer Applikation von Botulinumtoxin

Die intraglanduläre Injektion von Botulinumtoxinen führt zu einer temporären Denervation der Speicheldrüsen, welche eine reduzierte Speichelsekretion zur Folge hat. In dieser Arbeit wurden die funktionellen und strukturellen Veränderungen der submandibulären Drüsen von 18 Wistar-Ratten, nach Behandlung mit Botulinumtoxin A, B und einer Kombination von beiden Toxinen, untersucht. Die Toxine wurden jeweils als 0,1 ml Injektion in die rechte Gl. submandibularis der Tiere appliziert, während die linken Drüsen als Kontrollen mit 0,1 ml physiologischer Kochsalzlösung behandelt wurden. 14 Tage nach der intraglandulären Injektion wurden die Gll. submandibulares der Ratten entnommen und mit verschiedenen etablierten Methoden untersucht. Dabei wurde überprüft, ob es zu einer temporären Atrophie der Drüsen nach Applikation von Botulinumtoxinen kommt. In histologischen Untersuchungen von Semidünnschnitten und elektronenmikroskopischen Analysen des Drüsengewebes, insbesondere der Zellgranula und sekretorischen Vesikel, konnten eindeutige Zeichen der Atrophie der Azinuszellen gefunden werden. Diese waren am deutlichsten in den mit BoNT/A und BoNT/B in Kombination behandelten Drüsen zu sehen. Zudem waren die mit Toxin behandelten Gll. submandibulares bei der Gewichtsmessung direkt nach Entnahme signifikant leichter als ihre jeweiligen Kontrolldrüsen (P=0,004). Morphometrische Messungen zur Größe der Azinuszellen bestätigten diese Ergebnisse mit signifikant kleineren Zellflächen nach BoNT-Injektion (P=0,031). Desweiteren wurden Western-Blot-Analysen und immunhistochemische Amylasefärbungen des Drüsengewebes durchgeführt, die einen reduzierten Amylasegehalt in den mit BoNT behandelten submandibulären Drüsen im Vergleich zu den Kontrolldrüsen zeigten. Die Ergebnisse dieser Arbeit verdeutlichen, dass intraglanduläre Applikation von BoNT strukturelle und funktionelle Veränderungen der Speicheldrüsen induziert. Diese Effekte könnten auf die Blockade der Acetylcholinausschüttung durch die Spaltung von SNAREs an den neuroglandulären Synapsen, aber auch insbesondere auf die Spaltung der an der Vesikelexozytose in den Azinuszellen beteiligten SNAREs, zurückgeführt werden. Besonders deutliche Effekte konnten in den histologischen Untersuchungen von Semidünnschnitten und in den elektronenmikroskopischen Untersuchungen bei Kombinationsgabe von BoNT/A und BoNT/B gezeigt werden. Hierfür könnte die Spaltung von verschiedenen SNAREs an der neuroglandulären Synapse und in der Azinuszelle durch die unterschiedlichen BoNT verantwortlich sein

Complete Genome Sequences of Two Nosocomiicoccus ampullae Strains and a Growth-Adapted Mutant

Here, we present the circular and complete genome sequences of the Nosocomiicoccus ampullae isolate 19-00310 and type strain DSM 19163. To our knowledge, these represent the first complete, circular chromosomes in the entire genus. Sequencing of a growth-adapted mutant suggests iron availability as a factor for growth improvement.Peer Reviewe

Steckbrief «DOCA – Database of Variables for Content Analysis». Zur Relevanz, Zielstellung, Inhalt und Partizipationsmöglichkeiten der Datenbank für Operationalisierungen der standardisierten Inhaltsanalyse

