Evolutionary Constraints in the b-Globin Cluster: The Signature of Purifying Selection at the d-Globin (HBD) Locus and Its Role in Developmental Gene Regulation

Human hemoglobins, the oxygen carriers in the blood, are composed by two α-like and two β-like globin monomers. The β-globin gene cluster located at 11p15.5 comprises one pseudogene and five genes whose expression undergoes two critical switches: the embryonic-to-fetal and fetal-to-adult transition. HBD encodes the δ-globin chain of the minor adult hemoglobin (HbA2), which is assumed to be physiologically irrelevant. Paradoxically, reduced diversity levels have been reported for this gene. In this study, we sought a detailed portrait of the genetic variation within the β-globin cluster in a large human population panel from different geographic backgrounds. We resequenced the coding and noncoding regions of the two adult β-globin genes (HBD and HBB) in European and African populations, and analyzed the data from the β-globin cluster (HBE, HBG2, HBG1, HBBP1, HBD, and HBB) in 1,092 individuals representing 14 populations sequenced as part of the 1000 Genomes Project. Additionally, we assessed the diversity levels in nonhuman primates using chimpanzee sequence data provided by the PanMap Project. Comprehensive analyses, based on classic neutrality tests, empirical and haplotype-based studies, revealed that HBD and its neighbor pseudogene HBBP1 have mainly evolved under purifying selection, suggesting that their roles are essential and nonredundant. Moreover, in the light of recent studies on the chromatin conformation of the β-globin cluster, we present evidence sustaining that the strong functional constraints underlying the decreased contemporary diversity at these two regions were not driven by protein function but instead are likely due to a regulatory role in ontogenic switches of gene expression

Expansion of activated cxcr5+icos+ tfh cells and plasmablasts induced by seasonal influenza vaccine is impaired in anti-il-6r treated rheumatoid arthritis patients

Objectives: To investigate the importance of IL-6 for the in vivo differentiation of human Tfh cells, taking advantage of influenza vaccination in patients under anti-IL-6R therapy.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Atividade de lipase em quimo de três espécies tropicais de peixes Teleostei de água doce

O objetivo do presente trabalho foi avaliar a atividade de lipase no quimo dos intestinos médio e posterior de três espécies de peixes Teleostei, com hábitos alimentares diferentes, piracanjuba (Brycon orbignyanus), piau (Leporinus friderici), onívoros, e surubim (Pseudoplatystoma curuscans), preferencialmente carnívoro, visando fornecer referência à nutrição para o ajuste de diferentes sistemas de alimentação artificial. Foram determinadas as atividades de lipase, utilizando-se kit BIOCLIN. Os resultados demonstraram atividade específica média de lipase de 99,86%, sendo menor para a piracanjuba (1,89 UI/mg) em relação ao piau (1347,82 UI/mg), ambos de hábito alimentar onívoro. A diferença de atividade específica de lipase entre piracanjuba e surubim (793,76 UI/mg) também apresentou média de 99,76%. O surubim apresentou atividade específica de lipase 41,11% menor que o piau. Estes dados sugerem que o piau apresenta atividade específica de lipase mais próxima à de um peixe carnívoro que onívoro. Estudos adicionais com testes de alimentação são necessários para a avaliação do comportamento destas espécies a novos sistemas de alimentação.The objective of this work was to evaluate the lipase activity in the chime present in the intestines or in the rectum of three tropical freshwater Teleostei species with different feeding habits: piracanjuba, Brycon orbignyanus (Valenciennes, 1849), piau, Leporinus friderici, omnivorous, and surubim (Pseudoplatystoma coruscans), preferably carnivorous, aiming to provide nutritional data for the adjustment of different artificial feeding systems. The lipase activity was thus determined by the use of BIOCLIN kit. The results showed average specific lipase activity of 99.86%, being lower for piracanjuba (1.89 UI/mg) as compared to piau (1347.82 UI/mg), both omnivorous, while the activity of the same enzyme for piracanjuba was 99.76% lower when compared to surubim (793.76 UI/mg). Surubim showed specific activity of 41.11% lower than of piau. This data suggests that piau presented specific lipase activity closely to carnivorous fish than the omnivorous one. Additional studies with feeding test are necessary to evaluate the behavior of these species under a new feeding systems

Interação diferencial de genótipos de soja em espécies do complexo Fusarium solani causadoras da podridão vermelha da raiz.

