Antibacterial Potency from Ethanol Extract Leaves of Kluwih (Artocarpus camansi Blanco) against Shigella dysenteriae and Bacillus subtilis

Gastrointestinal infection is a common infection in Indonesia. Many bacteria could cause gastrointestinal disorder, including Shigella dysenteriae and Bacillus subtilis. Currently, they are treated using chemical and traditional drugs. One of the common pants in Indonesia is Kluwih (Artocarpus camansi). The objective our study to determine antibacterial activity and inhibitory mechanism of Kluwih leaf extract against pathogenic bacteria which cause gastrointestinal infection, i.e. Shigella dysenteriae and Bacillus subtilis. The extraction process used maceration technique using 96% ethanol solvent and the antibacterial activity was studied using agar diffusion method. The research result showed that Kluwih leaf extract had inhibitory power with KHM (minimum inhibitory concentration) value of 25% against S. dysenteriae and 6.25% against B. subtilis. The present study also revealed that Kluwih leaf was suspected to have inhibitory activity against bacteria by making holes in the membrane of bacterial cell, leading to the release of nucleic acid and protein and cell death.Keywords: antibacterial, Artocarpus camansi, kluwih, Shigella dysenteriae, Bacillus subtilis

Efek Larvasida Fraksi Etil Asetat Daun Bangun-bangun (Plectranthus amboinicus) terhadap Mortalitas Larva Aedes aegypti

Abstract. Mosquitoes are insects that can transmit diseases to humans through their bites. Dengue haemorrhagic fever is one of the diseases that could be transmitted by Aedes aegypti mosquito. The use of insecticides to control the occurrence of dengue haemorrhagic fever builds resistance of the mosquito towards the chemical substance. Therefore, natural larvicide was used as an alternative to chemical insecticides. This research was conducted to study the effectiveness of larvicides from the ethyl acetate fraction of Bangun-bangun leaves (Plectranthus amboinicus) in killing the Aedes aegypti larvae and to identify the active larvicide compounds. This laboratory experiment research tested six extract concentrations (0.0; 1.0; 1.8; 3.2; 5.6; 10.0%) in three replications. Observations were administered for 48 hours to count the number of the dead Aedes aegypti instar III larvae obtained from the Entomology Laboratory of the Faculty of Veterinary, IPB. The results showed that the larvae mortality increased as the extract concentration increased. The percentage of Aedes aegypti killed reached 96% at an extract concentration of 10%. Meanwhile, the probit analysis showed that LC50 was found at a concentration of 5.56%. The identification of active compounds using GCMS revealed that the larvicidal compounds in ethyl acetate fraction were the ones from an organic acid group which were, stearic acid, and palmitic acid.  Keywords: Aedes aegypti, identification, larvacidal, mortality   Abstrak. Nyamuk merupakan serangga yang dapat menularkan penyakit melalui gigitannya. Salah satu penyakit yang ditularkan adalah demam berdarah dengue yang dibawa oleh nyamuk Aedes aegypti. Pengendalian demam berdarah dengue menggunakan insektisida berbahan kimia dapat menyebabkan resisten nyamuk terhadap insektisida meningkat, oleh karena itu larvasida alami diharapkan dapat menjadi alternatif pengganti insektisida kimia. Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui afektifitas larvasida dari fraksi etil asetat daun Bangun-bangun (Plectranthus amboinicus) terhadap mortalitas larva Aedes aegypti dan mengidentifikasi jenis senyawa aktif yang berperan sebagai larvasida. Penelitian ini merupakan eksperimen laboratorium dengan enam konsentrasi ekstrak (0,0; 1,0; 1,8; 3,2; 5,6; 10,0%) dan tiga kali ulangan. Pengamatan dilakukan selama 48 jam terhadap jumlah kematian larva Aedes aegypti instar III yang diperoleh dari Laboratorium Entomologi Fakultas Kedokteran Hewan, IPB. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kematian larva meningkat seiring dengan meningkatnya konsentrasi ekstrak. Kematian Aedes aegypti mencapai 96% pada konsentrasi ekstrak 10% dan hasil analisa probit menunjukkan LC50 terdapat pada konsentrasi 5,56%.  Identifikasi senyawa aktif menggunakan GCMS menunjukkan bahwa senyawa yang bersifat larvasida dalam fraksi etil asetat ini adalah senyawa dari golongan asam organik yaitu, asam stearate, dan asam palmitat.  Kata Kunci: Aedes aegypti, identifikasi, larvasida, mortalita