Die Open Access Database of Variables for Content Analysis DOCA sammelt, systematisiert und evaluiert Operationalisierungen für die standardisierte manuelle und automatisierte Inhaltsanalyse in der Kommunikationswissenschaft. DOCA soll Forschenden das Finden von geeigneten und etablierten bzw. getesteten Operationalisierungen (sowie den gesamten Codebüchern) für die standardisierte Inhaltsanalyse erleichtern. Für die kommunikationswissenschaftliche Forschung soll dies mit einer besseren Vergleichbarkeit inhaltsanalytischer Studien und Projekte sowie einer erhöhten Bedeutungszuschreibung der Transparenz von Operationalisierungen und Qualitätsindikatoren einhergehen. Mit dem vorliegenden Steckbrief sind zwei zentrale Zielsetzungen verbunden: Erstens soll über DOCA und deren Einsatzgebiete informiert werden und so auch der Bekanntheitsgrad dieser Forschungsinfrastruktur gesteigert werden. Zweitens soll dieser Artikel aus der Perspektive der Herausgeberinnen den Prozess und die damit verbundenen Herausforderungen für die Konzeption, Realisation und Aufrechterhaltung einer Forschungsinfrastruktur darlegen. The Open Access Database of Variables for Content Analysis (DOCA) collects, systematizes, and evaluates operationalizations for standardized manual and automatic content analysis in the field of communication science. DOCA aims to facilitate researchers in finding suitable and established or tested operationalizations (as well as complete codebooks) for standardized content analysis. For communication science research, this is expected to result in increased comparability of content analytic studies and projects, as well as greater emphasis on the transparency of operationalizations and quality indicators. The present fact sheet is associated with two central objectives: firstly, to provide information about DOCA and its applications, thereby increasing awareness of this research infrastructure. Secondly, from the personal perspective of the editors, this article aims to outline the process and associated challenges involved in the conception, realization, and maintenance of a research database

What knowledge do teachers need for inclusive education? Perspectives on Professional Practice

Die Forschung zu professionellen Lehrkompetenzen im Kontext Inklusion fokussiert bislang Einstellungen und bildet das professionelle Wissen unzureichend ab. Der vorliegende Beitrag untersucht, welche Wissensbestände aus Sicht von in inklusiven Settings tätigen Lehrkräften notwendig sind, um mit Inklusion im schulischen Kontext professionell umgehen zu können. Mit einem literaturbasierten Kategoriensystem wurden die Interviews von 53 Lehrkräften verschiedener Schulformen analysiert. Zunächst wird die Perspektive aller befragten Lehrkräfte dargestellt, anschließend erfolgt eine nach Schulform und Schulentwicklungsstand differenzierte Auswertung. Die Ergebnisse zeigen, dass die Lehrkräfte die aus der Forschungsliteratur abstrahierten Wissensbestände nennen, diese jedoch um induktive Kategorien ergänzt werden sollten. Dabei unterscheiden sich die Aussagen hinsichtlich der Schulformen. Sichtbar wird auch ein Zusammenhang zwischen Schulkontext und Professionalisierung der einzelnen Lehrkraft, welcher konkrete Hinweise für die Gestaltung von inklusionsbezogenen Fortund Weiterbildungen von Lehrkräften geben kann.Research about teaching competencies in the context of inclusion focuses so far attitudes and does not take adequate account of professional knowledge. This paper investigates what kind of knowledge is relevant from the view of teachers in practice to handle inclusion in schools. Interviews of 53 teachers of different types of school were analysed qualitatively with a literature based category system. First, the perspective of all interviewed teachers is presented. It follows an analysis, which regards the type of school and the level of school development. Our results show that teachers use the categories, which are abstracted from the research literature. These categories need to be supplemented by inductive categories. There is a difference between the types of school, and a relation between school context and professional development of individual teachers. This could be discussed as a specific indication for teacher trainings, which aim to foster inclusive competencies

Genome-Wide Association Studies for the Detection of Genetic Variants Associated With Daptomycin and Ceftaroline Resistance in Staphylococcus aureus

