Data Mining of the Coffee Rust Genome

The genomes of nine isolates of _Hemileia vastatrix_, the causal agent of coffee leaf rust were sequenced by Illumina and 454. Quality control, cleaning and _de novo_ assemblies of data were performed. Since isolates were obtained from the field and it is not possible to produce axenic cultures of _H. vastatrix_, MEGAN software was used to evaluate contamination levels and to select contigs with fungal similarities. Mitochondrial contigs were identified and annotated by comparing this assembly against the _Puccinia_ genome. Furthermore, two transcriptomes from isolates of _H. vastatrix_ were assembled to complement the genomic data

«La pobreza»: ficción en los medios, realidad en la comunidad

Este trabajo propone analizar la representación de la pobreza como fenómeno social, desde la perspectiva de los medios de comunicación. Para este caso, se analizaron algunas notas de prensa del diario El Espectador, publicadas entre finales del 2013 y principios del 2014, en las que el término de pobreza evidenció diversos sentidos, que dan forma a políticas públicas o modos de vida que afectan a los sectores clasificados bajo este concepto. Se realizó una clasificación de estrategias discursivas existentes y se identificó cuáles habían sido utilizadas en las notas; luego, la información presentada mediante estas fue contrastada con la realidad social del país. Posteriormente, se revisaron estos conceptos a la luz de un marco teórico que aborda los temas de: pobreza, estrategias discursivas, representaciones lingüísticas, teorías de la comunicación y periódicos digitales. Una vez establecidas algunas referencias teóricas, se hizo posible relacionar las intencionalidades que posan detrás de las estrategias empleadas, lo cual permitió observar cómo la pobreza se convierte en un fenómeno social que se debate entre la ficción y la realidad

Bioética: ¿solo una necesidad filosófica moderna?

The current article makes a revision of some important topics that are dealt with in light of bioethics, starting with what historically ethics and moral mean, its transcendence in our procedure legacies and as foundation of life in society, to arrive at what modernly one knows as bioethics and its implications in the advance of science and human well-beingEl presente artículo hace una revisión de algunos temas importantes que son tratados a la luz de bioética, partiendo históricamente de lo que significa ética y moral, su trascendencia en nuestros legados de procedimiento y como artífices de la vida en sociedad, para llegar a lo que modernamente se entiende como bioética y las implicaciones que está tiene en el avance de la ciencia y el bienestar humano

The type VI secretion system of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis is involved in virulence and in vitro motility.

BACKGROUND: The type VI protein secretion system (T6SS) is important in diverse cellular processes in Gram-negative bacteria, including interactions with other bacteria and with eukaryotic hosts. In this study we analyze the evolution of the T6SS in the genus Xanthomonas and evaluate its importance of the T6SS for virulence and in vitro motility in Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm), the causal agent of bacterial blight in cassava (Manihot esculenta). We delineate the organization of the T6SS gene clusters in Xanthomonas and then characterize proteins of this secretion system in Xpm strain CIO151. RESULTS: We describe the presence of three different clusters in the genus Xanthomonas that vary in their organization and degree of synteny between species. Using a gene knockout strategy, we also found that vgrG and hcp are required for maximal aggressiveness of Xpm on cassava plants while clpV is important for both motility and maximal aggressiveness. CONCLUSION: We characterized the T6SS in 15 different strains in Xanthomonas and our phylogenetic analyses suggest that the T6SS might have been acquired by a very ancient event of horizontal gene transfer and maintained through evolution, hinting at their importance for the adaptation of Xanthomonas to their hosts. Finally, we demonstrated that the T6SS of Xpm is functional, and significantly contributes to virulence and motility. This is the first experimental study that demonstrates the role of the T6SS in the Xpm-cassava interaction and the T6SS organization in the genus Xanthomonas

An outbreak of suspected cutaneous leishmaniasis in Ghana: lessons learnt and preparation for future outbreaks

Human cutaneous leishmaniasis (CL) has previously been reported in West Africa, but more recently, sporadic reports of CL have increased. Leishmania major has been identified from Mauritania, Senegal, Mali, and Burkina Faso. Three zymodemes (MON-26, MON-117, and MON-74, the most frequent) have been found. The geographic range of leishmaniasis is limited by the sand fly vector, its feeding preferences, and its capacity to support internal development of specific species of Leishmania. The risk of acquiring CL has been reported to increase considerably with human activity and epidemics of CL have been associated with deforestation, road construction, wars, or other activities where humans intrude the habitat of the vector. In the Ho Municipality in the Volta Region of Ghana, a localised outbreak of skin ulcers, possibly CL, was noted in 2003 without any such documented activity. This outbreak was consistent with CL as evidenced using various methods including parasite identification, albeit, in a small number of patients with ulcers

Thioredoxin 80-Activated-Monocytes (TAMs) Inhibit the Replication of Intracellular Pathogens

