Utilisation de l'espèce sauvage diploide Gossypium australe F. Muell. pour l'amélioration de l'espèce cultivée tétraploïde G. hirsutum L. par la méthode des lignées monosomiques d'addition

The wild diploïd species Gossypium australe carry interesting agronomic characters such as resistance to wilt fusarium and « delay of the gossypol glands morphogenesis in the seed » that makes it an important source of variability for the genetic improvement of the main cultivated cotton species G. hirsutum. One of the approach to introgress these characters is to isolate and exploit monosomic alien addition lines (MAAL). In order to isolate new MAAL of G. australe in G. hirsutum, the [2(G.hirsutum x G.australe)x G.hirsutum] pentaploid was backcrossed as male parent to G. hirsutum. Among the 253 BC1 derivatives obtained, 106 plants (42%) presented morphological alterations attributed to presence of G. australe chromatin. To define an SSR linkage group for each of the 13 G. australe chromosomes, 42 plants representative of the phenotypic variability observed in the BC1 generation and seven alien addition lines already isolated in our laboratory were analyzed using SSR markers developed from the G. hirsutum species. Out of the 150 SSR markers used, 100 % amplified G. australe DNA and 84 (56 %) generated 89 polymorphic loci. All these loci but two have been assigned, by means of an cluster algorithm, to 13 linkage groups assumed to match up to the 13 chromosomes of the diploid species. On this basis, about 60% of the analyzed plants were multisomic addition lines, 20%, MAAL while 20 % carrying no markers were supposed to be euploid. The newly isolated MAAL appeared to be the same as those already available. Five disomic alien addition plants carrying at least one additional chromosome different from the chromosomes of G. australe previously isolated in a monosomic addition configuration were selfed and the BC1S1 progenies obtained have been analyzed with SSR markers and GISH. Five new MAAL of G. australe in G. hirsutum have thus been isolated. In order to monitor the potentialities of using MAAL for the transfer of genetic material from the additional chromosome to the genetic background, the transmission frequency and integrity of the supernumerary chromosome have been analyzed with SSR markers in the self-progeny of five MAAL. Three of them revealed a transmission frequency significantly lower than the 3:1 expected ratio, one MAAL presented an exclusive preferential transmission of the additional chromosome. In these four MAAL the alien chromosome was transmitted almost unaltered. With the fifth MAAL the alien chromosome was normally transmitted but was altered in half of the plants containing G. australe chromatin. One of the investigated MAAL characterized by its brown fiber produced few plants carrying also white fibers. It has been shown that this mosaicism was due to the loss of the alien supernumerary chromosome. The complete loss of this chromosome seems to be linked to its fragmentation. Résumé : L'espèce diploïde sauvage Gossypium australe possède des caractères agronomiques d'intérêt tels que la résistance au fusarium et le « retard à la morphogenèse des glandes à gossypol » qui en font une importante source de variabilité pour l'amélioration génétique de la principale espèce de cotonnier cultivé G. hirsutum. Une des approches pour l'introgression de ces caractères est la production et l'exploitation de lignées monosomiques d'addition (LMA). Pour isoler les LMA de G. australe sur G. hirsutum, le pentaploïde [2(G.hirsutum x G.australe)x G.hirsutum] a été rétrocroisé comme parent mâle avec l'espèce tétraploïde. Sur les 253 graines obtenues, 106 (42%) ont donné des plantes présentant une morphologie nettement distincte de celle de G. hirsutum. Cette différence a été attribuée à la présence de chromosomes de G. australe.Afin de définir des groupes de liaison pour chacun des chromosomes de G. australe, 42 plantes représentatives de la variabilité phénotypique observée ainsi que 7 lignées d'addition déjà isolées ont été sélectionnées et analysées avec des marqueurs SSR développés sur l'espèce tétraploïde. Tous les 150 marqueurs utilisés ont amplifié l'ADN de G. australe et 84 (56%) ont généré 89 loci polymorphes. Tous ces loci, sauf deux, ont pu être assignés, par classification numérique, à 13 groupes de liaison supposés correspondre aux 13 chromosomes de l'espèce diploïde. Sur cette base, 60% des plantes analysées sont des plurisomiques d'addition; 20%, des LMA tandis que 20 % ne portant aucun marqueur ont été supposées euploïdes. Les nouvelles LMA isolées s'étant révélées être identiques à celles déjà isolées, 5 plantes disomiques d'addition portant au moins un chromosome non-encore isolé à l'état monosomique d'addition ont été autofécondées et leur descendance analysée avec des marqueurs SSR et par la GISH. Cinq nouvelles LMA ont pu ainsi être isolées. Afin d'étudier les potentialités d'utilisation de la méthode des LMA pour le transfert de matériel génétique de l'espèce sauvage vers l'espèce cultivée, la fréquence de transmission et l'intégrité du chromosome surnuméraire, a été analysée avec des marqueurs SSR dans une génération autofécondée de cinq LMA. Trois lignées ont donné un taux de transmission inférieur au ratio attendu de 3:1, chez la quatrième lignée le chromosome surnuméraire a été transmis à toute la descendance. Pour ces quatre lignées le chromosome additionnel a été transmis presque inaltéré. Avec la cinquième lignée, le chromosome additionnel a été transmis suivant le taux attendu mais a été altéré dans la moitié des plantes contenant de la chromatine de G. australe. Une des lignées analysées caractérisée par la couleur brune de ses fibres a produit quelques plantes portant également des fibres blanches. Il a été montré que ce mosaïcisme de la couleur des fibres était dû à la perte du chromosome additionnel. Cette perte semble être liée à une fragmentation du chromosome