Identifikasi Senyawa Aktif Ekstrak Buah Mengkudu (Morinda citrifolia L.) dan Potensinya sebagai Inhibitor Karies Gigi

Dental caries is a disease that many people experience, which is formed by the buildup of plaque on the teeth and the presence of bacteria. The bacteria known to be involved in the formation of dental caries is Streptococcus mutans. Dental caries used to be treated using antibiotics. However, it is known that many antibiotics are no longer effective against this bacteria hence it is necessary to look for another alternative. One alternative choice as an antibacterial is Noni fruit. This study aims to identify the bioactive compounds of noni fruit (Morinda citrifolia L) and to know the mechanism of action in inhibiting the growth of Streptococcus mutans. Noni fruit was macerated using 96% ethanol, then fractionated using n-hexane and ethyl acetate. Antibacterial activity test was done using agar difusion method, and identification of bioactive compounds was conducted using GCMS. The results showed that ethyl acetate fraction has the highest inhibitory activity on the growth of Streptococcus mutans with inhibition zone of ±17 mm and MIC (minimum inhibitor concentration) value of 10%. The inhibition mechanism is asumed to be done by making holes in cell membranes, which can be seen from the high concentration of proteins and nucleic acids coming out of cells after treatment that in turn means that cell leakage has occurred. The results of this study indicate that noni fruit (Morinda citrifolia L) contain bioactive quinolone compounds that can be a new source for treating dental carie

DNA Barcoding Tanaman Mangga Kasturi (Mangifera casturi) Asal Kalimantan Selatan Berbasis DNA Kloroplas Gen rbcL dan matK

This study aims to see the genetic diversity of the musk mango (Mangifera casturi) plant in South Kalimantan based on DNA barcode techniques using sequences from the rbcL gene and the matK gene. The plant samples used in this study were the leaves of the musk mango (Mangifera casturi) taken from eight regencies and cities in South Kalimantan Province, namely from Amuntai, Astambul, Barito Kuala, Peat, Kandanga, Babirik, Tabalong, and Tanah Laut. Isolation and DNA analysis of the musk mango plant was carried out in the research laboratory of the Faculty of Biotechnology, Atma Jaya Catholic University of Indonesia, Jakarta. The analysis of the genetic diversity of the musk mango began with the stage of amplifying genomic DNA (gDNA) using rbcL and matK primers. The results of the DNA isolation samples showed a high concentration level of 17-91 ng/µL with a purity of 1.72 -1.92 ng/µL. When PCR was carried out using rbcL and matK primers, from 8 areas in South Kalimantan, 5 samples (Babirik, Tabalong, Kandangan, Amuntai, Batola, Peat, and Tanah Laut) were amplified with rbcL primers and 6 samples (Tanah Laut, Babirik, Tabalong , Amuntai, Peat, and Kandangan) amplified with matK primer. The relationship between the musk mango in South Kalimantan can be seen from the phylogenetic tree.Penelitian ini bertujuan untuk melihat keragaman genetik tanaman mangga kasturi (Mangifera casturi) di Kalimantan Selatan menggunakan sekuens dari gen rbcL dan gen matK. Sampel tumbuhan yang digunakan dalam penelitian ini adalah daun mangga kasturi (Mangifera casturi) yang diambil dari delapan kabupaten dan kota di Provinsi Kalimantan Selatan yaitu dari Kota Amuntai, Astambul, Barito Kuala, Gambut, Kandanga, Babirik, Tabalong, dan Tanah Laut. Isolasi dan analisis DNA tanaman mangga kasturi dilakukan di laboratorium penelitian Fakultas Bioteknologi Universitas Katolik Indonesia Atma Jaya, Jakarta. Analisis keragaman genetik mangga kasturi dimulai dengan tahap amplifikasi DNA genom (gDNA) menggunakan primer rbcL dan matK. Hasil isolasi DNA sampel menunjukkan konsentrasi yang tinggi yaitu 17-91 ng/µL dengan kemurnian berkisar antara 1,72-1,92 ng/µL. Pada saat PCR dilakukan dengan primer rbcL dan matK, dari 8 wilayah di Kalimantan Selatan, terdapat 5 sampel (Babirik, Tabalong, Kandangan, Amuntai, Batola, Gambut, dan Tanah Laut) dapat teramplifikasi menggunakan primer rbcL dan 6 sampel (Tanah Laut, Babirik, Tabalong, Amuntai, Gambut, dan Kandangan) teramplifikasi menggunakan primer matK. Hubungan antara mangga kasturi di Kalimantan Selatan dapat dilihat dari pohon filogenetiknya

