GPU in Physics Computation: Case Geant4 Navigation

General purpose computing on graphic processing units (GPU) is a potential method of speeding up scientific computation with low cost and high energy efficiency. We experimented with the particle physics simulation toolkit Geant4 used at CERN to benchmark its geometry navigation functionality on a GPU. The goal was to find out whether Geant4 physics simulations could benefit from GPU acceleration and how difficult it is to modify Geant4 code to run in a GPU. We ported selected parts of Geant4 code to C99 & CUDA and implemented a simple gamma physics simulation utilizing this code to measure efficiency. The performance of the program was tested by running it on two different platforms: NVIDIA GeForce 470 GTX GPU and a 12-core AMD CPU system. Our conclusion was that GPUs can be a competitive alternate for multi-core computers but porting existing software in an efficient way is challenging

Bakteerien mikrobilääkeherkkyyden tuloksen tulkinta muuttuu

Bakteerien mikrobilääkeherkkyysmäärityksissä herkän (S) ja resistentin (R) tuloksen määritelmät pysyvät ennallaan, mutta välimuotoisesti herkän (I) tuloksen tulkinta on muuttumassa. Jatkossa I-tulos tarkoittaa sitä, että bakteerin aiheuttama infektio on hoidettavissa kyseisellä lääkkeellä, mutta annostuksen on oltava riittävän suuri. Suomessa uusi määritelmä otetaan käyttöön asteittain vuoden 2021 aikana

Koronainfektion laboratoriodiagnostiikka: Miten laboratorio valitsee menetelmät?

Laboratoriot valitsevat käyttöönsä testit käyttötarkoituksen ja soveltuvuuden perusteella siten, että diagnostiikka on mahdollisimman vaikuttavaa. PCR on luotettavin koronavirustartunnan toteamiseen, mutta etenkin tuoreissa tartunnoissa voidaan käyttää antigeenitestejä.</p

Koronainfektion laboratoriodiagnostiikka : miten laboratorio valitsee menetelmät?

Laboratoriot valitsevat käyttöönsä testit käyttötarkoituksen ja soveltuvuuden perusteella siten, että diagnostiikka on mahdollisimman vaikuttavaa. PCR on luotettavin koronavirustartunnan toteamiseen, mutta etenkin tuoreissa tartunnoissa voidaan käyttää antigeenitestejä.publishedVersio

Koronainfektion laboratoriodiagnostiikka : miten laboratorio valitsee menetelmät?

Laboratoriot valitsevat käyttöönsä testit käyttötarkoituksen ja soveltuvuuden perusteella siten, että diagnostiikka on mahdollisimman vaikuttavaa. PCR on luotettavin koronavirustartunnan toteamiseen, mutta etenkin tuoreissa tartunnoissa voidaan käyttää antigeenitestejä

Bakteerien mikrobilääkeresistenssi Suomessa : Finres 2020

Vuosittainen Finres-raportti kuvaa kattavasti Suomen resistenssitilannetta ja sen kehittymistä viimeisen kymmenenvuoden ajalta. Raportissa on koottu yhteen kliinisten mikrobiologianlaboratorioiden ja THL:n Mykobakteerilaboratorion vuosittain rutiinisti tuottamaa mikrobilääkeherkkyystietoa. Finres-raportin resistenssiseurantatiedot koostuvat pääosin kliinisistä infektioista eristettyjen bakteerien resistenssitiedoista

Enterovirus infection during pregnancy is inversely associated with atopic disease in the offspring

Background: Prenatal environment has been shown to influence child's risk of atopic diseases. Laboratory-confirmed data about the role of maternal infections during pregnancy is scarce. Objective: The aim of this study was to determine the associations between serologically confirmed maternal infections during pregnancy and atopic disease in the offspring. Methods: This was a nested case-control study within a prospective birth cohort study. Altogether 202 atopic case children and 333 matched non-atopic control children were included. Atopic outcome was defined as having an atopic disease and IgE sensitization by the age of 5 years. We analysed serologically acute enterovirus (EV), influenza virus A (IAV) and Mycoplasma pneumoniae (M. pneumoniae) infections during pregnancy, and mother's seropositivity against human cytomegalovirus (CMV) and Helicobacter pylori. Results: Maternal EV infection during pregnancy was inversely associated with atopic outcome in the offspring (odds ratio 0.43; 95% confidence interval: 0.23-0.80, P = 0.008). Acute IAV or M. pneumoniae infections or seropositivity against CMV or Helicobacter pylori were not associated with the atopic outcome. Conclusions and Clinical Relevance: Our results suggest that maternal EV infections during pregnancy are inversely associated with atopic disease in the offspring. Our finding provides further support to the previous studies suggesting an important role of the in utero environment in the development of atopic diseases.Peer reviewe