Physico-Chemical Composition of the Sesame Variety (Sesamum indicum L.) 32-15 and Characterization of its Derived Products (Seeds, Oil and Oilcake) in Senegal

The variety 32-15 is a variety of sesame (Sesamum indicum L.) introduced in Senegal. Its integration into the Senegalese culture system has been accompanied by a process of agro-morphological research. The purpose of this study is to understand the qualities of the sesame variety 32-15 by operating its biochemical characterization for better use. The study of the physico-chemical composition was carried out on the seeds, oil and sesame cakes of the variety 32-15. The results showed that the seed contained 95.15% dry matter, 20.75% crude protein, 5.39% ash, 3.04% crude fiber, 51.92% fat, and 14.05% carbohydrate. Seeds have proven to be good sources of minerals. Calcium showed the highest rate (689.92 ± 15.97 mg/100 g) followed by phosphorus (575.99 ± 16.75 mg/100 g), magnesium (315.84 ± 8.66 mg/100 g), zinc (38.56 ± 1.86 mg/100 g) and iron (122.50 ± 4.21 mg/100 g). The quality factors of oil extracts showed stable oil and liquid state at room temperature. The analysis of the oilcakes showed a protein content ranging from 33.93 ± 0.27 to 39.87 ± 0.95% with a slightly high fat composition revealing the low yields of the used presses. Keywords: sesame, variety 32-15, derived products, physico-chemical composition, Senega

Flore aquatique et des zones inondables du Parc National des Oiseaux du Djoudj (Sénégal)

This work was carried out in the Djoudj National Bird Park, which has been a wetland of international importance or a Ramsar site since 1977. This study aims to characterize the structure of the aquatic flora and flood zones in the environment. The use of the floristic survey method allowed us to characterize the flora of the site. The results indicate that the aquatic flora of the park consists of 88 species distributed in 63 genera and 26 families. The class of Dicotyledons (64.3%) is more important. This flora is dominated by therophytes (45.2%). From the point of view of biogeographic distribution, pantropical species (46.4%) are more important followed by African species (19.0%). The Fabaceae (17.9%), Poaceae (16.7%), and Cyperaceae (9.5%) families are the most diverse. These results are important in the management of the park's plant resources and in the development of a management plan. Keywords: Flora, Wetland, Djoudj National Bird ParkCe travail a été réalisé dans le Parc National des Oiseaux du Djoudj (PNOD) qui est une zone humide d’importance internationale ou site Ramsar depuis 1977. Cette étude vise à caractériser la structure de la flore aquatique et des zones inondables du milieu. L’utilisation de la méthode des relevés floristiques nous a permis de caractériser la flore du site. Les résultats indiquent que la flore aquatique du parc est constituée de 88 espèces réparties dans 63 genres et 26 familles. La classe des Dicotylédones (64,3%) est plus importante. Cette flore est dominée par les thérophytes (45,2%). Du point vue répartition biogéographique, les espèces pantropicales (46,4%) sont plus importantes suivie des espèces africaines (19,0%). Les familles des Fabaceae (17,9 %), des Poaceae (16,7%), des Cyperaceae (9,5%) sont les plus diversifiées. Ces résultats sont important dans la gestion des ressources végétale du parc et dans l’élaboration d’un plan de gestion. Mots clés:  Flore, Zone humide, Parc National des Oiseaux du Djoud