EFEK ANTIBAKTERI EKSTRAK DAUN CENGKEH (Syzygium aromaticum) TERHADAP Escherichia coli DAN Staphylococcus aureus

Antibacterial Effect of Clove Leaf Extract (Syzygium aromaticum) against Escherichia coli and Staphylococcus aureus Escherichia coli and Staphylococcus aureus are microorganisms that cause infection. Overcoming infection using antibiotics is known to generate bacteria that are resistant to some antibiotics, hence the need of other antibacterial resources. One of the natural sources that can be utilized is clove leaf (Syzygium aromaticum). This study aims to determine the types of compounds contained in clove leaves and their inhibitory activity against E. coli and S. aureus. The study began with extraction using maceration techniques, then the separation of the compounds through ethanol, n-hexane, and ethyl acetate fractionation. Next step was the identification of secondary metabolites of clove leaf compounds using Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS). The results showed the ethyl acetate fraction was the most active in inhibiting the growth of E. coli and S. aureus with a minimum inhibitory value (MIC) of 10%. The most dominant compound in the ethyl acetate fraction was found to be caffeine with a content of 23.36%.  Keywords: antibacterial, clove leaves, GC-MS, MIC, Syzygium aromaticum ABSTRAK Escherichia coli dan Staphylococcus aureus adalah mikroorganisme penyebab infeksi. Penanggulangan infeksi menggunakan antibiotik telah memunculkan bakteri yang resisten terhadap beberapa antibiotik sehingga perlu mencari sumber antibakteri lain. Salah satu bahan alam yang dapat dimanfaatkan adalah daun cengkeh (Syzygium aromaticum). Penelitian ini bertujuan mengetahui jenis senyawa yang terkandung dalam daun cengkeh dan aktivitas penghambatannya terhadap bakteri E. coli dan S. aureus. Penelitian diawali dengan ekstraksi menggunakan teknik maserasi, kemudian dilakukan pemisahan senyawa berdasarkan tingkat kepolaran melalui fraksinasi etanol, n-heksan, dan etil asetat. Hasil fraksinasi diujikan ke bakteri uji. Identifikasi senyawa metabolit sekunder daun cengkeh menggunakan Gas Chromatography Mass Spectrometry (GC-MS). Hasil penelitian menunjukkan bahwa fraksi etil asetat paling aktif menghambat pertumbuhan bakteri E. coli dan S. aureus dengan nilai kadar hambat minimum (KHM) 10%. Senyawa paling dominan pada fraksi etil asetat adalah kafein dengan kadar 23,36%

UJI AKTIVITAS ANTIBAKTERI EKSTRAK ETANOL 96% DAUN RAMBAI (Sonneratia caseolaris, (L.) Engl) TERHADAP PERTUMBUHAN BAKTERI Escherichia coli

