Superresolution imaging of single DNA molecules using stochastic photoblinking of minor groove and intercalating dyes

As proof-of-principle for generating superresolution structural information from DNA we applied a method of localization microscopy utilizing photoblinking comparing intercalating dye YOYO-1 against minor groove binding dye SYTO-13, using a bespoke multicolor single-molecule fluorescence microscope. We used a full-length ∼49kbp λ DNA construct possessing oligo inserts at either terminus allowing conjugation of digoxigenin and biotin at opposite ends for tethering to a glass coverslip surface and paramagnetic microsphere respectively. We observed stochastic DNA-bound dye photoactivity consistent with dye photoblinking as opposed to binding/unbinding events, evidenced through both discrete simulations and continuum kinetics analysis. We analyzed dye photoblinking images of immobilized DNA molecules using superresolution reconstruction software from two existing packages, rainSTORM and QuickPALM, and compared the results against our own novel home-written software called ADEMS code. ADEMS code generated lateral localization precision values of 30-40nm and 60-70nm for YOYO-1 and SYTO-13 respectively at video-rate sampling, similar to rainSTORM, running more slowly than rainSTORM and QuickPALM algorithms but having a complementary capability over both in generating automated centroid distribution and cluster analyses. Our imaging system allows us to observe dynamic topological changes to single molecules of DNA in real-time, such as rapid molecular snapping events. This will facilitate visualization of fluorescently-labeled DNA molecules conjugated to a magnetic bead in future experiments involving newly developed magneto-optical tweezers combined with superresolution microscopy

Scientific monitoring of bank protection structures designing

In general, the classification of bank protection structures of active and passive types with indication of advantages and disadvantages of each structure is illustrated. Factors having a destructive impact on bank protection structures are specified. Possible destructions of coatings thereof due to effects of waves and ice are considered. Necessity of the scientific monitoring of bank protection structures designing is rationalized

Some patterns of development radio-induced metachronous tumors

Objective: to determine the specific features of the development of metachronous tumors and survival rates in patients with metachronous primary and multiple cancers after radiotherapy for the first tumor.Material and methods. The archival data of the Chelyabinsk Regional Oncology Dispensary on the treatment of 232 patients, in whom metachronous primary and multiple tumors occurred after radiotherapy for primary tumor, were studied.Results. The patients’ mean age at the diagnosis of the first tumor was 60.23 years (95% CI 58,75–61,72). The time from the first tumor to the second one averaged 91.81 months (95% CI 80,57–103,05). The patients survived for an average of 129.41months (95% CI 116,55–142,28) after the diagnosis of the first tumor and 37.64 months (95% CI 31,92–43,35) after the occurrence of the second tumor. Overall, the patients survived for an average of 127.03 months (95% CI 114,02–140,03) followingradiotherapy for the first tumor. According to the classification, the authors identified three metachronous tumor subgroups: multicentric multiple tumors in one organ (16.0%), systemic tumors and tumors of paired organs (15.5%), and nonsystemic multiple tumors of different organs (68.5%).Conclusion. Patients with multicentric metachronous multiple tumors in one organ are younger and have the shortest time from the diagnosis of the first tumor to the emergence of the second one and the longest survival after the diagnosis of the firsttumor, that after the detection of the second tumor and that after the initiation of radiotherapy. Patients with nonsystemic multiple tumors in different organs areolder and have the longest time from the diagnosis of the first tumor to the occurrence of the second one and the shortest survival

ПРІОРИТЕТИ НАЦІОНАЛЬНОГО ПЛАНУ ДІЙ З ПРИПИНЕННЯ СМЕРТЕЙ НОВОНАРОДЖЕНИХ, ЯКІ МОЖНА ПОПЕРЕДИТИ, В РАМКАХ ГЛОБАЛЬНОЇ СТРАТЕГІЇ ООН «КОЖНА ЖІНКА, КОЖНА ДИТИНА»