No Brasil, três espécies do Complexo Fusarium solani estão associadas à podridão vermelha da raiz (PVR): Fusarium brasiliense, F. crassistipitatum e F. tucumaniae. Pesquisadores brasileiros têm avaliado a resistência de genótipos de soja a PVR sem levar em conta a ocorrência dessas diferentes espécies. O objetivo deste trabalho foi verificar se há interação entre as três espécies de Fusarium causadoras da PVR e genótipos de soja. Vinte e dois genótipos, entre cultivares e linhagens, foram cultivados em vasos alocados em casa-de-vegetação. Plantas no estádio V1-V2 foram inoculadas pelo método do ?palito de dente?, com três isolados, cada um de uma das três espécies citadas de Fusarium. O experimento foi montado em blocos ao acaso, com quatro repetições, em esquema fatorial (22 genótipos x 3 isolados). O tamanho da lesão na haste foi medido aos 20 dias após a inoculação. Também foi verificada a presença de clorose / necrose internerval. As médias de tamanho de lesão foram submetidas à análise de variância e comparadas pelo teste de Scott-Knott. Apenas o isolado de F. brasiliense provocou o sintoma reflexo de clorose/necrose internerval em 11 dos 22 genótipos. Constatou-se interação significativa (P≤0,05) entre os genótipos utilizados e os três isolados. Esse resultado contribui diretamente com os programas de melhoramento, pois a seleção de genótipos resistentes à PVR terá que ser feita independentemente para cada espécie de Fusarium

Sistemas de plantio de soja e efeito sobre a concentração de microesclerócios de Macrophomina phaseolina.

Esse estudo apresenta os resultados da avaliação do efeito de cinco sistemas de plantio de soja (Grade Pesada; Arado de Disco; Escarificador; Plantio Direto com escarificação a cada três anos; Plantio direto sem escarificação) sobre a concentração de microesclerócios do fungo Macrophomina phaseolina nos solos, expressa em número de colônias por grama de solo seco. Os dados foram obtidos a partir de amostragens de solo realizadas em um experimento de longa duração implantado em abril de 1992, na pós-colheita de três safras consecutivas (2015-2017). Além da concentração total de microesclerócios nas amostras de solo extraídas na profundidade 0-10 cm, avaliou-se também a distribuição de microesclerócios nas profundidades 0-5 cm, 5-10 cm, 10-15 cm, 15-20 cm e 20-30 cm, na primeira safra. Os resultados das análises mostraram que a concentração de microesclerócios nos solos variou entre as safras, independente do sistema de plantio, porém em diferentes magnitudes. Essa variação é discutida com base nas características de cada sistema de plantio, em face das condições climáticas ocorridas em cada safra. Além disso, as análises mostraram que o sistema de plantio pode alterar significativamente a taxa de microesclerócios nas diferentes camadas de solo. Finalmente, esse trabalho mostra que embora os fatores climáticos sejam sabidamente críticos à severidade da doença, os sistemas de plantio podem contribuir para o aumento ou a redução da concentração de inóculo do fungo M. phaseolina no solo.bitstream/item/179484/1/BOLETIM-PB-15-.pd

Study of circulating antigens and antibodies in goat and sheep fascioliasis by electroimmunodiffusion test and micro-Elisa

Des antigènes circulants de F. hepática sont détectés par immunoélectro- diffusion et micro-Elisa respectivement chez 96,4 % et 88,4 % de 138 caprins et chez 91,8 % et 72,6 % de 73 ovins infectés naturellement alors que les anticorps ne sont retrouvés qu’en IED chez 8 % des caprins et 9,5 % des ovins. 60 animaux témoins non infectés ne comportent ni antigène ni anti corps. De plus dans l’infection expérimentale du lapin des antigènes circu lants sont détectés à 48 h, 5 jours et 20 jours, suggérant une relation avec le cycle du parasite et confirmant leur précocité d’apparition. La recherche d’antigène circulant apparaît comme une excellente méthode de diagnostic des animaux infectés.Circulating antigens were detected by electroimmunodiffusion test and micro-Elisa respectively in 96,4 % and 88,4 % sera of 138 goats and in 91,8 % and 72,6 % sera of 73 sheep with F. hepática natural infection. Whereas using the same methods antibody detection was positive respectively in 8 % and 9,5 % sera of the goats and negative in sheep. 60 controls without F. hepática infection had neither antigens nor antibodies in their sera. In rabbit experimental infection circulating antigens were detected after 48 hours, 5 and 20 days proving their early presence and suggesting a rela tionship between the parasite cycle. Circulating antigen detection appears to be a sensitive method of fascioliasis diagnosis in goats and sheep