ABSTRAK Kebanyakan masyarakat Indonesia telah mengenal obat-obatan tradisional dan lebih suka menggunakan obat-obatan tradisional untuk mengobati berbagai penyakit. Di Kalimantan Tengah buah rambai dapat dimakan demikian pula daunnya digunakan untuk mengobati penyakit cacar, obat diare dan mengobati luka memar dikulit, daun rambai mengandung tanin, flavonoid dan saponin. Tujuan penelitin ini untuk mengetahui efektivitas ekstrak daun rambai (Sonneratia caseolaris (L.) Engl) dalam menghambat pertumbuhan bakteri Escherichia coli (ATCC 25922). Metode yang digunakan adalah metode difusi cakram tujuannya untuk mengetahui aktivitas antibakteri ekstrak etanol 96% daun rambai  (Sonneratia caseolaris (L.) Engl). Kotrimoxazol 25μg digunakan sebagai pembanding aktivitas antibakteri. Ekstrak etanol 96% daun rambai (Sonneratia caseolaris (L.) Engl) menunjukkan adanya aktivitas antibakteri terhadap bakteri Escherichia coli. Aktivitas antibakeri yang paling tinggi adalah pada konsentrasi 100% dengan rerata diameter adalah 22,48 mm. Kata Kunci: Sonneratia caseolaris L. Engl, antibakteri, difusi cakram ABSTRACT Most Indonesian people have known traditional medicine and prefer to use traditional medicine to treat various diseases. In Central Kalimantan,rambai fruit is edibleas well as its leaves are used to treat smallpox, diarrhea and skin bruises. Rambai leaves contain tannins, flavonoids and saponins. The purpose of this study is to determine the effectiveness of the extract of Rambai leaf (Sonneratia caseolaris (L.) Engl) in inhibiting the growth of Escherichia coli bacterium (ATCC 25922). The method used is disc diffusion method to determine the antibacterial activity of 96% ethanol extract of the Rambai leaf (Sonneratia caseolaris (L.) Engl). Cotrimoxazole 25μg is used as a comparison of antibacterial activity. 96% ethanol extract of Rambai leaf (Sonneratia caseolaris (L.) Engl) shows antibacterial activity against Escherichia coli. The highestantibacterial activity is at a concentration of 100% with a mean diameter of 22.48 mm. Keywords: Sonneratia caseolaris, L. Engl, antibacterial, disc difussio

UJI AKTIVITAS ANTIBAKTERI EKSTRAK DAN FRAKSI DAUN JATI (Tectona grandiss Linn.F )DALAM MENGHAMBAT PERTUMBUHAN BAKTERI Escherichia coli dan Staphylococcus aureus SECARA IN VITRO

Penggunaan bahan alam sebagai obat tradisional telah lama dilakukan, hal ini terjadi sejak zaman nenek moyang yang melakukan pengobatan sendiri secara empiris. Salah satu bahan yang berpotensi adalah daun Jati. Daun jati diketahui memiliki kandungan senyawa flavonoid, saponin, tanin galat, tanin katekat, kuinon, dan steroid/triterpenoid, yang memiliki aktivitas antibakteri. Maka dari itu perlu adanya pengujian untuk mengetahui aktivitas ekstrak etanol dan fraksi daun jati dalam menghambat pertumbuhan bakteri Escherichia coli  dan Staphylococcus aureus.Penelitian ini merupakan penelitian eksperimental dengan rancangan post test only control group design. Uji aktivitas anti bakteri dilakukan dengan difusi cakram (Kirby-bauer), dimana media Nutrien Agar yang sudah dibiakkan Escherichia coli dan Staphylococus aureus dan diinkubasikan selama 24 jam. Kelompok kontrol positif menggunakan ampicillin, kelompok kontrol negatif menggunakan aquabides, serta sampel uji yakni ekstrak etanol, fraksi etil dan fraksi N-Heksana. Zona hambat diukur menggunakan jangka sorong millimeter. Data yang diperoleh dianalisis menggunakan  uji Kolmogorov, uji levene’s dan Two way annova. Uji lanjutan dengan mengukur KHM dari senyawa yang memiliki aktivitas tertinggi terhadap pertumbuhan bakteri, dilakukan dengan metode dilusi cair. Media Nutrien Broth yang sudah dibiaakkan Escherichia coli dan Staphylococus aureus diberikan konsentrasi ekstrak masing-masing 5 %,10 %, 15 %, 20 % dan 25 %Hasil penelitian menunjukan ekstrak etanol daun jati memiliki aktivitas dalam menghambat pertumbuhan bakteri paling besar dengan rerata zona hambat 16,92 ± 0,32 mm untuk Escherichia coli dan 17,13 ± 0,08 mm untuk Staphylococcus aureus. Dilanjutkan dengan uji KHM dengan Nilai KHM 15 % untuk masing- masing bakteri. Uji kebocoran asam nukleat dan protein menunjukkan adanya kebocoran sel pada kedua bakteri pada nilai 1 KHM dan 2 KHM. Kata kunci : Ekstrak, Daun Jati, Tectona grandis Linn. f., Escherichia coli Staphylococcus aureu