To substantiate the priorities of the national action plan to end the preventable deaths of newborns in Ukraine. Spend a content analysis of the UN advisory basis, the Council of Europe in the field of health and WHO to terminate preventable neonatal deaths, as well as the analysis of the database «MATRIX - BABIES» and unified forms of regional neonatologists statements for 2014.The main priorities of the National Plan of Action for cessation of preventable neonatal deaths are: adequate financial and resource support neonatal units; further regionalization of perinatal care; Further unification / standardization of medical care for newborns and the creation of a single information space; the organization of the monitoring system, early intervention and palliative care for children with chronic perinatal pathology; improving the quality and safety of health care; Cooperation with NGOs. To implement these priorities need to develop a national action plan in the framework of the WHO initiative, UNICEF, "Every Newborn", the purpose of which is to end preventable newborn deaths and a reduction in the incidence of disabling diseases among children in Ukraine.Обосновать приоритеты национального плана действий по прекращению предотвратимых смертей новорожденных в Украине. Проведен контент-анализ рекомендательной базы ООН, Совета Европы в области здравоохранения и ВОЗ о прекращении предотвратимых смертей новорожденных, а также анализ базы данных «MATRIX - BABIES» и унифицированных форм тчетности областных неонатологов за 2014 год. Основными приоритетами Национального плана действий по прекращения предотвратимых смертей новорожденных является: адекватное финансовое и ресурсное обеспечение неонатальных подразделений; дальнейшая регионализация перинатальной помощи; дальнейшая унификация/ стандартизация оказания медицинской помощи новорожденным и создание единого информационного пространства; организация системы наблюдения, раннего вмешательства и паллиативной помощи детям с хронической перинатальной патологией; повышение качества и безопасности оказания медицинской помощи; сотрудничество с общественными организациями. Для реализации указанных приоритетов нужно разработать свой национальный план действий в рамках инициативы ВОЗ, ЮНИСЕФ «Каждый Новорожденный», целью которого является прекращение предотвратимых смертей новорожденных и уменьшение частоты развития инвалидизирующей патологии среди детей Украины.Обґрунтування пріоритетів Національного плану дій з припинення попереджувальних смертей новонароджених в Україні. Проведено контент-аналіз рекомендаційної бази ООН, Ради Європи в галузі охорони здоров'я та ВООЗ щодо припинення попереджувальних смертей новонароджених, а також аналіз бази даних «MATRIX - BABIES» т а уніфікованих форм звітності о бласних неонатологів за 2014 рік.Основними пріоритетами Національного плану дій з припинення попереджувальних смертей новонароджених є адекватне фінансове та ресурсне забезпечення неонатальних підрозділів; подальша регіоналізація перинатальної допомоги; подальша уніфікація/стандартизація надання медичної допомоги новонародженим та створення єдиного інформаційного простору; організація системи спостереження, раннього втручання та паліативної допомоги дітям з тяжкими формами перинатальної патології; підвищення якості та безпеки надання медичної допомоги та співпраця з гро мадськими організаціями.Для реалізації зазначених пріоритетів потрібно розробити свій Національний план дій в рамках ініціативи ВООЗ, ЮНІСЕФ «Кожен Новонароджений», метою якого є припинення попереджувальних смертей новонароджених та зменшення частоти ро звитку інвалідизуючої патології серед дітей України

Substantiation of the priorities of national action plan to end preventable deaths of newborns within the global strategy of the un «Every women every child»

Резюме. Обґрунтування пріоритетів Національного плану дій з припинення попереджувальних смертей новонароджених в Україні. Проведено контент-аналіз рекомендаційної бази ООН, Ради Європи в галузі охорони здоров'я та ВООЗ щодо припинення попереджувальних смертей новонароджених, а також аналіз бази даних «MATRIX - BABIES» та уніфікованих форм звітності обласних неонатологів за 2014 рік. Основними пріоритетами Національного плану дій з припинення попереджувальних смертей новонароджених є адекватне фінансове та ресурсне забезпечення неонатальних підрозділів; подальша регіоналізація перинатальної допомоги; подальша уніфікація/стандартизація надання медичної допомоги новонародженим та створення єдиного інформаційного простору; організація системи спостереження, раннього втручання та паліативної допомоги дітям з тяжкими формами перинатальної патології; підвищення якості та безпеки надання медичної допомоги та співпраця з громадськими організаціями Для реалізації зазначених пріоритетів потрібно розробити свій Національний план дій в рамках ініціативи ВООЗ, ЮНІСЕФ «Кожен Новонароджений», метою якого є припинення попереджувальних смертей новонароджених та зменшення частоти розвитку інвалідизуючої патології серед дітей України; Резюме. Обосновать приоритеты национального плана действий по прекращению предотвратимых смертей новорожденных в Украине. Проведен контент-анализ рекомендательной базы ООН, Совета Европы в области здравоохранения и ВОЗ о прекращении предотвратимых смертей новорожденных, а также анализ базы данных «MATRIX - BABIES» и унифицированных форм отчетности областных неонатологов за 2014 год. Основными приоритетами Национального плана действий по прекращения предотвратимых смертей новорожденных является: адекватное финансовое и ресурсное обеспечение неонатальных подразделений; дальнейшая регионализация перинатальной помощи; дальнейшая унификация/стандартизация оказания медицинской помощи новорожденным и создание единого информационного пространства; организация системы наблюдения, раннего вмешательства и паллиативной помощи детям с хронической перинатальной патологией; повышение качества и безопасности оказания медицинской помощи; сотрудничество с общественными организациями. Для реализации указанных приоритетов нужно разработать свой национальный план действий в рамках инициативы ВОЗ, ЮНИСЕФ «Каждый Новорожденный», целью которого является прекращение предотвратимых смертей новорожденных и уменьшение частоты развития инвалидизирующей патологии среди детей Украины; Summary. To substantiate the priorities of the national action plan to end the preventable deaths of newborns in Ukraine. Spend a content analysis of the UN advisory basis, the Council of Europe in the field of health and WHO to terminate preventable neonatal deaths, as well as the analysis of the database «MATRIX - BABIES» and unified forms of regional neonatologists statements for 2014. The main priorities of the National Plan of Action for cessation of preventable neonatal deaths are: adequate financial and resource support neonatal units; further regionalization of perinatal care; Further unification / standardization of medical care for newborns and the creation of a single information space; the organization of the monitoring system, early intervention and palliative care for children with chronic perinatal pathology; improving the quality and safety of health care; Cooperation with NGOs.To implement these priorities need to develop a national action plan in the framework of the WHO initiative, UNICEF, "Every Newborn", the purpose of which is to end preventable newborn deaths and a reduction in the incidence of disabling diseases among children in Ukraine