BACKGROUND: Thioredoxin 80 (Trx80) is an 80 amino acid natural cleavage product of Trx, produced primarily by monocytes. Trx80 induces differentiation of human monocytes into a novel cell type, named Trx80-activated-monocytes (TAMs). PRINCIPAL FINDINGS: In this investigation we present evidence for a role of TAMs in the control of intracellular bacterial infections. As model pathogens we have chosen Listeria monocytogenes and Brucella abortus which replicate in the cytosol and the endoplasmic reticulum respectively. Our data indicate that TAMs efficiently inhibit intracellular growth of both L. monocytogenes and B. abortus. Further analysis shows that Trx80 activation prevents the escape of GFP-tagged L. monocytogenes into the cytosol, and induces accumulation of the bacteria within the lysosomes. Inhibition of the lysosomal activity by chloroquine treatment resulted in higher replication of bacteria in TAMs compared to that observed in control cells 24 h post-infection, indicating that TAMs kill bacteria by preventing their escape from the endosomal compartments, which progress into a highly degradative phagolysosome. SIGNIFICANCE: Our results show that Trx80 potentiates the bactericidal activities of professional phagocytes, and contributes to the first line of defense against intracellular bacteria

Multilocus Genotyping of Human Giardia Isolates Suggests Limited Zoonotic Transmission and Association between Assemblage B and Flatulence in Children

Giardia intestinalis is a protozoan parasite found world-wide and it is a major cause of diarrhea in humans and other mammals. The genetic variability within G. intestinalis is high with eight distinct genotypes or assemblages (A-H). Here we performed sequence-based multilocus genotyping of around 200 human Giardia isolates. We found evidence of limited zoonotic transmission of certain A subtypes and an association between flatulence and assemblage B infection in children. This shows that it is important to investigate different assemblages and sub-assemblages of G. intestinalis in human infections in order to understand the clinical significance, zoonotic potential, sequence divergence, and transmission pathways of this parasite

Socialización escolar : procesos, experiencias y trayectos

En los artículos que forman parte de este libro se despliega un conjunto de temas, problemas y debates que, en un primer momento, se hicieron presentes entre el equipo coordinador del libro y que luego fueron compartidos con los investigadores miembros del Grupo de Trabajo "Juventudes, Infancias: Políticas, Culturas e Instituciones Sociales" (GT) del Consejo Latinoamericano de Ciencias Sociales (CLACSO). En tal sentido, el propósito de la compilación consiste en aportar a la actualización de un área o campo que, desde sus inicios, fue y es pensado por las ciencias sociales: la escuela y los sistemas educativos. Sin embargo, en los últimos años, el campo de estudios sobre la escuela se ha diversificado y especializado, encontrando nuevos objetos de estudio y ampliando los ya existentes, al tiempo que los temas y problemas educativos se hablan y debaten por toda la sociedad

Relativismo y racionalidad

¿Qué quiere decir que el hombre es un ser racional? ¿Hay una o muchas racionalidades? ¿Son los límites de lo que podemos decir sobre la realidad también los límites de la realidad? ¿Es la percepción de algo real la garantía de que todos percibimos lo mismo? ¿Son la explicación y la compresión formas de justificación dependientes de contextos culturales, de la escogencia más o menos convencional de modelos de explicación, o de estructuras de comprensión universal? ¿Hay una verdad y una realidad en la matemática con independencia de nuestras formas de razonar, relacionadas de algún modo con nuestras formas de vida?. / Contenido. Preliminares; Capítulo 1 - Relativismo y escepticismo. Interpretando al otro: comunicación, racionalidad y relativismo, pág. 19; Interpretando al otro: imperialismo conceptual y relativismo como síntomas, pág. 41; Realismo, esencialismo y extensionalismo, pág. 67; ¿Hay algo más allá de lo que podemos decir?, pág. 95; Percepción e inconmensurabilidad, pág. 101; Contenido no conceptual, modularidad y distintos tipos de ver, pág. 121; Dudas y sospechas, pág. 129; Dudas y sospechas sobre "Dudas y sospechas", pág. 145; Racionalidad y eficacia crítica en una historia multívoca, pág. 165 Capítulo 2 – Racionalidad práctica. Razones internas vs razones externas. Reflexiones sobre una distinción, pág. 181; Razones y motivos para actuar, pág. 195; La paradoja de la irracionalidad según Donald Davidson, pág. 215; Identidad personal e imaginación práctica, pág. 235 Capítulo 3 – Filosofía del lenguaje, de la lógica y de la matemática. La explicitación de las reglas: un problema para la pragmática normativa, pág. 271; Acerca de la normatividad de la semántica, pág. 293; La forma lógica en el Tractatus: sintaxis y semántica, pág. 299 Semántica y aplicación de la lógica, pág. 313; Necesidad lógica e historias naturales ficticias en el Wittgenstein tardío, pág. 323; Realismo y racionalismo en la matemática, pág. 337; El lenguaje y la realidad de la matemática, pág. 351 Capítulo 4 – Explicación teórica. Explicación contextualista y ratificación etnocéntrica de los criterios de justificación, pág. 367; La explicación científica: causalidad, unificación y subsunción teórica, pág. 383; Limites de la explicación como subsunción, pág. 41