The characterization of bacteriocins produced by Lactobacillus plantarum strains isolated from traditional fermented foods in Indonesia and the detection of its plantaricin-encoding genes

Lactobacillus plantarum is widely found in either anaerobic plant matter or fermented foods, and it has been recognized as producing antimicrobial bacteriocins. This study aimed to characterize the antimicrobial bacteriocins of L. plantarum and detect its genes that encode plantaricins. Samples were isolated from traditional fermented foods from Indonesia. Antimicrobial activity was evaluated using the agar diffusion assay procedure. The titration method applied the maximum amounts of lactic acid at 1054 mg/mL and hydrogen peroxide at 3.85 mg/mL. Based on the results, the supernatant of the L. plantarum strains appeared to have a broad spectrum of antimicrobial activity against pathogens, which would be active at pH 2.0–12.0 and stable temperature. In addition, almost all of the L. plantarum strains contained plantaricin-encoding genes (e.g. plnA, plnF,plnJK, and plnW), which were grouped into one cluster as indicated by phylogenetic analysis. Therefore, this study discovered clear evidence of the potential of some L. plantarum strains to act as antimicrobial agents

IDENTIFIKASI SENYAWA AKTIF EKSTRAK DAUN CENGKEH (Syzygium aromaticum) SEBAGAI INHIBITOR Streptococcus mutans