Validation of an UV-Visible spectrophotometry assay method for the determination of chlorpheniramine maleate tablets without prior extraction

Methods proposed by pharmacopeias to check the quality of chlorpheniramine maleate tablets are multi steps methods which involve extraction and present issues with repeatability. An alternative method is proposed with a sensitive, reliable, simple and rapid UV-VISIBLE spectrophotometry method developed for the determination without extraction of chlorpheniramine maleate in tablets. The method was validated using the accuracy profile approach with an accuracy ranging from 99.70 to 100.46%. Analysis was done using 0.25 mol/L sulfuric acid, distilled water, and raw material in a room at 23 °C for 25 to 30 minutes. Chlorpheniramine maleate concentration varied from 0.018 to 0.03 mg/mL. The method was found to be specific with the appearance of the corresponding maxima at 265 nm and a correlation coefficient (R2 ) of 0.9993. Limits of detection and quantification were respectively 1.39 × 10-4and 2.26 × 10-3 mg/mL. The tolerance limits for the different concentration levels (75, 100 and 125%) were respectively: 88.37; 92.74 and91.62% for lower limits and 111.03; 108.17 and 108.02% for upper limits. It was observed that the tolerance limits were within the limits of acceptability set at 20%. Consequently, the method was declared valid and reliable for routine analysis of chlorpheniramine maleate in tablets containing chlorphenamine as active principle.Keywords : Chlorpheniramine maleate, tablets, accuracy profile, assay method without extraction, validatio

Evaluation automatique de la qualité de données: Challenge Amies Le Foyer - Comment évaluer de manière automatique la qualité d’une table de données ?

Le Challenge AMIES met en lien des doctorants en mathématiques et des entreprises ayant des problématiques de recherche qu’ellles souhaitent approfondir. La société d’assurance le Foyer a dans ce contexte proposé un sujet de ‘Data Quality‘. Ce dernier propose aux participants de construire des algorithmes qui mettront en exergue les erreurs se trouvant dans un set de données, sans connaissances a priori de son contenu ou même du "métier" concerné. Cela tout en gardant le maximum "d’explicabilité" et "d’interprétabilité" (explainability, interpretability).Nous définisssons dans ce document, une donnée valide (donc de qualité) comme étant une donnée observée, non répetée et vraisemblable par rapport aux autres observés. Nous rappelons aussi la définition de l’explicabilité selon une partie de la littérature, avant de la réadapter à notre contexte de data quality, comme étant la possibilité de justifer la non validité d’une entrée du set de données. Nous proposons ensuite une trame (framework) de détection des entrées non-valide d’un set de données. Celle-ci est une succession d’algorithmes de statistique et de machine learning (ML). Ce framework consiste en l’élimination des duplicatas, la détection des "anomalies" statistiques (outliers), la détection des erreurs typographiques et finalement celle des erreurs de logique. Ensuite, les résultats obtenus sont présentés. Nous retrouvons bien une proportion importante des erreurs d’un set de données factices.Nous concluant enfin, en soulignant que les techniques de statistiques et de ML, permettent en effet d’évaluer la qualité d’un set de données en gardant une certaine lisibilité et en permettant l’automatisation. Toutefois, l’état actuel de la littérature semble laisser penser que, l’automatisation, particulièrement, sans a priori sur le set de données, se fera très souvent au détriment de l’explicabilité et / ou de la performance informatique

Comparison of the efficacy of the bispecific and trispecific pathways to exploit Australian wild diploid species for the genetic improvement of upland cotton

peer reviewe

Alien chromosome transmission and somatic elimination in monosomic addition lines of Gossypium australe F. Muell in G. hirsutum L