Background: As next generation sequencing (NGS) technologies have experienced a rapid development over the last decade, the investigation of the bacterial genetic architecture reveals a high potential to dissect causal loci of antibiotic resistance phenotypes. Although genome-wide association studies (GWAS) have been successfully applied for investigating the basis of resistance traits, complex resistance phenotypes have been omitted so far. For S. aureus this especially refers to antibiotics of last resort like daptomycin and ceftaroline. Therefore, we aimed to perform GWAS for the identification of genetic variants associated with DAP and CPT resistance in clinical S. aureus isolates. Materials/methods: To conduct microbial GWAS, we selected cases and controls according to their clonal background, date of isolation, and geographical origin. Association testing was performed with PLINK and SEER analysis. By using in silico analysis, we also searched for rare genetic variants in candidate loci that have previously been described to be involved in the development of corresponding resistance phenotypes. Results: GWAS revealed MprF P314L and L826F to be significantly associated with DAP resistance. These mutations were found to be homogenously distributed among clonal lineages suggesting convergent evolution. Additionally, rare and yet undescribed single nucleotide polymorphisms could be identified within mprF and putative candidate genes. Finally, we could show that each DAP resistant isolate exhibited at least one amino acid substitution within the open reading frame of mprF. Due to the presence of strong population stratification, no genetic variants could be associated with CPT resistance. However, the investigation of the staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) revealed various mecA SNPs to be putatively linked with CPT resistance. Additionally, some CPT resistant isolates revealed no mecA mutations, supporting the hypothesis that further and still unknown resistance determinants are crucial for the development of CPT resistance in S. aureus. Conclusion: We hereby confirmed the potential of GWAS to identify genetic variants that are associated with antibiotic resistance traits in S. aureus. However, precautions need to be taken to prevent the detection of spurious associations. In addition, the implementation of different approaches is still essential to detect multiple forms of variations and mutations that occur with a low frequency.Peer Reviewe

Corrigendum: Genome-Wide Association Studies for the Detection of Genetic Variants Associated With Daptomycin and Ceftaroline Resistance in Staphylococcus aureus

Peer Reviewe

ERAD Components in Organisms with Complex Red Plastids Suggest Recruitment of a Preexisting Protein Transport Pathway for the Periplastid Membrane

The plastids of cryptophytes, haptophytes, and heterokontophytes (stramenopiles) (together once known as chromists) are surrounded by four membranes, reflecting the origin of these plastids through secondary endosymbiosis. They share this trait with apicomplexans, which are alveolates, the plastids of which have been suggested to stem from the same secondary symbiotic event and therefore form a phylogenetic clade, the chromalveolates. The chromists are quantitatively the most important eukaryotic contributors to primary production in marine ecosystems. The mechanisms of protein import across their four plastid membranes are still poorly understood. Components of an endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) machinery in cryptophytes, partially encoded by the reduced genome of the secondary symbiont (the nucleomorph), are implicated in protein transport across the second outermost plastid membrane. Here, we show that the haptophyte Emiliania huxleyi, like cryptophytes, stramenopiles, and apicomplexans, possesses a nuclear-encoded symbiont-specific ERAD machinery (SELMA, symbiont-specific ERAD-like machinery) in addition to the host ERAD system, with targeting signals that are able to direct green fluorescent protein or yellow fluorescent protein to the predicted cellular localization in transformed cells of the stramenopile Phaeodactylum tricornutum. Phylogenies of the duplicated ERAD factors reveal that all SELMA components trace back to a red algal origin. In contrast, the host copies of cryptophytes and haptophytes associate with the green lineage to the exclusion of stramenopiles and alveolates. Although all chromalveolates with four membrane-bound plastids possess the SELMA system, this has apparently not arisen in a single endosymbiotic event. Thus, our data do not support the chromalveolate hypothesis

Manuelle standardisierte Inhaltsanalyse

Die manuelle Inhaltsanalyse gilt nach wie vor als zentrale Methode kommunikationswissenschaftlicher Forschung. Die nachfolgenden Ausführungen sollen ein Grundverständnis über Merkmale, Schritte, Qualitätskriterien und Schwerpunkte der manuellen Inhaltsanalyse vermitteln, die für die Nachvollziehbarkeit von Konzept und Idee des Handbuchs behilflich sein können. So wird in diesem Kapitel deutlich, was unter standardisierter Inhaltsanalyse – auch in Abgrenzung zur qualitativen Inhaltsanalyse – verstanden wird. Zudem werden auch Qualitätskriterien der manuellen Inhaltsanalyse skizziert, die bei der Auswahl der berichteten Studien in diesem Handbuch und auch der Operationalisierungen für die dazugehörige Datenbank zentral waren