AbstrakKaries gigi adalah penyakit yang umum dialami oleh masyarakat yang terjadi karena buruknya kebersihan mulut. Kebiasaan masyarakat yang kurang menjaga kebersihan mulut mengakibatkan terbentuknya plak. Plak pada gigi terbentuk karena aktivitas dari berbagai macam mikroorganisme di mulut. Mikroorganisme yang diketahui terlibat dalam pembentukan karies gigi adalah Streptococcus mutans. Salah satu bahan alternatif sebagai antibakteri adalah daun cengkeh. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi senyawa bioaktif daun cengkeh dan mengetahui mekanisme aksinya dalam menghambat pertumbuhan Streptococcus mutans. Daun cengkeh (Syzygium aromaticum) yang digunakan dalam penelitian ini dimaserasi menggunakan metanol 96%. Pengujian aktivitas antibakteri dilakukan dengan metode difusi agar, senyawa bioaktif diidentifikasi menggunakan gas chromatography mass spectrometry dan perubahan membran sel bakteri diamati dengan scanning electron microscopy. Hasil penelitian menunjukkan ekstrak metanol daun cengkeh memiliki aktivitas penghambatan terhadap pertumbuhan bakteri Streptococcus mutans dengan zona hambat sebesar ±32 mm serta nilai konsentrasi hambat minimum (KHM) 20% ekstrak. Mekanisme aksi penghambatan ekstrak daun cengkeh terhadap pertumbuhan bakteri diduga dengan membuat lubang pada membran sel bakteri. Hasil penelitian ini juga menunjukkan bahwa daun cengkeh memiliki kandungan senyawa bioaktif 3-allyl-6-methoxyphenol-eugenol, caryophyllene 1,4,7,-cycloundecatriene, 1,5,9,9-tetramethyl, phenol, 2-methoxy-4-(2-propenyl), dan eugenol acetate yang dapat menjadi kandidat penghasil senyawa aktif untuk mengatasi karies gigi.Abstract Dental caries is a common disease experienced by people who do not maintain oral hygiene. Habits of not maintain oral hygiene result in the formation of plaque. The microorganism known to be involved in the formation of dental caries is Streptococcus mutans. Plants that have antibacterial properties, such as clove (Syzygium aromaticum) leaf, can be an alternative for carrying this problem. This study aims to identify the bioactive compounds of clove leaves and to determine the mechanism of its action in inhibiting the growth of Streptococcus mutans. Clove leaves were macerated using 96% methanol for the extraction. Antibacterial activity was examined by agar diffusion method, bioactive compounds were identified using gas chromatography mass spectrometry, and bacterial cell membrane changes were observed by an image captured using scanning electron microscopy. The results showed that the methanol extract of clove leaf had inhibitory activity on Streptococcus mutans growth, with inhibitory zones of ±32 mm and the minimum inhibitory concentration (MIC) of 20% extract. It was suspected that the mechanism of inhibitory action is by making pores in the bacterial cell membrane. The results also showed that the clove leaves contain bioactive compounds of 3-allyl-6-methoxyphenol-eugenol, caryophyllene, 1,4,7, -cycloundecatriene, 1,5,9,9-tetramethyl, phenol, 2 -methoxy-4- (2-propenyl), and eugenol acetate which can be candidates for producing active compounds to overcome dental caries

PEMBERIAN PELATIHAN ISOLASI DNA TANAMAN KELAPA SAWIT DAN APLIKASI METODE ANALISIS SSR (SIMPLE SEQUENCE REPEAT) DI PT SOCFINDO, MEDAN SUMATERA UTARA

AbstrakPT. Socfin Indonesia sebagai perusahaan perkebunan kelapa sawit dan karet yang telah berdiri 100 tahun menyadari pentingnya usaha pemuliaan dan seleksi kelapa sawit. Secara umum, ada beberapa pendekatan yang diadopsi untuk pemuliaan kelapa sawit. Diantaranya adalah Reciprocal Recurrent Selection (RRS) dan Family and Individual Selection (FIS) namun teknik ini memerlukan waktu yang lama. Untuk membantu memotong siklus pemuliaan yang panjang, metode seleksi berbasis DNA digunakan untuk meningkatkan efisiensi dan presisi dalam studi gen. Salah satunya adalah menggunakan marka SSR (Simple Sequence Repeat). Untuk melakukan teknik SSR ini diperlukan keterampilan dalam mengisolasi DNA dan menerapkannya dalam analisis secara SSR. Oleh karena itulah kegiatan pelatihan yang meruapakan bentuk pengabdian kepada masyarakat ini bertujuan untuk membantu dan mendampingi para teknisi dalam melakukan isolasi DNA tanaman kelapa sawit menggunakan Kit ekstraksi serta melakukan amplifikasi pada salah satu primer untuk analisis SSR. Kegiatan yang dilakukan adalah pemberian materi mengenai molekular biologi, prinsip isolasi DNA, prinsip PCR, prinsip teknik SSR, pemberian pelatihan teknik untuk mengisolasi DNA dari sample daun kelapa sawit, teknik mengamplifikasi dengan PCR dan analisis SSR. Kegiatan berjalan dengan baik dan mendapat respon yang tinggi dari peserta selama pelatihan. Hasil kegiatan ini juga menunjukkan bahwa peserta pelatihan dapat mengaplikasikan teknik isolasi DNA tanaman menggunakan Kit ekstraksi dengan baik dan dapat melakukan amplifikasi salah satu primer SSR menggunakan Kit PCR yang diberikan dengan baik.Kata kunci: Isolasi DNA, Kelapa sawit, Pelatiha