The efficiency of using monosomic alien addition lines (MAALs) to introgress agronomical traits of interest carried by wild diploid Gossypium species into the main cultivated cotton species G. hirsutum depends on the opportunities of confronting the alien chromosome with the recipient background genome at each generation and on the occurrence of translocations and homoeologous recombinations. The selfed-progeny of five MAALs of G. australe in G. hirsutum was screened with SSR markers to determine the transmission frequency of the alien chromosome and monitor its integrity. Three MAALs revealed a transmission frequency significantly lower than the expected ratio and one MAAL presented an exclusive transmission of the additional chromosome. In these four MAAL the alien chromosome was transmitted almost unaltered. With the fifth MAAL the alien chromosome was normally transmitted but was altered in half of the plants carrying it. In one MAAL, normally carrying brown fiber, the emergence of some plants carrying white and brown fiber revealed the somatic elimination of the additional chromosome. The loss of this chromosome seems to be triggered by its deletion. (Résumé d'auteur

Étude de la composition minérale et des teneurs en protéines et en matières grasses de huit variétés de sésame (

Huit variétés de sésame (EF153, EF147, LC162, LC164, HB168, 32-15, 38-1-7 et Birkan) qui, selon le Centre d’Étude Régional pour l’Amélioration de l’Adaptation à la Sécheresse (CERAAS), sont les mieux appréciées sur le plan agro-morphologique, ont fait l’objet de cette étude. Les teneurs en protéines, en matières grasses et en éléments minéraux de chacune d’elles ont été déterminées. L’étude des éléments minéraux a porté sur le calcium, le phosphore, le magnésium, le fer et le zinc. Les résultats ont montré que, pour les huit variétés de sésame étudiées, les teneurs en protéines varient de 22,59 % à 29,37 % tandis que celles en matières grasses s’établissent dans une fourchette de 48,65 % à 52,45 %. L’étude montre aussi que toutes les variétés sont riches en éléments minéraux. Cependant, le calcium demeure l’élément le plus important dans toutes les variétés étudiées, suivi du phosphore, du magnésium, du fer et du zinc. Les meilleures teneurs minérales obtenues, pour tous les minéraux étudiés, sont avec la variété 38-1-7 : magnésium 455,04 mg/100 g ; phosphore 711,17 mg/100 g ; calcium 973,22 mg/100 g de ; fer 10,86 mg/100 g et le zinc 7,88 mg/100 g. L’étude statistique des teneurs en protéines, en matières grasses et en composition minérale des variétés a permis d’identifier trois variétés plus appréciées, mais aussi d’indiquer leurs domaines potentiels d’utilisation. Ainsi, les variétés LC162 et 38-1-7 pourraient être utilisées respectivement comme additifs en protéines et en éléments minéraux dans les aliments destinés aux enfants. Quant à la variété EF147, elle pourrait être recommandée pour la consommation d’huile

Étude de la composition minérale et des teneurs en protéines et en matières grasses de huit variétés de sésame (Sesamum indicum L.) introduites au Sénégal pour un criblage variétal

Huit variétés de sésame (EF153, EF147, LC162, LC164, HB168, 32-15, 38-1-7 et Birkan) qui, selon le Centre d’Étude Régional pour l’Amélioration de l’Adaptation à la Sécheresse (CERAAS), sont les mieux appréciées sur le plan agro-morphologique, ont fait l’objet de cette étude. Les teneurs en protéines, en matières grasses et en éléments minéraux de chacune d’elles ont été déterminées. L’étude des éléments minéraux a porté sur le calcium, le phosphore, le magnésium, le fer et le zinc. Les résultats ont montré que, pour les huit variétés de sésame étudiées, les teneurs en protéines varient de 22,59 % à 29,37 % tandis que celles en matières grasses s’établissent dans une fourchette de 48,65 % à 52,45 %. L’étude montre aussi que toutes les variétés sont riches en éléments minéraux. Cependant, le calcium demeure l’élément le plus important dans toutes les variétés étudiées, suivi du phosphore, du magnésium, du fer et du zinc. Les meilleures teneurs minérales obtenues, pour tous les minéraux étudiés, sont avec la variété 38-1-7 : magnésium 455,04 mg/100 g ; phosphore 711,17 mg/100 g ; calcium 973,22 mg/100 g de ; fer 10,86 mg/100 g et le zinc 7,88 mg/100 g. L’étude statistique des teneurs en protéines, en matières grasses et en composition minérale des variétés a permis d’identifier trois variétés plus appréciées, mais aussi d’indiquer leurs domaines potentiels d’utilisation. Ainsi, les variétés LC162 et 38-1-7 pourraient être utilisées respectivement comme additifs en protéines et en éléments minéraux dans les aliments destinés aux enfants. Quant à la variété EF147, elle pourrait être recommandée pour la consommation d’huile